MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012582	TCG	2	6	133630	133635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2502	NC_012582	TGC	2	6	133673	133678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2503	NC_012582	GC	3	6	133699	133704	0 %	0 %	50 %	50 %	227116503
2504	NC_012582	TGC	2	6	133747	133752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2505	NC_012582	AAG	2	6	133771	133776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116503
2506	NC_012582	CCA	2	6	133792	133797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116503
2507	NC_012582	AG	3	6	133850	133855	50 %	0 %	50 %	0 %	227116503
2508	NC_012582	CAA	2	6	133872	133877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116503
2509	NC_012582	TTG	2	6	133879	133884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116503
2510	NC_012582	CAA	2	6	133889	133894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116503
2511	NC_012582	ATC	2	6	133924	133929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116503
2512	NC_012582	TGC	2	6	134145	134150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2513	NC_012582	TGG	2	6	134159	134164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116503
2514	NC_012582	AG	3	6	134195	134200	50 %	0 %	50 %	0 %	227116503
2515	NC_012582	GATT	2	8	134213	134220	25 %	50 %	25 %	0 %	227116503
2516	NC_012582	TGA	2	6	134222	134227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116503
2517	NC_012582	GTG	2	6	134315	134320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116503
2518	NC_012582	CGC	2	6	134382	134387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116503
2519	NC_012582	CAA	2	6	134472	134477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116503
2520	NC_012582	GGT	2	6	134487	134492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116503
2521	NC_012582	CAC	2	6	134521	134526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116503
2522	NC_012582	ACGC	2	8	134561	134568	25 %	0 %	25 %	50 %	227116503
2523	NC_012582	GC	3	6	134574	134579	0 %	0 %	50 %	50 %	227116503
2524	NC_012582	GCC	2	6	134608	134613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116503
2525	NC_012582	ACA	2	6	134669	134674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116503
2526	NC_012582	CAAA	2	8	134721	134728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_012582	ATC	2	6	134746	134751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116504
2528	NC_012582	CGG	2	6	134772	134777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116504
2529	NC_012582	CGCT	2	8	134780	134787	0 %	25 %	25 %	50 %	227116504
2530	NC_012582	AAC	2	6	134806	134811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116504
2531	NC_012582	GCCA	2	8	134893	134900	25 %	0 %	25 %	50 %	227116504
2532	NC_012582	TGC	2	6	134909	134914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2533	NC_012582	AAG	2	6	135062	135067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116504
2534	NC_012582	GAA	2	6	135115	135120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116504
2535	NC_012582	GC	3	6	135161	135166	0 %	0 %	50 %	50 %	227116504
2536	NC_012582	GTG	2	6	135172	135177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116504
2537	NC_012582	GAA	2	6	135187	135192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116504
2538	NC_012582	TGG	2	6	135203	135208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116504
2539	NC_012582	GGT	2	6	135226	135231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116504
2540	NC_012582	TGGT	2	8	135236	135243	0 %	50 %	50 %	0 %	227116504
2541	NC_012582	CAC	2	6	135336	135341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116504
2542	NC_012582	ATT	2	6	135343	135348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116504
2543	NC_012582	GAT	2	6	135355	135360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116504
2544	NC_012582	TCG	2	6	135371	135376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2545	NC_012582	TGA	2	6	135401	135406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116504
2546	NC_012582	TCG	2	6	135435	135440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2547	NC_012582	CGG	3	9	135453	135461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116504
2548	NC_012582	GCT	2	6	135603	135608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2549	NC_012582	CAT	2	6	135672	135677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116504
2550	NC_012582	TGAT	2	8	135767	135774	25 %	50 %	25 %	0 %	227116504
2551	NC_012582	GCA	2	6	135789	135794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2552	NC_012582	ACTC	2	8	135813	135820	25 %	25 %	0 %	50 %	227116504
2553	NC_012582	GCGCC	2	10	135825	135834	0 %	0 %	40 %	60 %	227116504
2554	NC_012582	GTA	2	6	135919	135924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116504
2555	NC_012582	GAA	2	6	135988	135993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116504
2556	NC_012582	CGT	2	6	136038	136043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116504
2557	NC_012582	A	6	6	136060	136065	100 %	0 %	0 %	0 %	227116504
2558	NC_012582	TTC	2	6	136105	136110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116504
2559	NC_012582	ATC	2	6	136155	136160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116505
2560	NC_012582	T	6	6	136215	136220	0 %	100 %	0 %	0 %	227116505
2561	NC_012582	GCG	2	6	136228	136233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116505
2562	NC_012582	TCA	2	6	136258	136263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116505
2563	NC_012582	TGG	2	6	136273	136278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116505
2564	NC_012582	ACGT	2	8	136324	136331	25 %	25 %	25 %	25 %	227116505
2565	NC_012582	TGC	2	6	136379	136384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116505
2566	NC_012582	TTA	2	6	136399	136404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116505
2567	NC_012582	ACC	2	6	136452	136457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116505
2568	NC_012582	GAT	2	6	136485	136490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116505
2569	NC_012582	GCC	2	6	136493	136498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116505
2570	NC_012582	TGT	2	6	136507	136512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116505
2571	NC_012582	G	6	6	136590	136595	0 %	0 %	100 %	0 %	227116505
2572	NC_012582	AGC	2	6	136638	136643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116505
2573	NC_012582	CG	4	8	136645	136652	0 %	0 %	50 %	50 %	227116505
2574	NC_012582	T	6	6	136706	136711	0 %	100 %	0 %	0 %	227116505
2575	NC_012582	CGG	2	6	136778	136783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116505
