MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	TTAA	2	8	13	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012582	GATT	2	8	126	133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012582	AATC	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	227116372
4	NC_012582	TGGC	2	8	1387	1394	0 %	25 %	50 %	25 %	227116372
5	NC_012582	AGAT	2	8	1641	1648	50 %	25 %	25 %	0 %	227116372
6	NC_012582	CTTT	2	8	1945	1952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012582	CAAC	2	8	2317	2324	50 %	0 %	0 %	50 %	227116373
8	NC_012582	GGCA	2	8	2787	2794	25 %	0 %	50 %	25 %	227116373
9	NC_012582	GGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	75 %	0 %	227116373
10	NC_012582	GCAA	2	8	3488	3495	50 %	0 %	25 %	25 %	227116373
11	NC_012582	AAAG	2	8	4853	4860	75 %	0 %	25 %	0 %	227116374
12	NC_012582	CAAA	2	8	4944	4951	75 %	0 %	0 %	25 %	227116374
13	NC_012582	TCCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	227116374
14	NC_012582	CGTT	2	8	5794	5801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012582	TCTA	2	8	5965	5972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012582	AACA	2	8	6486	6493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012582	GAAA	2	8	7244	7251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012582	GTTG	2	8	7291	7298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012582	GATA	2	8	7335	7342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012582	TTGT	2	8	7440	7447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012582	TCAT	2	8	8128	8135	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
22	NC_012582	TCTT	2	8	8296	8303	0 %	75 %	0 %	25 %	227116375
23	NC_012582	CTAT	2	8	8335	8342	25 %	50 %	0 %	25 %	227116375
24	NC_012582	TTGA	2	8	8480	8487	25 %	50 %	25 %	0 %	227116375
25	NC_012582	TGCT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	25 %	25 %	227116375
26	NC_012582	CTGA	2	8	9318	9325	25 %	25 %	25 %	25 %	227116376
27	NC_012582	ATGA	2	8	9417	9424	50 %	25 %	25 %	0 %	227116376
28	NC_012582	TCTA	2	8	9885	9892	25 %	50 %	0 %	25 %	227116377
29	NC_012582	AATT	2	8	10005	10012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012582	GGTG	2	8	10882	10889	0 %	25 %	75 %	0 %	227116379
31	NC_012582	GATG	2	8	11179	11186	25 %	25 %	50 %	0 %	227116379
32	NC_012582	GAAT	2	8	11233	11240	50 %	25 %	25 %	0 %	227116379
33	NC_012582	ATGA	2	8	12129	12136	50 %	25 %	25 %	0 %	227116380
34	NC_012582	TTTG	2	8	12466	12473	0 %	75 %	25 %	0 %	227116381
35	NC_012582	TGAT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	25 %	0 %	227116382
36	NC_012582	CTTG	2	8	13269	13276	0 %	50 %	25 %	25 %	227116382
37	NC_012582	TCGC	2	8	13291	13298	0 %	25 %	25 %	50 %	227116382
38	NC_012582	GTCT	2	8	13994	14001	0 %	50 %	25 %	25 %	227116382
39	NC_012582	AAGA	2	8	14031	14038	75 %	0 %	25 %	0 %	227116382
40	NC_012582	ATGT	2	8	14474	14481	25 %	50 %	25 %	0 %	227116382
41	NC_012582	TCAT	2	8	14902	14909	25 %	50 %	0 %	25 %	227116383
42	NC_012582	AGCA	2	8	14958	14965	50 %	0 %	25 %	25 %	227116383
43	NC_012582	TTCG	2	8	15168	15175	0 %	50 %	25 %	25 %	227116383
44	NC_012582	TGGT	2	8	15307	15314	0 %	50 %	50 %	0 %	227116383
45	NC_012582	GACG	3	12	15335	15346	25 %	0 %	50 %	25 %	227116383
46	NC_012582	TTGT	2	8	15388	15395	0 %	75 %	25 %	0 %	227116383
47	NC_012582	AAGA	2	8	15489	15496	75 %	0 %	25 %	0 %	227116383
