MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012791	GCA	2	6	17410	17415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813036
502	NC_012791	GCC	2	6	17507	17512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813036
503	NC_012791	GCT	2	6	17584	17589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813036
504	NC_012791	GCA	2	6	17590	17595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813036
505	NC_012791	TGG	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813036
506	NC_012791	CG	3	6	17659	17664	0 %	0 %	50 %	50 %	239813036
507	NC_012791	TCGG	2	8	17679	17686	0 %	25 %	50 %	25 %	239813036
508	NC_012791	GTG	2	6	17696	17701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813036
509	NC_012791	TGG	2	6	17724	17729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012791	CTG	2	6	17785	17790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813037
511	NC_012791	GC	3	6	17831	17836	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
512	NC_012791	GCC	2	6	17852	17857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813037
513	NC_012791	CG	4	8	17898	17905	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
514	NC_012791	GCC	2	6	17909	17914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813037
515	NC_012791	GCCG	2	8	18019	18026	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
516	NC_012791	GGC	2	6	18036	18041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813037
517	NC_012791	GC	3	6	18074	18079	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
518	NC_012791	GCAC	2	8	18086	18093	25 %	0 %	25 %	50 %	239813037
519	NC_012791	CGT	2	6	18150	18155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813037
520	NC_012791	GCCG	2	8	18187	18194	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
521	NC_012791	GCT	2	6	18264	18269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813037
522	NC_012791	AGG	2	6	18294	18299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813037
523	NC_012791	CGG	2	6	18335	18340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813037
524	NC_012791	CGGC	2	8	18371	18378	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
525	NC_012791	GC	3	6	18413	18418	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
526	NC_012791	CGT	2	6	18429	18434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813037
527	NC_012791	GCA	2	6	18441	18446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813037
528	NC_012791	CGA	2	6	18465	18470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813037
529	NC_012791	GCG	2	6	18474	18479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813037
530	NC_012791	CGG	2	6	18483	18488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813037
531	NC_012791	GC	3	6	18497	18502	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
532	NC_012791	CGGTG	2	10	18537	18546	0 %	20 %	60 %	20 %	239813038
533	NC_012791	GCC	2	6	18556	18561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
534	NC_012791	AGC	2	6	18571	18576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
535	NC_012791	CGC	2	6	18655	18660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
536	NC_012791	GCA	2	6	18689	18694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
537	NC_012791	GC	3	6	18732	18737	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
538	NC_012791	GCG	2	6	18760	18765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
539	NC_012791	GCC	2	6	18786	18791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
540	NC_012791	GC	3	6	18825	18830	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
541	NC_012791	AGC	2	6	18865	18870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
542	NC_012791	GCT	2	6	18926	18931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813038
543	NC_012791	TGC	2	6	18941	18946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813038
544	NC_012791	CGC	2	6	18947	18952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
545	NC_012791	CCTT	2	8	18964	18971	0 %	50 %	0 %	50 %	239813038
546	NC_012791	GTT	2	6	18975	18980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813038
547	NC_012791	TCGA	2	8	18982	18989	25 %	25 %	25 %	25 %	239813038
548	NC_012791	CGA	2	6	18992	18997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
549	NC_012791	GAA	2	6	19026	19031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813038
550	NC_012791	GC	4	8	19057	19064	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
551	NC_012791	CAGC	2	8	19065	19072	25 %	0 %	25 %	50 %	239813038
552	NC_012791	GC	3	6	19094	19099	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
553	NC_012791	GC	4	8	19110	19117	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
554	NC_012791	GCA	2	6	19193	19198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
555	NC_012791	GCC	2	6	19224	19229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
556	NC_012791	GC	5	10	19233	19242	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
557	NC_012791	GCCCTT	2	12	19323	19334	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	239813038
558	NC_012791	CGG	3	9	19370	19378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
559	NC_012791	GCG	2	6	19391	19396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
560	NC_012791	AGC	2	6	19508	19513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
561	NC_012791	CGCC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	239813038
562	NC_012791	GAAT	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	239813038
563	NC_012791	GAC	2	6	19609	19614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
564	NC_012791	CCG	2	6	19628	19633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813038
565	NC_012791	GGCC	2	8	19661	19668	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
