MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012668	CTT	3	9	152199	152207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606268
3002	NC_012668	TTG	2	6	152225	152230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606268
3003	NC_012668	ACTGT	2	10	152266	152275	20 %	40 %	20 %	20 %	229606268
3004	NC_012668	TCA	2	6	152282	152287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606268
3005	NC_012668	TG	3	6	152304	152309	0 %	50 %	50 %	0 %	229606268
3006	NC_012668	CAG	2	6	152325	152330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606268
3007	NC_012668	ATCA	2	8	152338	152345	50 %	25 %	0 %	25 %	229606268
3008	NC_012668	AGC	2	6	152351	152356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606268
3009	NC_012668	TCAA	2	8	152420	152427	50 %	25 %	0 %	25 %	229606268
3010	NC_012668	CCA	2	6	152442	152447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606268
3011	NC_012668	GCA	2	6	152463	152468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606268
3012	NC_012668	CAC	2	6	152473	152478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606268
3013	NC_012668	CAG	3	9	152602	152610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606268
3014	NC_012668	T	6	6	152652	152657	0 %	100 %	0 %	0 %	229606268
3015	NC_012668	ACC	2	6	152713	152718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606268
3016	NC_012668	T	6	6	152734	152739	0 %	100 %	0 %	0 %	229606268
3017	NC_012668	TACC	2	8	152796	152803	25 %	25 %	0 %	50 %	229606268
3018	NC_012668	ACCGCC	2	12	152848	152859	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	229606268
3019	NC_012668	TCAA	2	8	152903	152910	50 %	25 %	0 %	25 %	229606268
3020	NC_012668	TCA	2	6	152924	152929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606268
3021	NC_012668	CGC	2	6	152946	152951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606268
3022	NC_012668	CAC	2	6	152955	152960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606268
3023	NC_012668	CAC	2	6	152964	152969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606268
3024	NC_012668	GCC	2	6	152977	152982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606268
3025	NC_012668	GCC	2	6	153025	153030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606268
3026	NC_012668	TCC	2	6	153079	153084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606268
3027	NC_012668	ATAA	2	8	153242	153249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012668	A	6	6	153248	153253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012668	CCA	2	6	153256	153261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_012668	TCA	2	6	153281	153286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_012668	CAG	2	6	153303	153308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606269
3032	NC_012668	GTT	2	6	153331	153336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606269
3033	NC_012668	ACGA	2	8	153442	153449	50 %	0 %	25 %	25 %	229606269
3034	NC_012668	CAC	2	6	153474	153479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606269
3035	NC_012668	ACC	2	6	153535	153540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606269
3036	NC_012668	T	6	6	153544	153549	0 %	100 %	0 %	0 %	229606269
3037	NC_012668	TTG	2	6	153558	153563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606269
3038	NC_012668	TAA	2	6	153572	153577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012668	TTG	2	6	153630	153635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606270
3040	NC_012668	ACG	3	9	153651	153659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606270
3041	NC_012668	ACT	2	6	153712	153717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606270
3042	NC_012668	CAG	2	6	153771	153776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606270
3043	NC_012668	GTT	2	6	153857	153862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606270
3044	NC_012668	ACC	2	6	153864	153869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606270
3045	NC_012668	ATC	2	6	153958	153963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_012668	ATG	2	6	153987	153992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_012668	A	7	7	154016	154022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_012668	CAAA	2	8	154041	154048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_012668	TAT	2	6	154099	154104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012668	AGA	2	6	154116	154121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_012668	AACGA	2	10	154212	154221	60 %	0 %	20 %	20 %	229606271
3052	NC_012668	CTCAA	2	10	154228	154237	40 %	20 %	0 %	40 %	229606271
3053	NC_012668	CAAC	2	8	154256	154263	50 %	0 %	0 %	50 %	229606271
3054	NC_012668	ATC	2	6	154275	154280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606271
3055	NC_012668	GTG	3	9	154282	154290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606271
3056	NC_012668	TCACA	2	10	154350	154359	40 %	20 %	0 %	40 %	229606271
3057	NC_012668	CTG	3	9	154363	154371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606271
3058	NC_012668	ATTC	2	8	154382	154389	25 %	50 %	0 %	25 %	229606271
3059	NC_012668	GAT	2	6	154410	154415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606271
3060	NC_012668	GCC	2	6	154476	154481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606271
3061	NC_012668	CTCG	2	8	154510	154517	0 %	25 %	25 %	50 %	229606271
3062	NC_012668	GAT	2	6	154523	154528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606271
3063	NC_012668	TGA	2	6	154561	154566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606271
3064	NC_012668	ACC	2	6	154632	154637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606271
3065	NC_012668	TG	3	6	154714	154719	0 %	50 %	50 %	0 %	229606271
3066	NC_012668	TGAT	2	8	154786	154793	25 %	50 %	25 %	0 %	229606271
3067	NC_012668	TGA	2	6	154820	154825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606271
3068	NC_012668	CCTAC	2	10	154866	154875	20 %	20 %	0 %	60 %	229606271
3069	NC_012668	GCA	2	6	154892	154897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606271
3070	NC_012668	GAT	2	6	154919	154924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606271
3071	NC_012668	ACAA	2	8	155080	155087	75 %	0 %	0 %	25 %	229606271
