MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012668	GCT	2	6	127253	127258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_012668	ACC	2	6	127613	127618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_012668	GCA	2	6	127653	127658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_012668	TTC	2	6	127675	127680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_012668	CGG	2	6	127706	127711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_012668	CAC	2	6	127774	127779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_012668	TTCGC	2	10	127787	127796	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_012668	CTTGC	2	10	127815	127824	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2509	NC_012668	CATC	2	8	127827	127834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_012668	CACC	2	8	127923	127930	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2511	NC_012668	TACC	2	8	128000	128007	25 %	25 %	0 %	50 %	229606244
2512	NC_012668	CTT	2	6	128045	128050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606244
2513	NC_012668	CCA	2	6	128057	128062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606244
2514	NC_012668	CAC	2	6	128063	128068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606244
2515	NC_012668	GAT	2	6	128130	128135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606244
2516	NC_012668	CGCA	2	8	128259	128266	25 %	0 %	25 %	50 %	229606244
2517	NC_012668	ACA	2	6	128276	128281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606244
2518	NC_012668	CGC	2	6	128343	128348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606244
2519	NC_012668	CGA	2	6	128438	128443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606244
2520	NC_012668	GTTG	2	8	128519	128526	0 %	50 %	50 %	0 %	229606244
2521	NC_012668	TTG	2	6	128539	128544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606244
2522	NC_012668	TGA	2	6	128593	128598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606244
2523	NC_012668	CGC	2	6	128619	128624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606244
2524	NC_012668	GTC	2	6	128629	128634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606244
2525	NC_012668	CCG	2	6	128762	128767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606244
2526	NC_012668	CG	3	6	128774	128779	0 %	0 %	50 %	50 %	229606244
2527	NC_012668	TGA	2	6	128782	128787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606244
2528	NC_012668	CAT	2	6	128873	128878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606244
2529	NC_012668	TAA	2	6	129055	129060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_012668	GTA	2	6	129074	129079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606245
2531	NC_012668	CAA	2	6	129082	129087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606245
2532	NC_012668	CAA	2	6	129124	129129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606245
2533	NC_012668	GTAA	2	8	129169	129176	50 %	25 %	25 %	0 %	229606245
2534	NC_012668	GCA	2	6	129498	129503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606245
2535	NC_012668	ATT	2	6	129504	129509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606245
2536	NC_012668	GGC	2	6	129603	129608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606245
2537	NC_012668	GCA	2	6	129630	129635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606245
2538	NC_012668	AGC	2	6	129699	129704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606245
2539	NC_012668	GCAG	2	8	129712	129719	25 %	0 %	50 %	25 %	229606245
2540	NC_012668	CAT	2	6	129883	129888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606246
2541	NC_012668	GATT	2	8	129894	129901	25 %	50 %	25 %	0 %	229606246
2542	NC_012668	CGC	2	6	129913	129918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606246
2543	NC_012668	TCAC	2	8	129944	129951	25 %	25 %	0 %	50 %	229606246
2544	NC_012668	CAC	2	6	129988	129993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606246
2545	NC_012668	TGC	2	6	130006	130011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606246
2546	NC_012668	CAA	2	6	130016	130021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606246
2547	NC_012668	TGG	2	6	130029	130034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606246
2548	NC_012668	GT	3	6	130067	130072	0 %	50 %	50 %	0 %	229606246
2549	NC_012668	GCG	2	6	130121	130126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606246
2550	NC_012668	GT	3	6	130128	130133	0 %	50 %	50 %	0 %	229606246
2551	NC_012668	CA	3	6	130273	130278	50 %	0 %	0 %	50 %	229606246
2552	NC_012668	GCC	2	6	130343	130348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606246
2553	NC_012668	TCT	2	6	130371	130376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606246
2554	NC_012668	GCA	2	6	130393	130398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606246
2555	NC_012668	TGA	2	6	130420	130425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606246
2556	NC_012668	ACA	2	6	130447	130452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606246
2557	NC_012668	GCC	2	6	130469	130474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606246
2558	NC_012668	GGC	2	6	130535	130540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606246
2559	NC_012668	GCG	2	6	130610	130615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606246
2560	NC_012668	CG	3	6	130622	130627	0 %	0 %	50 %	50 %	229606246
2561	NC_012668	AAC	2	6	130638	130643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606246
2562	NC_012668	TCA	2	6	130724	130729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606247
2563	NC_012668	CAT	2	6	130749	130754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606247
2564	NC_012668	GGT	2	6	130755	130760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606247
2565	NC_012668	CG	4	8	130785	130792	0 %	0 %	50 %	50 %	229606247
2566	NC_012668	GCA	2	6	130880	130885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606247
2567	NC_012668	CCA	2	6	130895	130900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606247
2568	NC_012668	TTCCTC	2	12	130987	130998	0 %	50 %	0 %	50 %	229606247
