MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012791	AC	3	6	137518	137523	50 %	0 %	0 %	50 %	239813157
4002	NC_012791	GTG	2	6	137585	137590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813157
4003	NC_012791	GCC	2	6	137623	137628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813157
4004	NC_012791	CATCG	2	10	137638	137647	20 %	20 %	20 %	40 %	239813157
4005	NC_012791	AGC	2	6	137651	137656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4006	NC_012791	CCG	2	6	137703	137708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813157
4007	NC_012791	CCCAGC	2	12	137720	137731	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	239813157
4008	NC_012791	CGGC	2	8	137754	137761	0 %	0 %	50 %	50 %	239813157
4009	NC_012791	GCA	3	9	137772	137780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4010	NC_012791	TGC	2	6	137837	137842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4011	NC_012791	AAC	2	6	137876	137881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813157
4012	NC_012791	AGC	2	6	137891	137896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4013	NC_012791	CAG	2	6	137959	137964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4014	NC_012791	GCG	2	6	138003	138008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813157
4015	NC_012791	GGT	2	6	138022	138027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813157
4016	NC_012791	TGA	2	6	138030	138035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813157
4017	NC_012791	CTG	2	6	138040	138045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4018	NC_012791	GCA	2	6	138061	138066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813157
4019	NC_012791	AGG	2	6	138074	138079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813157
4020	NC_012791	TCG	2	6	138121	138126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_012791	GTT	4	12	138128	138139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_012791	CCGG	2	8	138146	138153	0 %	0 %	50 %	50 %	239813158
4023	NC_012791	CGG	2	6	138164	138169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813158
4024	NC_012791	GGTC	2	8	138193	138200	0 %	25 %	50 %	25 %	239813158
4025	NC_012791	CG	5	10	138224	138233	0 %	0 %	50 %	50 %	239813158
4026	NC_012791	ATC	2	6	138303	138308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813158
4027	NC_012791	GCGCG	2	10	138349	138358	0 %	0 %	60 %	40 %	239813158
4028	NC_012791	CAG	2	6	138423	138428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813158
4029	NC_012791	GCG	2	6	138464	138469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813158
4030	NC_012791	CTC	2	6	138470	138475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813158
4031	NC_012791	CGG	2	6	138520	138525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813158
4032	NC_012791	GAA	2	6	138533	138538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813158
4033	NC_012791	TCG	2	6	138543	138548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813158
4034	NC_012791	CGGC	2	8	138571	138578	0 %	0 %	50 %	50 %	239813158
4035	NC_012791	GCC	2	6	138585	138590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813158
4036	NC_012791	CAG	3	9	138605	138613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813158
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4038	NC_012791	CAG	2	6	138682	138687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813159
4039	NC_012791	TCG	2	6	138752	138757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813159
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4041	NC_012791	TGG	2	6	138864	138869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813159
4042	NC_012791	GGC	2	6	138898	138903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813159
4043	NC_012791	CG	4	8	138958	138965	0 %	0 %	50 %	50 %	239813159
4044	NC_012791	GCG	3	9	138984	138992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813159
4045	NC_012791	GC	3	6	139035	139040	0 %	0 %	50 %	50 %	239813159
4046	NC_012791	GC	3	6	139051	139056	0 %	0 %	50 %	50 %	239813159
4047	NC_012791	CGG	2	6	139136	139141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813159
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4050	NC_012791	GGA	2	6	139177	139182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012791	GC	3	6	139203	139208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_012791	CGCCC	2	10	139227	139236	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
4053	NC_012791	GAA	2	6	139265	139270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813160
4054	NC_012791	CGC	2	6	139289	139294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813160
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4057	NC_012791	CG	4	8	139341	139348	0 %	0 %	50 %	50 %	239813160
4058	NC_012791	GGT	2	6	139391	139396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813160
4059	NC_012791	TGC	2	6	139402	139407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813160
4060	NC_012791	TGG	2	6	139414	139419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813160
4061	NC_012791	CCA	2	6	139423	139428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813160
4062	NC_012791	CG	4	8	139478	139485	0 %	0 %	50 %	50 %	239813160
4063	NC_012791	GC	3	6	139538	139543	0 %	0 %	50 %	50 %	239813160
4064	NC_012791	GCC	2	6	139550	139555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813160
4065	NC_012791	CCAG	2	8	139564	139571	25 %	0 %	25 %	50 %	239813160
4066	NC_012791	GCC	2	6	139577	139582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813160
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4070	NC_012791	TTC	2	6	139659	139664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813160
4071	NC_012791	CCTT	2	8	139677	139684	0 %	50 %	0 %	50 %	239813160
4072	NC_012791	GCG	2	6	139718	139723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813160
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4075	NC_012791	GAG	2	6	139785	139790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813160
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4080	NC_012791	CAC	2	6	139877	139882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813160
4081	NC_012791	GCCACG	2	12	139908	139919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813160
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4091	NC_012791	TGA	2	6	140191	140196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813160
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4094	NC_012791	AGCC	2	8	140268	140275	25 %	0 %	25 %	50 %	239813160
4095	NC_012791	AGCGTG	2	12	140319	140330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239813160
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4102	NC_012791	T	7	7	140504	140510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_012791	GCCC	2	8	140539	140546	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4104	NC_012791	GCC	2	6	140612	140617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813161
4105	NC_012791	TGGC	2	8	140630	140637	0 %	25 %	50 %	25 %	239813161
4106	NC_012791	GCC	3	9	140653	140661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813161
4107	NC_012791	CG	3	6	140669	140674	0 %	0 %	50 %	50 %	239813161
4108	NC_012791	GGCCAT	2	12	140677	140688	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813161
4109	NC_012791	GC	4	8	140731	140738	0 %	0 %	50 %	50 %	239813161
4110	NC_012791	GCT	2	6	140770	140775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813161
