MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012667	TGGTT	2	10	3948	3957	0 %	60 %	40 %	0 %	229605067
2	NC_012667	ATTGT	2	10	5708	5717	20 %	60 %	20 %	0 %	229605069
3	NC_012667	CGCGC	2	10	6031	6040	0 %	0 %	40 %	60 %	229605069
4	NC_012667	CAACG	2	10	7599	7608	40 %	0 %	20 %	40 %	229605070
5	NC_012667	TGCCC	2	10	8560	8569	0 %	20 %	20 %	60 %	229605071
6	NC_012667	CGATG	2	10	9027	9036	20 %	20 %	40 %	20 %	229605072
7	NC_012667	CGCAG	2	10	9919	9928	20 %	0 %	40 %	40 %	229605073
8	NC_012667	ACCAA	2	10	10412	10421	60 %	0 %	0 %	40 %	229605074
9	NC_012667	ACCAA	2	10	10440	10449	60 %	0 %	0 %	40 %	229605074
10	NC_012667	TCAAC	2	10	13612	13621	40 %	20 %	0 %	40 %	229605079
11	NC_012667	AACGC	2	10	14413	14422	40 %	0 %	20 %	40 %	229605079
12	NC_012667	GGAGC	2	10	16987	16996	20 %	0 %	60 %	20 %	229605082
13	NC_012667	CCATA	2	10	18936	18945	40 %	20 %	0 %	40 %	229605084
14	NC_012667	ATCAC	2	10	21220	21229	40 %	20 %	0 %	40 %	229605086
15	NC_012667	TCCAC	2	10	21686	21695	20 %	20 %	0 %	60 %	229605086
16	NC_012667	GATCA	2	10	24070	24079	40 %	20 %	20 %	20 %	229605089
17	NC_012667	TTTAT	2	10	26171	26180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012667	AGCCA	2	10	28247	28256	40 %	0 %	20 %	40 %	229605092
19	NC_012667	TGGTC	2	10	28824	28833	0 %	40 %	40 %	20 %	229605092
20	NC_012667	AGTGA	2	10	32837	32846	40 %	20 %	40 %	0 %	229605095
21	NC_012667	TCAAA	2	10	33781	33790	60 %	20 %	0 %	20 %	229605096
22	NC_012667	CCACC	2	10	35038	35047	20 %	0 %	0 %	80 %	229605096
23	NC_012667	CAGCT	2	10	35798	35807	20 %	20 %	20 %	40 %	229605096
24	NC_012667	TGAGT	2	10	36146	36155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012667	TAATT	2	10	36591	36600	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012667	GCAGA	2	10	38183	38192	40 %	0 %	40 %	20 %	229605097
27	NC_012667	GACAC	2	10	39033	39042	40 %	0 %	20 %	40 %	229605098
28	NC_012667	TTTAA	2	10	39629	39638	40 %	60 %	0 %	0 %	229605099
29	NC_012667	AGATG	2	10	41118	41127	40 %	20 %	40 %	0 %	229605101
30	NC_012667	AGTAC	2	10	41696	41705	40 %	20 %	20 %	20 %	229605102
31	NC_012667	CCTGC	2	10	47619	47628	0 %	20 %	20 %	60 %	229605105
32	NC_012667	ATCAA	2	10	48676	48685	60 %	20 %	0 %	20 %	229605106
33	NC_012667	AGGAA	2	10	48857	48866	60 %	0 %	40 %	0 %	229605107
34	NC_012667	CAAGC	2	10	49720	49729	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_012667	GCTTG	2	10	49735	49744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012667	TTGGT	2	10	50039	50048	0 %	60 %	40 %	0 %	229605108
37	NC_012667	GGTGT	2	10	50833	50842	0 %	40 %	60 %	0 %	229605108
38	NC_012667	ATATC	2	10	53373	53382	40 %	40 %	0 %	20 %	229605110
39	NC_012667	GAATT	2	10	58276	58285	40 %	40 %	20 %	0 %	229605114
40	NC_012667	GTGAT	2	10	64621	64630	20 %	40 %	40 %	0 %	229605119
41	NC_012667	GGTTT	2	10	66755	66764	0 %	60 %	40 %	0 %	229605121