3072	NC_012668	ACTC	2	8	155162	155169	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_012668	A	6	6	155194	155199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012668	TGCC	2	8	155304	155311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_012668	CAG	2	6	155326	155331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_012668	GCTTT	2	10	155388	155397	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3077	NC_012668	TACA	2	8	155419	155426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_012668	CAAT	2	8	155502	155509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_012668	CCA	2	6	155562	155567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_012668	ATC	2	6	155585	155590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_012668	ATCTT	2	10	155735	155744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_012668	GGC	2	6	155746	155751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_012668	AAT	2	6	155827	155832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012668	AAT	2	6	155851	155856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012668	ACA	2	6	155928	155933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_012668	CG	3	6	155983	155988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_012668	ACC	2	6	156023	156028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_012668	TGACC	2	10	156081	156090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3089	NC_012668	CGC	2	6	156157	156162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_012668	GTG	2	6	156209	156214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012668	GCG	2	6	156230	156235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012668	TAG	2	6	156277	156282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_012668	CCA	2	6	156290	156295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_012668	ACC	2	6	156300	156305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_012668	ACA	2	6	156348	156353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_012668	AC	3	6	156474	156479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3097	NC_012668	AG	3	6	156520	156525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_012668	AAGA	2	8	156529	156536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012668	ATC	2	6	156566	156571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_012668	GA	3	6	156658	156663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012668	T	6	6	156676	156681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012668	ATT	2	6	156686	156691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012668	T	6	6	156690	156695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012668	CCA	2	6	156784	156789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_012668	A	6	6	156821	156826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012668	TAAT	2	8	156935	156942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012668	ACT	2	6	156965	156970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_012668	GGC	2	6	156985	156990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_012668	AAGT	2	8	156991	156998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_012668	GCATAG	2	12	157011	157022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3111	NC_012668	A	7	7	157106	157112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012668	ATT	2	6	157160	157165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606272
3113	NC_012668	CAA	2	6	157349	157354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606272
3114	NC_012668	ACC	2	6	157456	157461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606272
3115	NC_012668	CTT	2	6	157502	157507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606272
3116	NC_012668	ACA	2	6	157538	157543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606272
3117	NC_012668	ACC	2	6	157569	157574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606272
3118	NC_012668	ATCTTT	2	12	157602	157613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	229606272
3119	NC_012668	GTG	2	6	157654	157659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606272
3120	NC_012668	AC	3	6	157685	157690	50 %	0 %	0 %	50 %	229606272
3121	NC_012668	T	6	6	157695	157700	0 %	100 %	0 %	0 %	229606272
3122	NC_012668	TAA	2	6	157745	157750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606272
3123	NC_012668	AC	3	6	157770	157775	50 %	0 %	0 %	50 %	229606272
3124	NC_012668	T	6	6	157784	157789	0 %	100 %	0 %	0 %	229606272
3125	NC_012668	CAG	2	6	158018	158023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606272
3126	NC_012668	GCC	2	6	158064	158069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606272
3127	NC_012668	CAAT	2	8	158188	158195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_012668	CTG	2	6	158225	158230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_012668	ACAGTG	2	12	158323	158334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3130	NC_012668	GT	3	6	158359	158364	0 %	50 %	50 %	0 %	229606273
3131	NC_012668	AAG	2	6	158414	158419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606273
3132	NC_012668	AGA	2	6	158480	158485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606273
3133	NC_012668	TTG	2	6	158509	158514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606273
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3135	NC_012668	ACA	2	6	158539	158544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606273
3136	NC_012668	GTAC	2	8	158589	158596	25 %	25 %	25 %	25 %	229606273
3137	NC_012668	AGATGG	2	12	158608	158619	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	229606273
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3140	NC_012668	TCGC	2	8	158746	158753	0 %	25 %	25 %	50 %	229606273
3141	NC_012668	CT	3	6	158762	158767	0 %	50 %	0 %	50 %	229606273
3142	NC_012668	TG	3	6	158864	158869	0 %	50 %	50 %	0 %	229606273
3143	NC_012668	ATG	2	6	158910	158915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_012668	CAT	2	6	158959	158964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3145	NC_012668	CAC	2	6	158969	158974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3146	NC_012668	TAA	2	6	159039	159044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_012668	TGT	2	6	159088	159093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_012668	T	7	7	159093	159099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_012668	GCT	2	6	159111	159116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3150	NC_012668	CAGG	2	8	159152	159159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3151	NC_012668	GAAG	2	8	159202	159209	50 %	0 %	50 %	0 %	229606274
