MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 5073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012791	AAGAG	2	10	1487	1496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012791	GAGCT	2	10	3464	3473	20 %	20 %	40 %	20 %	239813022
3	NC_012791	GTGCT	2	10	3713	3722	0 %	40 %	40 %	20 %	239813022
4	NC_012791	CCGCG	2	10	5315	5324	0 %	0 %	40 %	60 %	239813022
5	NC_012791	CCCGG	2	10	7865	7874	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_012791	ACGCC	2	10	11769	11778	20 %	0 %	20 %	60 %	239813030
7	NC_012791	GGCCA	2	10	14512	14521	20 %	0 %	40 %	40 %	239813033
8	NC_012791	GCGCT	2	10	15094	15103	0 %	20 %	40 %	40 %	239813034
9	NC_012791	GGTGC	2	10	15279	15288	0 %	20 %	60 %	20 %	239813034
10	NC_012791	CACGG	2	10	15728	15737	20 %	0 %	40 %	40 %	239813035
11	NC_012791	CCCGC	2	10	15943	15952	0 %	0 %	20 %	80 %	239813035
12	NC_012791	CGGTG	2	10	18537	18546	0 %	20 %	60 %	20 %	239813038
13	NC_012791	CCAGC	2	10	21041	21050	20 %	0 %	20 %	60 %	239813040
14	NC_012791	TCGGC	2	10	22141	22150	0 %	20 %	40 %	40 %	239813041
15	NC_012791	GCGCA	2	10	24527	24536	20 %	0 %	40 %	40 %	239813042
16	NC_012791	CGCGG	2	10	24854	24863	0 %	0 %	60 %	40 %	239813042
17	NC_012791	CGCGG	2	10	25183	25192	0 %	0 %	60 %	40 %	239813043
18	NC_012791	CGCGG	2	10	26366	26375	0 %	0 %	60 %	40 %	239813043
19	NC_012791	GCCGC	2	10	28831	28840	0 %	0 %	40 %	60 %	239813045
20	NC_012791	TGCGC	2	10	28991	29000	0 %	20 %	40 %	40 %	239813045
21	NC_012791	GCGCC	2	10	29989	29998	0 %	0 %	40 %	60 %	239813046
22	NC_012791	TGCGC	2	10	30056	30065	0 %	20 %	40 %	40 %	239813046
23	NC_012791	ATGAA	2	10	32600	32609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012791	GCGCC	2	10	32920	32929	0 %	0 %	40 %	60 %	239813050
25	NC_012791	GGCGT	2	10	35771	35780	0 %	20 %	60 %	20 %	239813052
26	NC_012791	GCCGT	2	10	35834	35843	0 %	20 %	40 %	40 %	239813052
27	NC_012791	CGCAT	2	10	36137	36146	20 %	20 %	20 %	40 %	239813052
28	NC_012791	TCGCC	2	10	36234	36243	0 %	20 %	20 %	60 %	239813052
29	NC_012791	CTGCG	2	10	36490	36499	0 %	20 %	40 %	40 %	239813052
30	NC_012791	GATCG	2	10	36607	36616	20 %	20 %	40 %	20 %	239813052
31	NC_012791	TGGCA	2	10	39344	39353	20 %	20 %	40 %	20 %	239813056
32	NC_012791	AGCGC	2	10	39985	39994	20 %	0 %	40 %	40 %	239813056
33	NC_012791	GCCGC	2	10	40446	40455	0 %	0 %	40 %	60 %	239813057
34	NC_012791	GGCGC	2	10	40552	40561	0 %	0 %	60 %	40 %	239813057
35	NC_012791	AGGCC	2	10	41008	41017	20 %	0 %	40 %	40 %	239813058
36	NC_012791	CAGGC	2	10	42213	42222	20 %	0 %	40 %	40 %	239813059
37	NC_012791	TCGCC	2	10	42676	42685	0 %	20 %	20 %	60 %	239813059
38	NC_012791	CGCGG	2	10	44034	44043	0 %	0 %	60 %	40 %	239813060
39	NC_012791	AAGGC	2	10	45205	45214	40 %	0 %	40 %	20 %	239813061
40	NC_012791	GCGCA	2	10	45945	45954	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012791	GGGCC	2	10	46690	46699	0 %	0 %	60 %	40 %	239813064
42	NC_012791	GCCGC	2	10	47206	47215	0 %	0 %	40 %	60 %	239813064
43	NC_012791	GCCGG	2	10	48633	48642	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012791	GCGCG	2	10	52152	52161	0 %	0 %	60 %	40 %	239813070
45	NC_012791	GCAAG	2	10	52542	52551	40 %	0 %	40 %	20 %	239813070
46	NC_012791	AAGGC	2	10	52736	52745	40 %	0 %	40 %	20 %	239813070
