MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 174391

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014931	TTC	2	6	17886	17891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790712
502	NC_014931	GC	3	6	17966	17971	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
503	NC_014931	AGC	2	6	18028	18033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790712
504	NC_014931	CTT	2	6	18044	18049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790712
505	NC_014931	ACATGT	2	12	18107	18118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319790712
506	NC_014931	CGG	2	6	18174	18179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790712
507	NC_014931	CGT	2	6	18189	18194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
508	NC_014931	GTC	2	6	18246	18251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
509	NC_014931	CG	3	6	18302	18307	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
510	NC_014931	CCAG	2	8	18338	18345	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
511	NC_014931	GCG	2	6	18350	18355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790712
512	NC_014931	GGCG	2	8	18366	18373	0 %	0 %	75 %	25 %	319790712
513	NC_014931	GCG	2	6	18398	18403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790712
514	NC_014931	AGC	2	6	18473	18478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790712
515	NC_014931	CCA	2	6	18489	18494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790712
516	NC_014931	TGC	2	6	18509	18514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
517	NC_014931	CG	3	6	18518	18523	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
518	NC_014931	GC	3	6	18586	18591	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
519	NC_014931	ATG	2	6	18613	18618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790712
520	NC_014931	CGGT	2	8	18634	18641	0 %	25 %	50 %	25 %	319790712
521	NC_014931	GAA	2	6	18768	18773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790712
522	NC_014931	GC	3	6	18830	18835	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
523	NC_014931	CCT	2	6	18899	18904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790712
524	NC_014931	AGC	2	6	18913	18918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790712
525	NC_014931	CGGC	2	8	18919	18926	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
526	NC_014931	CGT	2	6	18956	18961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
527	NC_014931	GCT	2	6	19002	19007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
528	NC_014931	GGC	2	6	19029	19034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790712
529	NC_014931	GC	3	6	19033	19038	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
530	NC_014931	CAGC	2	8	19053	19060	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
531	NC_014931	GCA	2	6	19103	19108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790712
532	NC_014931	CAC	2	6	19146	19151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790712
533	NC_014931	GCAGCG	2	12	19208	19219	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319790712
534	NC_014931	GCG	2	6	19259	19264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790712
535	NC_014931	CGT	2	6	19286	19291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790712
536	NC_014931	A	6	6	19377	19382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014931	GCCG	2	8	19383	19390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
538	NC_014931	CTG	2	6	19418	19423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790713
539	NC_014931	GC	3	6	19464	19469	0 %	0 %	50 %	50 %	319790713
540	NC_014931	GAT	2	6	19489	19494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790713
541	NC_014931	GAGC	2	8	19549	19556	25 %	0 %	50 %	25 %	319790713
542	NC_014931	GGCCCC	2	12	19579	19590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
543	NC_014931	GC	3	6	19719	19724	0 %	0 %	50 %	50 %	319790713
544	NC_014931	GC	3	6	19732	19737	0 %	0 %	50 %	50 %	319790713
545	NC_014931	GCC	2	6	19773	19778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
546	NC_014931	CGT	2	6	19783	19788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790713
547	NC_014931	GCACCC	2	12	19821	19832	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319790713
548	NC_014931	GGTGG	2	10	19892	19901	0 %	20 %	80 %	0 %	319790713
549	NC_014931	GCC	2	6	19915	19920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
550	NC_014931	CAGC	2	8	19960	19967	25 %	0 %	25 %	50 %	319790713
551	NC_014931	GGC	2	6	19987	19992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790713
552	NC_014931	CCG	2	6	20056	20061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
553	NC_014931	CG	3	6	20066	20071	0 %	0 %	50 %	50 %	319790713
554	NC_014931	GCC	2	6	20081	20086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
555	NC_014931	GCA	2	6	20095	20100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790713
556	NC_014931	TTC	2	6	20114	20119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790713
557	NC_014931	CCG	2	6	20137	20142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790713
558	NC_014931	GC	3	6	20151	20156	0 %	0 %	50 %	50 %	319790713
559	NC_014931	TG	3	6	20198	20203	0 %	50 %	50 %	0 %	319790714
560	NC_014931	GCC	3	9	20228	20236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
561	NC_014931	AGC	2	6	20246	20251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
