MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Verrucosispora maris AB-18-032 plasmid pVMKU

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015409	GC	3	6	2511	2516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015409	CT	3	6	2553	2558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015409	GC	3	6	2662	2667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015409	GA	3	6	3108	3113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015409	CT	3	6	4299	4304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015409	CG	3	6	5121	5126	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
7	NC_015409	GC	4	8	5159	5166	0 %	0 %	50 %	50 %	330464833
8	NC_015409	CG	3	6	8125	8130	0 %	0 %	50 %	50 %	330464836
9	NC_015409	GC	3	6	8244	8249	0 %	0 %	50 %	50 %	330464836
10	NC_015409	TC	3	6	8794	8799	0 %	50 %	0 %	50 %	330464836
11	NC_015409	CG	3	6	8890	8895	0 %	0 %	50 %	50 %	330464836
12	NC_015409	CG	3	6	9124	9129	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
13	NC_015409	GC	3	6	9177	9182	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
14	NC_015409	GC	3	6	9304	9309	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
15	NC_015409	GC	4	8	9322	9329	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
16	NC_015409	CG	3	6	9410	9415	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
17	NC_015409	GC	3	6	9673	9678	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
18	NC_015409	GC	3	6	9742	9747	0 %	0 %	50 %	50 %	330464837
19	NC_015409	GC	3	6	10549	10554	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
20	NC_015409	CG	3	6	11049	11054	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
21	NC_015409	GC	3	6	11347	11352	0 %	0 %	50 %	50 %	330464838
22	NC_015409	TG	3	6	12356	12361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015409	CT	3	6	12405	12410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015409	CG	3	6	12516	12521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015409	GC	3	6	13381	13386	0 %	0 %	50 %	50 %	330464840
26	NC_015409	GA	3	6	13541	13546	50 %	0 %	50 %	0 %	330464840
27	NC_015409	CG	3	6	13613	13618	0 %	0 %	50 %	50 %	330464840
28	NC_015409	GC	3	6	16582	16587	0 %	0 %	50 %	50 %	330464842
29	NC_015409	CG	3	6	18240	18245	0 %	0 %	50 %	50 %	330464842
30	NC_015409	GC	3	6	19706	19711	0 %	0 %	50 %	50 %	330464844
31	NC_015409	GC	3	6	19865	19870	0 %	0 %	50 %	50 %	330464844
32	NC_015409	CG	3	6	20210	20215	0 %	0 %	50 %	50 %	330464845
33	NC_015409	GC	3	6	21019	21024	0 %	0 %	50 %	50 %	330464846
34	NC_015409	CG	3	6	21548	21553	0 %	0 %	50 %	50 %	330464846
35	NC_015409	CG	3	6	21642	21647	0 %	0 %	50 %	50 %	330464846
36	NC_015409	CG	3	6	22361	22366	0 %	0 %	50 %	50 %	330464848
37	NC_015409	CA	3	6	23470	23475	50 %	0 %	0 %	50 %	330464849
38	NC_015409	CG	3	6	23581	23586	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
39	NC_015409	CG	3	6	23739	23744	0 %	0 %	50 %	50 %	330464850
40	NC_015409	GC	3	6	25008	25013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015409	CG	3	6	26310	26315	0 %	0 %	50 %	50 %	330464853
42	NC_015409	CT	3	6	26458	26463	0 %	50 %	0 %	50 %	330464853
43	NC_015409	GC	3	6	26830	26835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015409	GC	3	6	27165	27170	0 %	0 %	50 %	50 %	330464854
45	NC_015409	CG	3	6	27554	27559	0 %	0 %	50 %	50 %	330464854
46	NC_015409	CG	3	6	27813	27818	0 %	0 %	50 %	50 %	330464855
47	NC_015409	TC	3	6	29167	29172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015409	GC	3	6	31160	31165	0 %	0 %	50 %	50 %	330464859
