MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012667	GCG	2	6	26070	26075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012667	CAC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_012667	ATT	2	6	26161	26166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_012667	TTTAT	2	10	26171	26180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012667	AT	3	6	26206	26211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012667	ATT	2	6	26235	26240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012667	TTTA	2	8	26258	26265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012667	CTAA	2	8	26272	26279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_012667	TTA	2	6	26348	26353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012667	TGA	2	6	26368	26373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012667	AAT	2	6	26420	26425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012667	GCCA	2	8	26447	26454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_012667	TTA	2	6	26534	26539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605091
514	NC_012667	ATG	2	6	26559	26564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605091
515	NC_012667	TAGT	2	8	26571	26578	25 %	50 %	25 %	0 %	229605091
516	NC_012667	TTGA	2	8	26582	26589	25 %	50 %	25 %	0 %	229605091
517	NC_012667	AGC	2	6	26622	26627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605091
518	NC_012667	TAA	3	9	26665	26673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605091
519	NC_012667	A	7	7	26861	26867	100 %	0 %	0 %	0 %	229605092
520	NC_012667	GCC	2	6	26879	26884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605092
521	NC_012667	T	6	6	26893	26898	0 %	100 %	0 %	0 %	229605092
522	NC_012667	CAG	2	6	26899	26904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
523	NC_012667	GTG	2	6	26939	26944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605092
524	NC_012667	AATT	2	8	26955	26962	50 %	50 %	0 %	0 %	229605092
525	NC_012667	GGA	2	6	27040	27045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605092
526	NC_012667	AGC	2	6	27099	27104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
527	NC_012667	GAT	2	6	27236	27241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
528	NC_012667	AGC	2	6	27415	27420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
529	NC_012667	A	6	6	27439	27444	100 %	0 %	0 %	0 %	229605092
530	NC_012667	TTA	2	6	27451	27456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605092
531	NC_012667	CAA	2	6	27478	27483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605092
532	NC_012667	GC	3	6	27530	27535	0 %	0 %	50 %	50 %	229605092
533	NC_012667	AACGGT	2	12	27587	27598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229605092
534	NC_012667	TGA	2	6	27633	27638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
535	NC_012667	GAA	2	6	27659	27664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605092
536	NC_012667	GT	3	6	27675	27680	0 %	50 %	50 %	0 %	229605092
537	NC_012667	GT	3	6	27827	27832	0 %	50 %	50 %	0 %	229605092
538	NC_012667	GGGC	2	8	27939	27946	0 %	0 %	75 %	25 %	229605092
539	NC_012667	AGC	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
540	NC_012667	CG	3	6	28068	28073	0 %	0 %	50 %	50 %	229605092
541	NC_012667	GAT	2	6	28199	28204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
542	NC_012667	CAG	2	6	28239	28244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
543	NC_012667	AGCCA	2	10	28247	28256	40 %	0 %	20 %	40 %	229605092
544	NC_012667	CG	3	6	28303	28308	0 %	0 %	50 %	50 %	229605092
545	NC_012667	ACG	2	6	28346	28351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605092
546	NC_012667	GAT	2	6	28355	28360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
547	NC_012667	TC	3	6	28429	28434	0 %	50 %	0 %	50 %	229605092
548	NC_012667	TGC	2	6	28638	28643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605092
549	NC_012667	GGCT	2	8	28787	28794	0 %	25 %	50 %	25 %	229605092
550	NC_012667	TGGTC	2	10	28824	28833	0 %	40 %	40 %	20 %	229605092
551	NC_012667	GTT	2	6	29084	29089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605092
552	NC_012667	CAC	2	6	29104	29109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605092
553	NC_012667	CT	3	6	29156	29161	0 %	50 %	0 %	50 %	229605092
554	NC_012667	AGT	2	6	29180	29185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
555	NC_012667	GCAG	2	8	29276	29283	25 %	0 %	50 %	25 %	229605092
556	NC_012667	GCGATA	2	12	29319	29330	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	229605092
557	NC_012667	TCA	2	6	29332	29337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605092
558	NC_012667	AC	3	6	29355	29360	50 %	0 %	0 %	50 %	229605092
559	NC_012667	ATG	2	6	29535	29540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605092
560	NC_012667	GATG	2	8	29554	29561	25 %	25 %	50 %	0 %	229605092
561	NC_012667	CAC	2	6	29575	29580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605092
562	NC_012667	TTC	2	6	29606	29611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_012667	T	6	6	29650	29655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012667	CGC	2	6	29721	29726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605093
565	NC_012667	TGC	2	6	29745	29750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
