MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 1037

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	AGGCC	2	10	209	218	20 %	0 %	40 %	40 %	239819986
2	NC_012792	CGGCA	2	10	1537	1546	20 %	0 %	40 %	40 %	239819987
3	NC_012792	GCCAG	2	10	2191	2200	20 %	0 %	40 %	40 %	239819988
4	NC_012792	GCGCG	2	10	3166	3175	0 %	0 %	60 %	40 %	239819989
5	NC_012792	CTTGC	2	10	3277	3286	0 %	40 %	20 %	40 %	239819989
6	NC_012792	GCGTC	2	10	6044	6053	0 %	20 %	40 %	40 %	239819992
7	NC_012792	TCGCT	2	10	6096	6105	0 %	40 %	20 %	40 %	239819992
8	NC_012792	GCATC	2	10	7533	7542	20 %	20 %	20 %	40 %	239819994
9	NC_012792	CTGGG	2	10	9755	9764	0 %	20 %	60 %	20 %	239819995
10	NC_012792	CGGCG	2	10	13794	13803	0 %	0 %	60 %	40 %	239819998
11	NC_012792	GCGCG	2	10	13876	13885	0 %	0 %	60 %	40 %	239819998
12	NC_012792	CGGCA	2	10	17065	17074	20 %	0 %	40 %	40 %	239820001
13	NC_012792	GACCA	2	10	19160	19169	40 %	0 %	20 %	40 %	239820003
14	NC_012792	GGCCA	2	10	20414	20423	20 %	0 %	40 %	40 %	239820004
15	NC_012792	GCGCG	2	10	20593	20602	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
16	NC_012792	CGCGG	2	10	20843	20852	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
17	NC_012792	CATCG	2	10	21279	21288	20 %	20 %	20 %	40 %	239820005
18	NC_012792	GGGCA	2	10	21397	21406	20 %	0 %	60 %	20 %	239820005
19	NC_012792	GGATC	2	10	22095	22104	20 %	20 %	40 %	20 %	239820006
20	NC_012792	ATTCG	2	10	22285	22294	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012792	CGCGA	2	10	26731	26740	20 %	0 %	40 %	40 %	239820011
22	NC_012792	GAGCA	2	10	28731	28740	40 %	0 %	40 %	20 %	239820012
23	NC_012792	TGCCC	2	10	28826	28835	0 %	20 %	20 %	60 %	239820012
24	NC_012792	GGGCT	2	10	30915	30924	0 %	20 %	60 %	20 %	239820015
25	NC_012792	CTGGC	2	10	31200	31209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820015
26	NC_012792	GAAAG	2	10	31929	31938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012792	GCGCC	2	10	34613	34622	0 %	0 %	40 %	60 %	239820017
28	NC_012792	CCTGG	2	10	35081	35090	0 %	20 %	40 %	40 %	239820017
29	NC_012792	CGACC	2	10	35228	35237	20 %	0 %	20 %	60 %	239820017
30	NC_012792	GCAAT	2	10	35946	35955	40 %	20 %	20 %	20 %	239820018
31	NC_012792	GCCGG	2	10	36308	36317	0 %	0 %	60 %	40 %	239820018
32	NC_012792	TGCGC	2	10	37838	37847	0 %	20 %	40 %	40 %	239820019
33	NC_012792	ACCTC	2	10	40008	40017	20 %	20 %	0 %	60 %	239820021
34	NC_012792	AAGGC	2	10	40107	40116	40 %	0 %	40 %	20 %	239820021
35	NC_012792	GTGCT	2	10	40790	40799	0 %	40 %	40 %	20 %	239820021
36	NC_012792	GGGCC	2	10	41467	41476	0 %	0 %	60 %	40 %	239820021
37	NC_012792	CGCGA	2	10	41531	41540	20 %	0 %	40 %	40 %	239820021
38	NC_012792	GGCGC	2	10	42005	42014	0 %	0 %	60 %	40 %	239820021
39	NC_012792	ACCTG	2	10	42877	42886	20 %	20 %	20 %	40 %	239820022
40	NC_012792	GCACC	2	10	43687	43696	20 %	0 %	20 %	60 %	239820023
41	NC_012792	TCGAA	2	10	43986	43995	40 %	20 %	20 %	20 %	239820023
42	NC_012792	GCACC	2	10	44137	44146	20 %	0 %	20 %	60 %	239820023
43	NC_012792	GGCCT	2	10	46063	46072	0 %	20 %	40 %	40 %	239820024
44	NC_012792	GGGCG	2	10	47563	47572	0 %	0 %	80 %	20 %	239820026
45	NC_012792	CCGGC	2	10	47655	47664	0 %	0 %	40 %	60 %	239820027
46	NC_012792	CCGGC	2	10	48044	48053	0 %	0 %	40 %	60 %	239820027
