MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012583	TGG	2	6	131569	131574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119298
2502	NC_012583	TGG	2	6	131581	131586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119298
2503	NC_012583	AGC	2	6	131617	131622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2504	NC_012583	AGC	2	6	131643	131648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2505	NC_012583	TGC	2	6	131669	131674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2506	NC_012583	GCG	2	6	131688	131693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119298
2507	NC_012583	TGG	3	9	131698	131706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119298
2508	NC_012583	AGC	2	6	131723	131728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2509	NC_012583	AAAC	2	8	131730	131737	75 %	0 %	0 %	25 %	227119298
2510	NC_012583	GCA	2	6	131821	131826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2511	NC_012583	CTG	2	6	131865	131870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2512	NC_012583	GAA	2	6	132051	132056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119298
2513	NC_012583	ACA	2	6	132059	132064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119298
2514	NC_012583	CGT	2	6	132072	132077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2515	NC_012583	GCT	2	6	132086	132091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2516	NC_012583	TGGC	2	8	132144	132151	0 %	25 %	50 %	25 %	227119298
2517	NC_012583	TGC	2	6	132173	132178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2518	NC_012583	TCGG	2	8	132186	132193	0 %	25 %	50 %	25 %	227119298
2519	NC_012583	AAG	2	6	132238	132243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119298
2520	NC_012583	ATG	2	6	132274	132279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119298
2521	NC_012583	CTG	2	6	132339	132344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2522	NC_012583	ATC	2	6	132352	132357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119298
2523	NC_012583	CGATG	2	10	132359	132368	20 %	20 %	40 %	20 %	227119298
2524	NC_012583	ACG	2	6	132405	132410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119298
2525	NC_012583	CTGT	2	8	132411	132418	0 %	50 %	25 %	25 %	227119298
2526	NC_012583	TTG	2	6	132505	132510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012583	GGC	2	6	132520	132525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_012583	GGT	2	6	132536	132541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012583	GCA	2	6	132543	132548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_012583	TGG	2	6	132597	132602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_012583	TGGC	2	8	132622	132629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_012583	AGC	2	6	132793	132798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_012583	TAAA	2	8	132847	132854	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_012583	ACT	2	6	132859	132864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2536	NC_012583	A	6	6	132979	132984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_012583	TGA	2	6	133011	133016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_012583	TGAT	2	8	133025	133032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_012583	GAA	2	6	133069	133074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_012583	ATG	2	6	133076	133081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_012583	CGC	2	6	133093	133098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2542	NC_012583	GCC	3	9	133139	133147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_012583	ACCGCC	2	12	133192	133203	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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2545	NC_012583	CTTT	2	8	133328	133335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2546	NC_012583	TGC	2	6	133469	133474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_012583	GAA	2	6	133504	133509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_012583	GCGA	2	8	133588	133595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2549	NC_012583	GTG	2	6	133622	133627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012583	CAA	2	6	133648	133653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_012583	TACC	2	8	133658	133665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_012583	TGA	2	6	133674	133679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012583	CGT	2	6	133690	133695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_012583	GTCT	2	8	133700	133707	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_012583	GC	3	6	133728	133733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_012583	CAT	2	6	133776	133781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2558	NC_012583	CT	3	6	133849	133854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2559	NC_012583	AG	3	6	134002	134007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012583	TTC	2	6	134056	134061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2562	NC_012583	CTT	2	6	134160	134165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_012583	TTG	2	6	134189	134194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012583	TCAA	2	8	134198	134205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2565	NC_012583	GAA	2	6	134218	134223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012583	TGC	2	6	134234	134239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2569	NC_012583	GCT	2	6	134352	134357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2572	NC_012583	TGA	2	6	134661	134666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012583	A	6	6	134780	