MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 20566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	GCC	3	9	6	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
2	NC_012792	CGC	2	6	15	20	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
3	NC_012792	GCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819986
4	NC_012792	GCC	2	6	55	60	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
5	NC_012792	GCG	2	6	96	101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819986
6	NC_012792	CCA	2	6	119	124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819986
7	NC_012792	GCA	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
8	NC_012792	CCA	2	6	327	332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819986
9	NC_012792	GTC	2	6	481	486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819986
10	NC_012792	GCC	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
11	NC_012792	GCG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819986
12	NC_012792	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819986
13	NC_012792	CGC	2	6	633	638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
14	NC_012792	GAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819986
15	NC_012792	AGC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
16	NC_012792	AGC	2	6	841	846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
17	NC_012792	CGC	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819986
18	NC_012792	CAG	2	6	861	866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819986
19	NC_012792	CTT	2	6	936	941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012792	CGA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
21	NC_012792	TGG	2	6	1074	1079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819987
22	NC_012792	GGT	2	6	1081	1086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819987
23	NC_012792	CGG	2	6	1137	1142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819987
24	NC_012792	AAG	2	6	1157	1162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819987
25	NC_012792	TGC	3	9	1188	1196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
26	NC_012792	GCT	2	6	1237	1242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
27	NC_012792	GAC	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
28	NC_012792	TGC	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819987
29	NC_012792	GCA	2	6	1599	1604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
30	NC_012792	GCC	2	6	1634	1639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819987
31	NC_012792	GGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819987
32	NC_012792	GCA	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819987
33	NC_012792	CCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819988
34	NC_012792	GCG	2	6	2002	2007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
35	NC_012792	GAT	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819988
36	NC_012792	TGG	2	6	2064	2069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819988
37	NC_012792	CGA	2	6	2107	2112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819988
38	NC_012792	CGG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
39	NC_012792	GTC	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819988
40	NC_012792	GCG	2	6	2299	2304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819988
41	NC_012792	GTG	3	9	2364	2372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819988
42	NC_012792	TGA	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819988
43	NC_012792	GAG	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239819989
44	NC_012792	GCT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
45	NC_012792	TGA	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819989
46	NC_012792	AGC	3	9	2783	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
47	NC_012792	CGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
48	NC_012792	GCC	3	9	2863	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
49	NC_012792	TCG	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
50	NC_012792	CGA	2	6	2943	2948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
51	NC_012792	CCG	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
52	NC_012792	CGG	2	6	3025	3030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
53	NC_012792	TTG	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819989
54	NC_012792	CGG	2	6	3193	3198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
55	NC_012792	TTC	2	6	3208	3213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819989
56	NC_012792	GCC	2	6	3295	3300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
57	NC_012792	CGT	2	6	3372	3377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
58	NC_012792	TGG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
59	NC_012792	GCC	2	6	3511	3516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819989
60	NC_012792	GAA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819989
61	NC_012792	CGT	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819989
62	NC_012792	GTG	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
63	NC_012792	CGG	2	6	3587	3592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
64	NC_012792	GCA	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819989
65	NC_012792	TGT	2	6	3636	3641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819989
66	NC_012792	GGC	2	6	3742	3747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819989
67	NC_012792	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819989
68	NC_012792	TGG	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012792	TAA	2	6	3834	3839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012792	CCA	2	6	3896	3901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819990
71	NC_012792	GCA	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819990
72	NC_012792	CAC	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819990
73	NC_012792	GGT	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819990
74	NC_012792	CTG	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819990
75	NC_012792	GCG	2	6	4214	4219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819990
76	NC_012792	AGG	2	6	4440	4445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012792	ACG	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
78	NC_012792	CAG	2	6	4939	4944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
79	NC_012792	CGA	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
80	NC_012792	TCG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819991
81	NC_012792	CGC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819991
82	NC_012792	CGA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
83	NC_012792	CAC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239819991
84	NC_012792	CGG	2	6	5116	5121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819991
85	NC_012792	CCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819991
86	NC_012792	TCG	2	6	5165	5170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819991
87	NC_012792	TGG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819991
88	NC_012792	CAG	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819991
89	NC_012792	GCG	3	9	5415	5423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819992
90	NC_012792	GCC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
91	NC_012792	CGG	2	6	5529	5534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819992
92	NC_012792	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819992
93	NC_012792	GCC	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
94	NC_012792	GAA	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239819992
95	NC_012792	GCC	2	6	5728	5733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
96	NC_012792	GCC	2	6	5864	5869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
97	NC_012792	CTT	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819992
98	NC_012792	CGT	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819992
99	NC_012792	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
100	NC_012792	GAC	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819992
101	NC_012792	TCT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819992
102	NC_012792	GTC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819992
103	NC_012792	GAT	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819992
104	NC_012792	TGG	2	6	6177	6182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819992
105	NC_012792	GCT	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819992
106	NC_012792	TCG	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819992
107	NC_012792	CCG	2	6	6393	6398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819992
108	NC_012792	GTT	2	6	6489	6494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819993
109	NC_012792	GCC	2	6	6633	6638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819993
110	NC_012792	TGA	2	6	6656	6661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819993
111	NC_012792	GGC	2	6	6719	6724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819993
112	NC_012792	GCT	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
113	NC_012792	CGT	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
114	NC_012792	CGT	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
115	NC_012792	TCA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239819993
116	NC_012792	CGC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819993
117	NC_012792	CGA	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819993
118	NC_012792	CGC	2	6	6971	6976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819993
119	NC_012792	GTC	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
120	NC_012792	CAG	2	6	7122	7127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819993
121	NC_012792	GTC	2	6	7146	7151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
122	NC_012792	GGC	2	6	7287	7292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819993
123	NC_012792	TCG	2	6	7327	7332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819993
124	NC_012792	TCT	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819994
125	NC_012792	GGT	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239819994
126	NC_012792	TGT	2	6	7677	7682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239819994
127	NC_012792	GAT	2	6	7711	7716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819994
128	NC_012792	AGC	2	6	7808	7813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819994
129	NC_012792	CGG	2	6	7896	7901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819994
130	NC_012792	GCG	2	6	7920	7925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819994
131	NC_012792	GTA	2	6	7930	7935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239819994
132	NC_012792	ATC	3	9	8189	8197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239819994
133	NC_012792	CGT	2	6	8232	8237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239819994
134	NC_012792	GGC	2	6	8250	8255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819994
135	NC_012792	TTC	2	6	8329	8334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819994
136	NC_012792	GCG	2	6	8395	8400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012792	CAA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012792	CGA	2	6	8650	8655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239819995
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153	NC_012792	TTC	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239819995
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157	NC_012792	GCG	2	6	9783	9788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239819995
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161	NC_012792	CGC	3	9	10083	10091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239819996
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168	NC_012792	CGC	2	6	10510	10515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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