MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 5073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	CA	3	6	120	125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012582	TC	3	6	504	509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012582	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	227116371
4	NC_012582	GC	3	6	1109	1114	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
5	NC_012582	GC	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
6	NC_012582	AT	3	6	1822	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012582	CT	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	227116373
8	NC_012582	CG	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	227116374
9	NC_012582	GA	3	6	3970	3975	50 %	0 %	50 %	0 %	227116374
10	NC_012582	CA	3	6	4679	4684	50 %	0 %	0 %	50 %	227116374
11	NC_012582	CT	3	6	5066	5071	0 %	50 %	0 %	50 %	227116374
12	NC_012582	CT	3	6	5802	5807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012582	TA	4	8	6781	6788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012582	CT	3	6	7329	7334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012582	AT	3	6	7717	7722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012582	AT	3	6	7738	7743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012582	AT	3	6	7930	7935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012582	AT	3	6	7962	7967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012582	AT	3	6	9563	9568	50 %	50 %	0 %	0 %	227116376
20	NC_012582	AG	3	6	9647	9652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012582	TG	3	6	10481	10486	0 %	50 %	50 %	0 %	227116378
22	NC_012582	GA	3	6	10998	11003	50 %	0 %	50 %	0 %	227116379
23	NC_012582	TC	3	6	11476	11481	0 %	50 %	0 %	50 %	227116379
24	NC_012582	AC	3	6	12731	12736	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012582	TG	3	6	12841	12846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012582	AT	3	6	14201	14206	50 %	50 %	0 %	0 %	227116382
27	NC_012582	AC	3	6	14345	14350	50 %	0 %	0 %	50 %	227116382
28	NC_012582	GA	3	6	15454	15459	50 %	0 %	50 %	0 %	227116383
29	NC_012582	TG	4	8	15713	15720	0 %	50 %	50 %	0 %	227116383
30	NC_012582	TG	3	6	15990	15995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012582	CA	3	6	16944	16949	50 %	0 %	0 %	50 %	227116384
32	NC_012582	TC	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
33	NC_012582	CT	3	6	19195	19200	0 %	50 %	0 %	50 %	227116385
34	NC_012582	TG	3	6	19300	19305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012582	AG	3	6	21141	21146	50 %	0 %	50 %	0 %	227116386
36	NC_012582	AG	3	6	22349	22354	50 %	0 %	50 %	0 %	227116388
37	NC_012582	TC	3	6	23005	23010	0 %	50 %	0 %	50 %	227116389
38	NC_012582	CT	3	6	23012	23017	0 %	50 %	0 %	50 %	227116389
39	NC_012582	AG	3	6	23123	23128	50 %	0 %	50 %	0 %	227116389
40	NC_012582	CA	3	6	23513	23518	50 %	0 %	0 %	50 %	227116389
41	NC_012582	CT	3	6	24659	24664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012582	CT	3	6	24938	24943	0 %	50 %	0 %	50 %	227116391
43	NC_012582	TC	3	6	25185	25190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012582	CA	3	6	25475	25480	50 %	0 %	0 %	50 %	227116392
45	NC_012582	AT	3	6	25715	25720	50 %	50 %	0 %	0 %	227116392
46	NC_012582	TC	3	6	26721	26726	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
