MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012667	AG	3	6	131796	131801	50 %	0 %	50 %	0 %	229605179
2502	NC_012667	TAG	2	6	131811	131816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605179
2503	NC_012667	T	7	7	131822	131828	0 %	100 %	0 %	0 %	229605179
2504	NC_012667	A	6	6	131889	131894	100 %	0 %	0 %	0 %	229605180
2505	NC_012667	ATA	2	6	131919	131924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605180
2506	NC_012667	ATG	2	6	131983	131988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605180
2507	NC_012667	TGA	2	6	132005	132010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605180
2508	NC_012667	GCA	2	6	132081	132086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_012667	TGA	2	6	132100	132105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_012667	TGA	2	6	132113	132118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605181
2511	NC_012667	CTG	2	6	132127	132132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605181
2512	NC_012667	TACGCT	2	12	132144	132155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	229605181
2513	NC_012667	GCA	2	6	132176	132181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605181
2514	NC_012667	CAA	2	6	132267	132272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605181
2515	NC_012667	AAG	2	6	132338	132343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605181
2516	NC_012667	TG	3	6	132364	132369	0 %	50 %	50 %	0 %	229605181
2517	NC_012667	AAC	2	6	132414	132419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_012667	TTAA	2	8	132459	132466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_012667	GTA	2	6	132473	132478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012667	CATT	2	8	132488	132495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_012667	TAT	2	6	132528	132533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_012667	TA	3	6	132544	132549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_012667	CAC	2	6	132612	132617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_012667	TA	3	6	132634	132639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_012667	TGCT	2	8	132671	132678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2526	NC_012667	ATC	2	6	132685	132690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2527	NC_012667	AGA	2	6	132715	132720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_012667	ATT	2	6	132724	132729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012667	AC	3	6	132769	132774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_012667	T	6	6	132780	132785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_012667	CCA	2	6	132830	132835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_012667	TAA	2	6	132844	132849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_012667	T	6	6	132936	132941	0 %	100 %	0 %	0 %	229605182
2534	NC_012667	T	7	7	132957	132963	0 %	100 %	0 %	0 %	229605182
2535	NC_012667	CCA	2	6	132972	132977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605182
2536	NC_012667	AAT	2	6	133035	133040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605182
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2538	NC_012667	CAG	2	6	133148	133153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605182
2539	NC_012667	CAAA	2	8	133166	133173	75 %	0 %	0 %	25 %	229605182
2540	NC_012667	TAA	2	6	133223	133228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605182
2541	NC_012667	GTT	2	6	133235	133240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605182
2542	NC_012667	ACA	2	6	133285	133290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605182
2543	NC_012667	TGA	2	6	133341	133346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605182
2544	NC_012667	AT	3	6	133351	133356	50 %	50 %	0 %	0 %	229605182
2545	NC_012667	TGA	2	6	133377	133382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605182
2546	NC_012667	CCA	2	6	133408	133413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605182
2547	NC_012667	ATT	2	6	133506	133511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605182
2548	NC_012667	ACCC	2	8	133519	133526	25 %	0 %	0 %	75 %	229605182
2549	NC_012667	AGT	2	6	133552	133557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605182
2550	NC_012667	GGGT	2	8	133603	133610	0 %	25 %	75 %	0 %	229605182
2551	NC_012667	TGG	2	6	133612	133617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605182
2552	NC_012667	CTT	2	6	133724	133729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605182
2553	NC_012667	GTA	2	6	133730	133735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605182
2554	NC_012667	GAG	2	6	133818	133823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605182
2555	NC_012667	TCA	2	6	133870	133875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605182
2556	NC_012667	CAT	2	6	133902	133907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605182
2557	NC_012667	CGCGC	2	10	133936	133945	0 %	0 %	40 %	60 %	229605182
2558	NC_012667	TGC	2	6	134019	134024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605182
2559	NC_012667	CTGC	2	8	134053	134060	0 %	25 %	25 %	50 %	229605182
2560	NC_012667	GCC	2	6	134064	134069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605182
