MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 157715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012791	GTA	2	6	154834	154839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813172
4502	NC_012791	CAC	2	6	154930	154935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813172
4503	NC_012791	CTT	2	6	154938	154943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813172
4504	NC_012791	CCG	2	6	154977	154982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
4505	NC_012791	GCA	2	6	155115	155120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4506	NC_012791	CTT	2	6	155137	155142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813172
4507	NC_012791	CGA	2	6	155145	155150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4508	NC_012791	GC	3	6	155194	155199	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4509	NC_012791	CTC	2	6	155200	155205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813172
4510	NC_012791	CGA	2	6	155220	155225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4511	NC_012791	GC	3	6	155231	155236	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4512	NC_012791	GCA	2	6	155295	155300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4513	NC_012791	GC	3	6	155307	155312	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4514	NC_012791	TCG	2	6	155360	155365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4515	NC_012791	GA	3	6	155414	155419	50 %	0 %	50 %	0 %	239813172
4516	NC_012791	GCG	2	6	155424	155429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813172
4517	NC_012791	CAG	2	6	155455	155460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4518	NC_012791	CGC	2	6	155469	155474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
4519	NC_012791	GCA	2	6	155475	155480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4520	NC_012791	GCG	2	6	155482	155487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813172
4521	NC_012791	GC	3	6	155559	155564	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4522	NC_012791	GCG	2	6	155592	155597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813172
4523	NC_012791	ACC	3	9	155600	155608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813172
4524	NC_012791	CGC	2	6	155613	155618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
4525	NC_012791	CG	3	6	155623	155628	0 %	0 %	50 %	50 %	239813172
4526	NC_012791	GCC	3	9	155668	155676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
4527	NC_012791	CGC	2	6	155700	155705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813172
4528	NC_012791	CCA	2	6	155709	155714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813172
4529	NC_012791	CGA	2	6	155721	155726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4530	NC_012791	CTG	2	6	155731	155736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4531	NC_012791	CGG	2	6	155781	155786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813172
4532	NC_012791	GCT	3	9	155791	155799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813172
4533	NC_012791	AGGGGA	2	12	155813	155824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813172
4534	NC_012791	GCGA	2	8	155825	155832	25 %	0 %	50 %	25 %	239813172
4535	NC_012791	GCC	2	6	155947	155952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_012791	TA	3	6	156025	156030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012791	CAA	2	6	156048	156053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_012791	GC	3	6	156062	156067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_012791	GTC	2	6	156131	156136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4540	NC_012791	GTCGC	2	10	156155	156164	0 %	20 %	40 %	40 %	239813173
4541	NC_012791	GCA	2	6	156170	156175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4542	NC_012791	GCA	2	6	156185	156190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4543	NC_012791	GCC	2	6	156206	156211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813173
4544	NC_012791	AAG	2	6	156296	156301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813173
4545	NC_012791	GAT	2	6	156325	156330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813173
4546	NC_012791	GCC	2	6	156380	156385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813173
4547	NC_012791	ACG	2	6	156489	156494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4548	NC_012791	GC	3	6	156537	156542	0 %	0 %	50 %	50 %	239813173
4549	NC_012791	GGCCT	2	10	156563	156572	0 %	20 %	40 %	40 %	239813173
4550	NC_012791	CAA	2	6	156580	156585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813173
4551	NC_012791	GGCC	2	8	156655	156662	0 %	0 %	50 %	50 %	239813173
4552	NC_012791	ACG	2	6	156666	156671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4553	NC_012791	GC	3	6	156706	156711	0 %	0 %	50 %	50 %	239813173
4554	NC_012791	CCG	2	6	156720	156725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813173
4555	NC_012791	CCA	2	6	156738	156743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813173
4556	NC_012791	GC	3	6	156780	156785	0 %	0 %	50 %	50 %	239813173
