MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012668	GAA	2	6	52419	52424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606175
1002	NC_012668	GCC	2	6	52431	52436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606175
1003	NC_012668	GCC	2	6	52507	52512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606175
1004	NC_012668	CCG	2	6	52520	52525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606175
1005	NC_012668	CAG	2	6	52563	52568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1006	NC_012668	CG	3	6	52588	52593	0 %	0 %	50 %	50 %	229606175
1007	NC_012668	AGCA	2	8	52615	52622	50 %	0 %	25 %	25 %	229606175
1008	NC_012668	GCA	2	6	52638	52643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1009	NC_012668	GCT	2	6	52645	52650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1010	NC_012668	CA	3	6	52690	52695	50 %	0 %	0 %	50 %	229606175
1011	NC_012668	ACTC	2	8	52766	52773	25 %	25 %	0 %	50 %	229606175
1012	NC_012668	CCA	2	6	52865	52870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606175
1013	NC_012668	CG	3	6	53023	53028	0 %	0 %	50 %	50 %	229606175
1014	NC_012668	GCCAT	2	10	53044	53053	20 %	20 %	20 %	40 %	229606175
1015	NC_012668	GCA	2	6	53054	53059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1016	NC_012668	GAGC	2	8	53084	53091	25 %	0 %	50 %	25 %	229606175
1017	NC_012668	AGC	2	6	53095	53100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1018	NC_012668	ACCC	2	8	53179	53186	25 %	0 %	0 %	75 %	229606175
1019	NC_012668	GTG	2	6	53187	53192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606175
1020	NC_012668	TGG	2	6	53201	53206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606175
1021	NC_012668	A	6	6	53423	53428	100 %	0 %	0 %	0 %	229606175
1022	NC_012668	CAT	2	6	53441	53446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606175
1023	NC_012668	GAA	2	6	53448	53453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606175
1024	NC_012668	GTT	2	6	53528	53533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606175
1025	NC_012668	AGC	2	6	53557	53562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1026	NC_012668	CAA	2	6	53565	53570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606175
1027	NC_012668	GGC	2	6	53573	53578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606175
1028	NC_012668	TGC	2	6	53599	53604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1029	NC_012668	GC	3	6	53618	53623	0 %	0 %	50 %	50 %	229606175
1030	NC_012668	AAG	2	6	53659	53664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606175
1031	NC_012668	GGT	2	6	53682	53687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606175
1032	NC_012668	AATG	2	8	53711	53718	50 %	25 %	25 %	0 %	229606175
1033	NC_012668	GAT	2	6	53919	53924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606175
1034	NC_012668	TGG	2	6	53950	53955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606175
1035	NC_012668	GATG	2	8	54011	54018	25 %	25 %	50 %	0 %	229606175
1036	NC_012668	CTCG	2	8	54053	54060	0 %	25 %	25 %	50 %	229606175
1037	NC_012668	CTGG	2	8	54270	54277	0 %	25 %	50 %	25 %	229606175
1038	NC_012668	GC	4	8	54303	54310	0 %	0 %	50 %	50 %	229606175
1039	NC_012668	ACA	2	6	54317	54322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606175
1040	NC_012668	AAGCC	2	10	54360	54369	40 %	0 %	20 %	40 %	229606175
1041	NC_012668	CTC	2	6	54457	54462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229606175
1042	NC_012668	GCT	2	6	54497	54502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606175
1043	NC_012668	ACA	2	6	54549	54554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_012668	GAC	2	6	54667	54672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1045	NC_012668	CTT	2	6	54733	54738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1046	NC_012668	AAG	2	6	54761	54766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606176
1047	NC_012668	CTT	2	6	54787	54792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1048	NC_012668	AGC	2	6	54825	54830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1049	NC_012668	TCA	2	6	54843	54848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606176
1050	NC_012668	CAG	2	6	54899	54904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1051	NC_012668	CCA	2	6	54921	54926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606176
1052	NC_012668	CGTT	2	8	54951	54958	0 %	50 %	25 %	25 %	229606176
1053	NC_012668	GCA	2	6	54964	54969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1054	NC_012668	CAT	2	6	54979	54984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606176
1055	NC_012668	GGTC	2	8	54990	54997	0 %	25 %	50 %	25 %	229606176
1056	NC_012668	TCT	2	6	55014	55019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1057	NC_012668	AAAT	2	8	55068	55075	75 %	25 %	0 %	0 %	229606176
1058	NC_012668	GAC	2	6	55088	55093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1059	NC_012668	TCA	2	6	55126	55131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606176
1060	NC_012668	CCA	2	6	55157	55162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606176
1061	NC_012668	GTAG	2	8	55169	55176	25 %	25 %	50 %	0 %	229606176
1062	NC_012668	CTT	2	6	55237	55242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1063	NC_012668	ACC	2	6	55296	55301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606176
1064	NC_012668	TCA	2	6	55341	55346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606176
1065	NC_012668	ACG	2	6	55358	55363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606176
1066	NC_012668	CTT	3	9	55375	55383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1067	NC_012668	TTC	2	6	55505	55510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606176
1068	NC_012668	TGG	2	6	55769	55774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606177
1069	NC_012668	TCT	2	6	55778	55783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606177
1070	NC_012668	TCCT	2	8	55803	55810	0 %	50 %	0 %	50 %	229606177
1071	NC_012668	AGC	2	6	55816	55821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606177
1072	NC_012668	ATG	2	6	55867	55872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606177
1073	NC_012668	TTG	2	6	55975	55980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606177
1074	NC_012668	TCT	2	6	56045	56050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606177
1075	NC_012668	ACATTA	2	12	56074	56085	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606177
1076	NC_012668	TTTGTT	2	12	56119	56130	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	229606177
1077	NC_012668	T	6	6	56154	56159	0 %	100 %	0 %	0 %	229606177
1078	NC_012668	CGT	2	6	56241	56246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606177
