MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012583	CTA	2	6	77846	77851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1502	NC_012583	CG	3	6	77877	77882	0 %	0 %	50 %	50 %	227119249
1503	NC_012583	TAC	2	6	77933	77938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1504	NC_012583	TTGA	2	8	77985	77992	25 %	50 %	25 %	0 %	227119249
1505	NC_012583	CT	3	6	78046	78051	0 %	50 %	0 %	50 %	227119249
1506	NC_012583	GTTG	2	8	78080	78087	0 %	50 %	50 %	0 %	227119249
1507	NC_012583	TTG	2	6	78090	78095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119249
1508	NC_012583	TGC	2	6	78096	78101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119249
1509	NC_012583	TG	3	6	78113	78118	0 %	50 %	50 %	0 %	227119249
1510	NC_012583	TCA	2	6	78221	78226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1511	NC_012583	CT	3	6	78280	78285	0 %	50 %	0 %	50 %	227119249
1512	NC_012583	CTT	2	6	78356	78361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119249
1513	NC_012583	TTG	2	6	78405	78410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119249
1514	NC_012583	ATG	2	6	78433	78438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119249
1515	NC_012583	ACT	2	6	78453	78458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1516	NC_012583	TGCTCA	2	12	78520	78531	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227119249
1517	NC_012583	TCA	2	6	78535	78540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1518	NC_012583	GTC	2	6	78544	78549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119249
1519	NC_012583	ATC	2	6	78595	78600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1520	NC_012583	GTTT	2	8	78814	78821	0 %	75 %	25 %	0 %	227119249
1521	NC_012583	ATCA	2	8	78906	78913	50 %	25 %	0 %	25 %	227119249
1522	NC_012583	GTG	2	6	78916	78921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119249
1523	NC_012583	TGA	2	6	78938	78943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119249
1524	NC_012583	GTT	2	6	78944	78949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119249
1525	NC_012583	TGG	2	6	78967	78972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119249
1526	NC_012583	AAC	2	6	79021	79026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119249
1527	NC_012583	TAC	2	6	79044	79049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119249
1528	NC_012583	TTA	2	6	79111	79116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012583	AAT	2	6	79119	79124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012583	AAAT	2	8	79137	79144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012583	ATA	2	6	79153	79158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012583	ATG	2	6	79166	79171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012583	TGA	2	6	79199	79204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012583	GAA	2	6	79250	79255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119250
1535	NC_012583	T	6	6	79277	79282	0 %	100 %	0 %	0 %	227119250
1536	NC_012583	TGA	2	6	79460	79465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119251
1537	NC_012583	TTC	2	6	79641	79646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119251
1538	NC_012583	GAA	2	6	79738	79743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119251
1539	NC_012583	TTG	2	6	79880	79885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119251
1540	NC_012583	GTG	2	6	79916	79921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119251
1541	NC_012583	CAT	2	6	79932	79937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119251
1542	NC_012583	AAG	2	6	79964	79969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119251
1543	NC_012583	AGCG	2	8	80115	80122	25 %	0 %	50 %	25 %	227119251
1544	NC_012583	CAA	2	6	80179	80184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119251
1545	NC_012583	AGCACA	2	12	80196	80207	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	227119251
1546	NC_012583	TAAC	2	8	80277	80284	50 %	25 %	0 %	25 %	227119251
1547	NC_012583	TTTA	2	8	80325	80332	25 %	75 %	0 %	0 %	227119252
1548	NC_012583	CAA	2	6	80371	80376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119252
1549	NC_012583	ATA	2	6	80395	80400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119252
1550	NC_012583	ACG	2	6	80426	80431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119252
1551	NC_012583	GTTT	2	8	80461	80468	0 %	75 %	25 %	0 %	227119252
1552	NC_012583	CAT	2	6	80504	80509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119252
1553	NC_012583	AAG	2	6	80548	80553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119252
1554	NC_012583	ACC	2	6	80591	80596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119252
1555	NC_012583	TGGCG	2	10	80606	80615	0 %	20 %	60 %	20 %	227119252
1556	NC_012583	GTC	2	6	80634	80639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119252
1557	NC_012583	CTT	2	6	80783	80788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119252
1558	NC_012583	ATC	2	6	80799	80804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119252
1559	NC_012583	CG	3	6	80922	80927	0 %	0 %	50 %	50 %	227119252
