MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012667	CTG	2	6	158020	158025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605198
3002	NC_012667	T	7	7	158036	158042	0 %	100 %	0 %	0 %	229605198
3003	NC_012667	AGA	2	6	158069	158074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605198
3004	NC_012667	TGCT	2	8	158113	158120	0 %	50 %	25 %	25 %	229605199
3005	NC_012667	CCA	2	6	158133	158138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605199
3006	NC_012667	TGC	2	6	158162	158167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605199
3007	NC_012667	ATCA	2	8	158177	158184	50 %	25 %	0 %	25 %	229605199
3008	NC_012667	GCA	2	6	158202	158207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605199
3009	NC_012667	AGC	2	6	158270	158275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605199
3010	NC_012667	CAT	2	6	158284	158289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605199
3011	NC_012667	CAT	2	6	158335	158340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605199
3012	NC_012667	CTA	2	6	158359	158364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605199
3013	NC_012667	AT	3	6	158474	158479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012667	ACA	2	6	158489	158494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_012667	TCT	2	6	158583	158588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_012667	ATTAA	2	10	158660	158669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012667	ATTA	2	8	158711	158718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012667	TTA	2	6	158727	158732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012667	TGA	2	6	158819	158824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012667	ACA	2	6	158839	158844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_012667	ATTA	2	8	158882	158889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012667	TGT	2	6	158917	158922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_012667	ACT	2	6	158945	158950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_012667	AAGT	2	8	158971	158978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012667	TCA	3	9	158979	158987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_012667	ATAA	2	8	158993	159000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012667	CAA	2	6	159067	159072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_012667	CTCA	2	8	159293	159300	25 %	25 %	0 %	50 %	229605200
3029	NC_012667	GCA	2	6	159379	159384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605200
3030	NC_012667	GCG	2	6	159410	159415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605200
3031	NC_012667	TCC	2	6	159460	159465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605200
3032	NC_012667	T	6	6	159493	159498	0 %	100 %	0 %	0 %	229605200
3033	NC_012667	CAA	2	6	159533	159538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605200
3034	NC_012667	TGAGC	2	10	159616	159625	20 %	20 %	40 %	20 %	229605200
3035	NC_012667	GCG	2	6	159628	159633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605200
3036	NC_012667	CAA	2	6	159643	159648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605200
3037	NC_012667	CAG	2	6	159668	159673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605200
3038	NC_012667	AGA	2	6	159685	159690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605200
3039	NC_012667	AGAAAA	2	12	159697	159708	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229605200
3040	NC_012667	AC	3	6	159709	159714	50 %	0 %	0 %	50 %	229605200
3041	NC_012667	GAA	2	6	159734	159739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605200
3042	NC_012667	CAA	2	6	159746	159751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605200
3043	NC_012667	GCG	2	6	159872	159877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605200
3044	NC_012667	A	6	6	159884	159889	100 %	0 %	0 %	0 %	229605200
3045	NC_012667	CATTG	2	10	160045	160054	20 %	40 %	20 %	20 %	229605200
3046	NC_012667	TGG	2	6	160064	160069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605200
3047	NC_012667	AAG	2	6	160103	160108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605200
3048	NC_012667	CTG	2	6	160263	160268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605200
3049	NC_012667	TC	3	6	160273	160278	0 %	50 %	0 %	50 %	229605200
3050	NC_012667	GTGCAT	2	12	160289	160300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229605200
3051	NC_012667	AACA	2	8	160418	160425	75 %	0 %	0 %	25 %	229605200
3052	NC_012667	TG	3	6	160524	160529	0 %	50 %	50 %	0 %	229605200
3053	NC_012667	GAT	2	6	160538	160543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605200
3054	NC_012667	GCA	2	6	160567	160572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605200
3055	NC_012667	CACT	2	8	160584	160591	25 %	25 %	0 %	50 %	229605200
3056	NC_012667	CAT	2	6	160685	160690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605200
3057	NC_012667	GTTT	2	8	160746	160753	0 %	75 %	25 %	0 %	229605200
3058	NC_012667	AAC	2	6	160764	160769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605200
3059	NC_012667	AGC	2	6	160794	160799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605200
3060	NC_012667	AAAAG	2	10	160836	160845	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_012667	TGGT	2	8	160890	160897	0 %	50 %	50 %	0 %	229605201
3062	NC_012667	CAC	2	6	160930	160935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605201