566	NC_012667	CTG	2	6	29759	29764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
567	NC_012667	TGC	2	6	29775	29780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
568	NC_012667	ATA	2	6	29828	29833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605093
569	NC_012667	CTG	2	6	29843	29848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
570	NC_012667	ATC	2	6	29867	29872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605093
571	NC_012667	CACC	2	8	29902	29909	25 %	0 %	0 %	75 %	229605093
572	NC_012667	TGC	2	6	29934	29939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
573	NC_012667	TGC	2	6	30135	30140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
574	NC_012667	CAG	2	6	30142	30147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605093
575	NC_012667	CCA	2	6	30191	30196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605093
576	NC_012667	C	6	6	30212	30217	0 %	0 %	0 %	100 %	229605093
577	NC_012667	CGC	2	6	30248	30253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605093
578	NC_012667	TGC	2	6	30330	30335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605093
579	NC_012667	GA	3	6	30369	30374	50 %	0 %	50 %	0 %	229605093
580	NC_012667	CG	3	6	30391	30396	0 %	0 %	50 %	50 %	229605093
581	NC_012667	T	7	7	30526	30532	0 %	100 %	0 %	0 %	229605093
582	NC_012667	TCA	2	6	30666	30671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605094
583	NC_012667	CAT	2	6	30715	30720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605094
584	NC_012667	AGT	2	6	30808	30813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605094
585	NC_012667	ATA	2	6	30875	30880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605094
586	NC_012667	GGT	2	6	30905	30910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605094
587	NC_012667	GCC	2	6	30915	30920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605094
588	NC_012667	AG	3	6	30959	30964	50 %	0 %	50 %	0 %	229605094
589	NC_012667	ATCA	2	8	30968	30975	50 %	25 %	0 %	25 %	229605094
590	NC_012667	CCA	2	6	30979	30984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
591	NC_012667	CTCA	2	8	31013	31020	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
592	NC_012667	CAC	2	6	31039	31044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
593	NC_012667	TGG	2	6	31138	31143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605094
594	NC_012667	CCA	2	6	31146	31151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605094
595	NC_012667	T	6	6	31175	31180	0 %	100 %	0 %	0 %	229605094
596	NC_012667	ATCC	2	8	31322	31329	25 %	25 %	0 %	50 %	229605094
597	NC_012667	TTG	2	6	31397	31402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605094
598	NC_012667	GAA	2	6	31440	31445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605094
599	NC_012667	GA	3	6	31452	31457	50 %	0 %	50 %	0 %	229605094
600	NC_012667	TTAA	2	8	31593	31600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012667	AGA	2	6	31604	31609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012667	TAA	2	6	31664	31669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012667	A	6	6	31721	31726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012667	A	6	6	31740	31745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012667	TCA	2	6	31788	31793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_012667	TGCT	2	8	31808	31815	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_012667	CCA	2	6	31848	31853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
608	NC_012667	AG	3	6	31870	31875	50 %	0 %	50 %	0 %	229605095
609	NC_012667	GTC	2	6	31931	31936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
610	NC_012667	GTTG	2	8	31938	31945	0 %	50 %	50 %	0 %	229605095
611	NC_012667	CCA	2	6	31974	31979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
612	NC_012667	GA	3	6	32059	32064	50 %	0 %	50 %	0 %	229605095
613	NC_012667	ACC	2	6	32090	32095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
614	NC_012667	GCGA	2	8	32106	32113	25 %	0 %	50 %	25 %	229605095
615	NC_012667	CCA	2	6	32229	32234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605095
616	NC_012667	TGA	2	6	32368	32373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605095
617	NC_012667	T	6	6	32443	32448	0 %	100 %	0 %	0 %	229605095
618	NC_012667	GCTT	2	8	32471	32478	0 %	50 %	25 %	25 %	229605095
619	NC_012667	GC	4	8	32604	32611	0 %	0 %	50 %	50 %	229605095
620	NC_012667	AC	3	6	32616	32621	50 %	0 %	0 %	50 %	229605095
621	NC_012667	TCG	2	6	32631	32636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
622	NC_012667	CTT	2	6	32661	32666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605095
623	NC_012667	CA	3	6	32718	32723	50 %	0 %	0 %	50 %	229605095
624	NC_012667	CGC	3	9	32770	32778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605095
625	NC_012667	AGTGA	2	10	32837	32846	40 %	20 %	40 %	0 %	229605095
626	NC_012667	TGAA	2	8	32847	32854	50 %	25 %	25 %	0 %	229605095
627	NC_012667	CTG	2	6	32865	32870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
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629	NC_012667	TGC	2	6	32942	32947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605095
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