49	NC_015409	TG	3	6	31720	31725	0 %	50 %	50 %	0 %	330464859
50	NC_015409	TC	3	6	31728	31733	0 %	50 %	0 %	50 %	330464859
51	NC_015409	CG	3	6	32592	32597	0 %	0 %	50 %	50 %	330464861
52	NC_015409	CG	3	6	32775	32780	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
53	NC_015409	CG	3	6	32986	32991	0 %	0 %	50 %	50 %	330464862
54	NC_015409	CG	3	6	33555	33560	0 %	0 %	50 %	50 %	330464863
55	NC_015409	CG	3	6	34924	34929	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
56	NC_015409	GC	3	6	35180	35185	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
57	NC_015409	CG	3	6	35950	35955	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
58	NC_015409	GC	3	6	37292	37297	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
59	NC_015409	CG	3	6	37465	37470	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
60	NC_015409	CG	3	6	38911	38916	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
61	NC_015409	CT	3	6	39156	39161	0 %	50 %	0 %	50 %	330464865
62	NC_015409	GC	3	6	39288	39293	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
63	NC_015409	GC	3	6	39857	39862	0 %	0 %	50 %	50 %	330464865
64	NC_015409	CT	3	6	40459	40464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015409	CT	3	6	40749	40754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015409	CG	3	6	41491	41496	0 %	0 %	50 %	50 %	330464866
67	NC_015409	CG	3	6	41615	41620	0 %	0 %	50 %	50 %	330464866
68	NC_015409	CG	3	6	42512	42517	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
69	NC_015409	CG	3	6	42954	42959	0 %	0 %	50 %	50 %	330464867
70	NC_015409	TC	4	8	43491	43498	0 %	50 %	0 %	50 %	330464867
71	NC_015409	CG	3	6	43995	44000	0 %	0 %	50 %	50 %	330464868
72	NC_015409	CG	3	6	44126	44131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015409	GC	3	6	44198	44203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015409	AG	3	6	44271	44276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015409	GC	3	6	44560	44565	0 %	0 %	50 %	50 %	330464869
76	NC_015409	GC	3	6	45417	45422	0 %	0 %	50 %	50 %	330464870
77	NC_015409	CG	3	6	46300	46305	0 %	0 %	50 %	50 %	330464871
78	NC_015409	GC	4	8	46564	46571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015409	CG	3	6	46722	46727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015409	AC	3	6	47797	47802	50 %	0 %	0 %	50 %	330464874
81	NC_015409	GC	3	6	47956	47961	0 %	0 %	50 %	50 %	330464874
82	NC_015409	AC	3	6	48154	48159	50 %	0 %	0 %	50 %	330464874
83	NC_015409	GC	3	6	48775	48780	0 %	0 %	50 %	50 %	330464875
84	NC_015409	GC	3	6	50073	50078	0 %	0 %	50 %	50 %	330464876
85	NC_015409	GC	3	6	50471	50476	0 %	0 %	50 %	50 %	330464876
86	NC_015409	CG	3	6	51525	51530	0 %	0 %	50 %	50 %	330464877
87	NC_015409	CG	3	6	51645	51650	0 %	0 %	50 %	50 %	330464877
88	NC_015409	CG	3	6	51840	51845	0 %	0 %	50 %	50 %	330464877
89	NC_015409	GC	3	6	53290	53295	0 %	0 %	50 %	50 %	330464878
90	NC_015409	GC	3	6	53782	53787	0 %	0 %	50 %	50 %	330464878
91	NC_015409	GC	3	6	53797	53802	0 %	0 %	50 %	50 %	330464878
92	NC_015409	GC	3	6	54416	54421	0 %	0 %	50 %	50 %	330464879
93	NC_015409	CG	3	6	56137	56142	0 %	0 %	50 %	50 %	330464881
94	NC_015409	GC	3	6	56317	56322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015409	CG	3	6	56622	56627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015409	GC	3	6	56941	56946	0 %	0 %	50 %	50 %	330464882
97	NC_015409	AC	3	6	57785	57790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.