47	NC_012791	ATGGC	2	10	54596	54605	20 %	20 %	40 %	20 %	239813072
48	NC_012791	ACGCG	2	10	55679	55688	20 %	0 %	40 %	40 %	239813074
49	NC_012791	GCCGC	2	10	58642	58651	0 %	0 %	40 %	60 %	239813080
50	NC_012791	GCAGG	2	10	58981	58990	20 %	0 %	60 %	20 %	239813080
51	NC_012791	TGCGC	2	10	60411	60420	0 %	20 %	40 %	40 %	239813082
52	NC_012791	TGCGC	2	10	60965	60974	0 %	20 %	40 %	40 %	239813083
53	NC_012791	AGCGA	2	10	61116	61125	40 %	0 %	40 %	20 %	239813083
54	NC_012791	GATCG	2	10	62608	62617	20 %	20 %	40 %	20 %	239813086
55	NC_012791	GCGCG	2	10	63013	63022	0 %	0 %	60 %	40 %	239813086
56	NC_012791	GCGGA	2	10	65024	65033	20 %	0 %	60 %	20 %	239813088
57	NC_012791	CGGCG	2	10	66575	66584	0 %	0 %	60 %	40 %	239813089
58	NC_012791	AGGGC	2	10	67996	68005	20 %	0 %	60 %	20 %	239813090
59	NC_012791	GCGCG	2	10	70533	70542	0 %	0 %	60 %	40 %	239813093
60	NC_012791	TTTCA	2	10	71579	71588	20 %	60 %	0 %	20 %	239813094
61	NC_012791	CGGCG	2	10	71744	71753	0 %	0 %	60 %	40 %	239813094
62	NC_012791	GCCGC	2	10	72786	72795	0 %	0 %	40 %	60 %	239813095
63	NC_012791	TCGCC	2	10	73898	73907	0 %	20 %	20 %	60 %	239813095
64	NC_012791	CGAAT	3	15	74169	74183	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012791	CGCGG	2	10	74184	74193	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_012791	CTGGC	2	10	74334	74343	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012791	TGCCG	2	10	74371	74380	0 %	20 %	40 %	40 %	239813096
68	NC_012791	AGCGC	2	10	75748	75757	20 %	0 %	40 %	40 %	239813096
69	NC_012791	CGGCG	2	10	75949	75958	0 %	0 %	60 %	40 %	239813096
70	NC_012791	CACTT	2	10	77488	77497	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012791	GCGCG	2	10	78422	78431	0 %	0 %	60 %	40 %	239813099
72	NC_012791	GGCCC	2	10	80000	80009	0 %	0 %	40 %	60 %	239813100
73	NC_012791	GCCGG	2	10	81099	81108	0 %	0 %	60 %	40 %	239813101
74	NC_012791	TGGCG	2	10	81258	81267	0 %	20 %	60 %	20 %	239813101
75	NC_012791	GGGAG	2	10	82925	82934	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012791	GCCAC	2	10	83017	83026	20 %	0 %	20 %	60 %	239813104
77	NC_012791	GCGCC	2	10	83365	83374	0 %	0 %	40 %	60 %	239813104
78	NC_012791	CGCGC	2	10	83897	83906	0 %	0 %	40 %	60 %	239813104
79	NC_012791	CGAAG	2	10	84358	84367	40 %	0 %	40 %	20 %	239813105
80	NC_012791	GGCGA	2	10	87805	87814	20 %	0 %	60 %	20 %	239813108
81	NC_012791	CGGCG	2	10	88161	88170	0 %	0 %	60 %	40 %	239813108
82	NC_012791	GCGCG	2	10	91330	91339	0 %	0 %	60 %	40 %	239813111
83	NC_012791	GCCGC	2	10	91713	91722	0 %	0 %	40 %	60 %	239813111
84	NC_012791	CTGAA	2	10	91828	91837	40 %	20 %	20 %	20 %	239813111
85	NC_012791	GCCGC	2	10	93296	93305	0 %	0 %	40 %	60 %	239813112
86	NC_012791	CCGCG	2	10	93316	93325	0 %	0 %	40 %	60 %	239813112
87	NC_012791	CAGCT	2	10	95475	95484	20 %	20 %	20 %	40 %	239813114
88	NC_012791	CTTGC	2	10	96423	96432	0 %	40 %	20 %	40 %	239813114
89	NC_012791	GGCGC	2	10	96846	96855	0 %	0 %	60 %	40 %	239813115
90	NC_012791	CGATG	2	10	98934	98943	20 %	20 %	40 %	20 %	239813118
91	NC_012791	CTTTT	2	10	99340	99349	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_012791	GCGCG	2	10	99519	99528	0 %	0 %	60 %	40 %	239813119
93	NC_012791	GCGCA	2	10	100399	100408	20 %	0 %	40 %	40 %	239813119
