MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 57958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016445	TGG	2	6	26063	26068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034428
502	NC_016445	CAT	2	6	26192	26197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034428
503	NC_016445	GTGA	2	8	26273	26280	25 %	25 %	50 %	0 %	360034428
504	NC_016445	TG	3	6	26303	26308	0 %	50 %	50 %	0 %	360034428
505	NC_016445	TAGT	2	8	26341	26348	25 %	50 %	25 %	0 %	360034428
506	NC_016445	TGA	2	6	26375	26380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034428
507	NC_016445	ATTATC	2	12	26391	26402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	360034428
508	NC_016445	CGT	2	6	26499	26504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016445	GAA	2	6	26516	26521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016445	GC	3	6	26550	26555	0 %	0 %	50 %	50 %	360034429
511	NC_016445	CAG	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034429
512	NC_016445	CAC	2	6	26720	26725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034429
513	NC_016445	TTC	2	6	26845	26850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034429
514	NC_016445	GGC	2	6	26935	26940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034429
515	NC_016445	TGA	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034429
516	NC_016445	CTT	2	6	27000	27005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034429
517	NC_016445	T	6	6	27040	27045	0 %	100 %	0 %	0 %	360034429
518	NC_016445	CA	3	6	27137	27142	50 %	0 %	0 %	50 %	360034429
519	NC_016445	CTT	2	6	27201	27206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034429
520	NC_016445	CGTTGT	2	12	27258	27269	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	360034429
521	NC_016445	CGCGG	2	10	27337	27346	0 %	0 %	60 %	40 %	360034429
522	NC_016445	TGTC	2	8	27510	27517	0 %	50 %	25 %	25 %	360034429
523	NC_016445	TCA	3	9	27554	27562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034429
524	NC_016445	TTGA	2	8	27604	27611	25 %	50 %	25 %	0 %	360034429
525	NC_016445	GGCG	2	8	27645	27652	0 %	0 %	75 %	25 %	360034429
526	NC_016445	CAT	2	6	27661	27666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034429
527	NC_016445	GCA	2	6	27747	27752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034429
528	NC_016445	GCAT	2	8	27764	27771	25 %	25 %	25 %	25 %	360034429
529	NC_016445	CTGC	2	8	27785	27792	0 %	25 %	25 %	50 %	360034429
530	NC_016445	TGCA	2	8	27910	27917	25 %	25 %	25 %	25 %	360034429
531	NC_016445	GCA	2	6	27938	27943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034429
532	NC_016445	CG	3	6	27944	27949	0 %	0 %	50 %	50 %	360034429
533	NC_016445	CTGG	2	8	27973	27980	0 %	25 %	50 %	25 %	360034429
534	NC_016445	TGA	3	9	28206	28214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034429
535	NC_016445	ATCA	2	8	28330	28337	50 %	25 %	0 %	25 %	360034429
536	NC_016445	AATTC	2	10	28433	28442	40 %	40 %	0 %	20 %	360034429
537	NC_016445	CTG	2	6	28539	28544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
538	NC_016445	TGC	2	6	28583	28588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
539	NC_016445	GCG	2	6	28651	28656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034430
540	NC_016445	CGC	2	6	28688	28693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034430
541	NC_016445	CAA	2	6	28763	28768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034430
542	NC_016445	TCA	2	6	28796	28801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034430
543	NC_016445	CA	3	6	28808	28813	50 %	0 %	0 %	50 %	360034430
544	NC_016445	AGC	2	6	28846	28851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034430
545	NC_016445	TTG	2	6	28854	28859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034430
546	NC_016445	GC	3	6	29006	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	360034430
547	NC_016445	TGC	2	6	29068	29073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
548	NC_016445	GTC	2	6	29142	29147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034430
549	NC_016445	AACGC	2	10	29198	29207	40 %	0 %	20 %	40 %	360034430
550	NC_016445	ATG	2	6	29224	29229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
551	NC_016445	CCG	2	6	29302	29307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034430
552	NC_016445	GTA	2	6	29322	29327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
553	NC_016445	TCC	2	6	29340	29345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034430
554	NC_016445	TGA	2	6	29374	29379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034430
555	NC_016445	GCA	2	6	29437	29442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
556	NC_016445	CTG	2	6	29458	29463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
557	NC_016445	TCA	2	6	29487	29492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
558	NC_016445	AC	4	8	29513	29520	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
559	NC_016445	GTAA	2	8	29551	29558	50 %	25 %	25 %	0 %	360034431
560	NC_016445	ATT	2	6	29564	29569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034431
561	NC_016445	TGT	2	6	29596	29601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
562	NC_016445	CCA	2	6	29738	29743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034431
563	NC_016445	TTG	2	6	29843	29848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
564	NC_016445	TGG	2	6	30001	30006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034431
565	NC_016445	AGT	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
566	NC_016445	TCA	2	6	30144	30149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
567	NC_016445	ATG	2	6	30150	30155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
568	NC_016445	CAT	2	6	30166	30171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
569	NC_016445	TG	3	6	30240	30245	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
570	NC_016445	CG	3	6	30267	30272	0 %	0 %	50 %	50 %	360034431
571	NC_016445	ATC	2	6	30329	30334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034431
572	NC_016445	TTG	2	6	30347	30352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
