MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012582	TTAA	2	8	13	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012582	ATC	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012582	CA	3	6	120	125	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012582	GATT	2	8	126	133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012582	TCT	2	6	247	252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012582	T	7	7	334	340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012582	ACA	2	6	368	373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012582	G	6	6	409	414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012582	TCT	2	6	497	502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012582	TC	3	6	504	509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012582	GTA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012582	CTT	2	6	611	616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116371
13	NC_012582	TCA	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116371
14	NC_012582	CCA	2	6	710	715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116371
15	NC_012582	CAAGC	2	10	869	878	40 %	0 %	20 %	40 %	227116371
16	NC_012582	AT	3	6	912	917	50 %	50 %	0 %	0 %	227116371
17	NC_012582	GAA	2	6	964	969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116371
18	NC_012582	TCC	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116372
19	NC_012582	TGG	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116372
20	NC_012582	TGCTTT	2	12	1056	1067	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227116372
21	NC_012582	GC	3	6	1109	1114	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
22	NC_012582	AATC	2	8	1129	1136	50 %	25 %	0 %	25 %	227116372
23	NC_012582	TCT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
24	NC_012582	TTC	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
25	NC_012582	TTC	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116372
26	NC_012582	TTG	2	6	1335	1340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116372
27	NC_012582	TGGC	2	8	1387	1394	0 %	25 %	50 %	25 %	227116372
28	NC_012582	GC	3	6	1482	1487	0 %	0 %	50 %	50 %	227116372
29	NC_012582	AGAT	2	8	1641	1648	50 %	25 %	25 %	0 %	227116372
30	NC_012582	ACC	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116372
31	NC_012582	A	6	6	1771	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012582	GCT	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012582	AT	3	6	1822	1827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012582	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012582	ATT	2	6	1855	1860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012582	CATTAG	2	12	1900	1911	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012582	AAG	2	6	1936	1941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012582	CTTT	2	8	1945	1952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012582	AGA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012582	A	6	6	1981	1986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012582	AGT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012582	CTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012582	TTG	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012582	GCA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116373
45	NC_012582	CCCAA	2	10	2210	2219	40 %	0 %	0 %	60 %	227116373
46	NC_012582	TTG	2	6	2225	2230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116373
47	NC_012582	ATC	2	6	2235	2240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
48	NC_012582	CAA	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116373
49	NC_012582	TGA	2	6	2261	2266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116373
50	NC_012582	TTG	2	6	2303	2308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116373
51	NC_012582	CAAC	2	8	2317	2324	50 %	0 %	0 %	50 %	227116373
52	NC_012582	CAA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116373
53	NC_012582	ATT	2	6	2521	2526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116373
54	NC_012582	ATC	2	6	2539	2544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
55	NC_012582	ATG	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116373
56	NC_012582	TGG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116373
57	NC_012582	CGATAA	2	12	2739	2750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227116373
58	NC_012582	GGCA	2	8	2787	2794	25 %	0 %	50 %	25 %	227116373
59	NC_012582	GGGA	2	8	2955	2962	25 %	0 %	75 %	0 %	227116373
60	NC_012582	CGG	2	6	3014	3019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116373
61	NC_012582	TGC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
62	NC_012582	ATA	2	6	3038	3043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
63	NC_012582	AAT	2	6	3106	3111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
64	NC_012582	ACG	2	6	3202	3207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116373
65	NC_012582	CT	3	6	3283	3288	0 %	50 %	0 %	50 %	227116373
66	NC_012582	AATCA	2	10	3292	3301	60 %	20 %	0 %	20 %	227116373
67	NC_012582	GCT	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
68	NC_012582	GCT	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
69	NC_012582	GCAA	2	8	3488	3495	50 %	0 %	25 %	25 %	227116373
70	NC_012582	A	6	6	3505	3510	100 %	0 %	0 %	0 %	227116373
71	NC_012582	GTC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116373
72	NC_012582	AAT	2	6	3646	3651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116373
73	NC_012582	CAC	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116373
74	NC_012582	TGG	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116373
75	NC_012582	CTA	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116373
76	NC_012582	ATA	2	6	3847	3852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116374
77	NC_012582	CG	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	227116374
78	NC_012582	CAG	3	9	3861	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
79	NC_012582	TAA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116374
80	NC_012582	GTC	2	6	3929	3934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
81	NC_012582	TAG	2	6	3947	3952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116374
82	NC_012582	GA	3	6	3970	3975	50 %	0 %	50 %	0 %	227116374
83	NC_012582	ACG	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
84	NC_012582	ATC	2	6	4141	4146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
85	NC_012582	TGC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
86	NC_012582	AACTC	2	10	4208	4217	40 %	20 %	0 %	40 %	227116374
87	NC_012582	TTC	2	6	4253	4258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116374
88	NC_012582	GTT	2	6	4259	4264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
89	NC_012582	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
90	NC_012582	TGT	2	6	4494	4499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
91	NC_012582	ATC	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
92	NC_012582	TTG	2	6	4561	4566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
93	NC_012582	CAG	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
94	NC_012582	GCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
95	NC_012582	TGC	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116374
96	NC_012582	CAC	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
97	NC_012582	CA	3	6	4679	4684	50 %	0 %	0 %	50 %	227116374
98	NC_012582	GTT	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
99	NC_012582	AAAG	2	8	4853	4860	75 %	0 %	25 %	0 %	227116374
100	NC_012582	TGT	2	6	4902	4907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
101	NC_012582	CAAA	2	8	4944	4951	75 %	0 %	0 %	25 %	227116374
102	NC_012582	TCA	2	6	4961	4966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
103	NC_012582	CAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
104	NC_012582	CAT	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116374
105	NC_012582	CT	3	6	5066	5071	0 %	50 %	0 %	50 %	227116374
106	NC_012582	TTG	3	9	5179	5187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116374
107	NC_012582	ATG	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116374
108	NC_012582	ACC	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
109	NC_012582	GCA	2	6	5324	5329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
110	NC_012582	TCCA	2	8	5344	5351	25 %	25 %	0 %	50 %	227116374
111	NC_012582	CCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116374
112	NC_012582	AAC	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
113	NC_012582	CAA	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116374
114	NC_012582	AGC	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116374