562	NC_014931	CGC	2	6	20330	20335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
563	NC_014931	GCA	2	6	20364	20369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
564	NC_014931	GC	4	8	20407	20414	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
565	NC_014931	GCGCC	2	10	20428	20437	0 %	0 %	40 %	60 %	319790714
566	NC_014931	GCC	3	9	20435	20443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
567	NC_014931	GCC	2	6	20461	20466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
568	NC_014931	CAG	2	6	20587	20592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
569	NC_014931	GCT	2	6	20601	20606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790714
570	NC_014931	TGC	2	6	20616	20621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790714
571	NC_014931	CGC	2	6	20622	20627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
572	NC_014931	CCTT	2	8	20639	20646	0 %	50 %	0 %	50 %	319790714
573	NC_014931	GTT	2	6	20650	20655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790714
574	NC_014931	TCGA	2	8	20657	20664	25 %	25 %	25 %	25 %	319790714
575	NC_014931	CGTG	2	8	20694	20701	0 %	25 %	50 %	25 %	319790714
576	NC_014931	AAG	2	6	20702	20707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790714
577	NC_014931	GC	4	8	20732	20739	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
578	NC_014931	CAGC	2	8	20740	20747	25 %	0 %	25 %	50 %	319790714
579	NC_014931	GC	3	6	20785	20790	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
580	NC_014931	TGA	2	6	20835	20840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790714
581	NC_014931	GCA	2	6	20868	20873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
582	NC_014931	GC	3	6	20880	20885	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
583	NC_014931	GCC	2	6	20899	20904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790714
584	NC_014931	GC	5	10	20908	20917	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
585	NC_014931	GC	3	6	20956	20961	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
586	NC_014931	GGT	2	6	21049	21054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790714
587	NC_014931	CGCAG	2	10	21174	21183	20 %	0 %	40 %	40 %	319790714
588	NC_014931	GGCC	2	8	21192	21199	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
589	NC_014931	CGCC	2	8	21354	21361	0 %	0 %	25 %	75 %	319790714
590	NC_014931	CAG	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790714
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592	NC_014931	GCC	2	6	21528	21533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790715
593	NC_014931	CGA	2	6	21580	21585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790715
594	NC_014931	CAA	2	6	21628	21633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790715
595	NC_014931	GC	3	6	21671	21676	0 %	0 %	50 %	50 %	319790715
596	NC_014931	GC	3	6	21697	21702	0 %	0 %	50 %	50 %	319790715
597	NC_014931	GCT	2	6	21739	21744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790715
598	NC_014931	GCT	2	6	21820	21825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790715
599	NC_014931	CAG	2	6	21931	21936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790715
600	NC_014931	CAG	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790715
601	NC_014931	TGA	2	6	21997	22002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790715
602	NC_014931	GTG	2	6	22057	22062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790716
603	NC_014931	CGG	2	6	22085	22090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
604	NC_014931	GC	4	8	22102	22109	0 %	0 %	50 %	50 %	319790716
605	NC_014931	GGC	2	6	22121	22126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
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607	NC_014931	ACG	2	6	22153	22158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
608	NC_014931	ACG	2	6	22234	22239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
609	NC_014931	GCG	2	6	22299	22304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
610	NC_014931	CGA	2	6	22376	22381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
611	NC_014931	GGC	2	6	22388	22393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
612	NC_014931	CCA	2	6	22397	22402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790716
613	NC_014931	CG	3	6	22418	22423	0 %	0 %	50 %	50 %	319790716
614	NC_014931	AGC	2	6	22444	22449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
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617	NC_014931	GCG	2	6	22555	22560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
618	NC_014931	CAG	2	6	22581	22586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
619	NC_014931	CCA	2	6	22610	22615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790716
620	NC_014931	GCG	2	6	22628	22633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790716
621	NC_014931	ACG	2	6	22645	22650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790716
622	NC_014931	TGCC	2	8	22685	22692	0 %	25 %	25 %	50 %	319790716
623	NC_014931	GCCA	2	8	22702	22709	25 %	0 %	25 %	50 %	319790716
624	NC_014931	GC	3	6	22726	22731	0 %	0 %	50 %	50 %	319790716
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629	NC_014931	TGT	2	6	22952	22957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790716
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