MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012667	ACC	2	6	685480	685485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605656
13002	NC_012667	TAC	2	6	685530	685535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605656
13003	NC_012667	A	6	6	685673	685678	100 %	0 %	0 %	0 %	229605656
13004	NC_012667	CCA	2	6	685700	685705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605656
13005	NC_012667	TC	5	10	685785	685794	0 %	50 %	0 %	50 %	229605656
13006	NC_012667	TGCCA	2	10	685813	685822	20 %	20 %	20 %	40 %	229605656
13007	NC_012667	GCAAAG	2	12	685823	685834	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	229605656
13008	NC_012667	ATT	2	6	685849	685854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605656
13009	NC_012667	GAT	2	6	685906	685911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605656
13010	NC_012667	GAT	2	6	685930	685935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605656
13011	NC_012667	GCG	2	6	685953	685958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605656
13012	NC_012667	AACGGC	2	12	686011	686022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605656
13013	NC_012667	ATG	2	6	686048	686053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605656
13014	NC_012667	GTT	2	6	686062	686067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605656
13015	NC_012667	AAT	2	6	686087	686092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_012667	GA	3	6	686101	686106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_012667	ATA	2	6	686217	686222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605657
13018	NC_012667	ACGGCA	2	12	686241	686252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605657
13019	NC_012667	CACT	2	8	686319	686326	25 %	25 %	0 %	50 %	229605657
13020	NC_012667	CAG	2	6	686389	686394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605657
13021	NC_012667	CAC	2	6	686429	686434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605657
13022	NC_012667	ATGG	2	8	686463	686470	25 %	25 %	50 %	0 %	229605657
13023	NC_012667	GAGT	2	8	686496	686503	25 %	25 %	50 %	0 %	229605657
13024	NC_012667	C	7	7	686508	686514	0 %	0 %	0 %	100 %	229605657
13025	NC_012667	A	7	7	686591	686597	100 %	0 %	0 %	0 %	229605657
13026	NC_012667	CAAC	2	8	686617	686624	50 %	0 %	0 %	50 %	229605657
13027	NC_012667	TTGG	2	8	686698	686705	0 %	50 %	50 %	0 %	229605658
13028	NC_012667	TTG	2	6	686814	686819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605658
13029	NC_012667	TGC	2	6	686883	686888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605658
13030	NC_012667	AGT	2	6	686938	686943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605658
13031	NC_012667	AGG	2	6	687036	687041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_012667	TCAG	2	8	687055	687062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_012667	A	6	6	687074	687079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_012667	GCA	2	6	687176	687181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605659
13035	NC_012667	CCA	2	6	687237	687242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605659
13036	NC_012667	TGAGT	2	10	687256	687265	20 %	40 %	40 %	0 %	229605659
13037	NC_012667	CCA	2	6	687297	687302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605659
13038	NC_012667	A	7	7	687334	687340	100 %	0 %	0 %	0 %	229605659
13039	NC_012667	AAT	2	6	687442	687447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605659
13040	NC_012667	TA	3	6	687517	687522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_012667	GGC	2	6	687673	687678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_012667	AGT	2	6	687711	687716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_012667	ATAC	2	8	687747	687754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_012667	GTC	2	6	687863	687868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605661
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13046	NC_012667	T	7	7	688132	688138	0 %	100 %	0 %	0 %	229605661
13047	NC_012667	CGAC	2	8	688221	688228	25 %	0 %	25 %	50 %	229605661
13048	NC_012667	TG	3	6	688232	688237	0 %	50 %	50 %	0 %	229605661
13049	NC_012667	CAG	2	6	688382	688387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605661
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13051	NC_012667	AGA	3	9	688537	688545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605662
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13053	NC_012667	CA	3	6	688592	688597	50 %	0 %	0 %	50 %	229605662
13054	NC_012667	GCA	2	6	688608	688613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605662
13055	NC_012667	GTG	2	6	688784	688789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605662
13056	NC_012667	GCA	2	6	688845	688850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605662
13057	NC_012667	T	7	7	688917	688923	0 %	100 %	0 %	0 %	229605662
13058	NC_012667	CGGA	2	8	689019	689026	25 %	0 %	50 %	25 %	229605663
13059	NC_012667	TC	3	6	689050	689055	0 %	50 %	0 %	50 %	229605663
13060	NC_012667	G	6	6	689064	689069	0 %	0 %	100 %	0 %	229605663
13061	NC_012667	TTG	2	6	689092	689097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605663
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13063	NC_012667	CGG	2	6	689127	689132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605663
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13069	NC_012667	TGC	2	6	689750	689755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605663
13070	NC_012667	GTTGAG	2	12	689800	689811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229605663
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13072	NC_012667	CCG	2	6	689895	689900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605663
13073	NC_012667	AG	3	6	689917	689922	50 %	0 %	50 %	0 %	229605663
13074	NC_012667	AGA	2	6	690033	690038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13076	NC_012667	TC	3	6	690132	690137	0 %	50 %	0 %	50 %	229605664
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13082	NC_012667	TGAT	2	8	690425	690432	25 %	50 %	25 %	0 %	229605664
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13087	NC_012667	CAAA	2	8	690846	690853	75 %	0 %	0 %	25 %	229605664
13088	NC_012667	TGC	2	6	690863	690868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605664
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13092	NC_012667	CT	3	6	691042	691047	0 %	50 %	0 %	50 %	229605664
13093	NC_012667	TGTGG	2	10	691107	691116	0 %	40 %	60 %	0 %	229605664
13094	NC_012667	AC	3	6	691164	691169	50 %	0 %	0 %	50 %	229605664
13095	NC_012667	CGC	2	6	691170	691175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605664
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13103	NC_012667	TCAA	2	8	691406	691413	50 %	25 %	0 %	25 %	229605664
13104	NC_012667	GC	3	6	691435	691440	0 %	0 %	50 %	50 %	229605664
13105	NC_012667	CTT	2	6	691476	691481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605664
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13109	NC_012667	ACG	2	6	691628	691633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605664
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13111	NC_012667	TGA	2	6	691773	691778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605664
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13114	NC_012667	AGA	2	6	691929	691934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605664
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13234	NC_012667	CAGCC	2	10	698181	698190	20 %	0 %	20 %	60 %	229605668
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13364	NC_012667	TTGG	2	8	704266	704273	0 %	50 %	50 %	0 %	229605672
13365	NC_012667	TGA	2	6	704349	704354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605672
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13485	NC_012667	TGGTG	2	10	710431	710440	0 %	40 %	60 %	0 %	229605674
13486	NC_012667	GT	3	6	710488	710493	0 %	50 %	50 %	0 %	229605674
13487	NC_012667	CTGA	2	8	710521	710528	25 %	25 %	25 %	25 %	229605674
13488	NC_012667	GCT	2	6	710560	710565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605674
13489	NC_012667	AGC	2	6	710590	710595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605674
13490	NC_012667	CAA	2	6	710637	710642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605674
13491	NC_012667	GTTTGT	2	12	710772	710783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13493	NC_012667	GAT	2	6	710841	710846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13494	NC_012667	CATT	2	8	710875	710882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13496	NC_012667	GAT	2	6	710911	710916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_012667	GCA	2	6	710928	710933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_012667	A	6	6	710953	710958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_012667	AGA	2	6	710969	710974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_012667	TCG	2	6	711028	711033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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