MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016445	TGA	2	6	74986	74991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016445	CAC	2	6	75157	75162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034467
1503	NC_016445	CAG	2	6	75299	75304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034467
1504	NC_016445	AGC	2	6	75348	75353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034467
1505	NC_016445	GC	3	6	75352	75357	0 %	0 %	50 %	50 %	360034467
1506	NC_016445	TCA	2	6	75425	75430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034467
1507	NC_016445	TGT	2	6	75434	75439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034467
1508	NC_016445	GT	3	6	75521	75526	0 %	50 %	50 %	0 %	360034467
1509	NC_016445	CGGC	2	8	75543	75550	0 %	0 %	50 %	50 %	360034467
1510	NC_016445	CGA	2	6	75552	75557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034467
1511	NC_016445	AAGG	2	8	75561	75568	50 %	0 %	50 %	0 %	360034467
1512	NC_016445	CAT	2	6	75600	75605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034467
1513	NC_016445	CTT	2	6	75640	75645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034467
1514	NC_016445	TAG	2	6	75684	75689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034467
1515	NC_016445	CAC	2	6	75694	75699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034467
1516	NC_016445	CAG	3	9	75708	75716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034467
1517	NC_016445	AG	3	6	75715	75720	50 %	0 %	50 %	0 %	360034467
1518	NC_016445	TTTCA	2	10	75751	75760	20 %	60 %	0 %	20 %	360034467
1519	NC_016445	GGC	3	9	75811	75819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034467
1520	NC_016445	AGT	2	6	75863	75868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034467
1521	NC_016445	GGC	2	6	76104	76109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034468
1522	NC_016445	GCA	2	6	76121	76126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034468
1523	NC_016445	TGA	2	6	76196	76201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034468
1524	NC_016445	CGC	2	6	76242	76247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034468
1525	NC_016445	ATCA	2	8	76254	76261	50 %	25 %	0 %	25 %	360034468
1526	NC_016445	GA	3	6	76372	76377	50 %	0 %	50 %	0 %	360034468
1527	NC_016445	ATG	2	6	76396	76401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034468
1528	NC_016445	GCT	2	6	76460	76465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034468
1529	NC_016445	TGA	2	6	76471	76476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034468
1530	NC_016445	CG	3	6	76487	76492	0 %	0 %	50 %	50 %	360034468
1531	NC_016445	TGA	2	6	76522	76527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034468
1532	NC_016445	TGG	2	6	76550	76555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034468
1533	NC_016445	GC	3	6	76599	76604	0 %	0 %	50 %	50 %	360034468
1534	NC_016445	T	7	7	76733	76739	0 %	100 %	0 %	0 %	360034468
1535	NC_016445	ATC	2	6	76821	76826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034468
1536	NC_016445	CAC	2	6	76853	76858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034468
1537	NC_016445	AATC	2	8	76859	76866	50 %	25 %	0 %	25 %	360034468
1538	NC_016445	CCGG	2	8	76891	76898	0 %	0 %	50 %	50 %	360034468
1539	NC_016445	AGGA	2	8	76954	76961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016445	CCA	2	6	76995	77000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_016445	GGC	2	6	77038	77043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034469
1542	NC_016445	AAC	2	6	77055	77060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034469
1543	NC_016445	TGGA	2	8	77106	77113	25 %	25 %	50 %	0 %	360034469
1544	NC_016445	TTG	2	6	77144	77149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034469
1545	NC_016445	ATG	2	6	77205	77210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034469
1546	NC_016445	CG	3	6	77261	77266	0 %	0 %	50 %	50 %	360034469
1547	NC_016445	ATCG	2	8	77282	77289	25 %	25 %	25 %	25 %	360034469
1548	NC_016445	CGA	2	6	77312	77317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034469
1549	NC_016445	TCA	2	6	77334	77339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034469
1550	NC_016445	TCA	2	6	77404	77409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034469
1551	NC_016445	TGT	2	6	77437	77442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034469
1552	NC_016445	GTT	2	6	77457	77462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034469
1553	NC_016445	AGT	2	6	77466	77471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034469
1554	NC_016445	AATC	2	8	77482	77489	50 %	25 %	0 %	25 %	360034469
1555	NC_016445	CG	3	6	77724	77729	0 %	0 %	50 %	50 %	360034469
1556	NC_016445	TGT	2	6	77766	77771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034469
1557	NC_016445	CCAA	2	8	77794	77801	50 %	0 %	0 %	50 %	360034469
1558	NC_016445	CTT	2	6	77815	77820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034469
1559	NC_016445	CAT	2	6	77914	77919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034469
1560	NC_016445	ACGC	2	8	77936	77943	25 %	0 %	25 %	50 %	360034469
1561	NC_016445	CAAAC	2	10	78065	78074	60 %	0 %	0 %	40 %	360034469
1562	NC_016445	TCA	2	6	78075	78080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034469
1563	NC_016445	GCC	2	6	78132	78137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034469