4557	NC_012791	GGC	2	6	156811	156816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813173
4558	NC_012791	GGCCAA	2	12	156871	156882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4559	NC_012791	GTC	2	6	156931	156936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4560	NC_012791	GCC	2	6	156962	156967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813173
4561	NC_012791	TTC	2	6	156977	156982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813173
4562	NC_012791	GAAG	2	8	157006	157013	50 %	0 %	50 %	0 %	239813173
4563	NC_012791	CTG	2	6	157025	157030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813173
4564	NC_012791	CG	4	8	157120	157127	0 %	0 %	50 %	50 %	239813174
4565	NC_012791	GCG	3	9	157125	157133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813174
4566	NC_012791	C	6	6	157150	157155	0 %	0 %	0 %	100 %	239813174
4567	NC_012791	GCC	2	6	157158	157163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813174
4568	NC_012791	CG	3	6	157169	157174	0 %	0 %	50 %	50 %	239813174
4569	NC_012791	TCGC	2	8	157182	157189	0 %	25 %	25 %	50 %	239813174
4570	NC_012791	GC	3	6	157211	157216	0 %	0 %	50 %	50 %	239813174
4571	NC_012791	TGC	2	6	157222	157227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813174
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4573	NC_012791	CGG	2	6	157280	157285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813174
4574	NC_012791	GCC	2	6	157292	157297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813174
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4576	NC_012791	CGG	2	6	157400	157405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813174
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4579	NC_012791	CGGCCT	2	12	157513	157524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239813174
4580	NC_012791	GCT	2	6	157532	157537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813174
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4588	NC_012791	GC	3	6	157698	157703	0 %	0 %	50 %	50 %	239813174
4589	NC_012791	CTC	2	6	157799	157804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813174
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4591	NC_012791	ATC	2	6	157872	157877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813174
4592	NC_012791	CCG	2	6	157928	157933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813174
4593	NC_012791	TGA	2	6	157956	157961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813174
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4595	NC_012791	CG	3	6	157989	157994	0 %	0 %	50 %	50 %	239813175
4596	NC_012791	GCT	2	6	158029	158034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813175
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4598	NC_012791	TCG	2	6	158118	158123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813175
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4601	NC_012791	GTG	2	6	158201	158206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813175
4602	NC_012791	TTC	2	6	158312	158317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813175
4603	NC_012791	AGC	2	6	158361	158366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813175
4604	NC_012791	GCA	2	6	158380	158385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813175
4605	NC_012791	GC	5	10	158399	158408	0 %	0 %	50 %	50 %	239813175
4606	NC_012791	TGC	3	9	158427	158435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813175
4607	NC_012791	GC	3	6	158451	158456	0 %	0 %	50 %	50 %	239813175
4608	NC_012791	GC	3	6	158513	158518	0 %	0 %	50 %	50 %	239813175
4609	NC_012791	CACG	2	8	158536	158543	25 %	0 %	25 %	50 %	239813175
4610	NC_012791	CGA	2	6	158548	158553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813175
4611	NC_012791	GC	3	6	158589	158594	0 %	0 %	50 %	50 %	239813175
4612	NC_012791	GGCCG	2	10	158595	158604	0 %	0 %	60 %	40 %	239813175
4613	NC_012791	TGAAA	2	10	158756	158765	60 %	20 %	20 %	0 %	239813176
4614	NC_012791	GGCC	3	12	158839	158850	0 %	0 %	50 %	50 %	239813176
4615	NC_012791	CG	3	6	158913	158918	0 %	0 %	50 %	50 %	239813176
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4621	NC_012791	CTGC	2	8	159152	159159	0 %	25 %	25 %	50 %	239813176
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4988	NC_012791	GGC	2	6	171240	171245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813187
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4991	NC_012791	GCG	2	6	171283	171288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813187
4992	NC_012791	TGG	2	6	171299	171304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813187
4993	NC_012791	GGT	3	9	171306	171314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813187
4994	NC_012791	GGT	2	6	171324	171329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813187
4995	NC_012791	TCG	2	6	171361	171366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813188
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4999	NC_012791	CG	3	6	171449	171454	0 %	0 %	50 %	50 %	239813188
5000	NC_012791	ACCAC	2	10	171455	171464	40 %	0 %	0 %	60 %	239813188

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