MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome II

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012583	ATG	2	6	263962	263967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119431
5002	NC_012583	ATG	2	6	263971	263976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119431
5003	NC_012583	TCT	2	6	264016	264021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227119431
5004	NC_012583	ATT	2	6	264037	264042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119431
5005	NC_012583	CCTT	2	8	264093	264100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_012583	GGA	2	6	264276	264281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227119432
5007	NC_012583	TGG	2	6	264294	264299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119432
5008	NC_012583	T	6	6	264441	264446	0 %	100 %	0 %	0 %	227119432
5009	NC_012583	TGG	2	6	264535	264540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119432
5010	NC_012583	TAT	2	6	264564	264569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119432
5011	NC_012583	AG	3	6	264633	264638	50 %	0 %	50 %	0 %	227119432
5012	NC_012583	TTGT	2	8	264693	264700	0 %	75 %	25 %	0 %	227119432
5013	NC_012583	A	6	6	264701	264706	100 %	0 %	0 %	0 %	227119432
5014	NC_012583	GAAA	2	8	264734	264741	75 %	0 %	25 %	0 %	227119432
5015	NC_012583	GTT	2	6	264758	264763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119432
5016	NC_012583	AAG	2	6	264907	264912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119432
5017	NC_012583	GTG	2	6	264927	264932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119432
5018	NC_012583	TGC	2	6	264971	264976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119432
5019	NC_012583	GCG	2	6	265062	265067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119432
5020	NC_012583	GTG	2	6	265074	265079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119432
5021	NC_012583	GA	3	6	265099	265104	50 %	0 %	50 %	0 %	227119432
5022	NC_012583	GCT	2	6	265107	265112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119432
5023	NC_012583	AT	3	6	265154	265159	50 %	50 %	0 %	0 %	227119432
5024	NC_012583	AGA	2	6	265202	265207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119432
5025	NC_012583	GC	3	6	265212	265217	0 %	0 %	50 %	50 %	227119432
5026	NC_012583	CGC	2	6	265228	265233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119432
5027	NC_012583	GT	3	6	265290	265295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012583	TGC	2	6	265359	265364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5029	NC_012583	CTG	2	6	265413	265418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5030	NC_012583	AGT	2	6	265470	265475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119433
5031	NC_012583	TGC	2	6	265484	265489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5032	NC_012583	ATG	2	6	265529	265534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119433
5033	NC_012583	CGG	2	6	265615	265620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119433
5034	NC_012583	AG	3	6	265621	265626	50 %	0 %	50 %	0 %	227119433
5035	NC_012583	GCA	2	6	265678	265683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119433
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5037	NC_012583	ACC	2	6	265829	265834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119433
5038	NC_012583	CAG	2	6	265850	265855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5039	NC_012583	ATG	2	6	265857	265862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119433
5040	NC_012583	CAT	2	6	265871	265876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119433
5041	NC_012583	GGT	2	6	266084	266089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119433
5042	NC_012583	ATCA	2	8	266120	266127	50 %	25 %	0 %	25 %	227119433
5043	NC_012583	GGC	2	6	266173	266178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119433
5044	NC_012583	ATC	2	6	266310	266315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119433
5045	NC_012583	GCC	2	6	266369	266374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119433
5046	NC_012583	GAT	2	6	266384	266389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119433
5047	NC_012583	CA	5	10	266420	266429	50 %	0 %	0 %	50 %	227119433
5048	NC_012583	CG	4	8	266465	266472	0 %	0 %	50 %	50 %	227119433
5049	NC_012583	GGC	2	6	266497	266502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119433
5050	NC_012583	A	6	6	266529	266534	100 %	0 %	0 %	0 %	227119433
5051	NC_012583	TCG	2	6	266535	266540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5052	NC_012583	A	6	6	266544	266549	100 %	0 %	0 %	0 %	227119433
5053	NC_012583	GCG	2	6	266585	266590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119433
5054	NC_012583	ACC	2	6	266663	266668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119433
5055	NC_012583	CAG	3	9	266669	266677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5056	NC_012583	CAG	2	6	266684	266689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5057	NC_012583	TGTAC	2	10	266760	266769	20 %	40 %	20 %	20 %	227119433
5058	NC_012583	CAA	2	6	266806	266811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119433
5059	NC_012583	AG	3	6	266825	266830	50 %	0 %	50 %	0 %	227119433
5060	NC_012583	AGC	2	6	266856	266861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119433