42	NC_012667	AGCCA	2	10	68437	68446	40 %	0 %	20 %	40 %	229605124
43	NC_012667	GATGC	2	10	68910	68919	20 %	20 %	40 %	20 %	229605125
44	NC_012667	ACACT	2	10	71622	71631	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012667	GCAAA	2	10	72566	72575	60 %	0 %	20 %	20 %	229605129
46	NC_012667	CGTTT	2	10	74777	74786	0 %	60 %	20 %	20 %	229605132
47	NC_012667	GTCCT	2	10	77132	77141	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012667	TGAAC	2	10	77762	77771	40 %	20 %	20 %	20 %	229605134
49	NC_012667	TGCCG	2	10	78173	78182	0 %	20 %	40 %	40 %	229605134
50	NC_012667	AGCTC	2	10	81515	81524	20 %	20 %	20 %	40 %	229605137
51	NC_012667	CCAAT	2	10	84266	84275	40 %	20 %	0 %	40 %	229605140
52	NC_012667	GCCAT	2	10	87127	87136	20 %	20 %	20 %	40 %	229605142
53	NC_012667	GCAGC	2	10	87851	87860	20 %	0 %	40 %	40 %	229605142
54	NC_012667	AAGCG	2	10	92859	92868	40 %	0 %	40 %	20 %	229605147
55	NC_012667	AGCCA	2	10	96957	96966	40 %	0 %	20 %	40 %	229605150
56	NC_012667	TCCAT	2	10	98518	98527	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_012667	TGGAT	2	10	99255	99264	20 %	40 %	40 %	0 %	229605152
58	NC_012667	CGAAC	2	10	100139	100148	40 %	0 %	20 %	40 %	229605152
59	NC_012667	ACACC	2	10	108044	108053	40 %	0 %	0 %	60 %	229605161
60	NC_012667	CGTTT	2	10	108855	108864	0 %	60 %	20 %	20 %	229605161
61	NC_012667	GGAAA	2	10	112187	112196	60 %	0 %	40 %	0 %	229605163
62	NC_012667	CAAAC	2	10	114665	114674	60 %	0 %	0 %	40 %	229605166
63	NC_012667	CACCG	2	10	115307	115316	20 %	0 %	20 %	60 %	229605166
64	NC_012667	AGCGC	2	10	116375	116384	20 %	0 %	40 %	40 %	229605167
65	NC_012667	GGCAA	2	10	118798	118807	40 %	0 %	40 %	20 %	229605168
66	NC_012667	ATCGC	2	10	119035	119044	20 %	20 %	20 %	40 %	229605168
67	NC_012667	AAAGA	2	10	125343	125352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012667	CAAAC	2	10	125639	125648	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_012667	CAATC	2	10	126231	126240	40 %	20 %	0 %	40 %	229605174
70	NC_012667	CACGC	2	10	130459	130468	20 %	0 %	20 %	60 %	229605178
71	NC_012667	AGCTC	2	10	130953	130962	20 %	20 %	20 %	40 %	229605178
72	NC_012667	CGCGC	2	10	133936	133945	0 %	0 %	40 %	60 %	229605182
73	NC_012667	CTCCG	2	10	134154	134163	0 %	20 %	20 %	60 %	229605182
74	NC_012667	TGGCT	2	10	135339	135348	0 %	40 %	40 %	20 %	229605182
75	NC_012667	GATCA	2	10	136659	136668	40 %	20 %	20 %	20 %	229605183
76	NC_012667	TCACA	2	10	137147	137156	40 %	20 %	0 %	40 %	229605183
77	NC_012667	CGACG	2	10	138002	138011	20 %	0 %	40 %	40 %	229605184
78	NC_012667	GAAGA	2	10	140586	140595	60 %	0 %	40 %	0 %	229605184
79	NC_012667	CATCG	2	10	141176	141185	20 %	20 %	20 %	40 %	229605185
80	NC_012667	GTGCT	2	10	142308	142317	0 %	40 %	40 %	20 %	229605185
81	NC_012667	CACTG	2	10	142329	142338	20 %	20 %	20 %	40 %	229605185
82	NC_012667	CAGCT	2	10	143036	143045	20 %	20 %	20 %	40 %	229605186