48	NC_012582	TTTG	2	8	15503	15510	0 %	75 %	25 %	0 %	227116383
49	NC_012582	GACT	2	8	15975	15982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012582	AGCT	2	8	16074	16081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012582	TCAA	2	8	16178	16185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012582	ACTA	2	8	16470	16477	50 %	25 %	0 %	25 %	227116384
53	NC_012582	GTCT	2	8	17690	17697	0 %	50 %	25 %	25 %	227116384
54	NC_012582	TGAA	2	8	18672	18679	50 %	25 %	25 %	0 %	227116385
55	NC_012582	ATGG	2	8	18760	18767	25 %	25 %	50 %	0 %	227116385
56	NC_012582	AATG	2	8	19435	19442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012582	CACT	2	8	19900	19907	25 %	25 %	0 %	50 %	227116386
58	NC_012582	ATTT	2	8	20050	20057	25 %	75 %	0 %	0 %	227116386
59	NC_012582	CAAC	2	8	20455	20462	50 %	0 %	0 %	50 %	227116386
60	NC_012582	CAAA	2	8	20764	20771	75 %	0 %	0 %	25 %	227116386
61	NC_012582	TTGC	2	8	22160	22167	0 %	50 %	25 %	25 %	227116387
62	NC_012582	ATTA	2	8	22213	22220	50 %	50 %	0 %	0 %	227116387
63	NC_012582	CTAA	2	8	22667	22674	50 %	25 %	0 %	25 %	227116389
64	NC_012582	CCAG	2	8	23472	23479	25 %	0 %	25 %	50 %	227116389
65	NC_012582	TTGC	2	8	23493	23500	0 %	50 %	25 %	25 %	227116389
66	NC_012582	CTTT	2	8	23537	23544	0 %	75 %	0 %	25 %	227116389
67	NC_012582	CTGA	2	8	23762	23769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_012582	GGTC	2	8	23988	23995	0 %	25 %	50 %	25 %	227116390
69	NC_012582	CTAC	2	8	24097	24104	25 %	25 %	0 %	50 %	227116390
70	NC_012582	GCCT	2	8	24135	24142	0 %	25 %	25 %	50 %	227116390
71	NC_012582	AGGC	2	8	24300	24307	25 %	0 %	50 %	25 %	227116390
72	NC_012582	TTTA	2	8	24566	24573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012582	TAAA	2	8	24633	24640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012582	GTTT	2	8	24648	24655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012582	CATT	2	8	24814	24821	25 %	50 %	0 %	25 %	227116391
76	NC_012582	GCAC	2	8	24966	24973	25 %	0 %	25 %	50 %	227116391
77	NC_012582	ATAC	2	8	25529	25536	50 %	25 %	0 %	25 %	227116392
78	NC_012582	GTTA	2	8	25568	25575	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
79	NC_012582	GTTT	2	8	25609	25616	0 %	75 %	25 %	0 %	227116392
80	NC_012582	AATG	2	8	25785	25792	50 %	25 %	25 %	0 %	227116392
81	NC_012582	TGAT	2	8	26038	26045	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
82	NC_012582	ATTG	2	8	26080	26087	25 %	50 %	25 %	0 %	227116392
83	NC_012582	TGTC	2	8	26112	26119	0 %	50 %	25 %	25 %	227116392
84	NC_012582	CATC	2	8	26528	26535	25 %	25 %	0 %	50 %	227116392
85	NC_012582	TATT	2	8	26662	26669	25 %	75 %	0 %	0 %	227116392
86	NC_012582	GTTG	2	8	27833	27840	0 %	50 %	50 %	0 %	227116393
87	NC_012582	AGGT	2	8	28336	28343	25 %	25 %	50 %	0 %	227116393
88	NC_012582	AGAT	2	8	28532	28539	50 %	25 %	25 %	0 %	227116393
89	NC_012582	AGCC	2	8	29442	29449	25 %	0 %	25 %	50 %	227116393
90	NC_012582	TCAT	2	8	29964	29971	25 %	50 %	0 %	25 %	227116394
91	NC_012582	TGTT	2	8	30069	30076	0 %	75 %	25 %	0 %	227116394
92	NC_012582	CAGT	2	8	30084	30091	25 %	25 %	25 %	25 %	227116394
93	NC_012582	AAAT	2	8	30123	30130	75 %	25 %	0 %	0 %	227116394
94	NC_012582	TCCT	2	8	30261	30268	0 %	50 %	0 %	50 %	227116394
95	NC_012582	CTTT	2	8	30709	30716	0 %	75 %	0 %	25 %	227116394