3152	NC_012668	AAT	2	6	159232	159237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606274
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3154	NC_012668	TTA	2	6	159331	159336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606274
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3156	NC_012668	GTT	2	6	159396	159401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606274
3157	NC_012668	GGC	2	6	159416	159421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606274
3158	NC_012668	A	6	6	159539	159544	100 %	0 %	0 %	0 %	229606274
3159	NC_012668	GC	3	6	159547	159552	0 %	0 %	50 %	50 %	229606274
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3167	NC_012668	TCG	2	6	159891	159896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606274
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3178	NC_012668	TCACGT	2	12	160266	160277	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3179	NC_012668	TAC	2	6	160285	160290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3181	NC_012668	AAT	2	6	160338	160343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3182	NC_012668	ACA	3	9	160366	160374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606275
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3186	NC_012668	CGC	2	6	160616	160621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606275
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3193	NC_012668	TTTAC	2	10	160830	160839	20 %	60 %	0 %	20 %	229606275
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3202	NC_012668	TGG	2	6	161276	161281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606275
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3233	NC_012668	GAT	2	6	162603	162608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606275
3234	NC_012668	GA	3	6	162617	162622	50 %	0 %	50 %	0 %	229606275
3235	NC_012668	TAG	2	6	162743	162748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606275
3236	NC_012668	CAGCC	2	10	162765	162774	20 %	0 %	20 %	60 %	229606275
3237	NC_012668	AGC	2	6	162777	162782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606275
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3240	NC_012668	CTG	2	6	162880	162885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606275
3241	NC_012668	A	6	6	162896	162901	100 %	0 %	0 %	0 %	229606275
3242	NC_012668	A	6	6	162909	162914	100 %	0 %	0 %	0 %	229606275
3243	NC_012668	TCAA	2	8	162973	162980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3244	NC_012668	AG	3	6	163033	163038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_012668	TGAA	2	8	163074	163081	50 %	25 %	25 %	0 %	229606276
3246	NC_012668	TGG	2	6	163185	163190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606276
3247	NC_012668	ATG	2	6	163230	163235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606276
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3250	NC_012668	T	6	6	163525	163530	0 %	100 %	0 %	0 %	229606277
3251	NC_012668	GCA	2	6	163652	163657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606278
3252	NC_012668	TCA	2	6	163707	163712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606278
3253	NC_012668	GCT	2	6	163793	163798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606278
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3256	NC_012668	GAT	2	6	163921	163926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606278
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3259	NC_012668	CTT	2	6	164042	164047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3260	NC_012668	TTG	2	6	164065	164070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_012668	A	6	6	164075	164080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_012668	TCCA	2	8	164146	164153	25 %	25 %	0 %	50 %	229606279
3263	NC_012668	TCT	2	6	164177	164182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606279
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3271	NC_012668	GC	3	6	164904	164909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3272	NC_012668	A	7	7	164985	164991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3280	NC_012668	ATT	2	6	165461	165466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3281	NC_012668	CA	3	6	165522	165527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3282	NC_012668	ATT	2	6	165543	165548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3283	NC_012668	TTTG	2	8	165554	165561	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3300	NC_012668	A	6	6	166194	166199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3369	NC_012668	ATCGTG	2	12	169854	169865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229606285
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3371	NC_012668	AGGT	2	8	169983	169990	25 %	25 %	50 %	0 %	229606285
3372	NC_012668	AGA	2	6	169993	169998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606285
3373	NC_012668	AGA	2	6	170041	170046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606285
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3471	NC_012668	TACA	2	8	175067	175074	50 %	25 %	0 %	25 %	229606287
3472	NC_012668	ATG	2	6	175090	175095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606287
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3477	NC_012668	CAGA	2	8	175185	175192	50 %	0 %	25 %	25 %	229606287
3478	NC_012668	GAA	2	6	175253	175258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606287
3479	NC_012668	AAT	2	6	175266	175271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606287
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3481	NC_012668	CCG	2	6	175372	175377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3482	NC_012668	TCA	2	6	175468	175473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3491	NC_012668	CT	3	6	175865	175870	0 %	50 %	0 %	50 %	229606288
3492	NC_012668	TCAG	2	8	175932	175939	25 %	25 %	25 %	25 %	229606288
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3498	NC_012668	ACA	2	6	176184	176189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606288
3499	NC_012668	AATT	2	8	176336	176343	50 %	50 %	0 %	0 %	229606288
3500	NC_012668	TTC	2	6	176445	176450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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