3063	NC_012667	CTT	2	6	160947	160952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605201
3064	NC_012667	AAC	2	6	160968	160973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605201
3065	NC_012667	GCA	2	6	161007	161012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605201
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3067	NC_012667	CAGC	2	8	161127	161134	25 %	0 %	25 %	50 %	229605201
3068	NC_012667	CA	3	6	161188	161193	50 %	0 %	0 %	50 %	229605201
3069	NC_012667	CGC	2	6	161234	161239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605201
3070	NC_012667	TTCC	2	8	161343	161350	0 %	50 %	0 %	50 %	229605201
3071	NC_012667	CAT	2	6	161362	161367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605201
3072	NC_012667	CAG	2	6	161413	161418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605201
3073	NC_012667	TGA	2	6	161472	161477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605201
3074	NC_012667	GAT	2	6	161554	161559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605201
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3080	NC_012667	CAT	2	6	161827	161832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605201
3081	NC_012667	CAC	2	6	161944	161949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605201
3082	NC_012667	CGC	2	6	162016	162021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605201
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3087	NC_012667	GGTCAT	2	12	162310	162321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	229605201
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3092	NC_012667	AC	3	6	162461	162466	50 %	0 %	0 %	50 %	229605201
3093	NC_012667	GGC	2	6	162550	162555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605201
3094	NC_012667	CAT	2	6	162561	162566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605201
3095	NC_012667	TTCA	2	8	162643	162650	25 %	50 %	0 %	25 %	229605201
3096	NC_012667	CTG	2	6	162652	162657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_012667	CT	3	6	162708	162713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_012667	T	6	6	162819	162824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012667	ATGG	2	8	162868	162875	25 %	25 %	50 %	0 %	229605202
3100	NC_012667	CTA	2	6	162877	162882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605202
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3102	NC_012667	TC	3	6	162963	162968	0 %	50 %	0 %	50 %	229605202
3103	NC_012667	GGC	2	6	163052	163057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605202
3104	NC_012667	CATG	2	8	163077	163084	25 %	25 %	25 %	25 %	229605202
3105	NC_012667	CTT	2	6	163117	163122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605202
3106	NC_012667	AAG	2	6	163175	163180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605202
3107	NC_012667	CAC	2	6	163233	163238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605202
3108	NC_012667	CAG	2	6	163315	163320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605202
3109	NC_012667	AAT	2	6	163342	163347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605202
3110	NC_012667	GGC	2	6	163506	163511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_012667	AGTG	2	8	163513	163520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_012667	CA	3	6	163535	163540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_012667	ATT	2	6	163739	163744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605203
3114	NC_012667	T	7	7	163743	163749	0 %	100 %	0 %	0 %	229605203
3115	NC_012667	CTC	2	6	163770	163775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605203
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3119	NC_012667	AGA	2	6	164017	164022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605203
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3121	NC_012667	CT	4	8	164052	164059	0 %	50 %	0 %	50 %	229605203
3122	NC_012667	TTG	2	6	164093	164098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605203
3123	NC_012667	GTG	2	6	164135	164140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605203
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3125	NC_012667	AATCC	2	10	164268	164277	40 %	20 %	0 %	40 %	229605203
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3245	NC_012667	TG	3	6	171162	171167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3246	NC_012667	A	6	6	171184	171189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3248	NC_012667	TAATT	2	10	171255	171264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_012667	AGTG	2	8	171352	171359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_012667	GCT	3	9	171495	171503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3259	NC_012667	TCA	2	6	171797	171802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3376	NC_012667	T	7	7	178129	178135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3495	NC_012667	ATA	2	6	184354	184359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_012667	A	6	6	184388	184393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_012667	A	6	6	184461	184466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_012667	TG	3	6	184500	184505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_012667	GCA	2	6	184509	184514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3500	NC_012667	GTT	2	6	184520	184525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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