MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae MJ-1236 chromosome 2

Total Repeats: 20582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012667	TTG	2	6	236895	236900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605265
4502	NC_012667	TCA	2	6	236959	236964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605265
4503	NC_012667	GAC	2	6	237025	237030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605265
4504	NC_012667	T	6	6	237034	237039	0 %	100 %	0 %	0 %	229605265
4505	NC_012667	AGC	2	6	237107	237112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605265
4506	NC_012667	GAC	2	6	237283	237288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605265
4507	NC_012667	TCA	2	6	237340	237345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605265
4508	NC_012667	GCA	2	6	237346	237351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605265
4509	NC_012667	GAT	2	6	237365	237370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605265
4510	NC_012667	CT	3	6	237390	237395	0 %	50 %	0 %	50 %	229605265
4511	NC_012667	TCAA	2	8	237396	237403	50 %	25 %	0 %	25 %	229605265
4512	NC_012667	CAG	2	6	237416	237421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605265
4513	NC_012667	GTT	2	6	237460	237465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605265
4514	NC_012667	TG	3	6	237571	237576	0 %	50 %	50 %	0 %	229605265
4515	NC_012667	TGG	2	6	237592	237597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_012667	AGA	2	6	237635	237640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_012667	TGAG	2	8	237662	237669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_012667	GA	4	8	237673	237680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_012667	TTTGC	2	10	237756	237765	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4520	NC_012667	GTC	2	6	237790	237795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_012667	CCA	2	6	237802	237807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_012667	ACG	2	6	237828	237833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_012667	CT	3	6	237884	237889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_012667	AAC	2	6	237948	237953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605266
4525	NC_012667	C	6	6	237978	237983	0 %	0 %	0 %	100 %	229605266
4526	NC_012667	CCA	2	6	238018	238023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605266
4527	NC_012667	CAC	2	6	238110	238115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605266
4528	NC_012667	TCAC	2	8	238175	238182	25 %	25 %	0 %	50 %	229605266
4529	NC_012667	ACC	2	6	238334	238339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605266
4530	NC_012667	GTG	2	6	238406	238411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605266
4531	NC_012667	ACC	2	6	238430	238435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605266
4532	NC_012667	TGT	2	6	238461	238466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605266
4533	NC_012667	CAG	2	6	238560	238565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605266
4534	NC_012667	CGG	2	6	238641	238646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605266
4535	NC_012667	TGCAT	2	10	238736	238745	20 %	40 %	20 %	20 %	229605266
4536	NC_012667	TACG	2	8	238806	238813	25 %	25 %	25 %	25 %	229605266
4537	NC_012667	ATC	3	9	238840	238848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605266
4538	NC_012667	GTA	2	6	238868	238873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605266
4539	NC_012667	CATA	2	8	239103	239110	50 %	25 %	0 %	25 %	229605266
4540	NC_012667	AGC	2	6	239153	239158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605266
4541	NC_012667	TGG	2	6	239276	239281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605266
4542	NC_012667	GCC	2	6	239299	239304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605266
4543	NC_012667	TCA	2	6	239441	239446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605266
4544	NC_012667	GC	3	6	239453	239458	0 %	0 %	50 %	50 %	229605266
4545	NC_012667	CCG	3	9	239525	239533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605266
4546	NC_012667	CGCTT	2	10	239618	239627	0 %	40 %	20 %	40 %	229605266
4547	NC_012667	GAA	2	6	239641	239646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605266
4548	NC_012667	AG	3	6	239653	239658	50 %	0 %	50 %	0 %	229605266
4549	NC_012667	CGAT	2	8	239670	239677	25 %	25 %	25 %	25 %	229605266
4550	NC_012667	GAT	2	6	239680	239685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605266
4551	NC_012667	T	7	7	239703	239709	0 %	100 %	0 %	0 %	229605266
4552	NC_012667	TGA	2	6	239756	239761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605266
4553	NC_012667	AGC	2	6	239788	239793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605266
4554	NC_012667	CAA	2	6	239988	239993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605266
4555	NC_012667	GGT	2	6	240343	240348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605266
4556	NC_012667	TGC	2	6	240421	240426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605266
4557	NC_012667	GCG	2	6	240461	240466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605266
4558	NC_012667	TC	4	8	240493	240500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_012667	AG	3	6	240577	240582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_012667	T	6	6	240585	240590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_012667	A	8	8	240598	240605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_012667	GAG	2	6	240651	240656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_012667	ACAAA	2	10	240700	240709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4564	NC_012667	GATT	2	8	240721	240728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_012667	AGC	2	6	240750	240755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_012667	TTGC	2	8	240945	240952	0 %	50 %	25 %	25 %	229605267
