MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016445	ATTG	2	8	50266	50273	25 %	50 %	25 %	0 %	360034446
1002	NC_016445	TTCGCA	2	12	50319	50330	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	360034446
1003	NC_016445	CAGT	2	8	50353	50360	25 %	25 %	25 %	25 %	360034446
1004	NC_016445	CGTG	2	8	50384	50391	0 %	25 %	50 %	25 %	360034446
1005	NC_016445	C	6	6	50457	50462	0 %	0 %	0 %	100 %	360034446
1006	NC_016445	GGC	2	6	50512	50517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034446
1007	NC_016445	TGGA	2	8	50693	50700	25 %	25 %	50 %	0 %	360034446
1008	NC_016445	AGA	2	6	50720	50725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034446
1009	NC_016445	CGA	2	6	50730	50735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034446
1010	NC_016445	GCG	2	6	50743	50748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034446
1011	NC_016445	AAG	2	6	50754	50759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034446
1012	NC_016445	GCA	2	6	50853	50858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034446
1013	NC_016445	ATA	2	6	50859	50864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034446
1014	NC_016445	CGA	2	6	50890	50895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034446
1015	NC_016445	T	6	6	50896	50901	0 %	100 %	0 %	0 %	360034446
1016	NC_016445	CTT	2	6	51076	51081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034446
1017	NC_016445	TTG	2	6	51231	51236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034446
1018	NC_016445	TGA	2	6	51275	51280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034446
1019	NC_016445	GGC	2	6	51305	51310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034446
1020	NC_016445	GCA	2	6	51346	51351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034446
1021	NC_016445	CTT	2	6	51373	51378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034446
1022	NC_016445	A	8	8	51479	51486	100 %	0 %	0 %	0 %	360034446
1023	NC_016445	AAT	2	6	51497	51502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034446
1024	NC_016445	GTTCA	2	10	51566	51575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1025	NC_016445	ATT	2	6	51586	51591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016445	GTG	2	6	51733	51738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034447
1027	NC_016445	GAA	2	6	51756	51761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034447
1028	NC_016445	TGG	2	6	51928	51933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034447
1029	NC_016445	A	6	6	51947	51952	100 %	0 %	0 %	0 %	360034447
1030	NC_016445	CAC	2	6	51953	51958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034447
1031	NC_016445	CG	3	6	51973	51978	0 %	0 %	50 %	50 %	360034447
1032	NC_016445	AGC	2	6	52009	52014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034447
1033	NC_016445	GAT	2	6	52094	52099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034447
1034	NC_016445	TGA	2	6	52142	52147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034447
1035	NC_016445	ACA	2	6	52162	52167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034447
1036	NC_016445	TGA	2	6	52333	52338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034447
1037	NC_016445	CTG	2	6	52344	52349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034447
1038	NC_016445	GAA	2	6	52367	52372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034447
1039	NC_016445	TGA	2	6	52451	52456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034447
1040	NC_016445	CTA	2	6	52469	52474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034447
1041	NC_016445	GCT	2	6	52478	52483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034447
1042	NC_016445	CT	3	6	52482	52487	0 %	50 %	0 %	50 %	360034447
1043	NC_016445	TCCG	2	8	52489	52496	0 %	25 %	25 %	50 %	360034447
1044	NC_016445	AGA	2	6	52499	52504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034447
1045	NC_016445	ATC	2	6	52578	52583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034447
1046	NC_016445	GCA	2	6	52614	52619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034447
1047	NC_016445	TCA	2	6	52630	52635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034447
1048	NC_016445	AGA	2	6	52799	52804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034447
1049	NC_016445	ATAA	2	8	52907	52914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016445	CGG	2	6	53023	53028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034448
1051	NC_016445	AACA	2	8	53083	53090	75 %	0 %	0 %	25 %	360034448
1052	NC_016445	GCG	2	6	53187	53192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034448
1053	NC_016445	GCA	2	6	53241	53246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034448
1054	NC_016445	TTA	2	6	53324	53329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034448
1055	NC_016445	TCT	2	6	53363	53368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034448
1056	NC_016445	A	6	6	53391	53396	100 %	0 %	0 %	0 %	360034448
1057	NC_016445	TGA	2	6	53540	53545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034448
1058	NC_016445	GCTG	2	8	53616	53623	0 %	25 %	50 %	25 %	360034448
1059	NC_016445	CA	3	6	53760	53765	50 %	0 %	0 %	50 %	360034448
1060	NC_016445	CT	3	6	53771	53776	0 %	50 %	0 %	50 %	360034448
1061	NC_016445	CG	3	6	53844	53849	0 %	0 %	50 %	50 %	360034448
1062	NC_016445	CTGG	2	8	53912	53919	0 %	25 %	50 %	25 %	360034448
1063	NC_016445	TAT	2	6	53988	53993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034448
1064	NC_016445	GGT	2	6	54067	54072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034448
1065	NC_016445	GCG	2	6	54167	54172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034448
1066	NC_016445	TCT	2	6	54186	54191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034448
1067	NC_016445	G	6	6	54202	54207	0 %	0 %	100 %	0 %	360034448
1068	NC_016445	CTG	2	6	54241	54246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034448
1069	NC_016445	TCAA	2	8	54260	54267	50 %	25 %	0 %	25 %	360034448
1070	NC_016445	AG	3	6	54361	54366	50 %	0 %	50 %	0 %	360034448