1079	NC_012668	CGC	2	6	56247	56252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606177
1080	NC_012668	AGCCAC	2	12	56280	56291	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229606177
1081	NC_012668	CCA	2	6	56311	56316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606177
1082	NC_012668	AGG	2	6	56322	56327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606177
1083	NC_012668	T	6	6	56354	56359	0 %	100 %	0 %	0 %	229606177
1084	NC_012668	GATCA	2	10	56403	56412	40 %	20 %	20 %	20 %	229606177
1085	NC_012668	T	6	6	56460	56465	0 %	100 %	0 %	0 %	229606177
1086	NC_012668	TGT	2	6	56507	56512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606177
1087	NC_012668	AAT	2	6	56563	56568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606177
1088	NC_012668	AAT	2	6	56581	56586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606177
1089	NC_012668	TCA	2	6	56612	56617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606177
1090	NC_012668	ACC	2	6	56744	56749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606178
1091	NC_012668	GCA	2	6	56790	56795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606178
1092	NC_012668	GCCA	2	8	56842	56849	25 %	0 %	25 %	50 %	229606178
1093	NC_012668	TCG	2	6	56860	56865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606178
1094	NC_012668	GGGCA	2	10	57089	57098	20 %	0 %	60 %	20 %	229606178
1095	NC_012668	CAT	2	6	57119	57124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606178
1096	NC_012668	CGA	2	6	57133	57138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606178
1097	NC_012668	GCC	2	6	57165	57170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606178
1098	NC_012668	GCG	2	6	57308	57313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606179
1099	NC_012668	GGA	2	6	57382	57387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606179
1100	NC_012668	AATA	2	8	57395	57402	75 %	25 %	0 %	0 %	229606179
1101	NC_012668	TAAG	2	8	57518	57525	50 %	25 %	25 %	0 %	229606179
1102	NC_012668	AGC	2	6	57582	57587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606179
1103	NC_012668	AGT	2	6	57600	57605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606179
1104	NC_012668	GCC	3	9	57658	57666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606179
1105	NC_012668	CAT	2	6	57686	57691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606179
1106	NC_012668	TGAT	2	8	57709	57716	25 %	50 %	25 %	0 %	229606179
1107	NC_012668	TCA	2	6	57749	57754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606179
1108	NC_012668	CAC	2	6	57866	57871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606179
1109	NC_012668	ACAATC	2	12	57892	57903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	229606179
1110	NC_012668	CAT	2	6	57959	57964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606179
1111	NC_012668	CT	3	6	57998	58003	0 %	50 %	0 %	50 %	229606179
1112	NC_012668	CT	3	6	58013	58018	0 %	50 %	0 %	50 %	229606179
1113	NC_012668	CAC	2	6	58045	58050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606180
1114	NC_012668	TCT	2	6	58130	58135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606180
1115	NC_012668	CGCC	2	8	58290	58297	0 %	0 %	25 %	75 %	229606180
1116	NC_012668	TGC	2	6	58376	58381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606180
1117	NC_012668	ACGA	2	8	58464	58471	50 %	0 %	25 %	25 %	229606180
1118	NC_012668	CAGA	2	8	58476	58483	50 %	0 %	25 %	25 %	229606180
1119	NC_012668	CTGATT	2	12	58495	58506	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229606180
1120	NC_012668	GC	3	6	58537	58542	0 %	0 %	50 %	50 %	229606180
1121	NC_012668	GAC	2	6	58666	58671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606180
1122	NC_012668	CG	3	6	58855	58860	0 %	0 %	50 %	50 %	229606180
1123	NC_012668	GA	4	8	59055	59062	50 %	0 %	50 %	0 %	229606180
1124	NC_012668	T	6	6	59087	59092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012668	CTT	2	6	59144	59149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606181
1126	NC_012668	CGC	2	6	59232	59237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606181
1127	NC_012668	GAG	2	6	59346	59351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606181
1128	NC_012668	ATC	2	6	59379	59384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606181
1129	NC_012668	GGC	2	6	59399	59404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606181
1130	NC_012668	GCA	2	6	59416	59421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606181
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1132	NC_012668	ATG	2	6	59521	59526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606181
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1134	NC_012668	TTA	2	6	59589	59594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606182
1135	NC_012668	CAC	2	6	59683	59688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606182
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1139	NC_012668	GTG	2	6	59910	59915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229606182
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1143	NC_012668	GCC	2	6	60041	60046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606182
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1151	NC_012668	TCA	2	6	60380	60385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606183
1152	NC_012668	CTG	3	9	60433	60441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606183
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1155	NC_012668	TGC	2	6	60619	60624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1230	NC_012668	ATTC	2	8	64092	64099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1231	NC_012668	A	6	6	64110	64115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1232	NC_012668	TCG	2	6	64147	64152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1233	NC_012668	CA	4	8	64218	64225	50 %	0 %	0 %	50 %	229606189
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1243	NC_012668	AATCC	2	10	64647	64656	40 %	20 %	0 %	40 %	229606189
1244	NC_012668	CAT	2	6	64695	64700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606189
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1247	NC_012668	AAACGG	2	12	64786	64797	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	229606189
1248	NC_012668	CGG	3	9	64795	64803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606189
1249	NC_012668	AAG	2	6	64825	64830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606189
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1252	NC_012668	CCAA	2	8	64919	64926	50 %	0 %	0 %	50 %	229606189
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