MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 3168

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	ATCC	2	8	688	695	25 %	25 %	0 %	50 %	239819986
2	NC_012792	TCGT	2	8	718	725	0 %	50 %	25 %	25 %	239819986
3	NC_012792	ACCT	2	8	1352	1359	25 %	25 %	0 %	50 %	239819987
4	NC_012792	GCCG	2	8	1382	1389	0 %	0 %	50 %	50 %	239819987
5	NC_012792	CCTC	2	8	1431	1438	0 %	25 %	0 %	75 %	239819987
6	NC_012792	GGCG	2	8	1903	1910	0 %	0 %	75 %	25 %	239819987
7	NC_012792	TGAA	2	8	1985	1992	50 %	25 %	25 %	0 %	239819988
8	NC_012792	GAAC	2	8	3075	3082	50 %	0 %	25 %	25 %	239819989
9	NC_012792	TGCC	2	8	3117	3124	0 %	25 %	25 %	50 %	239819989
10	NC_012792	GGCC	2	8	3126	3133	0 %	0 %	50 %	50 %	239819989
11	NC_012792	CGAG	2	8	3426	3433	25 %	0 %	50 %	25 %	239819989
12	NC_012792	GACG	2	8	4167	4174	25 %	0 %	50 %	25 %	239819990
13	NC_012792	GGCC	2	8	4341	4348	0 %	0 %	50 %	50 %	239819990
14	NC_012792	TGCC	2	8	4683	4690	0 %	25 %	25 %	50 %	239819991
15	NC_012792	GCTG	2	8	5327	5334	0 %	25 %	50 %	25 %	239819991
16	NC_012792	TGCG	2	8	5820	5827	0 %	25 %	50 %	25 %	239819992
17	NC_012792	GTCG	2	8	7495	7502	0 %	25 %	50 %	25 %	239819994
18	NC_012792	CATC	2	8	8211	8218	25 %	25 %	0 %	50 %	239819994
19	NC_012792	GTCG	2	8	8731	8738	0 %	25 %	50 %	25 %	239819995
20	NC_012792	CGGC	2	8	9159	9166	0 %	0 %	50 %	50 %	239819995
21	NC_012792	CGAC	2	8	9297	9304	25 %	0 %	25 %	50 %	239819995
22	NC_012792	GGCT	2	8	9545	9552	0 %	25 %	50 %	25 %	239819995
23	NC_012792	TCCA	2	8	10851	10858	25 %	25 %	0 %	50 %	239819997
24	NC_012792	CGAC	2	8	12017	12024	25 %	0 %	25 %	50 %	239819997
25	NC_012792	CGAC	2	8	12080	12087	25 %	0 %	25 %	50 %	239819997
26	NC_012792	CCAG	2	8	13589	13596	25 %	0 %	25 %	50 %	239819997
27	NC_012792	GCCC	2	8	13739	13746	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_012792	GCCG	2	8	13915	13922	0 %	0 %	50 %	50 %	239819998
29	NC_012792	GGCC	2	8	13950	13957	0 %	0 %	50 %	50 %	239819998
30	NC_012792	GCCG	2	8	14308	14315	0 %	0 %	50 %	50 %	239819999
31	NC_012792	GCCG	2	8	14502	14509	0 %	0 %	50 %	50 %	239819999
32	NC_012792	GCCC	2	8	15276	15283	0 %	0 %	25 %	75 %	239820000
33	NC_012792	CTTC	2	8	15303	15310	0 %	50 %	0 %	50 %	239820000
34	NC_012792	CTCG	2	8	15480	15487	0 %	25 %	25 %	50 %	239820000
35	NC_012792	GACC	2	8	19771	19778	25 %	0 %	25 %	50 %	239820004
36	NC_012792	CAGC	2	8	19936	19943	25 %	0 %	25 %	50 %	239820004
37	NC_012792	CGGC	2	8	20220	20227	0 %	0 %	50 %	50 %	239820004
38	NC_012792	ATGC	2	8	20622	20629	25 %	25 %	25 %	25 %	239820004
39	NC_012792	CTCG	2	8	20902	20909	0 %	25 %	25 %	50 %	239820004
40	NC_012792	CTGC	2	8	21330	21337	0 %	25 %	25 %	50 %	239820005
41	NC_012792	CTGC	2	8	22117	22124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012792	TTCC	2	8	22234	22241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012792	CATC	2	8	22682	22689	25 %	25 %	0 %	50 %	239820007
44	NC_012792	CAGC	2	8	23033	23040	25 %	0 %	25 %	50 %	239820007
45	NC_012792	GCAG	2	8	23101	23108	25 %	0 %	50 %	25 %	239820007
46	NC_012792	CCCG	2	8	23135	23142	0 %	0 %	25 %	75 %	239820007
47	NC_012792	CGCC	2	8	23585	23592	0 %	0 %	25 %	75 %	239820007