2561	NC_012667	CCA	2	6	134107	134112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605182
2562	NC_012667	CTCCG	2	10	134154	134163	0 %	20 %	20 %	60 %	229605182
2563	NC_012667	TGT	2	6	134242	134247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605182
2564	NC_012667	GCT	2	6	134268	134273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605182
2565	NC_012667	GTTG	2	8	134318	134325	0 %	50 %	50 %	0 %	229605182
2566	NC_012667	TCAA	2	8	134401	134408	50 %	25 %	0 %	25 %	229605182
2567	NC_012667	TGCA	2	8	134427	134434	25 %	25 %	25 %	25 %	229605182
2568	NC_012667	GCA	2	6	134510	134515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605182
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2570	NC_012667	TACG	2	8	134569	134576	25 %	25 %	25 %	25 %	229605182
2571	NC_012667	TGA	2	6	134582	134587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605182
2572	NC_012667	TAC	2	6	134654	134659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605182
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2574	NC_012667	ACC	2	6	134913	134918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605182
2575	NC_012667	CTT	2	6	134921	134926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605182
2576	NC_012667	AGCA	2	8	135060	135067	50 %	0 %	25 %	25 %	229605182
2577	NC_012667	GCT	2	6	135167	135172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605182
2578	NC_012667	TGCG	2	8	135193	135200	0 %	25 %	50 %	25 %	229605182
2579	NC_012667	GGT	2	6	135267	135272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605182
2580	NC_012667	TGGCT	2	10	135339	135348	0 %	40 %	40 %	20 %	229605182
2581	NC_012667	GT	3	6	135388	135393	0 %	50 %	50 %	0 %	229605182
2582	NC_012667	CTT	2	6	135428	135433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605182
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2585	NC_012667	TGC	2	6	135580	135585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605182
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2587	NC_012667	TGC	2	6	135709	135714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605182
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2591	NC_012667	CGA	2	6	135965	135970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_012667	TG	3	6	136040	136045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_012667	A	6	6	136146	136151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_012667	CTTC	2	8	136181	136188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2595	NC_012667	CAA	2	6	136200	136205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605183
2596	NC_012667	GCT	2	6	136223	136228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605183
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2598	NC_012667	AGG	2	6	136318	136323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605183
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2601	NC_012667	CTG	2	6	136632	136637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605183
2602	NC_012667	GATCA	2	10	136659	136668	40 %	20 %	20 %	20 %	229605183
2603	NC_012667	C	6	6	136801	136806	0 %	0 %	0 %	100 %	229605183
2604	NC_012667	AAC	2	6	136843	136848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605183
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2607	NC_012667	TCACA	2	10	137147	137156	40 %	20 %	0 %	40 %	229605183
2608	NC_012667	TTGG	2	8	137163	137170	0 %	50 %	50 %	0 %	229605183
2609	NC_012667	TCA	2	6	137183	137188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605183
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2611	NC_012667	GTT	2	6	137288	137293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605183
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2619	NC_012667	GCTT	2	8	137946	137953	0 %	50 %	25 %	25 %	229605184
2620	NC_012667	CTT	2	6	137968	137973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605184
2621	NC_012667	CGACG	2	10	138002	138011	20 %	0 %	40 %	40 %	229605184
2622	NC_012667	TCA	2	6	138021	138026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605184
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2625	NC_012667	TCC	2	6	138177	138182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605184
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2753	NC_012667	GATTG	2	10	144456	144465	20 %	40 %	40 %	0 %	229605187
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2814	NC_012667	ATA	2	6	147222	147227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605188
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2864	NC_012667	TCAC	2	8	150405	150412	25 %	25 %	0 %	50 %	229605192
2865	NC_012667	TTG	2	6	150413	150418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605192
2866	NC_012667	CA	3	6	150440	150445	50 %	0 %	0 %	50 %	229605192
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2994	NC_012667	AAT	2	6	157629	157634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605198
2995	NC_012667	TCAA	2	8	157715	157722	50 %	25 %	0 %	25 %	229605198
2996	NC_012667	TAA	2	6	157730	157735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605198
2997	NC_012667	TTG	2	6	157738	157743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605198
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