47	NC_012792	GGGCA	2	10	48105	48114	20 %	0 %	60 %	20 %	239820027
48	NC_012792	GCTGC	2	10	48663	48672	0 %	20 %	40 %	40 %	239820027
49	NC_012792	CCGGG	2	10	49237	49246	0 %	0 %	60 %	40 %	239820027
50	NC_012792	GCGCG	2	10	51136	51145	0 %	0 %	60 %	40 %	239820029
51	NC_012792	CGGAT	2	10	51254	51263	20 %	20 %	40 %	20 %	239820029
52	NC_012792	GCCGA	2	10	51446	51455	20 %	0 %	40 %	40 %	239820029
53	NC_012792	CATCG	2	10	53094	53103	20 %	20 %	20 %	40 %	239820032
54	NC_012792	TGCCG	2	10	53831	53840	0 %	20 %	40 %	40 %	239820032
55	NC_012792	CGTGG	2	10	55120	55129	0 %	20 %	60 %	20 %	239820033
56	NC_012792	GCGCA	2	10	55404	55413	20 %	0 %	40 %	40 %	239820034
57	NC_012792	CGATG	2	10	57074	57083	20 %	20 %	40 %	20 %	239820035
58	NC_012792	TGCGC	2	10	58895	58904	0 %	20 %	40 %	40 %	239820037
59	NC_012792	CCCGG	2	10	60221	60230	0 %	0 %	40 %	60 %	239820039
60	NC_012792	GATCG	2	10	60308	60317	20 %	20 %	40 %	20 %	239820039
61	NC_012792	GGGCC	2	10	63816	63825	0 %	0 %	60 %	40 %	239820041
62	NC_012792	GCCCG	2	10	65788	65797	0 %	0 %	40 %	60 %	239820043
63	NC_012792	GGGCA	2	10	66035	66044	20 %	0 %	60 %	20 %	239820043
64	NC_012792	CCGCG	2	10	66408	66417	0 %	0 %	40 %	60 %	239820044
65	NC_012792	CAGCT	2	10	66709	66718	20 %	20 %	20 %	40 %	239820044
66	NC_012792	CGGCC	2	10	68247	68256	0 %	0 %	40 %	60 %	239820046
67	NC_012792	AGCGC	2	10	68444	68453	20 %	0 %	40 %	40 %	239820046
68	NC_012792	GCTCG	2	10	69155	69164	0 %	20 %	40 %	40 %	239820046
69	NC_012792	CGTGC	2	10	71435	71444	0 %	20 %	40 %	40 %	239820047
70	NC_012792	CGCGC	2	10	71653	71662	0 %	0 %	40 %	60 %	239820047
71	NC_012792	CCGCA	2	10	72005	72014	20 %	0 %	20 %	60 %	239820048
72	NC_012792	CGCTT	2	10	72370	72379	0 %	40 %	20 %	40 %	239820048
73	NC_012792	GCGCC	2	10	72442	72451	0 %	0 %	40 %	60 %	239820048
74	NC_012792	TCGCC	2	10	73502	73511	0 %	20 %	20 %	60 %	239820050
75	NC_012792	GGCCC	2	10	75368	75377	0 %	0 %	40 %	60 %	239820051
76	NC_012792	GCCGC	2	10	76209	76218	0 %	0 %	40 %	60 %	239820052
77	NC_012792	TGCGC	2	10	76511	76520	0 %	20 %	40 %	40 %	239820052
78	NC_012792	GCGCA	2	10	76604	76613	20 %	0 %	40 %	40 %	239820052
79	NC_012792	GCGCC	2	10	78108	78117	0 %	0 %	40 %	60 %	239820054
80	NC_012792	AGTGC	2	10	83449	83458	20 %	20 %	40 %	20 %	239820060
81	NC_012792	CCGCA	2	10	83803	83812	20 %	0 %	20 %	60 %	239820061
82	NC_012792	GGCCT	2	10	84223	84232	0 %	20 %	40 %	40 %	239820061
83	NC_012792	CGCAG	2	10	87817	87826	20 %	0 %	40 %	40 %	239820064
84	NC_012792	GCGCC	2	10	90063	90072	0 %	0 %	40 %	60 %	239820066
85	NC_012792	GCAAG	2	10	90760	90769	40 %	0 %	40 %	20 %	239820068
86	NC_012792	CGGCG	2	10	91174	91183	0 %	0 %	60 %	40 %	239820068
87	NC_012792	CGCTG	2	10	92004	92013	0 %	20 %	40 %	40 %	239820069
88	NC_012792	TGGCG	2	10	92056	92065	0 %	20 %	60 %	20 %	239820069
89	NC_012792	CCGCG	2	10	93360	93369	0 %	0 %	40 %	60 %	239820070
90	NC_012792	AGCCC	2	10	95017	95026	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_012792	GCCCG	2	10	96993	97002	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_012792	GGTGA	2	10	97110	97119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012792	CGATG	2	10	97595	97604	20 %	20 %	40 %	20 %	239820074