83	NC_012667	AGGGT	2	10	143403	143412	20 %	20 %	60 %	0 %	229605187
84	NC_012667	GATTG	2	10	144456	144465	20 %	40 %	40 %	0 %	229605187
85	NC_012667	TCAGC	2	10	145844	145853	20 %	20 %	20 %	40 %	229605188
86	NC_012667	CAGGA	2	10	146748	146757	40 %	0 %	40 %	20 %	229605188
87	NC_012667	CATCA	2	10	152248	152257	40 %	20 %	0 %	40 %	229605193
88	NC_012667	GTACC	2	10	152558	152567	20 %	20 %	20 %	40 %	229605194
89	NC_012667	CCCCA	2	10	152934	152943	20 %	0 %	0 %	80 %	229605194
90	NC_012667	GGACG	2	10	153258	153267	20 %	0 %	60 %	20 %	229605194
91	NC_012667	AGTTC	2	10	154857	154866	20 %	40 %	20 %	20 %	229605196
92	NC_012667	TGAAA	2	10	155557	155566	60 %	20 %	20 %	0 %	229605196
93	NC_012667	TGAGT	2	10	156239	156248	20 %	40 %	40 %	0 %	229605197
94	NC_012667	ATTAA	2	10	158660	158669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012667	TGAGC	2	10	159616	159625	20 %	20 %	40 %	20 %	229605200
96	NC_012667	CATTG	2	10	160045	160054	20 %	40 %	20 %	20 %	229605200
97	NC_012667	AAAAG	2	10	160836	160845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012667	AATCC	2	10	164268	164277	40 %	20 %	0 %	40 %	229605203
99	NC_012667	TAATT	2	10	171255	171264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012667	TGGTT	2	10	172262	172271	0 %	60 %	40 %	0 %	229605210
101	NC_012667	TTGCA	2	10	172631	172640	20 %	40 %	20 %	20 %	229605210
102	NC_012667	TGGTA	2	10	174755	174764	20 %	40 %	40 %	0 %	229605213
103	NC_012667	CTTAG	2	10	176854	176863	20 %	40 %	20 %	20 %	229605216
104	NC_012667	TGTGC	2	10	180596	180605	0 %	40 %	40 %	20 %	229605219
105	NC_012667	ATGGC	2	10	186013	186022	20 %	20 %	40 %	20 %	229605223
106	NC_012667	TGATC	2	10	189710	189719	20 %	40 %	20 %	20 %	229605226
107	NC_012667	ATGAA	2	10	190492	190501	60 %	20 %	20 %	0 %	229605226
108	NC_012667	TGGGT	2	10	191044	191053	0 %	40 %	60 %	0 %	229605227
109	NC_012667	ATGCG	2	10	194612	194621	20 %	20 %	40 %	20 %	229605231
110	NC_012667	CCAAT	2	10	195744	195753	40 %	20 %	0 %	40 %	229605231
111	NC_012667	CCTGT	2	10	196543	196552	0 %	40 %	20 %	40 %	229605232
112	NC_012667	GTGCG	2	10	196666	196675	0 %	20 %	60 %	20 %	229605232
113	NC_012667	CAGCA	2	10	198124	198133	40 %	0 %	20 %	40 %	229605233
114	NC_012667	TGGTT	2	10	198509	198518	0 %	60 %	40 %	0 %	229605234
115	NC_012667	CCACA	2	10	198879	198888	40 %	0 %	0 %	60 %	229605234
116	NC_012667	TAGCG	2	10	199729	199738	20 %	20 %	40 %	20 %	229605234
117	NC_012667	GTCAA	2	10	200290	200299	40 %	20 %	20 %	20 %	229605234
118	NC_012667	TTGTC	2	10	201418	201427	0 %	60 %	20 %	20 %	229605235
119	NC_012667	CTTGC	2	10	202464	202473	0 %	40 %	20 %	40 %	229605235
120	NC_012667	CCATT	2	10	204369	204378	20 %	40 %	0 %	40 %	229605236
121	NC_012667	CAAAT	2	10	209262	209271	60 %	20 %	0 %	20 %	229605241
122	NC_012667	AAACC	2	10	209402	209411	60 %	0 %	0 %	40 %	229605241
