MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vulcanisaeta distributa DSM 14429 chromosome

Total Repeats: 1554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014537	TGTAT	2	10	3357	3366	20 %	60 %	20 %	0 %	307594154
2	NC_014537	GTATT	2	10	4011	4020	20 %	60 %	20 %	0 %	307594155
3	NC_014537	TAACT	2	10	8123	8132	40 %	40 %	0 %	20 %	307594160
4	NC_014537	TTAAC	2	10	8859	8868	40 %	40 %	0 %	20 %	307594161
5	NC_014537	CGTTA	2	10	9573	9582	20 %	40 %	20 %	20 %	307594162
6	NC_014537	TCCTC	2	10	12683	12692	0 %	40 %	0 %	60 %	307594165
7	NC_014537	ATTAT	2	10	14911	14920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014537	GCAAT	2	10	16675	16684	40 %	20 %	20 %	20 %	307594168
9	NC_014537	CCTAA	2	10	17941	17950	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014537	TTAAG	2	10	18074	18083	40 %	40 %	20 %	0 %	307594171
11	NC_014537	ACTCA	2	10	18618	18627	40 %	20 %	0 %	40 %	307594172
12	NC_014537	TCCTC	2	10	19666	19675	0 %	40 %	0 %	60 %	307594173
13	NC_014537	TTGAT	2	10	21601	21610	20 %	60 %	20 %	0 %	307594176
14	NC_014537	CAGGG	2	10	22011	22020	20 %	0 %	60 %	20 %	307594177
15	NC_014537	GTTTT	2	10	22344	22353	0 %	80 %	20 %	0 %	307594177
16	NC_014537	CGGTG	2	10	22440	22449	0 %	20 %	60 %	20 %	307594178
17	NC_014537	GTCTG	2	10	22998	23007	0 %	40 %	40 %	20 %	307594178
18	NC_014537	ACATT	2	10	27507	27516	40 %	40 %	0 %	20 %	307594181
19	NC_014537	CGGCA	2	10	27795	27804	20 %	0 %	40 %	40 %	307594182
20	NC_014537	GCCTA	2	10	28606	28615	20 %	20 %	20 %	40 %	307594183
21	NC_014537	CGTTA	2	10	36163	36172	20 %	40 %	20 %	20 %	307594189
22	NC_014537	AGAGG	2	10	37456	37465	40 %	0 %	60 %	0 %	307594190
23	NC_014537	GGGTA	2	10	39312	39321	20 %	20 %	60 %	0 %	307594193
24	NC_014537	TTAAT	2	10	41304	41313	40 %	60 %	0 %	0 %	307594195
25	NC_014537	ATTCA	2	10	42654	42663	40 %	40 %	0 %	20 %	307594197
26	NC_014537	TAATA	2	10	44988	44997	60 %	40 %	0 %	0 %	307594198
27	NC_014537	ATTGA	2	10	47346	47355	40 %	40 %	20 %	0 %	307594201
28	NC_014537	CCAAA	2	10	47770	47779	60 %	0 %	0 %	40 %	307594201
29	NC_014537	GGATA	2	10	49052	49061	40 %	20 %	40 %	0 %	307594201
30	NC_014537	AGGAC	2	10	50534	50543	40 %	0 %	40 %	20 %	307594203
31	NC_014537	AAATT	2	10	52195	52204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014537	TAACT	2	10	52558	52567	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014537	TTAAG	2	10	52667	52676	40 %	40 %	20 %	0 %	307594206
34	NC_014537	AGGAA	2	10	53181	53190	60 %	0 %	40 %	0 %	307594207
35	NC_014537	CTTCT	2	10	55284	55293	0 %	60 %	0 %	40 %	307594209
36	NC_014537	CAATT	2	10	56427	56436	40 %	40 %	0 %	20 %	307594210
37	NC_014537	ATACC	2	10	57656	57665	40 %	20 %	0 %	40 %	307594210
38	NC_014537	TGAGT	2	10	60258	60267	20 %	40 %	40 %	0 %	307594212
39	NC_014537	TGAAT	2	10	61996	62005	40 %	40 %	20 %	0 %	307594213
40	NC_014537	CACAG	2	10	67008	67017	40 %	0 %	20 %	40 %	307594218
41	NC_014537	GGTTG	2	10	68453	68462	0 %	40 %	60 %	0 %	307594219
42	NC_014537	ATACC	2	10	72338	72347	40 %	20 %	0 %	40 %	307594222
43	NC_014537	TAATT	2	10	72652	72661	40 %	60 %	0 %	0 %	307594222
44	NC_014537	TGTCG	2	10	73834	73843	0 %	40 %	40 %	20 %	307594223
45	NC_014537	TGAAG	2	10	75426	75435	40 %	20 %	40 %	0 %	307594225
46	NC_014537	ATGTT	2	10	79671	79680	20 %	60 %	20 %	0 %	307594228
47	NC_014537	TTAAC	2	10	80205	80214	40 %	40 %	0 %	20 %	307594228
48	NC_014537	TATAT	2	10	81186	81195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014537	AACCT	2	10	83580	83589	40 %	20 %	0 %	40 %	307594234
50	NC_014537	ACCCT	2	10	87490	87499	20 %	20 %	0 %	60 %	307594239