47	NC_012582	CT	3	6	27224	27229	0 %	50 %	0 %	50 %	227116392
48	NC_012582	TC	3	6	28404	28409	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
49	NC_012582	CT	3	6	28572	28577	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
50	NC_012582	AT	3	6	28750	28755	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
51	NC_012582	AG	3	6	28789	28794	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
52	NC_012582	AG	3	6	29249	29254	50 %	0 %	50 %	0 %	227116393
53	NC_012582	TA	3	6	29626	29631	50 %	50 %	0 %	0 %	227116393
54	NC_012582	CT	3	6	29654	29659	0 %	50 %	0 %	50 %	227116393
55	NC_012582	TG	3	6	29843	29848	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
56	NC_012582	AT	3	6	29979	29984	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
57	NC_012582	CT	3	6	30682	30687	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
58	NC_012582	AT	3	6	30929	30934	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
59	NC_012582	AC	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
60	NC_012582	TA	3	6	31220	31225	50 %	50 %	0 %	0 %	227116394
61	NC_012582	CT	3	6	31388	31393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012582	CG	3	6	31861	31866	0 %	0 %	50 %	50 %	227116395
63	NC_012582	TA	3	6	32197	32202	50 %	50 %	0 %	0 %	227116395
64	NC_012582	AG	3	6	32282	32287	50 %	0 %	50 %	0 %	227116395
65	NC_012582	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	227116395
66	NC_012582	TC	3	6	33166	33171	0 %	50 %	0 %	50 %	227116396
67	NC_012582	TC	3	6	33176	33181	0 %	50 %	0 %	50 %	227116396
68	NC_012582	CT	3	6	34076	34081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012582	AG	3	6	34275	34280	50 %	0 %	50 %	0 %	227116398
70	NC_012582	CT	3	6	34831	34836	0 %	50 %	0 %	50 %	227116398
71	NC_012582	GC	3	6	34944	34949	0 %	0 %	50 %	50 %	227116398
72	NC_012582	GC	5	10	35314	35323	0 %	0 %	50 %	50 %	227116398
73	NC_012582	TA	3	6	35695	35700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012582	TG	3	6	35957	35962	0 %	50 %	50 %	0 %	227116399
75	NC_012582	CG	3	6	36150	36155	0 %	0 %	50 %	50 %	227116399
76	NC_012582	CG	3	6	38001	38006	0 %	0 %	50 %	50 %	227116401
77	NC_012582	AG	3	6	38037	38042	50 %	0 %	50 %	0 %	227116401
78	NC_012582	CG	3	6	38873	38878	0 %	0 %	50 %	50 %	227116402
79	NC_012582	GA	4	8	39158	39165	50 %	0 %	50 %	0 %	227116402
80	NC_012582	GC	3	6	39405	39410	0 %	0 %	50 %	50 %	227116402
81	NC_012582	AG	3	6	41240	41245	50 %	0 %	50 %	0 %	227116405
82	NC_012582	CA	3	6	41285	41290	50 %	0 %	0 %	50 %	227116405
83	NC_012582	CA	3	6	42387	42392	50 %	0 %	0 %	50 %	227116406
84	NC_012582	TC	3	6	42680	42685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012582	CA	3	6	43394	43399	50 %	0 %	0 %	50 %	227116409
86	NC_012582	TC	3	6	43941	43946	0 %	50 %	0 %	50 %	227116410
87	NC_012582	GT	3	6	45189	45194	0 %	50 %	50 %	0 %	227116411
88	NC_012582	TG	3	6	46771	46776	0 %	50 %	50 %	0 %	227116413
89	NC_012582	AG	3	6	46989	46994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012582	AG	3	6	47074	47079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012582	CA	3	6	47097	47102	50 %	0 %	0 %	50 %	227116414
92	NC_012582	TG	3	6	47667	47672	0 %	50 %	50 %	0 %	227116414
93	NC_012582	TC	3	6	48422	48427	0 %	50 %	0 %	50 %	227116416
94	NC_012582	CT	3	6	49208	49213	0 %	50 %	0 %	50 %	227116416
95	NC_012582	GC	3	6	49943	49948	0 %	0 %	50 %	50 %	227116417