4567	NC_012667	TGC	2	6	240962	240967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605267
4568	NC_012667	GGC	2	6	241050	241055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605267
4569	NC_012667	T	6	6	241056	241061	0 %	100 %	0 %	0 %	229605267
4570	NC_012667	CAT	3	9	241148	241156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605267
4571	NC_012667	GTG	2	6	241167	241172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605267
4572	NC_012667	CCAA	2	8	241192	241199	50 %	0 %	0 %	50 %	229605267
4573	NC_012667	CTC	2	6	241234	241239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229605267
4574	NC_012667	ACT	2	6	241274	241279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605267
4575	NC_012667	CAA	2	6	241284	241289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605267
4576	NC_012667	AAG	2	6	241327	241332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605267
4577	NC_012667	ATA	2	6	241375	241380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229605267
4578	NC_012667	GGC	2	6	241394	241399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605267
4579	NC_012667	GAA	2	6	241473	241478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605267
4580	NC_012667	TGC	2	6	241480	241485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605267
4581	NC_012667	CAA	2	6	241545	241550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229605267
4582	NC_012667	CTG	2	6	241565	241570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_012667	T	6	6	241623	241628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012667	CAT	2	6	241721	241726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605268
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4586	NC_012667	GCA	2	6	241786	241791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605268
4587	NC_012667	AGG	2	6	241801	241806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605268
4588	NC_012667	CCGCAA	2	12	241807	241818	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	229605268
4589	NC_012667	CAG	2	6	241883	241888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605268
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4591	NC_012667	CAC	2	6	241955	241960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605268
4592	NC_012667	CCA	3	9	242052	242060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605268
4593	NC_012667	CAG	2	6	242063	242068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605268
4594	NC_012667	CCA	2	6	242152	242157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605268
4595	NC_012667	ACC	2	6	242177	242182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605268
4596	NC_012667	CAT	3	9	242354	242362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605268
4597	NC_012667	CAGT	2	8	242388	242395	25 %	25 %	25 %	25 %	229605268
4598	NC_012667	GCC	2	6	242415	242420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229605268
4599	NC_012667	GGA	2	6	242433	242438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229605268
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4601	NC_012667	AACA	2	8	242495	242502	75 %	0 %	0 %	25 %	229605268
4602	NC_012667	TGC	2	6	242509	242514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605268
4603	NC_012667	GTT	2	6	242515	242520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229605268
4604	NC_012667	CAT	2	6	242564	242569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605268
4605	NC_012667	GGC	2	6	242570	242575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229605268
4606	NC_012667	AGC	2	6	242604	242609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605268
4607	NC_012667	GCT	2	6	242712	242717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605268
4608	NC_012667	ACC	2	6	242729	242734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605268
4609	NC_012667	A	7	7	242799	242805	100 %	0 %	0 %	0 %	229605268
4610	NC_012667	TGG	2	6	243004	243009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229605268
4611	NC_012667	ATT	3	9	243036	243044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229605268
4612	NC_012667	TTG	2	6	243178	243183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_012667	GAA	2	6	243310	243315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229605269
4614	NC_012667	GACA	2	8	243353	243360	50 %	0 %	25 %	25 %	229605269
4615	NC_012667	CCA	2	6	243385	243390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229605269
4616	NC_012667	GTCGC	2	10	243471	243480	0 %	20 %	40 %	40 %	229605269
4617	NC_012667	T	7	7	243514	243520	0 %	100 %	0 %	0 %	229605269
4618	NC_012667	T	6	6	243597	243602	0 %	100 %	0 %	0 %	229605269
4619	NC_012667	CT	3	6	243610	243615	0 %	50 %	0 %	50 %	229605269
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4751	NC_012667	CTG	2	6	250402	250407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605274
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4993	NC_012667	GTGAA	2	10	263318	263327	40 %	20 %	40 %	0 %	229605280
4994	NC_012667	ATG	2	6	263362	263367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229605280
4995	NC_012667	CAG	2	6	263368	263373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605280
4996	NC_012667	ACT	2	6	263424	263429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229605280
4997	NC_012667	TTGA	2	8	263503	263510	25 %	50 %	25 %	0 %	229605280
4998	NC_012667	AGC	2	6	263513	263518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229605280
4999	NC_012667	TGC	2	6	263549	263554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229605280
5000	NC_012667	CG	3	6	263560	263565	0 %	0 %	50 %	50 %	229605280

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