MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012582	TG	3	6	182826	182831	0 %	50 %	50 %	0 %	227116554
3502	NC_012582	TG	3	6	182847	182852	0 %	50 %	50 %	0 %	227116554
3503	NC_012582	GCC	2	6	182853	182858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116554
3504	NC_012582	AGA	2	6	182885	182890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116554
3505	NC_012582	AAAG	2	8	182925	182932	75 %	0 %	25 %	0 %	227116554
3506	NC_012582	AAG	2	6	182972	182977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116554
3507	NC_012582	ATC	2	6	183031	183036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116554
3508	NC_012582	ACA	2	6	183224	183229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116554
3509	NC_012582	AGC	2	6	183299	183304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116555
3510	NC_012582	TGCT	2	8	183352	183359	0 %	50 %	25 %	25 %	227116555
3511	NC_012582	A	6	6	183377	183382	100 %	0 %	0 %	0 %	227116555
3512	NC_012582	TAA	2	6	183422	183427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116555
3513	NC_012582	GTC	2	6	183511	183516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116555
3514	NC_012582	GAA	2	6	183572	183577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116555
3515	NC_012582	AAC	2	6	183616	183621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116555
3516	NC_012582	GCA	2	6	183637	183642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116555
3517	NC_012582	AGC	2	6	183649	183654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116555
3518	NC_012582	TTA	2	6	183712	183717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116555
3519	NC_012582	AAC	2	6	183845	183850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116556
3520	NC_012582	GTT	2	6	183868	183873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116556
3521	NC_012582	TATCG	2	10	183897	183906	20 %	40 %	20 %	20 %	227116556
3522	NC_012582	GCACTG	2	12	183988	183999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3523	NC_012582	TCGG	2	8	184015	184022	0 %	25 %	50 %	25 %	227116556
3524	NC_012582	GTA	2	6	184027	184032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116556
3525	NC_012582	GCT	2	6	184113	184118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3526	NC_012582	ATCG	2	8	184216	184223	25 %	25 %	25 %	25 %	227116556
3527	NC_012582	GAT	2	6	184272	184277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116556
3528	NC_012582	ATC	2	6	184306	184311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116556
3529	NC_012582	ATC	2	6	184354	184359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116556
3530	NC_012582	CTAT	2	8	184385	184392	25 %	50 %	0 %	25 %	227116556
3531	NC_012582	TTG	2	6	184472	184477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116556
3532	NC_012582	TGG	2	6	184478	184483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116556
3533	NC_012582	CTG	2	6	184499	184504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3534	NC_012582	CGT	2	6	184639	184644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3535	NC_012582	CCA	2	6	184645	184650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116556
3536	NC_012582	CTA	2	6	184696	184701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116556
3537	NC_012582	GTGAA	2	10	184751	184760	40 %	20 %	40 %	0 %	227116556
3538	NC_012582	ATC	2	6	184792	184797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116556
3539	NC_012582	AACTG	2	10	184875	184884	40 %	20 %	20 %	20 %	227116556
3540	NC_012582	GGT	2	6	184939	184944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116556
3541	NC_012582	AAG	2	6	184966	184971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116556
3542	NC_012582	CT	3	6	184972	184977	0 %	50 %	0 %	50 %	227116556
3543	NC_012582	GGT	2	6	184978	184983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116556
3544	NC_012582	GCT	2	6	184999	185004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3545	NC_012582	GGC	2	6	185016	185021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116556
3546	NC_012582	ACTGA	2	10	185089	185098	40 %	20 %	20 %	20 %	227116556
3547	NC_012582	TGTC	2	8	185123	185130	0 %	50 %	25 %	25 %	227116556
3548	NC_012582	TGC	2	6	185154	185159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3549	NC_012582	GCT	2	6	185212	185217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116556
3550	NC_012582	CTA	2	6	185218	185223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116556
3551	NC_012582	GAA	2	6	185307	185312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116556
3552	NC_012582	CCA	2	6	185371	185376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_012582	AGA	2	6	185446	185451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116557
3554	NC_012582	TGG	2	6	185470	185475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116557
3555	NC_012582	CGT	2	6	185490	185495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116557
3556	NC_012582	TCA	2	6	185514	185519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116557
3557	NC_012582	AGA	2	6	185597	185602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116557
3558	NC_012582	GAAGC	2	10	185607	185616	40 %	0 %	40 %	20 %	227116557
3559	NC_012582	CAT	2	6	185627	185632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116557
3560	NC_012582	TG	3	6	185653	185658	0 %	50 %	50 %	0 %	227116557
3561	NC_012582	A	6	6	185682	185687	100 %	0 %	0 %	0 %	227116557
3562	NC_012582	T	6	6	185765	185770	0 %	100 %	0 %	0 %	227116557