1071	NC_016445	CCA	2	6	54408	54413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_016445	TGC	2	6	54422	54427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_016445	CAA	2	6	54488	54493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016445	TCT	2	6	54528	54533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034449
1075	NC_016445	AGT	2	6	54610	54615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034449
1076	NC_016445	CTG	2	6	54640	54645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034449
1077	NC_016445	TTTC	2	8	54649	54656	0 %	75 %	0 %	25 %	360034449
1078	NC_016445	TTG	2	6	54669	54674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034449
1079	NC_016445	CAG	2	6	54712	54717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034449
1080	NC_016445	AAG	2	6	54802	54807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034449
1081	NC_016445	CAGA	2	8	54892	54899	50 %	0 %	25 %	25 %	360034449
1082	NC_016445	GTTT	2	8	54938	54945	0 %	75 %	25 %	0 %	360034449
1083	NC_016445	ACA	2	6	54951	54956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034449
1084	NC_016445	GCTT	2	8	54998	55005	0 %	50 %	25 %	25 %	360034449
1085	NC_016445	TGT	2	6	55045	55050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034449
1086	NC_016445	T	6	6	55072	55077	0 %	100 %	0 %	0 %	360034449
1087	NC_016445	TGT	2	6	55213	55218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034449
1088	NC_016445	TAG	2	6	55243	55248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034449
1089	NC_016445	AAG	2	6	55308	55313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034449
1090	NC_016445	CCA	2	6	55380	55385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034449
1091	NC_016445	GCA	2	6	55479	55484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034449
1092	NC_016445	TTA	2	6	55521	55526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_016445	TTG	2	6	55615	55620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016445	T	7	7	55672	55678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_016445	TTG	2	6	55742	55747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016445	TGTT	2	8	55787	55794	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016445	T	8	8	55803	55810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016445	AATTT	2	10	55811	55820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016445	T	6	6	55827	55832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016445	T	9	9	55834	55842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_016445	GAT	2	6	55946	55951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016445	ACCCG	2	10	56004	56013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1103	NC_016445	T	6	6	56032	56037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016445	ATG	2	6	56071	56076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034450
1105	NC_016445	GTG	2	6	56099	56104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034450
1106	NC_016445	GAA	2	6	56119	56124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034450
1107	NC_016445	TGC	2	6	56217	56222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034450
1108	NC_016445	ACGGTG	2	12	56341	56352	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360034450
1109	NC_016445	CGA	2	6	56367	56372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034450
1110	NC_016445	AGA	2	6	56375	56380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034450
1111	NC_016445	TGA	3	9	56397	56405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034450
1112	NC_016445	A	6	6	56582	56587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016445	T	6	6	56604	56609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016445	ATT	2	6	56623	56628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034451
1115	NC_016445	CAACA	2	10	56852	56861	60 %	0 %	0 %	40 %	360034451
1116	NC_016445	TG	3	6	56872	56877	0 %	50 %	50 %	0 %	360034451
1117	NC_016445	TGC	2	6	56892	56897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034451
1118	NC_016445	TGTT	2	8	56901	56908	0 %	75 %	25 %	0 %	360034451
1119	NC_016445	ATTT	2	8	56932	56939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016445	AGA	2	6	56982	56987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016445	GTG	2	6	57017	57022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016445	TTAG	2	8	57025	57032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016445	GAC	2	6	57094	57099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034452
1124	NC_016445	AGA	2	6	57119	57124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034452
1125	NC_016445	AGA	2	6	57156	57161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034452
1126	NC_016445	ACT	2	6	57180	57185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034452
1127	NC_016445	TGG	2	6	57225	57230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034452
1128	NC_016445	AGT	2	6	57252	57257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034452
1129	NC_016445	TCTT	2	8	57319	57326	0 %	75 %	0 %	25 %	360034452
1130	NC_016445	TCGA	2	8	57368	57375	25 %	25 %	25 %	25 %	360034452
1131	NC_016445	CCAG	2	8	57378	57385	25 %	0 %	25 %	50 %	360034452
1132	NC_016445	TGA	2	6	57552	57557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034452
1133	NC_016445	CTC	2	6	57612	57617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034452
1134	NC_016445	GCTA	2	8	57708	57715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_016445	GTA	2	6	57722	57727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016445	A	6	6	57784	57789	100 %	0 %	0 %	0 %	360034453
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1139	NC_016445	GGC	2	6	57965	57970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034453
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1142	NC_016445	CCT	2	6	58055	58060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034453
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1144	NC_016445	TCT	2	6	58131	58136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034453
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1151	NC_016445	CCT	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034453
