MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012668	A	7	7	176493	176499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012668	TTC	2	6	176568	176573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_012668	TGTT	2	8	176652	176659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012668	CTT	2	6	176674	176679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606289
3505	NC_012668	TA	3	6	176693	176698	50 %	50 %	0 %	0 %	229606289
3506	NC_012668	TCCA	2	8	176828	176835	25 %	25 %	0 %	50 %	229606289
3507	NC_012668	CCA	2	6	176850	176855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606289
3508	NC_012668	CGA	2	6	176877	176882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606289
3509	NC_012668	ATG	2	6	176909	176914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606289
3510	NC_012668	CTG	2	6	176984	176989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606289
3511	NC_012668	CTCA	2	8	177017	177024	25 %	25 %	0 %	50 %	229606289
3512	NC_012668	TGT	2	6	177036	177041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606289
3513	NC_012668	T	6	6	177085	177090	0 %	100 %	0 %	0 %	229606289
3514	NC_012668	TCT	2	6	177210	177215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606289
3515	NC_012668	CT	3	6	177255	177260	0 %	50 %	0 %	50 %	229606289
3516	NC_012668	TCT	3	9	177258	177266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606289
3517	NC_012668	AAG	2	6	177356	177361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606289
3518	NC_012668	TCT	2	6	177375	177380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606289
3519	NC_012668	CTTCT	2	10	177399	177408	0 %	60 %	0 %	40 %	229606289
3520	NC_012668	TAC	2	6	177467	177472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606289
3521	NC_012668	T	6	6	177499	177504	0 %	100 %	0 %	0 %	229606289
3522	NC_012668	CCG	2	6	177589	177594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606289
3523	NC_012668	AC	3	6	177609	177614	50 %	0 %	0 %	50 %	229606289
3524	NC_012668	TGT	2	6	177770	177775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606289
3525	NC_012668	TTAT	2	8	177780	177787	25 %	75 %	0 %	0 %	229606289
3526	NC_012668	TGT	2	6	177918	177923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606289
3527	NC_012668	AGTT	2	8	177953	177960	25 %	50 %	25 %	0 %	229606289
3528	NC_012668	CAA	2	6	178133	178138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_012668	AAC	2	6	178158	178163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_012668	TGC	2	6	178247	178252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_012668	GCA	2	6	178260	178265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_012668	CTT	2	6	178288	178293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_012668	ATTTT	2	10	178417	178426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_012668	CTT	2	6	178429	178434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_012668	CT	3	6	178453	178458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_012668	TCAA	2	8	178460	178467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3537	NC_012668	AGC	2	6	178590	178595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_012668	GCT	2	6	178652	178657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606290
3539	NC_012668	AC	3	6	178670	178675	50 %	0 %	0 %	50 %	229606290
3540	NC_012668	CCG	2	6	178740	178745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606290
3541	NC_012668	ATC	2	6	178848	178853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606290
3542	NC_012668	CAA	2	6	178898	178903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606290
3543	NC_012668	GCCT	2	8	178938	178945	0 %	25 %	25 %	50 %	229606290
3544	NC_012668	TTA	2	6	178957	178962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606290
3545	NC_012668	ACC	2	6	179001	179006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606290
3546	NC_012668	TCT	2	6	179065	179070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606290
3547	NC_012668	T	6	6	179080	179085	0 %	100 %	0 %	0 %	229606290
3548	NC_012668	TTC	2	6	179088	179093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606290
3549	NC_012668	ATA	2	6	179101	179106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606290
3550	NC_012668	GAT	2	6	179138	179143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606291
3551	NC_012668	TTC	2	6	179192	179197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606291
3552	NC_012668	GTT	2	6	179290	179295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606291
3553	NC_012668	ACC	2	6	179325	179330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606291
3554	NC_012668	CA	3	6	179374	179379	50 %	0 %	0 %	50 %	229606291
3555	NC_012668	CAC	2	6	179410	179415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606291
3556	NC_012668	ATA	2	6	179427	179432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606291
3557	NC_012668	CGA	2	6	179445	179450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606291
3558	NC_012668	CTT	2	6	179504	179509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606291
3559	NC_012668	TTC	2	6	179528	179533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606291
3560	NC_012668	TCA	2	6	179574	179579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606291
3561	NC_012668	CCT	2	6	179608	179613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606291
3562	NC_012668	TTCA	2	8	179648	179655	25 %	50 %	0 %	25 %	229606291
3563	NC_012668	GTT	2	6	179672	179677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606291
3564	NC_012668	TAG	2	6	179682	179687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606291
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3566	NC_012668	GCC	2	6	179813	179818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606291
3567	NC_012668	CT	3	6	179834	179839	0 %	50 %	0 %	50 %	229606291
3568	NC_012668	TTC	2	6	179861	179866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606291
3569	NC_012668	AT	3	6	179935	179940	50 %	50 %	0 %	0 %	229606291
3570	NC_012668	GCT	2	6	179948	179953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606291
3571	NC_012668	ATG	2	6	179980	179985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606291
3572	NC_012668	GTT	2	6	179992	179997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606291