48	NC_012792	AAGT	2	8	23631	23638	50 %	25 %	25 %	0 %	239820007
49	NC_012792	TTGC	2	8	24310	24317	0 %	50 %	25 %	25 %	239820008
50	NC_012792	ATCT	2	8	25400	25407	25 %	50 %	0 %	25 %	239820009
51	NC_012792	CGCC	2	8	25875	25882	0 %	0 %	25 %	75 %	239820010
52	NC_012792	ATCG	2	8	25932	25939	25 %	25 %	25 %	25 %	239820010
53	NC_012792	CGGC	2	8	26162	26169	0 %	0 %	50 %	50 %	239820010
54	NC_012792	ACCA	2	8	26626	26633	50 %	0 %	0 %	50 %	239820011
55	NC_012792	GAGC	2	8	26943	26950	25 %	0 %	50 %	25 %	239820011
56	NC_012792	TTCT	2	8	27238	27245	0 %	75 %	0 %	25 %	239820011
57	NC_012792	TACC	2	8	27824	27831	25 %	25 %	0 %	50 %	239820012
58	NC_012792	GATG	2	8	27844	27851	25 %	25 %	50 %	0 %	239820012
59	NC_012792	CCGG	2	8	28172	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	239820012
60	NC_012792	GCCT	2	8	28686	28693	0 %	25 %	25 %	50 %	239820012
61	NC_012792	CCCG	2	8	28892	28899	0 %	0 %	25 %	75 %	239820012
62	NC_012792	GCCG	2	8	29420	29427	0 %	0 %	50 %	50 %	239820013
63	NC_012792	AGCA	2	8	29478	29485	50 %	0 %	25 %	25 %	239820013
64	NC_012792	AAGG	2	8	29778	29785	50 %	0 %	50 %	0 %	239820013
65	NC_012792	CCTT	2	8	30242	30249	0 %	50 %	0 %	50 %	239820014
66	NC_012792	GGCC	2	8	33208	33215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012792	AGCG	2	8	33342	33349	25 %	0 %	50 %	25 %	239820017
68	NC_012792	CGCT	2	8	33411	33418	0 %	25 %	25 %	50 %	239820017
69	NC_012792	CCCG	2	8	33443	33450	0 %	0 %	25 %	75 %	239820017
70	NC_012792	GAAG	2	8	33452	33459	50 %	0 %	50 %	0 %	239820017
71	NC_012792	GAGC	2	8	33725	33732	25 %	0 %	50 %	25 %	239820017
72	NC_012792	TCGC	2	8	33981	33988	0 %	25 %	25 %	50 %	239820017
73	NC_012792	CCGA	2	8	35595	35602	25 %	0 %	25 %	50 %	239820017
74	NC_012792	CGGG	2	8	36228	36235	0 %	0 %	75 %	25 %	239820018
75	NC_012792	CCGA	2	8	36533	36540	25 %	0 %	25 %	50 %	239820018
76	NC_012792	GCTC	2	8	36978	36985	0 %	25 %	25 %	50 %	239820018
77	NC_012792	GAAG	2	8	37221	37228	50 %	0 %	50 %	0 %	239820018
78	NC_012792	GTGA	2	8	37437	37444	25 %	25 %	50 %	0 %	239820019
79	NC_012792	CGGC	2	8	37762	37769	0 %	0 %	50 %	50 %	239820019
80	NC_012792	GAAG	2	8	38363	38370	50 %	0 %	50 %	0 %	239820019
81	NC_012792	CTGG	2	8	39776	39783	0 %	25 %	50 %	25 %	239820020
82	NC_012792	GCCT	2	8	40433	40440	0 %	25 %	25 %	50 %	239820021
83	NC_012792	CGGC	2	8	40620	40627	0 %	0 %	50 %	50 %	239820021
84	NC_012792	CCGG	2	8	40755	40762	0 %	0 %	50 %	50 %	239820021
85	NC_012792	GGCC	2	8	41249	41256	0 %	0 %	50 %	50 %	239820021
86	NC_012792	ACCA	2	8	42184	42191	50 %	0 %	0 %	50 %	239820022
87	NC_012792	GGGC	2	8	43658	43665	0 %	0 %	75 %	25 %	239820023
88	NC_012792	CGCC	2	8	44845	44852	0 %	0 %	25 %	75 %	239820023
89	NC_012792	CGGC	2	8	45116	45123	0 %	0 %	50 %	50 %	239820024
90	NC_012792	AGGC	2	8	45158	45165	25 %	0 %	50 %	25 %	239820024
91	NC_012792	CGGC	2	8	45671	45678	0 %	0 %	50 %	50 %	239820024
92	NC_012792	AGCA	2	8	46174	46181	50 %	0 %	25 %	25 %	239820025
93	NC_012792	AGCA	2	8	46534	46541	50 %	0 %	25 %	25 %	239820025
94	NC_012792	GAAG	2	8	46761	46768	50 %	0 %	50 %	0 %	239820025
95	NC_012792	CAGG	2	8	46993	47000	25 %	0 %	50 %	25 %	239820026
