MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012583	GTG	2	6	184510	184515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_012583	ATT	2	6	184546	184551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_012583	A	6	6	184586	184591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012583	TAA	2	6	184600	184605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_012583	CATT	2	8	184615	184622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3506	NC_012583	T	6	6	184621	184626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_012583	GGT	2	6	184796	184801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119344
3508	NC_012583	TCG	2	6	184942	184947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119344
3509	NC_012583	TTG	2	6	185007	185012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119344
3510	NC_012583	TTG	2	6	185156	185161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119344
3511	NC_012583	T	6	6	185165	185170	0 %	100 %	0 %	0 %	227119344
3512	NC_012583	CAG	2	6	185179	185184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119344
3513	NC_012583	AGAGA	2	10	185274	185283	60 %	0 %	40 %	0 %	227119344
3514	NC_012583	AATTG	2	10	185304	185313	40 %	40 %	20 %	0 %	227119344
3515	NC_012583	CCA	2	6	185332	185337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119344
3516	NC_012583	TGT	2	6	185403	185408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119344
3517	NC_012583	AAG	2	6	185412	185417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119344
3518	NC_012583	GGC	2	6	185462	185467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119344
3519	NC_012583	TCC	2	6	185494	185499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119344
3520	NC_012583	GAC	2	6	185520	185525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119344
3521	NC_012583	CCA	2	6	185554	185559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119344
3522	NC_012583	CCT	2	6	185630	185635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_012583	GGT	2	6	185656	185661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119345
3524	NC_012583	GCTGC	2	10	185676	185685	0 %	20 %	40 %	40 %	227119345
3525	NC_012583	CTG	2	6	185694	185699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3526	NC_012583	TCCG	2	8	185749	185756	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3527	NC_012583	CTC	2	6	185808	185813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119345
3528	NC_012583	TTG	2	6	185877	185882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119345
3529	NC_012583	CCAAG	2	10	185988	185997	40 %	0 %	20 %	40 %	227119345
3530	NC_012583	CAG	2	6	186015	186020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3531	NC_012583	CAG	2	6	186027	186032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3532	NC_012583	AT	3	6	186037	186042	50 %	50 %	0 %	0 %	227119345
3533	NC_012583	CGA	2	6	186059	186064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3534	NC_012583	CTG	2	6	186066	186071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3535	NC_012583	GGCT	2	8	186088	186095	0 %	25 %	50 %	25 %	227119345
3536	NC_012583	TTC	2	6	186117	186122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119345
3537	NC_012583	TGCC	2	8	186146	186153	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3538	NC_012583	CCA	2	6	186189	186194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119345
3539	NC_012583	CCTG	2	8	186226	186233	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3540	NC_012583	CTTG	2	8	186248	186255	0 %	50 %	25 %	25 %	227119345
3541	NC_012583	CT	3	6	186322	186327	0 %	50 %	0 %	50 %	227119345
3542	NC_012583	GGATGT	2	12	186335	186346	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227119345
3543	NC_012583	TTG	3	9	186354	186362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119345
3544	NC_012583	ATGGC	2	10	186400	186409	20 %	20 %	40 %	20 %	227119345
3545	NC_012583	TTG	2	6	186447	186452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119345
3546	NC_012583	AGT	2	6	186542	186547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3547	NC_012583	GCCT	2	8	186648	186655	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3548	NC_012583	GCTC	2	8	186731	186738	0 %	25 %	25 %	50 %	227119345
3549	NC_012583	CGA	2	6	186796	186801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3550	NC_012583	GTTC	2	8	186862	186869	0 %	50 %	25 %	25 %	227119345
3551	NC_012583	AGT	2	6	187037	187042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3552	NC_012583	TGA	2	6	187049	187054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119345
3553	NC_012583	GAG	2	6	187063	187068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119345
3554	NC_012583	CAA	2	6	187085	187090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119345
3555	NC_012583	A	6	6	187089	187094	100 %	0 %	0 %	0 %	227119345
3556	NC_012583	CAG	2	6	187127	187132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3557	NC_012583	TGAC	2	8	187144	187151	25 %	25 %	25 %	25 %	227119345
3558	NC_012583	CAG	2	6	187248	187253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119345
3559	NC_012583	A	6	6	187262	187267	100 %	0 %	0 %	0 %	227119345
3560	NC_012583	GC	4	8	187354	187361	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3561	NC_012583	AGT	2	6	187362	187367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3562	NC_012583	AGA	2	6	187433	187438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119346
3563	NC_012583	GGT	2	6	187439	187444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119346
3564	NC_012583	GC	3	6	187549	187554	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3565	NC_012583	CAT	2	6	187573	187578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119346
3566	NC_012583	CT	3	6	187629	187634	0 %	50 %	0 %	50 %	227119346
