MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012583	AGTG	2	8	51292	51299	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012583	TTG	2	6	51440	51445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012583	TG	3	6	51520	51525	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
1004	NC_012583	GT	3	6	51706	51711	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
1005	NC_012583	ATCG	2	8	51746	51753	25 %	25 %	25 %	25 %	227119228
1006	NC_012583	TC	3	6	51794	51799	0 %	50 %	0 %	50 %	227119228
1007	NC_012583	GGT	2	6	51807	51812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119228
1008	NC_012583	CAG	2	6	51876	51881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1009	NC_012583	TCT	2	6	51891	51896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119228
1010	NC_012583	GAT	2	6	51909	51914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1011	NC_012583	GGA	2	6	51978	51983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119228
1012	NC_012583	TGA	2	6	52070	52075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1013	NC_012583	CAC	2	6	52160	52165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119228
1014	NC_012583	TG	3	6	52190	52195	0 %	50 %	50 %	0 %	227119228
1015	NC_012583	CTC	2	6	52208	52213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119228
1016	NC_012583	TCTG	2	8	52223	52230	0 %	50 %	25 %	25 %	227119228
1017	NC_012583	GCA	2	6	52256	52261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1018	NC_012583	ACC	2	6	52297	52302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119228
1019	NC_012583	AAGC	2	8	52395	52402	50 %	0 %	25 %	25 %	227119228
1020	NC_012583	TCG	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1021	NC_012583	TGG	2	6	52486	52491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119228
1022	NC_012583	ATG	2	6	52687	52692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1023	NC_012583	TCC	2	6	52707	52712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227119228
1024	NC_012583	GAC	2	6	52742	52747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1025	NC_012583	TGA	2	6	53108	53113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1026	NC_012583	TGG	2	6	53116	53121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119228
1027	NC_012583	ATG	2	6	53128	53133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1028	NC_012583	TTCAAT	2	12	53166	53177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227119228
1029	NC_012583	CAG	2	6	53251	53256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1030	NC_012583	GGT	2	6	53264	53269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119228
1031	NC_012583	AGC	2	6	53287	53292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1032	NC_012583	CTCA	2	8	53315	53322	25 %	25 %	0 %	50 %	227119228
1033	NC_012583	ATT	2	6	53325	53330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119228
1034	NC_012583	ATC	2	6	53364	53369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119228
1035	NC_012583	AATC	2	8	53405	53412	50 %	25 %	0 %	25 %	227119228
1036	NC_012583	TGA	2	6	53483	53488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1037	NC_012583	CTT	2	6	53792	53797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119228
1038	NC_012583	GAG	2	6	53820	53825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119228
1039	NC_012583	ATG	2	6	53848	53853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119228
1040	NC_012583	GCGT	2	8	53872	53879	0 %	25 %	50 %	25 %	227119228
1041	NC_012583	ATT	2	6	53943	53948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119228
1042	NC_012583	GAAA	2	8	53963	53970	75 %	0 %	25 %	0 %	227119228
1043	NC_012583	GAG	2	6	54051	54056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119228
1044	NC_012583	GCT	2	6	54107	54112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1045	NC_012583	GATG	2	8	54194	54201	25 %	25 %	50 %	0 %	227119228
1046	NC_012583	AAG	2	6	54469	54474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119228
1047	NC_012583	AGC	2	6	54532	54537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1048	NC_012583	GATT	2	8	54550	54557	25 %	50 %	25 %	0 %	227119228
1049	NC_012583	ATC	2	6	54618	54623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119228
1050	NC_012583	GCC	2	6	54687	54692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119228
1051	NC_012583	CTG	2	6	54702	54707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119228
1052	NC_012583	CAA	2	6	54747	54752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119229
1053	NC_012583	A	6	6	54751	54756	100 %	0 %	0 %	0 %	227119229
1054	NC_012583	CGTT	2	8	54827	54834	0 %	50 %	25 %	25 %	227119229
1055	NC_012583	C	6	6	54835	54840	0 %	0 %	0 %	100 %	227119229
1056	NC_012583	GT	3	6	54848	54853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012583	GCC	2	6	54881	54886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_012583	GAGGTA	2	12	54932	54943	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227119230
1059	NC_012583	ATC	2	6	55061	55066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119230
1060	NC_012583	CAC	2	6	55129	55134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119230
1061	NC_012583	TACCT	2	10	55193	55202	20 %	40 %	0 %	40 %	227119230
1062	NC_012583	AG	3	6	55254	55259	50 %	0 %	50 %	0 %	227119230
1063	NC_012583	GACA	2	8	55334	55341	50 %	0 %	25 %	25 %	227119230
1064	NC_012583	GCAC	2	8	55389	55396	25 %	0 %	25 %	50 %	227119230
1065	NC_012583	CAC	2	6	55465	55470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119230