115	NC_012582	TGT	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012582	CGTT	2	8	5794	5801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012582	CT	3	6	5802	5807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012582	A	7	7	5850	5856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012582	TTA	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012582	TCTA	2	8	5965	5972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012582	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012582	CAA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012582	CTC	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_012582	TGT	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012582	ACT	2	6	6269	6274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012582	GCA	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012582	GTT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012582	CAA	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012582	AACA	2	8	6486	6493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012582	GTA	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012582	A	6	6	6578	6583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012582	TCAAT	2	10	6632	6641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012582	AAC	2	6	6664	6669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012582	GGC	2	6	6685	6690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012582	TA	4	8	6781	6788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012582	T	6	6	6816	6821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012582	A	6	6	6828	6833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012582	GTG	2	6	6868	6873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012582	ATT	2	6	6928	6933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012582	GAT	2	6	6943	6948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012582	GCA	2	6	6958	6963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012582	TTC	2	6	7000	7005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012582	AGG	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012582	GTATG	2	10	7072	7081	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012582	ATT	2	6	7134	7139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012582	A	6	6	7219	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012582	ATG	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012582	GAAA	2	8	7244	7251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012582	GTTG	2	8	7291	7298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012582	ACG	2	6	7305	7310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_012582	CT	3	6	7329	7334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012582	GATA	2	8	7335	7342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012582	CAG	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_012582	TTGT	2	8	7440	7447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012582	A	6	6	7473	7478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012582	TAT	2	6	7492	7497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012582	A	7	7	7502	7508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012582	T	7	7	7527	7533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012582	A	7	7	7558	7564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012582	AT	3	6	7717	7722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012582	AT	3	6	7738	7743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012582	GAT	2	6	7817	7822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012582	TGA	2	6	7834	7839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_012582	A	6	6	7871	7876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012582	AGA	2	6	7888	7893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_012582	AT	3	6	7962	7967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012582	A	6	6	8061	8066	100 %	0 %	0 %	0 %	227116375
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199	NC_012582	TCACA	2	10	9797	9806	40 %	20 %	0 %	40 %	227116377
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276	NC_012582	ATC	2	6	13936	13941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116382
277	NC_012582	GTCT	2	8	13994	14001	0 %	50 %	25 %	25 %	227116382
278	NC_012582	AAGA	2	8	14031	14038	75 %	0 %	25 %	0 %	227116382
279	NC_012582	GCT	2	6	14061	14066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116382
280	NC_012582	GAA	2	6	14104	14109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116382
281	NC_012582	AAC	2	6	14135	14140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116382
282	NC_012582	ATT	2	6	14161	14166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116382
283	NC_012582	AT	3	6	14201	14206	50 %	50 %	0 %	0 %	227116382
284	NC_012582	AAC	3	9	14331	14339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116382
285	NC_012582	AC	3	6	14345	14350	50 %	0 %	0 %	50 %	227116382
286	NC_012582	TAG	2	6	14363	14368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116382
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289	NC_012582	TGA	2	6	14493	14498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116382
290	NC_012582	CTT	2	6	14765	14770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_012582	ATC	2	6	14781	14786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_012582	ACG	2	6	14824	14829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_012582	AAT	2	6	14834	14839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116383
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301	NC_012582	TTCG	2	8	15168	15175	0 %	50 %	25 %	25 %	227116383
302	NC_012582	TAC	2	6	15205	15210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116383
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322	NC_012582	TAG	2	6	15967	15972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
323	NC_012582	GACT	2	8	15975	15982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
324	NC_012582	A	6	6	15984	15989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_012582	TG	3	6	15990	15995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
326	NC_012582	T	8	8	16019	16026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
327	NC_012582	AGCT	2	8	16074	16081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
328	NC_012582	TCTAGT	2	12	16164	16175	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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330	NC_012582	TGA	2	6	16188	16193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_012582	CTT	2	6	16502	16507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116384
335	NC_012582	TGA	2	6	16570	16575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116384
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337	NC_012582	TAT	2	6	16607	16612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116384
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379	NC_012582	AATG	2	8	19435	19442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
380	NC_012582	GTTAG	2	10	19526	19535	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
381	NC_012582	TGATT	2	10	19552	19561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_012582	ATG	2	6	20398	20403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116386
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402	NC_012582	AGC	2	6	20474	20479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116386
403	NC_012582	ATC	2	6	20480	20485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
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406	NC_012582	TCT	2	6	20757	20762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
407	NC_012582	CAAA	2	8	20764	20771	75 %	0 %	0 %	25 %	227116386
408	NC_012582	CTT	2	6	20803	20808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
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410	NC_012582	TCA	2	6	20970	20975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116386
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414	NC_012582	TCT	2	6	21122	21127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116386
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463	NC_012582	A	6	6	23700	23705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_012582	CTGA	2	8	23762	23769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_012582	ATT	2	6	23831	23836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_012582	TAAA	2	8	24633	24640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_012582	GTTT	2	8	24648	24655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
477	NC_012582	CT	3	6	24659	24664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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483	NC_012582	GCAC	2	8	24966	24973	25 %	0 %	25 %	50 %	227116391
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493	NC_012582	ATAC	2	8	25529	25536	50 %	25 %	0 %	25 %	227116392
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