94	NC_012791	TGGCC	2	10	101695	101704	0 %	20 %	40 %	40 %	239813121
95	NC_012791	CCAGC	2	10	102433	102442	20 %	0 %	20 %	60 %	239813122
96	NC_012791	CGAGC	2	10	102829	102838	20 %	0 %	40 %	40 %	239813122
97	NC_012791	GCGCC	2	10	102963	102972	0 %	0 %	40 %	60 %	239813122
98	NC_012791	GCGCG	2	10	103547	103556	0 %	0 %	60 %	40 %	239813123
99	NC_012791	CGAAG	2	10	103864	103873	40 %	0 %	40 %	20 %	239813123
100	NC_012791	GCGCG	2	10	104888	104897	0 %	0 %	60 %	40 %	239813125
101	NC_012791	TGGCG	2	10	105470	105479	0 %	20 %	60 %	20 %	239813125
102	NC_012791	CGGGC	2	10	105485	105494	0 %	0 %	60 %	40 %	239813125
103	NC_012791	GGCCT	2	10	106632	106641	0 %	20 %	40 %	40 %	239813126
104	NC_012791	CCCAT	2	10	107094	107103	20 %	20 %	0 %	60 %	239813126
105	NC_012791	CGGCT	2	10	108354	108363	0 %	20 %	40 %	40 %	239813127
106	NC_012791	GCCGC	2	10	108636	108645	0 %	0 %	40 %	60 %	239813127
107	NC_012791	CGCGC	2	10	109127	109136	0 %	0 %	40 %	60 %	239813127
108	NC_012791	AGCGC	2	10	109165	109174	20 %	0 %	40 %	40 %	239813127
109	NC_012791	GCGCG	2	10	111015	111024	0 %	0 %	60 %	40 %	239813129
110	NC_012791	CGCGC	2	10	111285	111294	0 %	0 %	40 %	60 %	239813129
111	NC_012791	GCCAG	2	10	111803	111812	20 %	0 %	40 %	40 %	239813130
112	NC_012791	GCCGC	2	10	112122	112131	0 %	0 %	40 %	60 %	239813130
113	NC_012791	GATCG	2	10	112969	112978	20 %	20 %	40 %	20 %	239813131
114	NC_012791	CGCGG	2	10	114643	114652	0 %	0 %	60 %	40 %	239813132
115	NC_012791	CCGCG	2	10	114823	114832	0 %	0 %	40 %	60 %	239813133
116	NC_012791	GCGCT	2	10	117469	117478	0 %	20 %	40 %	40 %	239813136
117	NC_012791	GCCGC	2	10	118168	118177	0 %	0 %	40 %	60 %	239813136
118	NC_012791	GCGCG	2	10	118289	118298	0 %	0 %	60 %	40 %	239813136
119	NC_012791	CGCCA	2	10	121470	121479	20 %	0 %	20 %	60 %	239813140
120	NC_012791	GCGCG	2	10	123247	123256	0 %	0 %	60 %	40 %	239813142
121	NC_012791	CGCGG	2	10	124739	124748	0 %	0 %	60 %	40 %	239813143
122	NC_012791	CGCGC	2	10	126878	126887	0 %	0 %	40 %	60 %	239813146
123	NC_012791	CGGCG	2	10	126982	126991	0 %	0 %	60 %	40 %	239813146
124	NC_012791	CGCGC	2	10	128153	128162	0 %	0 %	40 %	60 %	239813147
125	NC_012791	GCGCC	2	10	128668	128677	0 %	0 %	40 %	60 %	239813147
126	NC_012791	AGGGC	2	10	129396	129405	20 %	0 %	60 %	20 %	239813148
127	NC_012791	GGTCG	2	10	129711	129720	0 %	20 %	60 %	20 %	239813149
128	NC_012791	TGGCC	2	10	130259	130268	0 %	20 %	40 %	40 %	239813149
129	NC_012791	GGCCG	2	10	131171	131180	0 %	0 %	60 %	40 %	239813150
130	NC_012791	CACTG	2	10	132145	132154	20 %	20 %	20 %	40 %	239813151
131	NC_012791	GCCGC	2	10	132766	132775	0 %	0 %	40 %	60 %	239813151
132	NC_012791	GCCGC	2	10	132806	132815	0 %	0 %	40 %	60 %	239813151
133	NC_012791	CGGCG	2	10	133815	133824	0 %	0 %	60 %	40 %	239813153
134	NC_012791	GCGTG	2	10	135934	135943	0 %	20 %	60 %	20 %	239813155
135	NC_012791	GCGCA	2	10	137084	137093	20 %	0 %	40 %	40 %	239813156
136	NC_012791	CATCG	2	10	137638	137647	20 %	20 %	20 %	40 %	239813157
137	NC_012791	GCGCG	2	10	138349	138358	0 %	0 %	60 %	40 %	239813158
138	NC_012791	CGCCC	2	10	139227	139236	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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