MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012667	A	6	6	289563	289568	100 %	0 %	0 %	0 %	229605303
5502	NC_012667	CCA	2	6	289658	289663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605303
5503	NC_012667	TGC	2	6	289676	289681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605303
5504	NC_012667	GGC	2	6	289826	289831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605303
5505	NC_012667	CGC	2	6	289864	289869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605303
5506	NC_012667	CAG	2	6	289874	289879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605303
5507	NC_012667	CAG	2	6	289913	289918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605303
5508	NC_012667	ACAA	2	8	290047	290054	75 %	0 %	0 %	25 %	229605304
5509	NC_012667	ATC	2	6	290158	290163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605304
5510	NC_012667	CTA	2	6	290174	290179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605304
5511	NC_012667	CG	3	6	290278	290283	0 %	0 %	50 %	50 %	229605304
5512	NC_012667	GCAG	2	8	290374	290381	25 %	0 %	50 %	25 %	229605304
5513	NC_012667	ATGA	2	8	290637	290644	50 %	25 %	25 %	0 %	229605304
5514	NC_012667	CTG	2	6	290653	290658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605304
5515	NC_012667	GCAC	2	8	290746	290753	25 %	0 %	25 %	50 %	229605304
5516	NC_012667	GCG	2	6	290761	290766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605304
5517	NC_012667	CATAGC	2	12	290783	290794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229605304
5518	NC_012667	CTG	2	6	290798	290803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605304
5519	NC_012667	TAA	2	6	291008	291013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605305
5520	NC_012667	GGC	2	6	291061	291066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605305
5521	NC_012667	CAGC	2	8	291108	291115	25 %	0 %	25 %	50 %	229605305
5522	NC_012667	TGA	2	6	291133	291138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605305
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5524	NC_012667	CAT	2	6	291255	291260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605305
5525	NC_012667	ATCG	2	8	291289	291296	25 %	25 %	25 %	25 %	229605305
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5530	NC_012667	AGCA	2	8	291991	291998	50 %	0 %	25 %	25 %	229605305
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5533	NC_012667	CGC	3	9	292123	292131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605305
5534	NC_012667	CAT	2	6	292200	292205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605305
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5536	NC_012667	CCT	2	6	292400	292405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605305
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5538	NC_012667	T	7	7	292431	292437	0 %	100 %	0 %	0 %	229605305
5539	NC_012667	TTAA	2	8	292451	292458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012667	TAACA	2	10	292466	292475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5541	NC_012667	ATTA	2	8	292476	292483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_012667	A	6	6	292524	292529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_012667	GCAG	2	8	292575	292582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_012667	ACG	2	6	292588	292593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_012667	GA	3	6	292602	292607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_012667	TGC	2	6	292614	292619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_012667	CCT	2	6	292639	292644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_012667	TTCAT	2	10	292681	292690	20 %	60 %	0 %	20 %	229605306
5549	NC_012667	TGAA	2	8	292720	292727	50 %	25 %	25 %	0 %	229605306
5550	NC_012667	AGC	3	9	292759	292767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605306
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5553	NC_012667	TTAT	2	8	292860	292867	25 %	75 %	0 %	0 %	229605306
5554	NC_012667	GCACA	2	10	292872	292881	40 %	0 %	20 %	40 %	229605306
5555	NC_012667	GCA	2	6	292886	292891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605306
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5557	NC_012667	GAT	2	6	293011	293016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605307
5558	NC_012667	TTCGA	2	10	293022	293031	20 %	40 %	20 %	20 %	229605307
5559	NC_012667	TCA	2	6	293132	293137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605307
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5562	NC_012667	A	8	8	293252	293259	100 %	0 %	0 %	0 %	229605307
5563	NC_012667	AAC	2	6	293414	293419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605308
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5571	NC_012667	GCT	2	6	294501	294506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605308
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5726	NC_012667	CAA	2	6	302126	302131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605315
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5732	NC_012667	GA	3	6	302645	302650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5733	NC_012667	CA	3	6	302729	302734	50 %	0 %	0 %	50 %	229605317
5734	NC_012667	GCA	2	6	302754	302759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605317
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5741	NC_012667	CGG	2	6	303231	303236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605317
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5990	NC_012667	TCA	2	6	316011	316016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605325
5991	NC_012667	T	6	6	316021	316026	0 %	100 %	0 %	0 %	229605325
5992	NC_012667	GGTT	2	8	316042	316049	0 %	50 %	50 %	0 %	229605325
5993	NC_012667	CTG	2	6	316085	316090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605325
5994	NC_012667	AGA	2	6	316211	316216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605325
5995	NC_012667	CTT	2	6	316222	316227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605325
5996	NC_012667	TGC	2	6	316241	316246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605325
5997	NC_012667	TAA	3	9	316268	316276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_012667	TGG	2	6	316297	316302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_012667	TTTG	2	8	316466	316473	0 %	75 %	25 %	0 %	229605326
6000	NC_012667	CTT	2	6	316540	316545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229605327

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