51	NC_014537	TGGTT	2	10	88273	88282	0 %	60 %	40 %	0 %	307594240
52	NC_014537	TAGCT	2	10	89213	89222	20 %	40 %	20 %	20 %	307594241
53	NC_014537	AACAC	2	10	92064	92073	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014537	CTTAC	2	10	92158	92167	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014537	TGGGC	2	10	92894	92903	0 %	20 %	60 %	20 %	307594244
56	NC_014537	TGGTT	2	10	94194	94203	0 %	60 %	40 %	0 %	307594245
57	NC_014537	CCAAG	2	10	97247	97256	40 %	0 %	20 %	40 %	307594247
58	NC_014537	GTGGC	2	10	99865	99874	0 %	20 %	60 %	20 %	307594248
59	NC_014537	TTACT	2	10	102469	102478	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014537	TTTCT	2	10	103472	103481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014537	ATACT	2	10	103813	103822	40 %	40 %	0 %	20 %	307594251
62	NC_014537	CAGGC	2	10	109438	109447	20 %	0 %	40 %	40 %	307594258
63	NC_014537	AATTC	2	10	110946	110955	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014537	ATGCA	2	10	111031	111040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014537	CCATC	2	10	115955	115964	20 %	20 %	0 %	60 %	307594267
66	NC_014537	CAAAA	2	10	118499	118508	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014537	TAAAT	2	10	120214	120223	60 %	40 %	0 %	0 %	307594273
68	NC_014537	AGCAT	2	10	121796	121805	40 %	20 %	20 %	20 %	307594274
69	NC_014537	TGGTT	2	10	125485	125494	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014537	AGGCC	2	10	125707	125716	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_014537	CCCCA	2	10	125869	125878	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_014537	AGCCT	2	10	127480	127489	20 %	20 %	20 %	40 %	307594278
73	NC_014537	GCCAA	2	10	130573	130582	40 %	0 %	20 %	40 %	307594282
74	NC_014537	GAGTC	2	10	130730	130739	20 %	20 %	40 %	20 %	307594282
75	NC_014537	ACTTA	2	10	131255	131264	40 %	40 %	0 %	20 %	307594283
76	NC_014537	GCCAC	2	10	132366	132375	20 %	0 %	20 %	60 %	307594283
77	NC_014537	CCAGC	2	10	133057	133066	20 %	0 %	20 %	60 %	307594283
78	NC_014537	CCAGG	2	10	134807	134816	20 %	0 %	40 %	40 %	307594283
79	NC_014537	AGGCA	2	10	135266	135275	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014537	TGAGG	2	10	135496	135505	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014537	GAATT	2	10	136228	136237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014537	GGCTT	2	10	136595	136604	0 %	40 %	40 %	20 %	307594284
83	NC_014537	TTGGC	2	10	137092	137101	0 %	40 %	40 %	20 %	307594284
84	NC_014537	AAGCC	2	10	137528	137537	40 %	0 %	20 %	40 %	307594284
85	NC_014537	AGCCT	2	10	137997	138006	20 %	20 %	20 %	40 %	307594284
86	NC_014537	ATCAC	2	10	139957	139966	40 %	20 %	0 %	40 %	307594289
87	NC_014537	CCAAC	2	10	144945	144954	40 %	0 %	0 %	60 %	307594294
88	NC_014537	GACTT	2	10	145295	145304	20 %	40 %	20 %	20 %	307594294
89	NC_014537	GTCAC	2	10	146383	146392	20 %	20 %	20 %	40 %	307594297
90	NC_014537	GATGC	2	10	153607	153616	20 %	20 %	40 %	20 %	307594306
91	NC_014537	TTGTT	2	10	160102	160111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014537	GCTCG	2	10	160861	160870	0 %	20 %	40 %	40 %	307594313
93	NC_014537	CACAG	2	10	164830	164839	40 %	0 %	20 %	40 %	307594317
94	NC_014537	TGGGT	2	10	168953	168962	0 %	40 %	60 %	0 %	307594320
95	NC_014537	GACGA	2	10	169915	169924	40 %	0 %	40 %	20 %	307594321
96	NC_014537	CTTAT	2	10	172063	172072	20 %	60 %	0 %	20 %	307594323
97	NC_014537	AATAA	2	10	172730	172739	80 %	20 %	0 %	0 %	307594323
98	NC_014537	ATGAT	2	10	172899	172908	40 %	40 %	20 %	0 %	307594323
99	NC_014537	AAATA	2	10	173659	173668	80 %	20 %	0 %	0 %	307594323