566	NC_012791	GTG	2	6	19675	19680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813038
567	NC_012791	CAG	2	6	19758	19763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
568	NC_012791	TCA	2	6	19804	19809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813039
569	NC_012791	GCC	3	9	19862	19870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
570	NC_012791	CGA	2	6	19914	19919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
571	NC_012791	CAA	2	6	19962	19967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813039
572	NC_012791	GCC	2	6	20048	20053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
573	NC_012791	GCA	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
574	NC_012791	CG	3	6	20083	20088	0 %	0 %	50 %	50 %	239813039
575	NC_012791	GCT	2	6	20154	20159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813039
576	NC_012791	GGCCAT	2	12	20224	20235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813039
577	NC_012791	GCG	2	6	20247	20252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813039
578	NC_012791	GCC	2	6	20261	20266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813039
579	NC_012791	CAG	2	6	20287	20292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
580	NC_012791	TGA	2	6	20331	20336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813039
581	NC_012791	GGC	2	6	20377	20382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
582	NC_012791	GTG	2	6	20391	20396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813040
583	NC_012791	GGCG	2	8	20455	20462	0 %	0 %	75 %	25 %	239813040
584	NC_012791	GCC	2	6	20465	20470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
585	NC_012791	GCC	2	6	20576	20581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
586	NC_012791	GCG	2	6	20633	20638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
587	NC_012791	CGA	2	6	20710	20715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
588	NC_012791	ACC	2	6	20733	20738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813040
589	NC_012791	GCT	2	6	20741	20746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813040
590	NC_012791	CG	3	6	20752	20757	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
591	NC_012791	CAG	2	6	20777	20782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
592	NC_012791	CGA	2	6	20840	20845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
593	NC_012791	CAG	2	6	20846	20851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
594	NC_012791	GGCC	2	8	20872	20879	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
595	NC_012791	GCG	2	6	20889	20894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
596	NC_012791	CGC	2	6	20898	20903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
597	NC_012791	CAG	2	6	20915	20920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
598	NC_012791	GCCAGC	2	12	20928	20939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	239813040
599	NC_012791	CCA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813040
600	NC_012791	GCG	2	6	20962	20967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
601	NC_012791	TGCCAG	2	12	21029	21040	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	239813040
602	NC_012791	CCAGC	2	10	21041	21050	20 %	0 %	20 %	60 %	239813040
603	NC_012791	GCG	2	6	21052	21057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
604	NC_012791	GC	3	6	21060	21065	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
605	NC_012791	CAG	2	6	21113	21118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813040
606	NC_012791	TCG	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813040
607	NC_012791	GCC	2	6	21148	21153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813040
608	NC_012791	GCG	2	6	21183	21188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
609	NC_012791	AGCC	2	8	21201	21208	25 %	0 %	25 %	50 %	239813040
610	NC_012791	T	6	6	21286	21291	0 %	100 %	0 %	0 %	239813040
611	NC_012791	GCG	2	6	21317	21322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
612	NC_012791	GCG	2	6	21332	21337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
613	NC_012791	CG	4	8	21336	21343	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
614	NC_012791	GCG	3	9	21341	21349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
615	NC_012791	CAC	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
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617	NC_012791	CAC	2	6	21506	21511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
618	NC_012791	CAG	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
619	NC_012791	GCC	2	6	21596	21601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
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621	NC_012791	CGA	2	6	21736	21741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
622	NC_012791	TCCGCG	2	12	21765	21776	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813041
623	NC_012791	CGT	2	6	21841	21846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
624	NC_012791	CCG	2	6	21858	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
625	NC_012791	CCA	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
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627	NC_012791	GC	3	6	21914	21919	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
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879	NC_012791	TAG	4	12	30587	30598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
880	NC_012791	T	6	6	30631	30636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
881	NC_012791	AAC	2	6	30710	30715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
882	NC_012791	CGG	3	9	30949	30957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
883	NC_012791	CGAA	2	8	30976	30983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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