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2577	NC_012582	TGG	2	6	136859	136864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116505
2578	NC_012582	CTT	2	6	136943	136948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116505
2579	NC_012582	GGTT	2	8	136983	136990	0 %	50 %	50 %	0 %	227116505
2580	NC_012582	CGT	2	6	137054	137059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116505
2581	NC_012582	GAT	2	6	137082	137087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116505
2582	NC_012582	GC	3	6	137101	137106	0 %	0 %	50 %	50 %	227116505
2583	NC_012582	CTG	2	6	137220	137225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116505
2584	NC_012582	ATC	2	6	137289	137294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116505
2585	NC_012582	TCA	2	6	137326	137331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116505
2586	NC_012582	CTGG	2	8	137343	137350	0 %	25 %	50 %	25 %	227116505
2587	NC_012582	GGATT	2	10	137367	137376	20 %	40 %	40 %	0 %	227116505
2588	NC_012582	GCA	2	6	137434	137439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116505
2589	NC_012582	GCC	2	6	137478	137483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116505
2590	NC_012582	A	6	6	137588	137593	100 %	0 %	0 %	0 %	227116506
2591	NC_012582	CAG	2	6	137723	137728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116506
2592	NC_012582	CTC	2	6	137742	137747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116506
2593	NC_012582	GTG	2	6	137787	137792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116506
2594	NC_012582	ATC	2	6	137811	137816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116506
2595	NC_012582	ACCA	2	8	137909	137916	50 %	0 %	0 %	50 %	227116506
2596	NC_012582	AGT	2	6	137918	137923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116506
2597	NC_012582	CAGT	2	8	137924	137931	25 %	25 %	25 %	25 %	227116506
2598	NC_012582	GAA	2	6	137984	137989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116506
2599	NC_012582	GCAGA	2	10	138086	138095	40 %	0 %	40 %	20 %	227116506
2600	NC_012582	AC	3	6	138102	138107	50 %	0 %	0 %	50 %	227116506
2601	NC_012582	GCC	2	6	138323	138328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116507
2602	NC_012582	CCCA	2	8	138340	138347	25 %	0 %	0 %	75 %	227116507
2603	NC_012582	AG	3	6	138418	138423	50 %	0 %	50 %	0 %	227116507
2604	NC_012582	TCA	2	6	138453	138458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116507
2605	NC_012582	GCGA	2	8	138473	138480	25 %	0 %	50 %	25 %	227116507
2606	NC_012582	ATC	2	6	138491	138496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116507
2607	NC_012582	AACC	2	8	138498	138505	50 %	0 %	0 %	50 %	227116507
2608	NC_012582	GTG	2	6	138510	138515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116507
2609	NC_012582	TAAA	2	8	138562	138569	75 %	25 %	0 %	0 %	227116507
2610	NC_012582	GCC	2	6	138664	138669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116507
2611	NC_012582	CAG	2	6	138730	138735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116507
2612	NC_012582	CTT	3	9	138792	138800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116507
2613	NC_012582	ACTC	2	8	138823	138830	25 %	25 %	0 %	50 %	227116507
2614	NC_012582	CAG	2	6	138907	138912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116508
2615	NC_012582	GC	3	6	138963	138968	0 %	0 %	50 %	50 %	227116508
2616	NC_012582	CCAT	2	8	139243	139250	25 %	25 %	0 %	50 %	227116508
2617	NC_012582	TGGC	2	8	139476	139483	0 %	25 %	50 %	25 %	227116508
2618	NC_012582	TTG	2	6	139485	139490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116508
2619	NC_012582	CAA	2	6	139528	139533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116508
2620	NC_012582	GAT	2	6	139587	139592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116508
2621	NC_012582	CTG	2	6	139626	139631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116508
2622	NC_012582	CCT	2	6	139703	139708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116508
2623	NC_012582	AAAT	2	8	139766	139773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_012582	ATT	2	6	139847	139852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_012582	CAA	2	6	139989	139994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116509
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2639	NC_012582	CTG	2	6	140543	140548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2746	NC_012582	ATGA	2	8	146586	146593	50 %	25 %	25 %	0 %	227116515
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2751	NC_012582	A	6	6	146800	146805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2754	NC_012582	T	7	7	146949	146955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2756	NC_012582	A	7	7	146972	146978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2757	NC_012582	GATA	2	8	147010	147017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2869	NC_012582	CAC	2	6	152204	152209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116520
2870	NC_012582	GGC	2	6	152244	152249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116520
2871	NC_012582	CTG	2	6	152256	152261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116520
2872	NC_012582	GCA	2	6	152266	152271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116520
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2875	NC_012582	CGGT	2	8	152428	152435	0 %	25 %	50 %	25 %	227116520
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2879	NC_012582	AGC	2	6	152534	152539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116520
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2898	NC_012582	ACT	2	6	153619	153624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2990	NC_012582	CGT	2	6	157940	157945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116527
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2992	NC_012582	AGCA	2	8	158044	158051	50 %	0 %	25 %	25 %	227116527
2993	NC_012582	GCT	2	6	158081	158086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116527
2994	NC_012582	CAA	2	6	158109	158114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116527
2995	NC_012582	GGC	2	6	158138	158143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116527
2996	NC_012582	GCAC	2	8	158283	158290	25 %	0 %	25 %	50 %	227116527
2997	NC_012582	GAT	2	6	158408	158413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116527
2998	NC_012582	CAA	2	6	158427	158432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116527
2999	NC_012582	CAG	2	6	158439	158444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116527
3000	NC_012582	CGG	2	6	158447	158452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116527

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