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1153	NC_016445	TGTCGG	2	12	58456	58467	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360034453
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1159	NC_016445	GATG	2	8	58624	58631	25 %	25 %	50 %	0 %	360034453
1160	NC_016445	ATT	2	6	58652	58657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034453
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1162	NC_016445	TGC	2	6	58701	58706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034453
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1167	NC_016445	CAA	2	6	58906	58911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034453
1168	NC_016445	ATG	2	6	58958	58963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034453
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1183	NC_016445	AT	3	6	59779	59784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1217	NC_016445	A	6	6	62060	62065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1220	NC_016445	T	8	8	62108	62115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1221	NC_016445	GA	3	6	62171	62176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1222	NC_016445	TGA	2	6	62201	62206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1223	NC_016445	CAA	2	6	62224	62229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1224	NC_016445	CAA	2	6	62317	62322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034456
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1229	NC_016445	CT	3	6	62664	62669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1230	NC_016445	ATC	2	6	62695	62700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1231	NC_016445	TTG	2	6	62701	62706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1233	NC_016445	TCG	2	6	62755	62760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1237	NC_016445	A	6	6	62897	62902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1238	NC_016445	T	6	6	62920	62925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_016445	T	7	7	62992	62998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_016445	AAG	2	6	63599	63604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034458
1250	NC_016445	ATCG	2	8	63635	63642	25 %	25 %	25 %	25 %	360034458
1251	NC_016445	CCG	2	6	63667	63672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034458
1252	NC_016445	CCAA	2	8	63701	63708	50 %	0 %	0 %	50 %	360034458
1253	NC_016445	GCG	2	6	63725	63730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034458
1254	NC_016445	TGA	3	9	63736	63744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034458
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1256	NC_016445	TTG	2	6	63867	63872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034458
1257	NC_016445	GAA	2	6	63916	63921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034458
1258	NC_016445	AAC	2	6	63956	63961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034458
1259	NC_016445	TCA	2	6	64077	64082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034458
1260	NC_016445	GT	3	6	64240	64245	0 %	50 %	50 %	0 %	360034458
1261	NC_016445	GTG	2	6	64254	64259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034458
1262	NC_016445	GAT	2	6	64319	64324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034458
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1264	NC_016445	TGA	2	6	64503	64508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034458
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1272	NC_016445	GCT	2	6	64663	64668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034458
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1281	NC_016445	GGA	2	6	64991	64996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_016445	GAA	2	6	65033	65038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034459
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1349	NC_016445	G	6	6	67750	67755	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1350	NC_016445	C	6	6	67770	67775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1351	NC_016445	TTCT	2	8	67777	67784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1352	NC_016445	GAT	2	6	67860	67865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034460
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1359	NC_016445	ACG	2	6	68272	68277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034461
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1362	NC_016445	TCCA	2	8	68561	68568	25 %	25 %	0 %	50 %	360034461
1363	NC_016445	GTC	2	6	68593	68598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034461
1364	NC_016445	GC	3	6	68643	68648	0 %	0 %	50 %	50 %	360034461
1365	NC_016445	TGA	2	6	68690	68695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034461
1366	NC_016445	GAT	2	6	68748	68753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034461
1367	NC_016445	TGC	2	6	68791	68796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034461
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1369	NC_016445	GGC	2	6	69048	69053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034461
1370	NC_016445	TTGGCG	2	12	69070	69081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	360034461
1371	NC_016445	TGG	2	6	69118	69123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034461
1372	NC_016445	GA	3	6	69270	69275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1373	NC_016445	AGC	2	6	69302	69307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034462
1374	NC_016445	ACTG	2	8	69371	69378	25 %	25 %	25 %	25 %	360034462
1375	NC_016445	ACC	2	6	69388	69393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034462
1376	NC_016445	CA	3	6	69412	69417	50 %	0 %	0 %	50 %	360034462
1377	NC_016445	CAC	2	6	69426	69431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034462
1378	NC_016445	CGT	2	6	69435	69440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034462
1379	NC_016445	CGT	2	6	69465	69470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034462
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