1564	NC_016445	GA	3	6	78173	78178	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
1565	NC_016445	A	6	6	78499	78504	100 %	0 %	0 %	0 %	360034469
1566	NC_016445	TCA	2	6	78519	78524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034469
1567	NC_016445	GA	3	6	78537	78542	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
1568	NC_016445	CGT	2	6	78565	78570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034469
1569	NC_016445	AAT	2	6	78608	78613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034469
1570	NC_016445	CCA	2	6	78625	78630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034469
1571	NC_016445	GAG	2	6	78659	78664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034469
1572	NC_016445	TTC	2	6	78683	78688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034469
1573	NC_016445	AG	3	6	78690	78695	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
1574	NC_016445	ATG	2	6	78765	78770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034469
1575	NC_016445	GA	4	8	78774	78781	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
1576	NC_016445	GTT	2	6	78842	78847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034469
1577	NC_016445	AG	3	6	78935	78940	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
1578	NC_016445	A	6	6	79004	79009	100 %	0 %	0 %	0 %	360034469
1579	NC_016445	TG	3	6	79018	79023	0 %	50 %	50 %	0 %	360034469
1580	NC_016445	TAC	2	6	79082	79087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_016445	CGA	2	6	79102	79107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016445	T	6	6	79225	79230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016445	ATG	2	6	79266	79271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_016445	GCT	2	6	79344	79349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034470
1585	NC_016445	A	8	8	79393	79400	100 %	0 %	0 %	0 %	360034470
1586	NC_016445	CTTG	2	8	79403	79410	0 %	50 %	25 %	25 %	360034470
1587	NC_016445	GTC	2	6	79542	79547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034470
1588	NC_016445	TTC	2	6	79641	79646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034470
1589	NC_016445	ACA	2	6	79721	79726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034470
1590	NC_016445	TTA	2	6	79813	79818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034470
1591	NC_016445	CTG	2	6	79841	79846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034471
1592	NC_016445	TGG	2	6	79853	79858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034471
1593	NC_016445	TGG	2	6	79949	79954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034471
1594	NC_016445	GAT	2	6	79960	79965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034471
1595	NC_016445	TTG	2	6	79976	79981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034471
1596	NC_016445	AGA	2	6	80058	80063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034471
1597	NC_016445	AAG	2	6	80099	80104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034471
1598	NC_016445	TG	3	6	80140	80145	0 %	50 %	50 %	0 %	360034471
1599	NC_016445	CTA	2	6	80163	80168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034471
1600	NC_016445	CG	3	6	80193	80198	0 %	0 %	50 %	50 %	360034471
1601	NC_016445	GTG	2	6	80245	80250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034471
1602	NC_016445	ATCCA	2	10	80323	80332	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1603	NC_016445	TC	3	6	80362	80367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_016445	GTC	2	6	80378	80383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_016445	TCT	2	6	80439	80444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034472
1606	NC_016445	CAA	2	6	80472	80477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034472
1607	NC_016445	ATCC	2	8	80487	80494	25 %	25 %	0 %	50 %	360034472
1608	NC_016445	CA	3	6	80522	80527	50 %	0 %	0 %	50 %	360034472
1609	NC_016445	TTG	2	6	80553	80558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034472
1610	NC_016445	GA	3	6	80601	80606	50 %	0 %	50 %	0 %	360034472
1611	NC_016445	TCA	2	6	80726	80731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034472
1612	NC_016445	CCG	2	6	80789	80794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034472
1613	NC_016445	CG	3	6	80793	80798	0 %	0 %	50 %	50 %	360034472
1614	NC_016445	GCA	2	6	80804	80809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034472
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1616	NC_016445	CAT	2	6	80833	80838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034472
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1618	NC_016445	TGCAA	2	10	80854	80863	40 %	20 %	20 %	20 %	360034473
1619	NC_016445	TGG	2	6	80976	80981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034473
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1621	NC_016445	GCA	2	6	81061	81066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034473
1622	NC_016445	CAG	2	6	81083	81088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034473
1623	NC_016445	GCA	2	6	81094	81099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034473
1624	NC_016445	TG	3	6	81111	81116	0 %	50 %	50 %	0 %	360034473
1625	NC_016445	AGCG	2	8	81186	81193	25 %	0 %	50 %	25 %	360034473
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1627	NC_016445	ATC	2	6	81260	81265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034473
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