3563	NC_012582	CAA	2	6	185771	185776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116557
3564	NC_012582	GCG	2	6	185779	185784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116557
3565	NC_012582	AGA	2	6	185831	185836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116557
3566	NC_012582	TCGGT	2	10	185842	185851	0 %	40 %	40 %	20 %	227116557
3567	NC_012582	GAA	2	6	185864	185869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116557
3568	NC_012582	GATC	2	8	185945	185952	25 %	25 %	25 %	25 %	227116557
3569	NC_012582	AGCA	2	8	186112	186119	50 %	0 %	25 %	25 %	227116557
3570	NC_012582	GCT	2	6	186141	186146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116557
3571	NC_012582	TGAT	2	8	186166	186173	25 %	50 %	25 %	0 %	227116557
3572	NC_012582	ACA	2	6	186190	186195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116557
3573	NC_012582	GGC	2	6	186206	186211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116557
3574	NC_012582	GGC	2	6	186240	186245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116557
3575	NC_012582	AAAC	2	8	186270	186277	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_012582	ATC	2	6	186319	186324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116558
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3579	NC_012582	CGT	2	6	186484	186489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116558
3580	NC_012582	AGA	2	6	186606	186611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116558
3581	NC_012582	GAA	2	6	186646	186651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116558
3582	NC_012582	GGT	2	6	186742	186747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116558
3583	NC_012582	ATG	2	6	186772	186777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116558
3584	NC_012582	CAA	2	6	186786	186791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116558
3585	NC_012582	AAC	2	6	186902	186907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116558
3586	NC_012582	CCA	2	6	186952	186957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116558
3587	NC_012582	ACTG	2	8	186978	186985	25 %	25 %	25 %	25 %	227116558
3588	NC_012582	TGA	2	6	187011	187016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116558
3589	NC_012582	CTG	2	6	187030	187035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116558
3590	NC_012582	ACA	2	6	187043	187048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116558
3591	NC_012582	TCTGC	2	10	187081	187090	0 %	40 %	20 %	40 %	227116558
3592	NC_012582	ACCA	2	8	187118	187125	50 %	0 %	0 %	50 %	227116558
3593	NC_012582	A	6	6	187174	187179	100 %	0 %	0 %	0 %	227116558
3594	NC_012582	TGACT	2	10	187221	187230	20 %	40 %	20 %	20 %	227116558
3595	NC_012582	CGC	2	6	187293	187298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116558
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3597	NC_012582	GCGTG	2	10	187389	187398	0 %	20 %	60 %	20 %	227116558
3598	NC_012582	CAT	2	6	187434	187439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116558
3599	NC_012582	CAAG	2	8	187476	187483	50 %	0 %	25 %	25 %	227116558
3600	NC_012582	GAAA	2	8	187578	187585	75 %	0 %	25 %	0 %	227116558
3601	NC_012582	CTG	2	6	187606	187611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116558
3602	NC_012582	GAA	2	6	187686	187691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116558
3603	NC_012582	AGG	2	6	187707	187712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_012582	GCA	2	6	187720	187725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116559
3605	NC_012582	A	6	6	187759	187764	100 %	0 %	0 %	0 %	227116559
3606	NC_012582	GCT	2	6	187842	187847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116559
3607	NC_012582	GGT	2	6	187918	187923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116559
3608	NC_012582	TTG	2	6	187925	187930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116559
3609	NC_012582	AGA	2	6	188004	188009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116559
3610	NC_012582	CGT	2	6	188017	188022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116559
3611	NC_012582	ATTGA	2	10	188113	188122	40 %	40 %	20 %	0 %	227116559
3612	NC_012582	CGT	2	6	188131	188136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116559
3613	NC_012582	T	6	6	188181	188186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_012582	GT	3	6	188215	188220	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_012582	T	6	6	188235	188240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_012582	TAA	2	6	188262	188267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_012582	AAT	2	6	188289	188294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_012582	CTT	2	6	188299	188304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_012582	ACG	2	6	188354	188359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_012582	TGC	2	6	188453	188458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116560
3621	NC_012582	TAA	2	6	188505	188510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116560
3622	NC_012582	GC	3	6	188516	188521	0 %	0 %	50 %	50 %	227116560
3623	NC_012582	TGG	2	6	188547	188552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116560
3624	NC_012582	GCA	2	6	188562	188567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116560
3625	NC_012582	GCA	2	6	188607	188612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116560
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3743	NC_012582	CAC	2	6	194099	194104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116564
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