1066	NC_012583	GGC	2	6	55529	55534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119230
1067	NC_012583	CTT	2	6	55717	55722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119230
1068	NC_012583	GAACA	2	10	55778	55787	60 %	0 %	20 %	20 %	227119230
1069	NC_012583	TGGTT	2	10	55806	55815	0 %	60 %	40 %	0 %	227119230
1070	NC_012583	CCA	2	6	55828	55833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119230
1071	NC_012583	AGT	2	6	55862	55867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119230
1072	NC_012583	GGT	2	6	55900	55905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119230
1073	NC_012583	TCA	2	6	55912	55917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119230
1074	NC_012583	CGC	2	6	55945	55950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119230
1075	NC_012583	AC	3	6	56013	56018	50 %	0 %	0 %	50 %	227119230
1076	NC_012583	CAG	2	6	56039	56044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119230
1077	NC_012583	ATT	2	6	56052	56057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119230
1078	NC_012583	GA	4	8	56102	56109	50 %	0 %	50 %	0 %	227119231
1079	NC_012583	TCA	2	6	56153	56158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119231
1080	NC_012583	AATG	2	8	56307	56314	50 %	25 %	25 %	0 %	227119231
1081	NC_012583	AAT	2	6	56374	56379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119231
1082	NC_012583	CGA	2	6	56400	56405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119231
1083	NC_012583	AAT	2	6	56427	56432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119231
1084	NC_012583	ATA	2	6	56509	56514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012583	ATA	2	6	56535	56540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012583	TGC	2	6	56566	56571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_012583	AC	4	8	56584	56591	50 %	0 %	0 %	50 %	227119232
1088	NC_012583	ACGT	2	8	56645	56652	25 %	25 %	25 %	25 %	227119232
1089	NC_012583	GCAT	2	8	56764	56771	25 %	25 %	25 %	25 %	227119232
1090	NC_012583	AGG	2	6	56837	56842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119232
1091	NC_012583	CAC	2	6	56843	56848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119232
1092	NC_012583	TCA	2	6	56920	56925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119232
1093	NC_012583	GCA	3	9	56981	56989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119232
1094	NC_012583	CCAA	2	8	57008	57015	50 %	0 %	0 %	50 %	227119232
1095	NC_012583	CGG	2	6	57016	57021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119232
1096	NC_012583	GGT	2	6	57093	57098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119232
1097	NC_012583	GGC	2	6	57164	57169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119232
1098	NC_012583	CTTT	2	8	57236	57243	0 %	75 %	0 %	25 %	227119232
1099	NC_012583	CA	3	6	57281	57286	50 %	0 %	0 %	50 %	227119232
1100	NC_012583	GAAT	2	8	57328	57335	50 %	25 %	25 %	0 %	227119232
1101	NC_012583	CAG	2	6	57363	57368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119232
1102	NC_012583	AG	3	6	57399	57404	50 %	0 %	50 %	0 %	227119232
1103	NC_012583	TCA	2	6	57488	57493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119232
1104	NC_012583	TTG	2	6	57513	57518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119232
1105	NC_012583	GCTTG	2	10	57527	57536	0 %	40 %	40 %	20 %	227119232
1106	NC_012583	CAG	2	6	57558	57563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119232
1107	NC_012583	TCA	2	6	57589	57594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119232
1108	NC_012583	GTA	2	6	57723	57728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119232
1109	NC_012583	TCA	2	6	57799	57804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119232
1110	NC_012583	CATGC	2	10	57807	57816	20 %	20 %	20 %	40 %	227119232
1111	NC_012583	CTCA	2	8	57888	57895	25 %	25 %	0 %	50 %	227119232
1112	NC_012583	AGC	2	6	57954	57959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119232
1113	NC_012583	GC	3	6	57958	57963	0 %	0 %	50 %	50 %	227119232
1114	NC_012583	CGG	2	6	58000	58005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119232
1115	NC_012583	TGA	2	6	58016	58021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119232
1116	NC_012583	GC	3	6	58033	58038	0 %	0 %	50 %	50 %	227119232
1117	NC_012583	GGT	2	6	58047	58052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119232
1118	NC_012583	CTT	2	6	58127	58132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119232
1119	NC_012583	GCA	2	6	58224	58229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1120	NC_012583	GCA	2	6	58316	58321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1121	NC_012583	GCT	2	6	58357	58362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1122	NC_012583	AGTG	2	8	58394	58401	25 %	25 %	50 %	0 %	227119233
1123	NC_012583	CA	3	6	58415	58420	50 %	0 %	0 %	50 %	227119233
1124	NC_012583	GAC	2	6	58450	58455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119233
1125	NC_012583	T	6	6	58471	58476	0 %	100 %	0 %	0 %	227119233
1126	NC_012583	CCA	2	6	58507	58512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119233
1127	NC_012583	GA	3	6	58535	58540	50 %	0 %	50 %	0 %	227119233
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1129	NC_012583	GCT	2	6	58599	58604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119233
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1155	NC_012583	ATA	2	6	59734	59739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_012583	ACG	2	6	59921	59926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119234
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