5061	NC_012583	CAG	2	6	266955	266960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_012583	A	6	6	266964	266969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012583	CTT	2	6	266990	266995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_012583	ACA	2	6	267020	267025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_012583	TGA	2	6	267071	267076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012583	TCA	2	6	267113	267118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_012583	GC	3	6	267153	267158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_012583	AC	3	6	267210	267215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_012583	GAC	2	6	267241	267246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_012583	CATCT	2	10	267339	267348	20 %	40 %	0 %	40 %	227119434
5071	NC_012583	ATA	3	9	267412	267420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119434
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5077	NC_012583	AG	3	6	267735	267740	50 %	0 %	50 %	0 %	227119434
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5086	NC_012583	GA	3	6	268163	268168	50 %	0 %	50 %	0 %	227119434
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5094	NC_012583	T	6	6	268685	268690	0 %	100 %	0 %	0 %	227119435
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5099	NC_012583	GGCT	2	8	268887	268894	0 %	25 %	50 %	25 %	227119436
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5102	NC_012583	GTTG	2	8	268995	269002	0 %	50 %	50 %	0 %	227119436
5103	NC_012583	TTG	2	6	269004	269009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119436
5104	NC_012583	T	7	7	269137	269143	0 %	100 %	0 %	0 %	227119437
5105	NC_012583	AG	3	6	269152	269157	50 %	0 %	50 %	0 %	227119437
5106	NC_012583	ATC	2	6	269189	269194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119437
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5110	NC_012583	CAG	2	6	269324	269329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119437
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5113	NC_012583	CAA	2	6	269395	269400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119437
5114	NC_012583	ATCGAT	2	12	269462	269473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227119437
5115	NC_012583	CCG	2	6	269485	269490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119437
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5117	NC_012583	A	6	6	269529	269534	100 %	0 %	0 %	0 %	227119437
5118	NC_012583	TGA	2	6	269544	269549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119437
5119	NC_012583	A	6	6	269590	269595	100 %	0 %	0 %	0 %	227119437
5120	NC_012583	ACC	2	6	269625	269630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119437
5121	NC_012583	ACAT	2	8	269631	269638	50 %	25 %	0 %	25 %	227119437
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5123	NC_012583	CGG	2	6	269686	269691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119437
5124	NC_012583	GCTG	2	8	269717	269724	0 %	25 %	50 %	25 %	227119437
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5136	NC_012583	GGAT	2	8	270203	270210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5172	NC_012583	AAATT	2	10	271865	271874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5235	NC_012583	ATTTG	2	10	274664	274673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_012583	ATC	2	6	274981	274986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119439
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5249	NC_012583	TCACT	2	10	275609	275618	20 %	40 %	0 %	40 %	227119439
5250	NC_012583	GCG	3	9	275677	275685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119439
5251	NC_012583	TG	3	6	275732	275737	0 %	50 %	50 %	0 %	227119439
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5253	NC_012583	CGA	2	6	275819	275824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119439
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5359	NC_012583	TCAA	2	8	281866	281873	50 %	25 %	0 %	25 %	227119443
5360	NC_012583	ACTA	2	8	281877	281884	50 %	25 %	0 %	25 %	227119443
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5364	NC_012583	ATT	2	6	282030	282035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_012583	ATC	2	6	282081	282086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5366	NC_012583	TAA	2	6	282102	282107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_012583	GTTA	2	8	282175	282182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_012583	TAAA	2	8	282190	282197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_012583	AATA	2	8	282211	282218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_012583	AT	3	6	282244	282249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_012583	ATAAA	2	10	282275	282284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_012583	AAT	2	6	282289	282294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5374	NC_012583	CGC	2	6	282380	282385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5375	NC_012583	CGA	2	6	282420	282425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5376	NC_012583	T	6	6	282537	282542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5377	NC_012583	GCTG	2	8	282563	282570	0 %	25 %	50 %	25 %	227119444
5378	NC_012583	GCA	2	6	282710	282715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119444
5379	NC_012583	CGTT	2	8	282810	282817	0 %	50 %	25 %	25 %	227119444
5380	NC_012583	ACG	2	6	282973	282978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119444
5381	NC_012583	CGT	2	6	283089	283094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119444
5382	NC_012583	TC	3	6	283119	283124	0 %	50 %	0 %	50 %	227119444
5383	NC_012583	CCG	2	6	283171	283176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119444
