MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012667	T	6	6	184531	184536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012667	A	6	6	184548	184553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012667	GGT	2	6	184574	184579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605222
3504	NC_012667	AACA	2	8	184581	184588	75 %	0 %	0 %	25 %	229605222
3505	NC_012667	TTC	2	6	184592	184597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605222
3506	NC_012667	T	6	6	184733	184738	0 %	100 %	0 %	0 %	229605222
3507	NC_012667	A	6	6	184761	184766	100 %	0 %	0 %	0 %	229605222
3508	NC_012667	CTT	2	6	184850	184855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605222
3509	NC_012667	A	6	6	184885	184890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_012667	TC	3	6	184942	184947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_012667	ATC	2	6	184969	184974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_012667	TAAT	2	8	185002	185009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_012667	T	6	6	185082	185087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_012667	GTCA	2	8	185110	185117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3515	NC_012667	GCC	2	6	185124	185129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_012667	CAA	2	6	185258	185263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605223
3517	NC_012667	GTG	2	6	185289	185294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3518	NC_012667	ATC	2	6	185364	185369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605223
3519	NC_012667	ATT	2	6	185376	185381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605223
3520	NC_012667	TGG	2	6	185393	185398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3521	NC_012667	CCA	2	6	185491	185496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605223
3522	NC_012667	CAT	2	6	185546	185551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605223
3523	NC_012667	TCG	2	6	185575	185580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605223
3524	NC_012667	TGGG	2	8	185610	185617	0 %	25 %	75 %	0 %	229605223
3525	NC_012667	CTT	2	6	185630	185635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605223
3526	NC_012667	TCA	2	6	185666	185671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605223
3527	NC_012667	TGG	2	6	185677	185682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3528	NC_012667	CAA	2	6	185716	185721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605223
3529	NC_012667	CTG	2	6	185724	185729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605223
3530	NC_012667	TGG	3	9	185809	185817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3531	NC_012667	TGG	2	6	185836	185841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3532	NC_012667	CCG	2	6	185998	186003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605223
3533	NC_012667	ATGGC	2	10	186013	186022	20 %	20 %	40 %	20 %	229605223
3534	NC_012667	GTTG	2	8	186050	186057	0 %	50 %	50 %	0 %	229605223
3535	NC_012667	TGG	2	6	186092	186097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3536	NC_012667	TGC	2	6	186101	186106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605223
3537	NC_012667	CG	3	6	186119	186124	0 %	0 %	50 %	50 %	229605223
3538	NC_012667	GGC	2	6	186147	186152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605223
3539	NC_012667	ATT	2	6	186195	186200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605223
3540	NC_012667	TGG	2	6	186265	186270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605223
3541	NC_012667	GC	3	6	186314	186319	0 %	0 %	50 %	50 %	229605223
3542	NC_012667	CTT	3	9	186551	186559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605223
3543	NC_012667	TGC	2	6	186560	186565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605223
3544	NC_012667	GAT	2	6	186680	186685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605223
3545	NC_012667	GCA	2	6	186825	186830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605223
3546	NC_012667	AGG	2	6	186939	186944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_012667	T	6	6	186946	186951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_012667	TCT	2	6	186962	186967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_012667	CAG	2	6	186980	186985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_012667	CA	3	6	187026	187031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_012667	TCA	2	6	187061	187066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_012667	AATA	2	8	187083	187090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_012667	A	6	6	187094	187099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_012667	AATT	2	8	187124	187131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_012667	AAAT	2	8	187146	187153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_012667	GT	3	6	187261	187266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_012667	GCA	2	6	187276	187281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_012667	ATAA	2	8	187291	187298	75 %	25 %	0 %	0 %	229605224
3559	NC_012667	CCA	2	6	187325	187330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605224
3560	NC_012667	ATC	2	6	187502	187507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605224
3561	NC_012667	GTTT	2	8	187584	187591	0 %	75 %	25 %	0 %	229605224
3562	NC_012667	CTT	2	6	187596	187601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605224
3563	NC_012667	CGTG	2	8	187615	187622	0 %	25 %	50 %	25 %	229605224