96	NC_012582	AGGT	2	8	30774	30781	25 %	25 %	50 %	0 %	227116394
97	NC_012582	CAAC	2	8	30955	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	227116394
98	NC_012582	TGAA	2	8	31514	31521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012582	CAAT	2	8	31571	31578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_012582	TGTT	2	8	31732	31739	0 %	75 %	25 %	0 %	227116395
101	NC_012582	CCTT	2	8	33595	33602	0 %	50 %	0 %	50 %	227116397
102	NC_012582	TTGG	2	8	33909	33916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012582	CAAG	2	8	34028	34035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_012582	TGAT	2	8	34442	34449	25 %	50 %	25 %	0 %	227116398
105	NC_012582	AAAC	2	8	34450	34457	75 %	0 %	0 %	25 %	227116398
106	NC_012582	CAAT	2	8	34485	34492	50 %	25 %	0 %	25 %	227116398
107	NC_012582	GGTG	2	8	35088	35095	0 %	25 %	75 %	0 %	227116398
108	NC_012582	TCAT	2	8	35423	35430	25 %	50 %	0 %	25 %	227116398
109	NC_012582	GAAC	2	8	35652	35659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012582	CCAA	2	8	35889	35896	50 %	0 %	0 %	50 %	227116399
111	NC_012582	GCAC	2	8	35900	35907	25 %	0 %	25 %	50 %	227116399
112	NC_012582	GAGC	2	8	36937	36944	25 %	0 %	50 %	25 %	227116400
113	NC_012582	AATG	2	8	37681	37688	50 %	25 %	25 %	0 %	227116400
114	NC_012582	CTGA	2	8	38706	38713	25 %	25 %	25 %	25 %	227116402
115	NC_012582	ACCC	2	8	39081	39088	25 %	0 %	0 %	75 %	227116402
116	NC_012582	TCGG	2	8	39421	39428	0 %	25 %	50 %	25 %	227116402
117	NC_012582	GCCA	2	8	39888	39895	25 %	0 %	25 %	50 %	227116403
118	NC_012582	GAAA	2	8	40012	40019	75 %	0 %	25 %	0 %	227116403
119	NC_012582	CATG	2	8	40602	40609	25 %	25 %	25 %	25 %	227116404
120	NC_012582	GCTT	2	8	41333	41340	0 %	50 %	25 %	25 %	227116405
121	NC_012582	CAAA	2	8	41597	41604	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_012582	CAAC	2	8	41717	41724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012582	AAGC	2	8	42998	43005	50 %	0 %	25 %	25 %	227116408
124	NC_012582	CATT	2	8	43105	43112	25 %	50 %	0 %	25 %	227116408
125	NC_012582	GGTC	2	8	43890	43897	0 %	25 %	50 %	25 %	227116410
126	NC_012582	TCAA	2	8	44055	44062	50 %	25 %	0 %	25 %	227116411
127	NC_012582	GGTA	2	8	45109	45116	25 %	25 %	50 %	0 %	227116411
128	NC_012582	ATTC	2	8	45321	45328	25 %	50 %	0 %	25 %	227116412
129	NC_012582	GATT	2	8	45501	45508	25 %	50 %	25 %	0 %	227116412
130	NC_012582	CAAG	2	8	45724	45731	50 %	0 %	25 %	25 %	227116412
131	NC_012582	CTGA	2	8	46247	46254	25 %	25 %	25 %	25 %	227116413
132	NC_012582	TGAC	2	8	46296	46303	25 %	25 %	25 %	25 %	227116413
133	NC_012582	ATGA	2	8	47759	47766	50 %	25 %	25 %	0 %	227116414
134	NC_012582	TTTG	2	8	48080	48087	0 %	75 %	25 %	0 %	227116415
135	NC_012582	TCGC	2	8	48222	48229	0 %	25 %	25 %	50 %	227116416
136	NC_012582	TGAA	2	8	48439	48446	50 %	25 %	25 %	0 %	227116416
137	NC_012582	ATCA	2	8	48567	48574	50 %	25 %	0 %	25 %	227116416
138	NC_012582	TGAA	2	8	49222	49229	50 %	25 %	25 %	0 %	227116416
139	NC_012582	GCTG	2	8	49869	49876	0 %	25 %	50 %	25 %	227116417
140	NC_012582	CGCT	2	8	49963	49970	0 %	25 %	25 %	50 %	227116417
141	NC_012582	CGCT	2	8	50021	50028	0 %	25 %	25 %	50 %	227116417
142	NC_012582	CGGG	2	8	50735	50742	0 %	0 %	75 %	25 %	227116418
143	NC_012582	CTCA	2	8	50788	50795	25 %	25 %	0 %	50 %	227116418
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