123	NC_012667	TGTAC	2	10	211233	211242	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012667	AATTG	2	10	211471	211480	40 %	40 %	20 %	0 %	229605244
125	NC_012667	CATGG	2	10	211677	211686	20 %	20 %	40 %	20 %	229605244
126	NC_012667	CTCAG	2	10	212127	212136	20 %	20 %	20 %	40 %	229605244
127	NC_012667	ATCTA	2	10	212196	212205	40 %	40 %	0 %	20 %	229605244
128	NC_012667	CAACT	2	10	212305	212314	40 %	20 %	0 %	40 %	229605245
129	NC_012667	GCATG	2	10	215699	215708	20 %	20 %	40 %	20 %	229605247
130	NC_012667	CAAGC	2	10	215979	215988	40 %	0 %	20 %	40 %	229605247
131	NC_012667	AAACC	2	10	217699	217708	60 %	0 %	0 %	40 %	229605249
132	NC_012667	TGTTC	2	10	217728	217737	0 %	60 %	20 %	20 %	229605249
133	NC_012667	AGGTA	2	10	218313	218322	40 %	20 %	40 %	0 %	229605249
134	NC_012667	GAGAA	2	10	221618	221627	60 %	0 %	40 %	0 %	229605250
135	NC_012667	TGAAT	2	10	222605	222614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012667	AAATG	2	10	223536	223545	60 %	20 %	20 %	0 %	229605253
137	NC_012667	CTCAT	2	10	225146	225155	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_012667	TTGAA	2	10	227750	227759	40 %	40 %	20 %	0 %	229605257
139	NC_012667	GTTGT	2	10	228467	228476	0 %	60 %	40 %	0 %	229605258
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143	NC_012667	AGCTC	2	10	232080	232089	20 %	20 %	20 %	40 %	229605261
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145	NC_012667	GAGTG	2	10	233005	233014	20 %	20 %	60 %	0 %	229605261
146	NC_012667	TCATG	2	10	233569	233578	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012667	AGCTC	2	10	235258	235267	20 %	20 %	20 %	40 %	229605263
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149	NC_012667	TGAGT	2	10	236263	236272	20 %	40 %	40 %	0 %	229605264
150	NC_012667	AGCTT	2	10	236382	236391	20 %	40 %	20 %	20 %	229605264
151	NC_012667	TAAGC	2	10	236819	236828	40 %	20 %	20 %	20 %	229605264
152	NC_012667	TTTGC	2	10	237756	237765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_012667	TGCAT	2	10	238736	238745	20 %	40 %	20 %	20 %	229605266
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156	NC_012667	GTCGC	2	10	243471	243480	0 %	20 %	40 %	40 %	229605269
157	NC_012667	TCTTT	2	10	246334	246343	0 %	80 %	0 %	20 %	229605272
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162	NC_012667	CCTAA	2	10	256333	256342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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211	NC_012667	CAGGG	2	10	329355	329364	20 %	0 %	60 %	20 %	229605335
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251	NC_012667	TGCAA	2	10	377190	377199	40 %	20 %	20 %	20 %	229605380
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254	NC_012667	AGCTT	2	10	378987	378996	20 %	40 %	20 %	20 %	229605382
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