94	NC_012792	TCGCC	2	10	98288	98297	0 %	20 %	20 %	60 %	239820074
95	NC_012792	TCCCA	2	10	99134	99143	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_012792	GCAGC	2	10	99835	99844	20 %	0 %	40 %	40 %	239820077
97	NC_012792	CGATG	2	10	99941	99950	20 %	20 %	40 %	20 %	239820077
98	NC_012792	GCAGC	2	10	100595	100604	20 %	0 %	40 %	40 %	239820078
99	NC_012792	GCCAC	2	10	100694	100703	20 %	0 %	20 %	60 %	239820078
100	NC_012792	CGGCG	2	10	101974	101983	0 %	0 %	60 %	40 %	239820078
101	NC_012792	GCCGC	2	10	103943	103952	0 %	0 %	40 %	60 %	239820079
102	NC_012792	CGCGC	2	10	106347	106356	0 %	0 %	40 %	60 %	239820080
103	NC_012792	GAGCA	2	10	106836	106845	40 %	0 %	40 %	20 %	239820080
104	NC_012792	TCCAG	2	10	107075	107084	20 %	20 %	20 %	40 %	239820080
105	NC_012792	GGCGA	2	10	107820	107829	20 %	0 %	60 %	20 %	239820080
106	NC_012792	CGAGA	2	10	108772	108781	40 %	0 %	40 %	20 %	239820081
107	NC_012792	CGGCG	2	10	109184	109193	0 %	0 %	60 %	40 %	239820082
108	NC_012792	CGGGC	2	10	109254	109263	0 %	0 %	60 %	40 %	239820082
109	NC_012792	GCGAT	2	10	109385	109394	20 %	20 %	40 %	20 %	239820082
110	NC_012792	GGCCT	2	10	109441	109450	0 %	20 %	40 %	40 %	239820082
111	NC_012792	GCCGA	2	10	110000	110009	20 %	0 %	40 %	40 %	239820083
112	NC_012792	CGCGG	2	10	110650	110659	0 %	0 %	60 %	40 %	239820084
113	NC_012792	GCCCA	2	10	111036	111045	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_012792	CGCAG	2	10	111377	111386	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012792	CGCGG	2	10	112168	112177	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012792	CTGGA	2	10	113403	113412	20 %	20 %	40 %	20 %	239820085
117	NC_012792	TGGGA	2	10	114895	114904	20 %	20 %	60 %	0 %	239820085
118	NC_012792	GCGCA	2	10	115043	115052	20 %	0 %	40 %	40 %	239820085
119	NC_012792	CGCGC	2	10	120613	120622	0 %	0 %	40 %	60 %	239820091
120	NC_012792	TCGAT	2	10	120857	120866	20 %	40 %	20 %	20 %	239820091
121	NC_012792	ATCGC	2	10	121995	122004	20 %	20 %	20 %	40 %	239820092
122	NC_012792	GCGCG	2	10	122087	122096	0 %	0 %	60 %	40 %	239820092
123	NC_012792	TGGGC	2	10	124088	124097	0 %	20 %	60 %	20 %	239820094
124	NC_012792	CGGGA	2	10	126683	126692	20 %	0 %	60 %	20 %	239820097
125	NC_012792	CCCGG	2	10	129154	129163	0 %	0 %	40 %	60 %	239820099
126	NC_012792	CGCGG	2	10	129644	129653	0 %	0 %	60 %	40 %	239820100
127	NC_012792	CAAAT	2	10	130344	130353	60 %	20 %	0 %	20 %	239820101
128	NC_012792	TCGGC	2	10	130509	130518	0 %	20 %	40 %	40 %	239820101
129	NC_012792	CTGCG	2	10	131200	131209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820102
130	NC_012792	CGCGC	2	10	131880	131889	0 %	0 %	40 %	60 %	239820103
131	NC_012792	GCATC	2	10	132298	132307	20 %	20 %	20 %	40 %	239820103
132	NC_012792	CTGGC	2	10	132486	132495	0 %	20 %	40 %	40 %	239820103
133	NC_012792	CCACC	2	10	133973	133982	20 %	0 %	0 %	80 %	239820105
134	NC_012792	GCACG	2	10	135716	135725	20 %	0 %	40 %	40 %	239820107
135	NC_012792	CCTGG	2	10	138362	138371	0 %	20 %	40 %	40 %	239820111
136	NC_012792	GCCGC	2	10	140468	140477	0 %	0 %	40 %	60 %	239820114
137	NC_012792	TCCCT	2	10	141349	141358	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012792	GCGCG	2	10	141692	141701	0 %	0 %	60 %	40 %	239820116