5384	NC_012583	ATC	2	6	283207	283212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119444
5385	NC_012583	GTCA	2	8	283295	283302	25 %	25 %	25 %	25 %	227119444
5386	NC_012583	TCTA	2	8	283379	283386	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5387	NC_012583	TCAC	2	8	283470	283477	25 %	25 %	0 %	50 %	227119445
5388	NC_012583	GCC	2	6	283480	283485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119445
5389	NC_012583	CA	3	6	283610	283615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5390	NC_012583	CT	3	6	283652	283657	0 %	50 %	0 %	50 %	227119446
5391	NC_012583	GGAA	2	8	283709	283716	50 %	0 %	50 %	0 %	227119446
5392	NC_012583	ATT	2	6	283752	283757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227119446
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5402	NC_012583	GGC	2	6	284272	284277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119446
5403	NC_012583	GAC	2	6	284283	284288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119446
5404	NC_012583	AG	3	6	284361	284366	50 %	0 %	50 %	0 %	227119446
5405	NC_012583	TGATC	2	10	284376	284385	20 %	40 %	20 %	20 %	227119446
5406	NC_012583	TGG	2	6	284426	284431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119446
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5408	NC_012583	CCA	2	6	284504	284509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227119446
5409	NC_012583	GGA	2	6	284640	284645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5410	NC_012583	CTC	2	6	284655	284660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5411	NC_012583	GTT	2	6	284708	284713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227119447
5412	NC_012583	TGTT	2	8	284730	284737	0 %	75 %	25 %	0 %	227119447
5413	NC_012583	TGA	2	6	284776	284781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119447
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5428	NC_012583	CTG	2	6	285654	285659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
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5431	NC_012583	CGT	2	6	285720	285725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119448
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5439	NC_012583	CTTT	2	8	286057	286064	0 %	75 %	0 %	25 %	227119448
5440	NC_012583	TAA	2	6	286124	286129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227119448
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5445	NC_012583	GATTTC	2	12	286304	286315	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	227119448
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5453	NC_012583	GCT	2	6	286690	286695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119449
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5457	NC_012583	ATC	2	6	286907	286912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119449
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5459	NC_012583	TCAGTA	2	12	286948	286959	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	227119449
5460	NC_012583	GTG	2	6	286974	286979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119449
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5462	NC_012583	GGT	4	12	287128	287139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227119449
5463	NC_012583	TCG	2	6	287181	287186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119449
5464	NC_012583	A	6	6	287192	287197	100 %	0 %	0 %	0 %	227119449
5465	NC_012583	GTGAT	2	10	287226	287235	20 %	40 %	40 %	0 %	227119449
5466	NC_012583	GCA	2	6	287331	287336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5467	NC_012583	GA	3	6	287410	287415	50 %	0 %	50 %	0 %	227119450
5468	NC_012583	T	6	6	287426	287431	0 %	100 %	0 %	0 %	227119450
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5474	NC_012583	ATC	2	6	288080	288085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227119450
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5480	NC_012583	AT	3	6	288431	288436	50 %	50 %	0 %	0 %	227119450
5481	NC_012583	AAG	2	6	288490	288495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119451
5482	NC_012583	AGC	2	6	288604	288609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119451
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5484	NC_012583	TGC	2	6	288668	288673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119451
5485	NC_012583	AACC	2	8	288747	288754	50 %	0 %	0 %	50 %	227119451
5486	NC_012583	AAC	2	6	288862	288867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227119451
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5488	NC_012583	CTG	2	6	288928	288933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227119451
5489	NC_012583	GTGG	2	8	288934	288941	0 %	25 %	75 %	0 %	227119451
5490	NC_012583	CGG	2	6	288966	288971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227119451
5491	NC_012583	TCAC	2	8	289000	289007	25 %	25 %	0 %	50 %	227119451
5492	NC_012583	ATG	2	6	289184	289189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5493	NC_012583	CAAG	2	8	289317	289324	50 %	0 %	25 %	25 %	227119451
5494	NC_012583	TGA	2	6	289377	289382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227119451
5495	NC_012583	TATGG	2	10	289510	289519	20 %	40 %	40 %	0 %	227119451
5496	NC_012583	GCA	2	6	289553	289558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227119451
5497	NC_012583	GAA	2	6	289570	289575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227119451
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5499	NC_012583	CCG	2	6	289640	289645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227119451
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