96	NC_012792	CGGC	2	8	47112	47119	0 %	0 %	50 %	50 %	239820026
97	NC_012792	ACGC	2	8	47581	47588	25 %	0 %	25 %	50 %	239820026
98	NC_012792	GGCC	2	8	48392	48399	0 %	0 %	50 %	50 %	239820027
99	NC_012792	CGGC	2	8	48784	48791	0 %	0 %	50 %	50 %	239820027
100	NC_012792	TGCG	2	8	49369	49376	0 %	25 %	50 %	25 %	239820027
101	NC_012792	CTGC	2	8	50032	50039	0 %	25 %	25 %	50 %	239820028
102	NC_012792	GAGC	2	8	50113	50120	25 %	0 %	50 %	25 %	239820028
103	NC_012792	GCAA	2	8	50330	50337	50 %	0 %	25 %	25 %	239820028
104	NC_012792	CCAG	2	8	50740	50747	25 %	0 %	25 %	50 %	239820028
105	NC_012792	CGTG	2	8	51466	51473	0 %	25 %	50 %	25 %	239820029
106	NC_012792	GCCG	2	8	51632	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	239820029
107	NC_012792	CGAG	2	8	52076	52083	25 %	0 %	50 %	25 %	239820030
108	NC_012792	GTCG	2	8	52260	52267	0 %	25 %	50 %	25 %	239820030
109	NC_012792	CGCC	2	8	52306	52313	0 %	0 %	25 %	75 %	239820030
110	NC_012792	TGGC	2	8	52388	52395	0 %	25 %	50 %	25 %	239820030
111	NC_012792	CGGC	2	8	53687	53694	0 %	0 %	50 %	50 %	239820032
112	NC_012792	CGGC	2	8	53702	53709	0 %	0 %	50 %	50 %	239820032
113	NC_012792	GGAA	2	8	54865	54872	50 %	0 %	50 %	0 %	239820033
114	NC_012792	ACGT	2	8	55194	55201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012792	CTGC	2	8	55566	55573	0 %	25 %	25 %	50 %	239820034
116	NC_012792	GGTG	2	8	55739	55746	0 %	25 %	75 %	0 %	239820034
117	NC_012792	GCCG	2	8	55763	55770	0 %	0 %	50 %	50 %	239820034
118	NC_012792	GCCC	2	8	56470	56477	0 %	0 %	25 %	75 %	239820035
119	NC_012792	GCCG	2	8	56606	56613	0 %	0 %	50 %	50 %	239820035
120	NC_012792	CGAC	2	8	56686	56693	25 %	0 %	25 %	50 %	239820035
121	NC_012792	AGGC	2	8	56973	56980	25 %	0 %	50 %	25 %	239820035
122	NC_012792	CCGG	2	8	57130	57137	0 %	0 %	50 %	50 %	239820035
123	NC_012792	CGGC	3	12	57505	57516	0 %	0 %	50 %	50 %	239820035
124	NC_012792	GCGA	2	8	57524	57531	25 %	0 %	50 %	25 %	239820035
125	NC_012792	CGAA	2	8	57677	57684	50 %	0 %	25 %	25 %	239820036
126	NC_012792	ATCC	2	8	57685	57692	25 %	25 %	0 %	50 %	239820036
127	NC_012792	GCGG	2	8	57856	57863	0 %	0 %	75 %	25 %	239820036
128	NC_012792	CGCA	2	8	57970	57977	25 %	0 %	25 %	50 %	239820036
129	NC_012792	GCAG	2	8	58178	58185	25 %	0 %	50 %	25 %	239820036
130	NC_012792	GACT	2	8	58237	58244	25 %	25 %	25 %	25 %	239820036
131	NC_012792	AACG	2	8	58351	58358	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012792	AACG	2	8	58384	58391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012792	GCCG	2	8	58547	58554	0 %	0 %	50 %	50 %	239820037
134	NC_012792	CGGC	2	8	58843	58850	0 %	0 %	50 %	50 %	239820037
135	NC_012792	GATG	2	8	59997	60004	25 %	25 %	50 %	0 %	239820038
136	NC_012792	CGCC	2	8	60415	60422	0 %	0 %	25 %	75 %	239820039
137	NC_012792	CGTT	2	8	60634	60641	0 %	50 %	25 %	25 %	239820039
138	NC_012792	GCCG	2	8	61232	61239	0 %	0 %	50 %	50 %	239820039
139	NC_012792	GGCC	2	8	61825	61832	0 %	0 %	50 %	50 %	239820039
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141	NC_012792	CCCA	2	8	62767	62774	25 %	0 %	0 %	75 %	239820040
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