100	NC_014537	GGAAA	2	10	173759	173768	60 %	0 %	40 %	0 %	307594323
101	NC_014537	AGATA	2	10	174349	174358	60 %	20 %	20 %	0 %	307594323
102	NC_014537	AATAT	2	10	174945	174954	60 %	40 %	0 %	0 %	307594323
103	NC_014537	GAAAG	2	10	176399	176408	60 %	0 %	40 %	0 %	307594325
104	NC_014537	AAAAG	2	10	179684	179693	80 %	0 %	20 %	0 %	307594326
105	NC_014537	AATAT	2	10	179864	179873	60 %	40 %	0 %	0 %	307594326
106	NC_014537	TGTAT	2	10	180059	180068	20 %	60 %	20 %	0 %	307594326
107	NC_014537	AGGAC	2	10	180255	180264	40 %	0 %	40 %	20 %	307594326
108	NC_014537	GGCTT	2	10	180371	180380	0 %	40 %	40 %	20 %	307594326
109	NC_014537	TCACT	2	10	182525	182534	20 %	40 %	0 %	40 %	307594327
110	NC_014537	ATGAT	2	10	188387	188396	40 %	40 %	20 %	0 %	307594334
111	NC_014537	CGAGG	2	10	188613	188622	20 %	0 %	60 %	20 %	307594335
112	NC_014537	GTTAA	2	10	190671	190680	40 %	40 %	20 %	0 %	307594337
113	NC_014537	TAGCC	2	10	191793	191802	20 %	20 %	20 %	40 %	307594339
114	NC_014537	CGAGG	2	10	195263	195272	20 %	0 %	60 %	20 %	307594344
115	NC_014537	GGGTA	2	10	196826	196835	20 %	20 %	60 %	0 %	307594345
116	NC_014537	CTCAA	2	10	201695	201704	40 %	20 %	0 %	40 %	307594350
117	NC_014537	TTTTA	2	10	201935	201944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014537	GTTAA	2	10	202395	202404	40 %	40 %	20 %	0 %	307594351
119	NC_014537	ATTAA	2	10	206239	206248	60 %	40 %	0 %	0 %	307594353
120	NC_014537	CAATG	2	10	207441	207450	40 %	20 %	20 %	20 %	307594353
121	NC_014537	ATTAA	2	10	207823	207832	60 %	40 %	0 %	0 %	307594354
122	NC_014537	GCCCT	2	10	209589	209598	0 %	20 %	20 %	60 %	307594356
123	NC_014537	ACCTG	2	10	211839	211848	20 %	20 %	20 %	40 %	307594357
124	NC_014537	GGGCT	2	10	213541	213550	0 %	20 %	60 %	20 %	307594358
125	NC_014537	TGAGT	2	10	215425	215434	20 %	40 %	40 %	0 %	307594360
126	NC_014537	TTTAA	2	10	218661	218670	40 %	60 %	0 %	0 %	307594363
127	NC_014537	TTAAT	2	10	223916	223925	40 %	60 %	0 %	0 %	307594368
128	NC_014537	CATAT	2	10	224723	224732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014537	CCAAG	2	10	229448	229457	40 %	0 %	20 %	40 %	307594374
130	NC_014537	GTGGC	2	10	229580	229589	0 %	20 %	60 %	20 %	307594374
131	NC_014537	AGGGT	2	10	229921	229930	20 %	20 %	60 %	0 %	307594375
132	NC_014537	CGGCG	2	10	233218	233227	0 %	0 %	60 %	40 %	307594377
133	NC_014537	GAGGC	2	10	234055	234064	20 %	0 %	60 %	20 %	307594378
134	NC_014537	ATTCA	2	10	234100	234109	40 %	40 %	0 %	20 %	307594378
135	NC_014537	TGCCT	2	10	235247	235256	0 %	40 %	20 %	40 %	307594380
136	NC_014537	TGTGG	2	10	235626	235635	0 %	40 %	60 %	0 %	307594380
137	NC_014537	GTAGG	2	10	237254	237263	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014537	GCTTA	2	10	238052	238061	20 %	40 %	20 %	20 %	307594382
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141	NC_014537	GCTAA	2	10	243829	243838	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014537	CTGCC	2	10	244478	244487	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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146	NC_014537	AATTC	2	10	249368	249377	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014537	CCTTA	2	10	249604	249613	20 %	40 %	0 %	40 %	307594394
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151	NC_014537	TAATT	2	10	262033	262042	40 %	60 %	0 %	0 %	307594405
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153	NC_014537	TTGGT	2	10	267239	267248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_014537	TCACC	2	10	314421	314430	20 %	20 %	0 %	60 %	307594458
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