MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 1

Total Repeats: 60260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012668	CTT	2	6	25502	25507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606151
502	NC_012668	ACGA	2	8	25527	25534	50 %	0 %	25 %	25 %	229606151
503	NC_012668	TGT	2	6	25595	25600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606151
504	NC_012668	GAC	2	6	25610	25615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606151
505	NC_012668	ATCG	2	8	25649	25656	25 %	25 %	25 %	25 %	229606151
506	NC_012668	T	6	6	25675	25680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012668	GCG	2	6	25692	25697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_012668	TCAA	2	8	25959	25966	50 %	25 %	0 %	25 %	229606152
509	NC_012668	CTG	2	6	26012	26017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606152
510	NC_012668	CAG	2	6	26053	26058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606152
511	NC_012668	CTT	2	6	26088	26093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606152
512	NC_012668	TCA	2	6	26103	26108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606152
513	NC_012668	TGC	2	6	26157	26162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606152
514	NC_012668	TTA	2	6	26223	26228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606152
515	NC_012668	CTG	3	9	26252	26260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606152
516	NC_012668	GCTT	2	8	26323	26330	0 %	50 %	25 %	25 %	229606152
517	NC_012668	A	6	6	26354	26359	100 %	0 %	0 %	0 %	229606152
518	NC_012668	TCT	2	6	26361	26366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606152
519	NC_012668	CTG	3	9	26390	26398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606152
520	NC_012668	TGC	2	6	26439	26444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606152
521	NC_012668	TTG	2	6	26456	26461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606152
522	NC_012668	A	6	6	26588	26593	100 %	0 %	0 %	0 %	229606152
523	NC_012668	GAC	2	6	26766	26771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606153
524	NC_012668	TCA	2	6	26809	26814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606153
525	NC_012668	ATG	2	6	26850	26855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606153
526	NC_012668	ACCGTT	2	12	26863	26874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229606153
527	NC_012668	AAC	2	6	26970	26975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606153
528	NC_012668	CCA	2	6	27004	27009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606153
529	NC_012668	CAG	2	6	27143	27148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606153
530	NC_012668	TGA	2	6	27166	27171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606153
531	NC_012668	GCT	2	6	27173	27178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606153
532	NC_012668	TGA	2	6	27205	27210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606153
533	NC_012668	AGA	2	6	27275	27280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606153
534	NC_012668	GGA	2	6	27306	27311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229606153
535	NC_012668	CGC	2	6	27321	27326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606153
536	NC_012668	TGC	2	6	27337	27342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606153
537	NC_012668	CAT	2	6	27380	27385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606153
538	NC_012668	ATCAAT	2	12	27411	27422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	229606153
539	NC_012668	GAT	2	6	27423	27428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606153
540	NC_012668	CAC	2	6	27460	27465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606153
541	NC_012668	GAA	2	6	27551	27556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229606153
542	NC_012668	TGC	3	9	27574	27582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606153
543	NC_012668	GC	3	6	27581	27586	0 %	0 %	50 %	50 %	229606153
544	NC_012668	GCT	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606153
545	NC_012668	TAA	2	6	27653	27658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606153
546	NC_012668	TTGA	2	8	27810	27817	25 %	50 %	25 %	0 %	229606153
547	NC_012668	GCACA	2	10	27951	27960	40 %	0 %	20 %	40 %	229606153
548	NC_012668	CAAA	2	8	28054	28061	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_012668	TGCC	2	8	28181	28188	0 %	25 %	25 %	50 %	229606154
550	NC_012668	CTT	2	6	28217	28222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606154
551	NC_012668	CGAG	2	8	28223	28230	25 %	0 %	50 %	25 %	229606154
552	NC_012668	CGC	2	6	28236	28241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606154
553	NC_012668	GAT	2	6	28404	28409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606154
554	NC_012668	TTTG	2	8	28497	28504	0 %	75 %	25 %	0 %	229606154
555	NC_012668	CAAAT	2	10	28518	28527	60 %	20 %	0 %	20 %	229606154
556	NC_012668	CCG	2	6	28577	28582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606154
557	NC_012668	TAA	2	6	28620	28625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606154
558	NC_012668	CAC	2	6	28664	28669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_012668	GTAG	2	8	28694	28701	25 %	25 %	50 %	0 %	229606155
560	NC_012668	GGCTTG	2	12	28758	28769	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	229606155
561	NC_012668	GCG	2	6	28776	28781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606155
562	NC_012668	CATCT	2	10	28794	28803	20 %	40 %	0 %	40 %	229606155