1560	NC_012583	AAG	2	6	80944	80949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119252
1561	NC_012583	CTG	2	6	80994	80999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119252
1562	NC_012583	CGC	2	6	81005	81010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119252
1563	NC_012583	ATC	2	6	81075	81080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119252
1564	NC_012583	CTG	2	6	81216	81221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119252
1565	NC_012583	TCA	2	6	81226	81231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119252
1566	NC_012583	GCG	2	6	81359	81364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119253
1567	NC_012583	CTT	2	6	81376	81381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119253
1568	NC_012583	ATC	2	6	81389	81394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119253
1569	NC_012583	GAT	2	6	81487	81492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119253
1570	NC_012583	CTT	2	6	81673	81678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119253
1571	NC_012583	ATT	2	6	81752	81757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119253
1572	NC_012583	GAA	2	6	81767	81772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119253
1573	NC_012583	CCG	2	6	81844	81849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119253
1574	NC_012583	TGG	2	6	81951	81956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119253
1575	NC_012583	GAA	2	6	82040	82045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119253
1576	NC_012583	TTG	2	6	82080	82085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119253
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1578	NC_012583	ATGG	2	8	82383	82390	25 %	25 %	50 %	0 %	227119254
1579	NC_012583	ACCCA	2	10	82457	82466	40 %	0 %	0 %	60 %	227119254
1580	NC_012583	TGCG	2	8	82504	82511	0 %	25 %	50 %	25 %	227119254
1581	NC_012583	TGA	2	6	82538	82543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119254
1582	NC_012583	CAG	3	9	82632	82640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119254
1583	NC_012583	CG	3	6	82652	82657	0 %	0 %	50 %	50 %	227119254
1584	NC_012583	GATG	2	8	82688	82695	25 %	25 %	50 %	0 %	227119254
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1588	NC_012583	GCA	2	6	82796	82801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119254
1589	NC_012583	GC	3	6	82803	82808	0 %	0 %	50 %	50 %	227119254
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1593	NC_012583	T	6	6	82995	83000	0 %	100 %	0 %	0 %	227119255
1594	NC_012583	ATTTC	2	10	83007	83016	20 %	60 %	0 %	20 %	227119255
1595	NC_012583	AATTCA	2	12	83126	83137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227119255
1596	NC_012583	CAT	3	9	83167	83175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119255
1597	NC_012583	TGC	2	6	83193	83198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119255
1598	NC_012583	GAT	2	6	83203	83208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119255
1599	NC_012583	C	6	6	83222	83227	0 %	0 %	0 %	100 %	227119255
1600	NC_012583	GTT	2	6	83263	83268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119255
1601	NC_012583	AG	4	8	83361	83368	50 %	0 %	50 %	0 %	227119255
1602	NC_012583	GCG	2	6	83380	83385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119255
1603	NC_012583	CA	3	6	83503	83508	50 %	0 %	0 %	50 %	227119255
1604	NC_012583	CAA	2	6	83518	83523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119255
1605	NC_012583	TACA	2	8	83575	83582	50 %	25 %	0 %	25 %	227119255
1606	NC_012583	TTG	2	6	83638	83643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119255
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1608	NC_012583	GTT	2	6	83706	83711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119255
1609	NC_012583	GC	3	6	83716	83721	0 %	0 %	50 %	50 %	227119255
1610	NC_012583	GAA	2	6	83734	83739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119255
1611	NC_012583	GATCA	2	10	83791	83800	40 %	20 %	20 %	20 %	227119255
1612	NC_012583	TAGG	2	8	83863	83870	25 %	25 %	50 %	0 %	227119255
1613	NC_012583	CAG	2	6	84022	84027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119255
1614	NC_012583	CTT	2	6	84084	84089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119256
1615	NC_012583	TAA	2	6	84130	84135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119256
1616	NC_012583	TTC	2	6	84142	84147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119256
1617	NC_012583	ACCA	2	8	84175	84182	50 %	0 %	0 %	50 %	227119256
1618	NC_012583	GTA	2	6	84225	84230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119256
1619	NC_012583	ATA	2	6	84246	84251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119256
1620	NC_012583	AGC	2	6	84276	84281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119256
1621	NC_012583	GCAG	2	8	84415	84422	25 %	0 %	50 %	25 %	227119256
1622	NC_012583	GGC	2	6	84457	84462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119256
1623	NC_012583	CAC	2	6	84511	84516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119256
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