139	NC_012792	GCGCC	2	10	142528	142537	0 %	0 %	40 %	60 %	239820116
140	NC_012792	GCGCC	2	10	143259	143268	0 %	0 %	40 %	60 %	239820117
141	NC_012792	CCCGG	2	10	144377	144386	0 %	0 %	40 %	60 %	239820118
142	NC_012792	CGCGA	2	10	144784	144793	20 %	0 %	40 %	40 %	239820119
143	NC_012792	CGCTG	2	10	147515	147524	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012792	CGCGG	2	10	147807	147816	0 %	0 %	60 %	40 %	239820121
145	NC_012792	TCTGG	2	10	150474	150483	0 %	40 %	40 %	20 %	239820123
146	NC_012792	CTTGC	2	10	151601	151610	0 %	40 %	20 %	40 %	239820124
147	NC_012792	CTTCG	2	10	155397	155406	0 %	40 %	20 %	40 %	239820129
148	NC_012792	CCCTG	2	10	155563	155572	0 %	20 %	20 %	60 %	239820129
149	NC_012792	GGTCG	2	10	157040	157049	0 %	20 %	60 %	20 %	239820130
150	NC_012792	CATGC	2	10	158454	158463	20 %	20 %	20 %	40 %	239820132
151	NC_012792	ATGCG	2	10	160314	160323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_012792	GGGAT	2	10	160817	160826	20 %	20 %	60 %	0 %	239820135
153	NC_012792	GAAAG	2	10	161036	161045	60 %	0 %	40 %	0 %	239820136
154	NC_012792	CTGCG	2	10	161119	161128	0 %	20 %	40 %	40 %	239820136
155	NC_012792	AGGCG	2	10	161206	161215	20 %	0 %	60 %	20 %	239820136
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157	NC_012792	CAGCG	2	10	161787	161796	20 %	0 %	40 %	40 %	239820137
158	NC_012792	CGATC	2	10	163116	163125	20 %	20 %	20 %	40 %	239820138
159	NC_012792	GGCCG	2	10	163221	163230	0 %	0 %	60 %	40 %	239820138
160	NC_012792	CCGAG	2	10	164627	164636	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
161	NC_012792	GCTGC	2	10	165625	165634	0 %	20 %	40 %	40 %	239820139
162	NC_012792	CGGCG	2	10	166770	166779	0 %	0 %	60 %	40 %	239820140
163	NC_012792	AGCGC	2	10	170924	170933	20 %	0 %	40 %	40 %	239820145
164	NC_012792	GCGCT	2	10	175512	175521	0 %	20 %	40 %	40 %	239820150
165	NC_012792	GGCGC	2	10	176391	176400	0 %	0 %	60 %	40 %	239820151
166	NC_012792	CCGGC	2	10	176438	176447	0 %	0 %	40 %	60 %	239820151
167	NC_012792	GGCCC	2	10	176550	176559	0 %	0 %	40 %	60 %	239820151
168	NC_012792	GGACG	2	10	177054	177063	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_012792	GCGCC	2	10	182314	182323	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
172	NC_012792	CAGGA	2	10	183139	183148	40 %	0 %	40 %	20 %	239820157
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175	NC_012792	CGGCG	2	10	191812	191821	0 %	0 %	60 %	40 %	239820164
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177	NC_012792	CAGGC	2	10	194865	194874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
178	NC_012792	CGGCC	2	10	195813	195822	0 %	0 %	40 %	60 %	239820168
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188	NC_012792	GCCGC	2	10	205185	205194	0 %	0 %	40 %	60 %	239820178
189	NC_012792	GGCTC	2	10	205413	205422	0 %	20 %	40 %	40 %	239820178
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194	NC_012792	GCAGC	2	10	210041	210050	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
195	NC_012792	ACGCG	2	10	211703	211712	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
196	NC_012792	CGGCC	2	10	212462	212471	0 %	0 %	40 %	60 %	239820186
197	NC_012792	TGCGC	2	10	215004	215013	0 %	20 %	40 %	40 %	239820188