3567	NC_012583	CTG	2	6	187643	187648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3568	NC_012583	TTTG	2	8	187671	187678	0 %	75 %	25 %	0 %	227119346
3569	NC_012583	TGA	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3570	NC_012583	TCT	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3571	NC_012583	CTT	2	6	187738	187743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3572	NC_012583	GGA	2	6	187748	187753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119346
3573	NC_012583	CTG	2	6	187769	187774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3574	NC_012583	TTGCTG	22	132	187775	187906	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227119346
3575	NC_012583	TGA	2	6	187944	187949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3576	NC_012583	CTTG	2	8	187957	187964	0 %	50 %	25 %	25 %	227119346
3577	NC_012583	TTG	2	6	188169	188174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119346
3578	NC_012583	CTG	2	6	188225	188230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3579	NC_012583	ACTC	2	8	188240	188247	25 %	25 %	0 %	50 %	227119346
3580	NC_012583	AGC	2	6	188253	188258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3581	NC_012583	GCG	2	6	188298	188303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3582	NC_012583	GCT	2	6	188389	188394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3583	NC_012583	GCT	2	6	188473	188478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3584	NC_012583	GC	3	6	188560	188565	0 %	0 %	50 %	50 %	227119346
3585	NC_012583	AAC	2	6	188616	188621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3586	NC_012583	ATC	2	6	188654	188659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119346
3587	NC_012583	TGA	2	6	188685	188690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3588	NC_012583	GCGGCA	2	12	188727	188738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227119346
3589	NC_012583	ATG	2	6	188757	188762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119346
3590	NC_012583	GA	3	6	188769	188774	50 %	0 %	50 %	0 %	227119346
3591	NC_012583	GCA	2	6	188779	188784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3592	NC_012583	CAC	2	6	188822	188827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119346
3593	NC_012583	CTT	2	6	188866	188871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119346
3594	NC_012583	AGG	2	6	188883	188888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119346
3595	NC_012583	AC	3	6	188971	188976	50 %	0 %	0 %	50 %	227119346
3596	NC_012583	GCG	2	6	188979	188984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3597	NC_012583	CGA	2	6	189046	189051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119346
3598	NC_012583	TAA	2	6	189065	189070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119346
3599	NC_012583	CGC	2	6	189084	189089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119346
3600	NC_012583	CAAT	2	8	189130	189137	50 %	25 %	0 %	25 %	227119346
3601	NC_012583	GCG	2	6	189168	189173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119346
3602	NC_012583	CAA	2	6	189176	189181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3603	NC_012583	CAA	2	6	189191	189196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119346
3604	NC_012583	AGC	2	6	189268	189273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3605	NC_012583	GATTG	2	10	189326	189335	20 %	40 %	40 %	0 %	227119347
3606	NC_012583	TTG	2	6	189384	189389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119347
3607	NC_012583	TGG	2	6	189419	189424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119347
3608	NC_012583	ACC	2	6	189499	189504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3609	NC_012583	GTG	2	6	189538	189543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119347
3610	NC_012583	GGC	2	6	189564	189569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119347
3611	NC_012583	TGC	2	6	189599	189604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3612	NC_012583	ATC	2	6	189619	189624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119347
3613	NC_012583	GCG	2	6	189632	189637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119347
3614	NC_012583	CCA	2	6	189869	189874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3615	NC_012583	CTG	2	6	189876	189881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3616	NC_012583	ACC	2	6	189925	189930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
3617	NC_012583	AGC	2	6	190003	190008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119347
3618	NC_012583	CGC	2	6	190095	190100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119347
3619	NC_012583	A	7	7	190122	190128	100 %	0 %	0 %	0 %	227119347
3620	NC_012583	A	6	6	190152	190157	100 %	0 %	0 %	0 %	227119347
3621	NC_012583	CCA	3	9	190164	190172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119347
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3623	NC_012583	GTG	2	6	190249	190254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119348
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3743	NC_012583	A	6	6	196353	196358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3744	NC_012583	TGA	2	6	196361	196366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3996	NC_012583	TGTT	2	8	210116	210123	0 %	75 %	25 %	0 %	227119368
3997	NC_012583	TTG	2	6	210134	210139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119368
3998	NC_012583	GCG	2	6	210172	210177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119368
3999	NC_012583	GCG	2	6	210208	210213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119368
4000	NC_012583	ACC	2	6	210292	210297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119368

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