3564	NC_012667	GAA	2	6	187682	187687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605224
3565	NC_012667	TGC	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605224
3566	NC_012667	GTT	2	6	187792	187797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605224
3567	NC_012667	GAA	2	6	187922	187927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605224
3568	NC_012667	AGC	2	6	187948	187953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605224
3569	NC_012667	GTG	2	6	188000	188005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605224
3570	NC_012667	TGG	2	6	188070	188075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605224
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3572	NC_012667	A	6	6	188114	188119	100 %	0 %	0 %	0 %	229605224
3573	NC_012667	GCA	2	6	188136	188141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605224
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3575	NC_012667	ACT	2	6	188560	188565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605224
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3579	NC_012667	ATC	2	6	188747	188752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_012667	TTA	2	6	188757	188762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_012667	ATC	2	6	188780	188785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_012667	ATG	2	6	188813	188818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_012667	AAT	2	6	188961	188966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605225
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3585	NC_012667	CGC	2	6	189047	189052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605225
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3588	NC_012667	TAC	2	6	189280	189285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605225
3589	NC_012667	TGGT	2	8	189328	189335	0 %	50 %	50 %	0 %	229605225
3590	NC_012667	GAA	2	6	189363	189368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605225
3591	NC_012667	TTA	2	6	189375	189380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605225
3592	NC_012667	AAG	2	6	189421	189426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605225
3593	NC_012667	CTG	2	6	189483	189488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605226
3594	NC_012667	CCTA	2	8	189640	189647	25 %	25 %	0 %	50 %	229605226
3595	NC_012667	TGATC	2	10	189710	189719	20 %	40 %	20 %	20 %	229605226
3596	NC_012667	TTC	2	6	189771	189776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605226
3597	NC_012667	GC	3	6	189789	189794	0 %	0 %	50 %	50 %	229605226
3598	NC_012667	AAC	2	6	189799	189804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605226
3599	NC_012667	TTG	2	6	189856	189861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605226
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3601	NC_012667	TGTA	2	8	189928	189935	25 %	50 %	25 %	0 %	229605226
3602	NC_012667	TTG	2	6	189987	189992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605226
3603	NC_012667	TG	3	6	190002	190007	0 %	50 %	50 %	0 %	229605226
3604	NC_012667	CCG	2	6	190124	190129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605226
3605	NC_012667	TC	4	8	190141	190148	0 %	50 %	0 %	50 %	229605226
3606	NC_012667	AAC	2	6	190242	190247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605226
3607	NC_012667	GT	3	6	190270	190275	0 %	50 %	50 %	0 %	229605226
3608	NC_012667	G	6	6	190283	190288	0 %	0 %	100 %	0 %	229605226
3609	NC_012667	CAT	2	6	190301	190306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605226
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3613	NC_012667	ATGAA	2	10	190492	190501	60 %	20 %	20 %	0 %	229605226
3614	NC_012667	A	6	6	190510	190515	100 %	0 %	0 %	0 %	229605226
3615	NC_012667	ATC	2	6	190612	190617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605227
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3617	NC_012667	AAG	2	6	190673	190678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605227
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3619	NC_012667	TGC	2	6	190709	190714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605227
3620	NC_012667	TGAG	2	8	190717	190724	25 %	25 %	50 %	0 %	229605227
3621	NC_012667	TTC	3	9	190745	190753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605227
3622	NC_012667	CATC	2	8	190815	190822	25 %	25 %	0 %	50 %	229605227
3623	NC_012667	GC	3	6	190852	190857	0 %	0 %	50 %	50 %	229605227
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3625	NC_012667	TCA	2	6	190967	190972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605227
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3991	NC_012667	CCAA	2	8	210043	210050	50 %	0 %	0 %	50 %	229605242
3992	NC_012667	ATC	2	6	210066	210071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605242
3993	NC_012667	CACG	2	8	210147	210154	25 %	0 %	25 %	50 %	229605242
3994	NC_012667	TCA	2	6	210213	210218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605242
3995	NC_012667	GCT	2	6	210266	210271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605243
3996	NC_012667	CACC	2	8	210344	210351	25 %	0 %	0 %	75 %	229605243
3997	NC_012667	AGCG	2	8	210400	210407	25 %	0 %	50 %	25 %	229605243
3998	NC_012667	CGA	2	6	210614	210619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605243
3999	NC_012667	T	7	7	210620	210626	0 %	100 %	0 %	0 %	229605243
4000	NC_012667	TCT	2	6	210724	210729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605243

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