198	NC_012792	TCGCG	2	10	215217	215226	0 %	20 %	40 %	40 %	239820188
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213	NC_012792	CGGCA	2	10	230918	230927	20 %	0 %	40 %	40 %	239820202
214	NC_012792	CCTGC	2	10	231032	231041	0 %	20 %	20 %	60 %	239820202
215	NC_012792	ACGCC	2	10	232798	232807	20 %	0 %	20 %	60 %	239820203
216	NC_012792	GGCCG	2	10	232932	232941	0 %	0 %	60 %	40 %	239820203
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218	NC_012792	GCCTG	2	10	234985	234994	0 %	20 %	40 %	40 %	239820205
219	NC_012792	GGCCG	2	10	235498	235507	0 %	0 %	60 %	40 %	239820206
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229	NC_012792	GGCTT	2	10	244972	244981	0 %	40 %	40 %	20 %	239820215
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231	NC_012792	CATTG	2	10	245331	245340	20 %	40 %	20 %	20 %	239820216
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236	NC_012792	CCGGC	2	10	247312	247321	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
237	NC_012792	GCCAG	2	10	247354	247363	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
238	NC_012792	GGCCG	2	10	249053	249062	0 %	0 %	60 %	40 %	239820219
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242	NC_012792	CGAAG	2	10	251270	251279	40 %	0 %	40 %	20 %	239820221
243	NC_012792	GCCGG	2	10	253245	253254	0 %	0 %	60 %	40 %	239820222
244	NC_012792	GCCGT	2	10	253609	253618	0 %	20 %	40 %	40 %	239820223
245	NC_012792	CCGTG	2	10	256140	256149	0 %	20 %	40 %	40 %	239820226
246	NC_012792	CAGCC	2	10	257261	257270	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
247	NC_012792	CATGC	2	10	258021	258030	20 %	20 %	20 %	40 %	239820228
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249	NC_012792	TCGCG	2	10	258888	258897	0 %	20 %	40 %	40 %	239820229
250	NC_012792	ATGCG	2	10	259268	259277	20 %	20 %	40 %	20 %	239820230
251	NC_012792	CCAGG	2	10	259535	259544	20 %	0 %	40 %	40 %	239820230
252	NC_012792	TCGCG	2	10	260585	260594	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
253	NC_012792	GCAGC	2	10	261032	261041	20 %	0 %	40 %	40 %	239820231
254	NC_012792	CGATC	2	10	261446	261455	20 %	20 %	20 %	40 %	239820231
255	NC_012792	CGGCT	2	10	261594	261603	0 %	20 %	40 %	40 %	239820231
256	NC_012792	CGAGC	2	10	262451	262460	20 %	0 %	40 %	40 %	239820231
257	NC_012792	CCGAC	2	10	262878	262887	20 %	0 %	20 %	60 %	239820232
258	NC_012792	TTATG	2	10	263685	263694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_012792	TTCGG	2	10	265121	265130	0 %	40 %	40 %	20 %	239820233
260	NC_012792	GCTCG	2	10	265603	265612	0 %	20 %	40 %	40 %	239820233
261	NC_012792	GATCG	2	10	266629	266638	20 %	20 %	40 %	20 %	239820233
262	NC_012792	TGGCG	2	10	267556	267565	0 %	20 %	60 %	20 %	239820233
263	NC_012792	ACGGC	2	10	268569	268578	20 %	0 %	40 %	40 %	239820233
264	NC_012792	GCAAG	2	10	271900	271909	40 %	0 %	40 %	20 %	239820234
265	NC_012792	GTGCA	2	10	271928	271937	20 %	20 %	40 %	20 %	239820234
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267	NC_012792	CATCG	2	10	273711	273720	20 %	20 %	20 %	40 %	239820237
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399	NC_012792	GCGCG	2	10	418130	418139	0 %	0 %	60 %	40 %	239820374
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