96	NC_012582	AG	3	6	49993	49998	50 %	0 %	50 %	0 %	227116417
97	NC_012582	GC	3	6	50081	50086	0 %	0 %	50 %	50 %	227116417
98	NC_012582	AC	3	6	50671	50676	50 %	0 %	0 %	50 %	227116418
99	NC_012582	GC	3	6	52173	52178	0 %	0 %	50 %	50 %	227116418
100	NC_012582	GA	3	6	52749	52754	50 %	0 %	50 %	0 %	227116418
101	NC_012582	GA	3	6	52989	52994	50 %	0 %	50 %	0 %	227116419
102	NC_012582	GC	3	6	53217	53222	0 %	0 %	50 %	50 %	227116419
103	NC_012582	GC	3	6	53707	53712	0 %	0 %	50 %	50 %	227116420
104	NC_012582	GA	3	6	55106	55111	50 %	0 %	50 %	0 %	227116421
105	NC_012582	GT	3	6	55687	55692	0 %	50 %	50 %	0 %	227116422
106	NC_012582	GC	4	8	55893	55900	0 %	0 %	50 %	50 %	227116422
107	NC_012582	GA	3	6	56048	56053	50 %	0 %	50 %	0 %	227116422
108	NC_012582	CA	3	6	56365	56370	50 %	0 %	0 %	50 %	227116423
109	NC_012582	GT	3	6	56508	56513	0 %	50 %	50 %	0 %	227116423
110	NC_012582	CG	3	6	56561	56566	0 %	0 %	50 %	50 %	227116423
111	NC_012582	GC	3	6	57054	57059	0 %	0 %	50 %	50 %	227116423
112	NC_012582	CG	3	6	60189	60194	0 %	0 %	50 %	50 %	227116426
113	NC_012582	CA	3	6	60803	60808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012582	CG	3	6	61057	61062	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
115	NC_012582	GC	3	6	61148	61153	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
116	NC_012582	GC	3	6	61565	61570	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
117	NC_012582	CG	3	6	61623	61628	0 %	0 %	50 %	50 %	227116428
118	NC_012582	CA	3	6	61769	61774	50 %	0 %	0 %	50 %	227116428
119	NC_012582	GT	3	6	62420	62425	0 %	50 %	50 %	0 %	227116429
120	NC_012582	TC	4	8	63561	63568	0 %	50 %	0 %	50 %	227116430
121	NC_012582	GA	3	6	63590	63595	50 %	0 %	50 %	0 %	227116430
122	NC_012582	AG	3	6	64730	64735	50 %	0 %	50 %	0 %	227116431
123	NC_012582	CT	3	6	65031	65036	0 %	50 %	0 %	50 %	227116431
124	NC_012582	GC	3	6	66810	66815	0 %	0 %	50 %	50 %	227116433
125	NC_012582	AG	3	6	66942	66947	50 %	0 %	50 %	0 %	227116433
126	NC_012582	GA	3	6	68060	68065	50 %	0 %	50 %	0 %	227116435
127	NC_012582	CT	3	6	68119	68124	0 %	50 %	0 %	50 %	227116435
128	NC_012582	CG	3	6	68737	68742	0 %	0 %	50 %	50 %	227116436
129	NC_012582	GC	3	6	69884	69889	0 %	0 %	50 %	50 %	227116437
130	NC_012582	GA	3	6	70121	70126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012582	GA	3	6	71505	71510	50 %	0 %	50 %	0 %	227116440
132	NC_012582	GC	3	6	72224	72229	0 %	0 %	50 %	50 %	227116440
133	NC_012582	GC	3	6	73160	73165	0 %	0 %	50 %	50 %	227116440
134	NC_012582	TA	3	6	76861	76866	50 %	50 %	0 %	0 %	227116446
135	NC_012582	AG	3	6	76959	76964	50 %	0 %	50 %	0 %	227116446
136	NC_012582	CT	3	6	77030	77035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_012582	GC	3	6	78503	78508	0 %	0 %	50 %	50 %	227116449
138	NC_012582	CT	3	6	80168	80173	0 %	50 %	0 %	50 %	227116450
139	NC_012582	CT	3	6	81881	81886	0 %	50 %	0 %	50 %	227116453
140	NC_012582	GA	3	6	82296	82301	50 %	0 %	50 %	0 %	227116453
141	NC_012582	GC	4	8	82323	82330	0 %	0 %	50 %	50 %	227116454
142	NC_012582	GT	3	6	82484	82489	0 %	50 %	50 %	0 %	227116454
143	NC_012582	CT	3	6	82656	82661	0 %	50 %	0 %	50 %	227116454
144	NC_012582	GA	3	6	83312	83317	50 %	0 %	50 %	0 %	227116455
145	NC_012582	CA	3	6	84080	84085	50 %	0 %	0 %	50 %	227116455
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