563	NC_012668	GCC	2	6	28881	28886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606155
564	NC_012668	CA	3	6	28961	28966	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
565	NC_012668	CGC	2	6	28982	28987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606155
566	NC_012668	AC	3	6	29033	29038	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
567	NC_012668	CAA	2	6	29143	29148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229606155
568	NC_012668	CCAT	2	8	29161	29168	25 %	25 %	0 %	50 %	229606155
569	NC_012668	CGAG	2	8	29264	29271	25 %	0 %	50 %	25 %	229606155
570	NC_012668	AT	3	6	29281	29286	50 %	50 %	0 %	0 %	229606155
571	NC_012668	TTCA	2	8	29466	29473	25 %	50 %	0 %	25 %	229606155
572	NC_012668	GCA	2	6	29513	29518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
573	NC_012668	GC	3	6	29525	29530	0 %	0 %	50 %	50 %	229606155
574	NC_012668	A	6	6	29632	29637	100 %	0 %	0 %	0 %	229606155
575	NC_012668	CCAA	2	8	29682	29689	50 %	0 %	0 %	50 %	229606155
576	NC_012668	GTA	2	6	29694	29699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606155
577	NC_012668	CTT	2	6	29753	29758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606155
578	NC_012668	AAT	2	6	29820	29825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606155
579	NC_012668	ACG	2	6	29844	29849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
580	NC_012668	CGA	2	6	29892	29897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
581	NC_012668	GA	3	6	29950	29955	50 %	0 %	50 %	0 %	229606155
582	NC_012668	CAG	2	6	30018	30023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606155
583	NC_012668	TGA	2	6	30050	30055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606155
584	NC_012668	GTTT	2	8	30212	30219	0 %	75 %	25 %	0 %	229606155
585	NC_012668	CGCTT	2	10	30259	30268	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
586	NC_012668	GGT	2	6	30274	30279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012668	CGC	2	6	30290	30295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_012668	AGC	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_012668	GAT	2	6	30372	30377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
590	NC_012668	CAC	2	6	30441	30446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229606156
591	NC_012668	AAT	2	6	30447	30452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
592	NC_012668	GCC	2	6	30481	30486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606156
593	NC_012668	TGC	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
594	NC_012668	TTG	2	6	30624	30629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606156
595	NC_012668	ATG	2	6	30687	30692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
596	NC_012668	GAT	2	6	30939	30944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
597	NC_012668	GCG	2	6	30950	30955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229606156
598	NC_012668	ACT	2	6	31003	31008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229606156
599	NC_012668	CTG	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
600	NC_012668	TCAAGG	2	12	31157	31168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229606156
601	NC_012668	CAAA	2	8	31205	31212	75 %	0 %	0 %	25 %	229606156
602	NC_012668	C	6	6	31217	31222	0 %	0 %	0 %	100 %	229606156
603	NC_012668	ATA	2	6	31223	31228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
604	NC_012668	TGC	2	6	31297	31302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
605	NC_012668	AGC	2	6	31342	31347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
606	NC_012668	TTC	2	6	31384	31389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
607	NC_012668	CTT	2	6	31499	31504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
608	NC_012668	GCA	2	6	31505	31510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
609	NC_012668	CTT	2	6	31535	31540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229606156
610	NC_012668	GCGA	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	229606156
611	NC_012668	GCT	2	6	31742	31747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
612	NC_012668	T	6	6	31757	31762	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
613	NC_012668	CACTA	2	10	31836	31845	40 %	20 %	0 %	40 %	229606156
614	NC_012668	A	6	6	31956	31961	100 %	0 %	0 %	0 %	229606156
615	NC_012668	GCC	2	6	31972	31977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229606156
616	NC_012668	CT	3	6	32002	32007	0 %	50 %	0 %	50 %	229606156
617	NC_012668	GAT	2	6	32040	32045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229606156
618	NC_012668	CTG	2	6	32073	32078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
619	NC_012668	TGT	2	6	32252	32257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229606156
620	NC_012668	AGC	2	6	32338	32343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229606156
621	NC_012668	GCT	2	6	32348	32353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229606156
622	NC_012668	TAA	2	6	32372	32377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229606156
623	NC_012668	GCTG	2	8	32398	32405	0 %	25 %	50 %	25 %	229606156
624	NC_012668	GTTT	2	8	32473	32480	0 %	75 %	25 %	0 %	229606156
625	NC_012668	ATT	2	6	32514	32519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229606156
626	NC_012668	T	6	6	32642	32647	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
627	NC_012668	GC	3	6	32686	32691	0 %	0 %	50 %	50 %	229606156
628	NC_012668	T	6	6	32783	32788	0 %	100 %	0 %	0 %	229606156
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