MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012791	GGCC	2	8	52494	52501	0 %	0 %	50 %	50 %	239813070
1502	NC_012791	CGG	3	9	52509	52517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813070
1503	NC_012791	CGG	2	6	52521	52526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813070
1504	NC_012791	GCAAG	2	10	52542	52551	40 %	0 %	40 %	20 %	239813070
1505	NC_012791	GCG	3	9	52643	52651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813070
1506	NC_012791	GGC	2	6	52669	52674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813070
1507	NC_012791	GCCG	2	8	52698	52705	0 %	0 %	50 %	50 %	239813070
1508	NC_012791	AGC	2	6	52706	52711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813070
1509	NC_012791	CGC	3	9	52723	52731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813070
1510	NC_012791	AAGGC	2	10	52736	52745	40 %	0 %	40 %	20 %	239813070
1511	NC_012791	A	6	6	52760	52765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_012791	GCC	2	6	52783	52788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_012791	ATG	2	6	52848	52853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813071
1514	NC_012791	TTC	2	6	52854	52859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813071
1515	NC_012791	GC	4	8	52867	52874	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1516	NC_012791	CAT	2	6	52886	52891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813071
1517	NC_012791	GCAG	2	8	53143	53150	25 %	0 %	50 %	25 %	239813071
1518	NC_012791	GTCG	2	8	53180	53187	0 %	25 %	50 %	25 %	239813071
1519	NC_012791	CG	3	6	53241	53246	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1520	NC_012791	GCC	2	6	53297	53302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813071
1521	NC_012791	GCCG	2	8	53348	53355	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1522	NC_012791	CAG	2	6	53375	53380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1523	NC_012791	CG	3	6	53455	53460	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1524	NC_012791	TGG	2	6	53491	53496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813071
1525	NC_012791	CCA	2	6	53611	53616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813071
1526	NC_012791	GCCG	2	8	53636	53643	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1527	NC_012791	CTT	2	6	53648	53653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813071
1528	NC_012791	CG	4	8	53654	53661	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1529	NC_012791	CGC	2	6	53680	53685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813071
1530	NC_012791	CG	4	8	53756	53763	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1531	NC_012791	GCC	2	6	53774	53779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813071
1532	NC_012791	GCT	2	6	53845	53850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1533	NC_012791	CACGGT	2	12	53870	53881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1534	NC_012791	GTC	2	6	53885	53890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1535	NC_012791	GCC	2	6	53939	53944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813071
1536	NC_012791	CAG	2	6	53954	53959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1537	NC_012791	CGA	2	6	53972	53977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1538	NC_012791	G	6	6	54074	54079	0 %	0 %	100 %	0 %	239813071
1539	NC_012791	TCG	2	6	54099	54104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1540	NC_012791	TGC	2	6	54145	54150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1541	NC_012791	GC	3	6	54155	54160	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
1542	NC_012791	GCA	2	6	54211	54216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813071
1543	NC_012791	G	6	6	54267	54272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_012791	GC	3	6	54300	54305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_012791	GCC	2	6	54423	54428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813072
1546	NC_012791	AGC	2	6	54470	54475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813072
1547	NC_012791	CGC	2	6	54523	54528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813072
1548	NC_012791	GAA	2	6	54535	54540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813072
1549	NC_012791	TCGA	2	8	54559	54566	25 %	25 %	25 %	25 %	239813072
1550	NC_012791	ATGGC	2	10	54596	54605	20 %	20 %	40 %	20 %	239813072
1551	NC_012791	GACG	2	8	54675	54682	25 %	0 %	50 %	25 %	239813072
1552	NC_012791	GC	3	6	54691	54696	0 %	0 %	50 %	50 %	239813072
1553	NC_012791	CGG	2	6	54698	54703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813072
1554	NC_012791	CAG	2	6	54766	54771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813072
1555	NC_012791	TGGC	2	8	54790	54797	0 %	25 %	50 %	25 %	239813072
1556	NC_012791	GGCCGC	2	12	54819	54830	0 %	0 %	50 %	50 %	239813072
1557	NC_012791	CAT	2	6	54850	54855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813073
1558	NC_012791	CGA	2	6	54892	54897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1559	NC_012791	CAC	2	6	54901	54906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813073
1560	NC_012791	ACA	2	6	54918	54923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813073
1561	NC_012791	ACC	2	6	54939	54944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813073