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4112	NC_012791	CG	3	6	140800	140805	0 %	0 %	50 %	50 %	239813161
4113	NC_012791	TAC	2	6	140849	140854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813161
4114	NC_012791	ACG	3	9	140865	140873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813161
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4118	NC_012791	CTG	2	6	140933	140938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813161
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4123	NC_012791	CAA	2	6	141106	141111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813161
4124	NC_012791	GCT	2	6	141112	141117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813161
4125	NC_012791	ACA	2	6	141126	141131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813161
4126	NC_012791	GGC	2	6	141146	141151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813161
4127	NC_012791	CGG	2	6	141186	141191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813161
4128	NC_012791	GGT	2	6	141229	141234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813161
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4143	NC_012791	CGA	2	6	141685	141690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813161
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4149	NC_012791	GCT	3	9	142114	142122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813161
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4152	NC_012791	CG	3	6	142162	142167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4153	NC_012791	CAG	2	6	142184	142189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813162
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4245	NC_012791	GCG	2	6	145586	145591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813166
4246	NC_012791	GCC	2	6	145592	145597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813166
4247	NC_012791	GTC	2	6	145631	145636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813166
4248	NC_012791	CGT	2	6	145642	145647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813166
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4273	NC_012791	CTT	2	6	146693	146698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813166
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4276	NC_012791	CGC	2	6	146923	146928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4277	NC_012791	CTG	2	6	146931	146936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4278	NC_012791	GATG	2	8	147045	147052	25 %	25 %	50 %	0 %	239813167
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4282	NC_012791	CGAT	2	8	147110	147117	25 %	25 %	25 %	25 %	239813167
4283	NC_012791	CGG	3	9	147137	147145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813167
4284	NC_012791	CGG	2	6	147226	147231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4285	NC_012791	TGC	2	6	147272	147277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813168
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4367	NC_012791	ACC	2	6	149944	149949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813169
4368	NC_012791	CGC	3	9	149962	149970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813169
4369	NC_012791	GC	3	6	149976	149981	0 %	0 %	50 %	50 %	239813169
4370	NC_012791	AGC	2	6	149983	149988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813169
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4372	NC_012791	TCG	2	6	150013	150018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813169
4373	NC_012791	GGA	2	6	150113	150118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813169
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4376	NC_012791	GGC	2	6	150275	150280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813169
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4378	NC_012791	CCGGCA	2	12	150325	150336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813169
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4380	NC_012791	ATC	2	6	150384	150389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813169
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4383	NC_012791	TGC	3	9	150481	150489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813169
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4394	NC_012791	CAG	2	6	150937	150942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4395	NC_012791	GCG	2	6	150959	150964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4396	NC_012791	AAGA	2	8	150971	150978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4397	NC_012791	CCG	2	6	150986	150991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4398	NC_012791	CGG	2	6	150992	150997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4399	NC_012791	GAG	2	6	151002	151007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_012791	GC	3	6	151100	151105	0 %	0 %	50 %	50 %	239813170
4401	NC_012791	GGA	3	9	151120	151128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813170
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4433	NC_012791	CGA	2	6	152400	152405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813170
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4439	NC_012791	CGC	2	6	152558	152563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813170
4440	NC_012791	AC	3	6	152721	152726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4441	NC_012791	GATG	2	8	152776	152783	25 %	25 %	50 %	0 %	239813171
4442	NC_012791	GCG	2	6	152824	152829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813171
4443	NC_012791	CGGCG	2	10	152861	152870	0 %	0 %	60 %	40 %	239813171
4444	NC_012791	CCG	3	9	152871	152879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813171
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4454	NC_012791	TCG	2	6	153277	153282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813171
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4478	NC_012791	CG	3	6	154114	154119	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
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4482	NC_012791	GC	3	6	154225	154230	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4483	NC_012791	CGA	2	6	154237	154242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4484	NC_012791	TTCGC	2	10	154265	154274	0 %	40 %	20 %	40 %	239813172
4485	NC_012791	CG	4	8	154285	154292	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4486	NC_012791	GC	3	6	154341	154346	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4487	NC_012791	GCA	2	6	154365	154370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4488	NC_012791	CGC	2	6	154371	154376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
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4490	NC_012791	GCT	2	6	154512	154517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4491	NC_012791	TGG	2	6	154530	154535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813172
4492	NC_012791	AGC	2	6	154538	154543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
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4494	NC_012791	AGG	2	6	154637	154642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813172
4495	NC_012791	CGG	2	6	154649	154654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813172
4496	NC_012791	AGC	2	6	154679	154684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
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