3573	NC_012668	TCA	2	6	180057	180062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606291
3574	NC_012668	TTG	2	6	180068	180073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606291
3575	NC_012668	CAT	2	6	180095	180100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606291
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3579	NC_012668	GCT	2	6	180330	180335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606291
3580	NC_012668	A	6	6	180459	180464	100 %	0 %	0 %	0 %	229606292
3581	NC_012668	AAT	2	6	180539	180544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606292
3582	NC_012668	TTA	2	6	180572	180577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606292
3583	NC_012668	TGC	2	6	180610	180615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606292
3584	NC_012668	TTTA	2	8	180693	180700	25 %	75 %	0 %	0 %	229606292
3585	NC_012668	AG	3	6	180705	180710	50 %	0 %	50 %	0 %	229606292
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3587	NC_012668	CAT	2	6	180855	180860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606292
3588	NC_012668	TTCTTT	2	12	180883	180894	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	229606292
3589	NC_012668	TA	3	6	180911	180916	50 %	50 %	0 %	0 %	229606292
3590	NC_012668	TTG	2	6	180950	180955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606292
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3592	NC_012668	ATT	2	6	181238	181243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606293
3593	NC_012668	CAT	2	6	181370	181375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606293
3594	NC_012668	TCT	2	6	181386	181391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606293
3595	NC_012668	T	6	6	181448	181453	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3596	NC_012668	GCT	2	6	181462	181467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3597	NC_012668	T	6	6	181477	181482	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3598	NC_012668	TGC	2	6	181505	181510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3599	NC_012668	TTC	2	6	181568	181573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606293
3600	NC_012668	TAATCA	2	12	181590	181601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606293
3601	NC_012668	GCA	2	6	181695	181700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3602	NC_012668	T	6	6	181868	181873	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3603	NC_012668	TGA	2	6	182013	182018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606293
3604	NC_012668	AGC	2	6	182198	182203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606293
3605	NC_012668	CT	3	6	182260	182265	0 %	50 %	0 %	50 %	229606293
3606	NC_012668	T	6	6	182275	182280	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3607	NC_012668	CTT	2	6	182321	182326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606293
3608	NC_012668	CAA	2	6	182431	182436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606293
3609	NC_012668	AGAA	2	8	182526	182533	75 %	0 %	25 %	0 %	229606293
3610	NC_012668	GCTG	2	8	182565	182572	0 %	25 %	50 %	25 %	229606293
3611	NC_012668	CAC	2	6	182578	182583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606293
3612	NC_012668	TGG	2	6	182598	182603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606293
3613	NC_012668	AAT	2	6	182638	182643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606293
3614	NC_012668	TAT	2	6	182668	182673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606293
3615	NC_012668	AAC	2	6	182742	182747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606293
3616	NC_012668	TA	3	6	182751	182756	50 %	50 %	0 %	0 %	229606293
3617	NC_012668	CT	3	6	182771	182776	0 %	50 %	0 %	50 %	229606293
3618	NC_012668	T	10	10	182805	182814	0 %	100 %	0 %	0 %	229606293
3619	NC_012668	A	6	6	182848	182853	100 %	0 %	0 %	0 %	229606293
3620	NC_012668	TA	3	6	182861	182866	50 %	50 %	0 %	0 %	229606293
3621	NC_012668	CAC	2	6	182878	182883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606293
3622	NC_012668	T	6	6	183012	183017	0 %	100 %	0 %	0 %	229606294
3623	NC_012668	AC	3	6	183057	183062	50 %	0 %	0 %	50 %	229606294
3624	NC_012668	TCC	2	6	183080	183085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606294
3625	NC_012668	GCT	2	6	183105	183110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606294
3626	NC_012668	T	7	7	183201	183207	0 %	100 %	0 %	0 %	229606294
3627	NC_012668	CAA	2	6	183208	183213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606294
3628	NC_012668	ACT	2	6	183257	183262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606294
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3636	NC_012668	CT	4	8	183452	183459	0 %	50 %	0 %	50 %	229606294
3637	NC_012668	TAT	3	9	183552	183560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606294
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3640	NC_012668	CACCAA	2	12	183600	183611	50 %	0 %	0 %	50 %	229606294
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3646	NC_012668	TCAAAT	2	12	183980	183991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606294
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3656	NC_012668	TTTG	2	8	184498	184505	0 %	75 %	25 %	0 %	229606294
3657	NC_012668	GTATTG	2	12	184510	184521	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229606294
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3662	NC_012668	CAC	2	6	184642	184647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3663	NC_012668	A	8	8	184708	184715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3681	NC_012668	T	7	7	185316	185322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3685	NC_012668	A	6	6	185433	185438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3700	NC_012668	AG	3	6	185885	185890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3985	NC_012668	ATCCCA	2	12	201798	201809	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3997	NC_012668	GT	3	6	202232	202237	0 %	50 %	50 %	0 %	229606306
3998	NC_012668	CAT	2	6	202250	202255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606306
3999	NC_012668	AC	3	6	202337	202342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4000	NC_012668	GTA	2	6	202477	202482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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