573	NC_016445	GTT	2	6	30376	30381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
574	NC_016445	A	7	7	30418	30424	100 %	0 %	0 %	0 %	360034431
575	NC_016445	AAC	2	6	30465	30470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034431
576	NC_016445	TGT	2	6	30519	30524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
577	NC_016445	ACC	2	6	30555	30560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034431
578	NC_016445	TGT	2	6	30570	30575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
579	NC_016445	CGT	2	6	30634	30639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
580	NC_016445	CAG	2	6	30677	30682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
581	NC_016445	CTTG	2	8	30688	30695	0 %	50 %	25 %	25 %	360034431
582	NC_016445	TTG	2	6	30698	30703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
583	NC_016445	AGC	2	6	30718	30723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
584	NC_016445	AGT	2	6	30736	30741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034431
585	NC_016445	GCA	2	6	30742	30747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034431
586	NC_016445	GT	3	6	30807	30812	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
587	NC_016445	ATA	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034431
588	NC_016445	CGT	2	6	30839	30844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
589	NC_016445	CA	3	6	30959	30964	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
590	NC_016445	CA	3	6	30988	30993	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
591	NC_016445	TGGT	2	8	31035	31042	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
592	NC_016445	CATT	2	8	31052	31059	25 %	50 %	0 %	25 %	360034431
593	NC_016445	GCT	2	6	31101	31106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_016445	AAC	2	6	31128	31133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034432
595	NC_016445	TTG	2	6	31262	31267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034432
596	NC_016445	CCA	2	6	31377	31382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034432
597	NC_016445	AGCG	2	8	31422	31429	25 %	0 %	50 %	25 %	360034432
598	NC_016445	CGTG	2	8	31440	31447	0 %	25 %	50 %	25 %	360034432
599	NC_016445	TCA	2	6	31541	31546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
600	NC_016445	AAC	2	6	31552	31557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034432
601	NC_016445	CGCTGA	2	12	31595	31606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360034432
602	NC_016445	CCA	2	6	31607	31612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034432
603	NC_016445	TGG	2	6	31648	31653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
604	NC_016445	T	6	6	31702	31707	0 %	100 %	0 %	0 %	360034432
605	NC_016445	CAG	2	6	31735	31740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034432
606	NC_016445	TGG	2	6	31754	31759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
607	NC_016445	TGAG	2	8	31779	31786	25 %	25 %	50 %	0 %	360034432
608	NC_016445	GTC	2	6	31837	31842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034432
609	NC_016445	ATC	2	6	31916	31921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
610	NC_016445	GGT	2	6	31927	31932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034432
611	NC_016445	CACC	2	8	31953	31960	25 %	0 %	0 %	75 %	360034432
612	NC_016445	CGT	2	6	31998	32003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034432
613	NC_016445	CAT	2	6	32014	32019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034432
614	NC_016445	GTT	2	6	32022	32027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034432
615	NC_016445	T	6	6	32066	32071	0 %	100 %	0 %	0 %	360034432
616	NC_016445	CGGT	2	8	32226	32233	0 %	25 %	50 %	25 %	360034433
617	NC_016445	GTTTT	2	10	32334	32343	0 %	80 %	20 %	0 %	360034433
618	NC_016445	TGG	2	6	32356	32361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034433
619	NC_016445	GGT	2	6	32391	32396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034433
620	NC_016445	TCAA	2	8	32432	32439	50 %	25 %	0 %	25 %	360034433
621	NC_016445	ATG	2	6	32453	32458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034433
622	NC_016445	CTT	2	6	32529	32534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034433
623	NC_016445	TCT	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034433
624	NC_016445	ACA	2	6	32573	32578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034433
625	NC_016445	GAGCGC	2	12	32623	32634	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	360034433
626	NC_016445	ACC	2	6	32662	32667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034433
627	NC_016445	ACG	2	6	32737	32742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034433
628	NC_016445	TTTC	2	8	32856	32863	0 %	75 %	0 %	25 %	360034433
629	NC_016445	TCA	2	6	32885	32890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034433
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729	NC_016445	TCA	2	6	37035	37040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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732	NC_016445	A	6	6	37245	37250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
733	NC_016445	TACT	2	8	37306	37313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
734	NC_016445	TTAAT	2	10	37389	37398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
735	NC_016445	ATTAA	2	10	37401	37410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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741	NC_016445	T	7	7	37535	37541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
742	NC_016445	GT	3	6	37562	37567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
743	NC_016445	TTG	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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760	NC_016445	TGC	2	6	38581	38586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034437
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764	NC_016445	GC	3	6	38788	38793	0 %	0 %	50 %	50 %	360034437
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1000	NC_016445	GAT	2	6	50259	50264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034446

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