134785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_012583	GC	3	6	134823	134828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2575	NC_012583	ATG	2	6	134870	134875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2577	NC_012583	GCT	2	6	134997	135002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_012583	GAT	2	6	135030	135035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2580	NC_012583	GGC	2	6	135174	135179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_012583	CTAT	2	8	135224	135231	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_012583	ATG	2	6	135277	135282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_012583	CAAG	2	8	135315	135322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_012583	GGA	2	6	135354	135359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_012583	GCTG	2	8	135384	135391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2587	NC_012583	TGA	2	6	135510	135515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_012583	GCGTC	2	10	135524	135533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2589	NC_012583	AAG	2	6	135563	135568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_012583	GATCA	2	10	135574	135583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2591	NC_012583	TTC	2	6	135610	135615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2593	NC_012583	CGT	2	6	135679	135684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2595	NC_012583	TCG	2	6	135923	135928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_012583	GAT	2	6	135939	135944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2598	NC_012583	GAG	2	6	136173	136178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119299
2599	NC_012583	CCG	2	6	136184	136189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119299
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2601	NC_012583	GCCT	2	8	136299	136306	0 %	25 %	25 %	50 %	227119299
2602	NC_012583	TGA	2	6	136348	136353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119299
2603	NC_012583	CCAA	2	8	136366	136373	50 %	0 %	0 %	50 %	227119299
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2607	NC_012583	TGG	2	6	136726	136731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119299
2608	NC_012583	G	6	6	136730	136735	0 %	0 %	100 %	0 %	227119299
2609	NC_012583	TGATC	2	10	136868	136877	20 %	40 %	20 %	20 %	227119299
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2612	NC_012583	CAA	2	6	137028	137033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119299
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2614	NC_012583	CCT	2	6	137213	137218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119299
2615	NC_012583	CAAA	2	8	137264	137271	75 %	0 %	0 %	25 %	227119299
2616	NC_012583	AGC	2	6	137308	137313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119299
2617	NC_012583	TTG	2	6	137331	137336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119299
2618	NC_012583	GAAG	2	8	137348	137355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_012583	T	6	6	137385	137390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_012583	CA	3	6	137491	137496	50 %	0 %	0 %	50 %	227119300
2621	NC_012583	TCG	2	6	137566	137571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119300
2622	NC_012583	A	7	7	137572	137578	100 %	0 %	0 %	0 %	227119300
2623	NC_012583	TCG	2	6	137647	137652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119301
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2626	NC_012583	CTTT	2	8	137919	137926	0 %	75 %	0 %	25 %	227119301
2627	NC_012583	CAG	2	6	137949	137954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119301
2628	NC_012583	TG	3	6	138051	138056	0 %	50 %	50 %	0 %	227119301
2629	NC_012583	CGC	2	6	138095	138100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119301
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2745	NC_012583	GCGA	2	8	143585	143592	25 %	0 %	50 %	25 %	227119306
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2747	NC_012583	A	6	6	143710	143715	100 %	0 %	0 %	0 %	227119307
2748	NC_012583	TTGA	2	8	143734	143741	25 %	50 %	25 %	0 %	227119307
2749	NC_012583	CTG	2	6	143761	143766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119307
2750	NC_012583	GTC	2	6	143779	143784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119307
2751	NC_012583	TCTT	2	8	143785	143792	0 %	75 %	0 %	25 %	227119307
2752	NC_012583	T	6	6	143802	143807	0 %	100 %	0 %	0 %	227119307
2753	NC_012583	ATC	2	6	143857	143862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119307
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2756	NC_012583	GCTG	2	8	144000	144007	0 %	25 %	50 %	25 %	227119307
2757	NC_012583	TGC	2	6	144009	144014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119307
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2765	NC_012583	CAT	2	6	144507	144512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119307
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2774	NC_012583	CTG	2	6	144737	144742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119308
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2854	NC_012583	A	7	7	148493	148499	100 %	0 %	0 %	0 %	227119311
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2995	NC_012583	TTG	2	6	155895	155900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119319
2996	NC_012583	TCT	2	6	155926	155931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119319
2997	NC_012583	ATCA	2	8	155997	156004	50 %	25 %	0 %	25 %	227119319
2998	NC_012583	GGC	2	6	156020	156025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119319
2999	NC_012583	AAAC	2	8	156066	156073	75 %	0 %	0 %	25 %	227119319
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