2569	NC_012668	CT	4	8	131005	131012	0 %	50 %	0 %	50 %	229606247
2570	NC_012668	GGC	2	6	131026	131031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606247
2571	NC_012668	TTG	2	6	131032	131037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606247
2572	NC_012668	TTG	2	6	131047	131052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606247
2573	NC_012668	CG	3	6	131056	131061	0 %	0 %	50 %	50 %	229606247
2574	NC_012668	CAT	2	6	131148	131153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606247
2575	NC_012668	GGC	2	6	131164	131169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606247
2576	NC_012668	TGC	2	6	131201	131206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606247
2577	NC_012668	GCA	2	6	131268	131273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606248
2578	NC_012668	CTG	2	6	131295	131300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606248
2579	NC_012668	GAA	2	6	131355	131360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606248
2580	NC_012668	CGC	2	6	131380	131385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606248
2581	NC_012668	GGT	3	9	131456	131464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606248
2582	NC_012668	AGCCA	2	10	131509	131518	40 %	0 %	20 %	40 %	229606248
2583	NC_012668	GCA	2	6	131535	131540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606248
2584	NC_012668	AAT	2	6	131548	131553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606248
2585	NC_012668	T	6	6	131575	131580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_012668	GAT	2	6	131609	131614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606249
2587	NC_012668	ACT	2	6	131618	131623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606249
2588	NC_012668	AGCG	2	8	131645	131652	25 %	0 %	50 %	25 %	229606249
2589	NC_012668	AGC	2	6	131656	131661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606249
2590	NC_012668	A	6	6	131662	131667	100 %	0 %	0 %	0 %	229606249
2591	NC_012668	TCAAC	2	10	131701	131710	40 %	20 %	0 %	40 %	229606249
2592	NC_012668	CG	3	6	131793	131798	0 %	0 %	50 %	50 %	229606249
2593	NC_012668	AAG	2	6	131890	131895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606249
2594	NC_012668	ACG	2	6	132054	132059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2595	NC_012668	GTC	2	6	132180	132185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2596	NC_012668	CAC	2	6	132227	132232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606250
2597	NC_012668	ATC	2	6	132249	132254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606250
2598	NC_012668	CGA	2	6	132289	132294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2599	NC_012668	GAT	2	6	132300	132305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606250
2600	NC_012668	GC	3	6	132334	132339	0 %	0 %	50 %	50 %	229606250
2601	NC_012668	GC	3	6	132354	132359	0 %	0 %	50 %	50 %	229606250
2602	NC_012668	GCT	2	6	132401	132406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2603	NC_012668	GAC	2	6	132429	132434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2604	NC_012668	CAGCG	2	10	132435	132444	20 %	0 %	40 %	40 %	229606250
2605	NC_012668	CG	3	6	132443	132448	0 %	0 %	50 %	50 %	229606250
2606	NC_012668	TG	3	6	132456	132461	0 %	50 %	50 %	0 %	229606250
2607	NC_012668	GAT	2	6	132483	132488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606250
2608	NC_012668	GCA	2	6	132547	132552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2609	NC_012668	GAA	2	6	132588	132593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606250
2610	NC_012668	CTG	2	6	132604	132609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2611	NC_012668	AGC	2	6	132631	132636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2612	NC_012668	AGC	2	6	132685	132690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606250
2613	NC_012668	GTG	2	6	132736	132741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606251
2614	NC_012668	CGCA	2	8	132774	132781	25 %	0 %	25 %	50 %	229606251
2615	NC_012668	GCT	2	6	132820	132825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606251
2616	NC_012668	CTG	2	6	132878	132883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606251
2617	NC_012668	CAG	2	6	132924	132929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606251
2618	NC_012668	CG	3	6	132937	132942	0 %	0 %	50 %	50 %	229606251
2619	NC_012668	TGC	2	6	132945	132950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606251
2620	NC_012668	CAA	2	6	133130	133135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606251
2621	NC_012668	CGC	2	6	133147	133152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606251
2622	NC_012668	AGCA	2	8	133227	133234	50 %	0 %	25 %	25 %	229606251
2623	NC_012668	CCG	2	6	133268	133273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606251
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2748	NC_012668	TCT	2	6	139471	139476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606257
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2752	NC_012668	TGC	2	6	139806	139811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606257
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2991	NC_012668	CT	3	6	151763	151768	0 %	50 %	0 %	50 %	229606267
2992	NC_012668	TTCCT	2	10	151784	151793	0 %	60 %	0 %	40 %	229606267
2993	NC_012668	AG	4	8	151812	151819	50 %	0 %	50 %	0 %	229606267
2994	NC_012668	AAAC	2	8	151832	151839	75 %	0 %	0 %	25 %	229606267
2995	NC_012668	A	6	6	151863	151868	100 %	0 %	0 %	0 %	229606267
2996	NC_012668	TCT	2	6	151934	151939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606268
2997	NC_012668	ATC	2	6	151951	151956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606268
2998	NC_012668	TCA	2	6	151964	151969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606268
2999	NC_012668	CGC	2	6	152128	152133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606268
3000	NC_012668	GAT	2	6	152173	152178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606268

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