1562	NC_012791	CTG	2	6	55034	55039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1563	NC_012791	GCA	2	6	55048	55053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1564	NC_012791	GCG	2	6	55071	55076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813073
1565	NC_012791	GCT	2	6	55099	55104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1566	NC_012791	GCT	2	6	55117	55122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1567	NC_012791	CGC	2	6	55153	55158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813073
1568	NC_012791	CG	4	8	55197	55204	0 %	0 %	50 %	50 %	239813073
1569	NC_012791	CTCG	2	8	55207	55214	0 %	25 %	25 %	50 %	239813073
1570	NC_012791	TG	3	6	55219	55224	0 %	50 %	50 %	0 %	239813073
1571	NC_012791	CGG	2	6	55238	55243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813073
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1573	NC_012791	CG	4	8	55339	55346	0 %	0 %	50 %	50 %	239813073
1574	NC_012791	CGG	2	6	55363	55368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813073
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1577	NC_012791	CGG	4	12	55410	55421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813073
1578	NC_012791	CGA	2	6	55438	55443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813073
1579	NC_012791	GAAG	2	8	55445	55452	50 %	0 %	50 %	0 %	239813073
1580	NC_012791	CAT	2	6	55455	55460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813073
1581	NC_012791	CTG	3	9	55519	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813074
1582	NC_012791	CCG	2	6	55529	55534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813074
1583	NC_012791	GCC	3	9	55596	55604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813074
1584	NC_012791	CGC	2	6	55647	55652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813074
1585	NC_012791	ACGCG	2	10	55679	55688	20 %	0 %	40 %	40 %	239813074
1586	NC_012791	GCG	2	6	55691	55696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813074
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1588	NC_012791	AGCC	2	8	55716	55723	25 %	0 %	25 %	50 %	239813074
1589	NC_012791	GCC	3	9	55791	55799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813074
1590	NC_012791	GC	3	6	55817	55822	0 %	0 %	50 %	50 %	239813074
1591	NC_012791	GC	3	6	55864	55869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_012791	CCG	2	6	55872	55877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_012791	TCC	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_012791	CAC	2	6	55992	55997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_012791	AGG	3	9	56047	56055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_012791	AC	3	6	56139	56144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_012791	ACC	2	6	56147	56152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_012791	CGC	2	6	56217	56222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813075
1599	NC_012791	GAC	2	6	56260	56265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813075
1600	NC_012791	TTC	2	6	56269	56274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813075
1601	NC_012791	ACA	2	6	56282	56287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813075
1602	NC_012791	TCT	2	6	56339	56344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813075
1603	NC_012791	CGC	2	6	56347	56352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813075
1604	NC_012791	CAG	2	6	56358	56363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813075
1605	NC_012791	CAC	3	9	56397	56405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813075
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1607	NC_012791	CG	3	6	56495	56500	0 %	0 %	50 %	50 %	239813075
1608	NC_012791	GGT	2	6	56547	56552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813075
1609	NC_012791	CCG	2	6	56570	56575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813075
1610	NC_012791	AGC	2	6	56630	56635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813075
1611	NC_012791	CTG	2	6	56659	56664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813075
1612	NC_012791	GCT	2	6	56721	56726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813076
1613	NC_012791	GC	3	6	56734	56739	0 %	0 %	50 %	50 %	239813076
1614	NC_012791	AGC	2	6	56819	56824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813076
1615	NC_012791	CCT	2	6	56844	56849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813076
1616	NC_012791	CGA	2	6	56877	56882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813076
1617	NC_012791	CG	3	6	56884	56889	0 %	0 %	50 %	50 %	239813076
1618	NC_012791	CAG	2	6	56914	56919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813076
1619	NC_012791	GT	4	8	56931	56938	0 %	50 %	50 %	0 %	239813076
1620	NC_012791	GC	4	8	56939	56946	0 %	0 %	50 %	50 %	239813076
1621	NC_012791	CG	3	6	56973	56978	0 %	0 %	50 %	50 %	239813076
1622	NC_012791	CGC	2	6	56994	56999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813076
1623	NC_012791	GCA	2	6	57000	57005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813076
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1625	NC_012791	CGT	2	6	57036	57041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813076
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