MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012582	TCC	2	6	104681	104686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116476
2003	NC_012582	TGC	2	6	104696	104701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116476
2004	NC_012582	CAG	2	6	104737	104742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116476
2005	NC_012582	AAT	2	6	104767	104772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116476
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2007	NC_012582	TGGT	2	8	104840	104847	0 %	50 %	50 %	0 %	227116476
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2009	NC_012582	TGC	2	6	104938	104943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116476
2010	NC_012582	GGTT	2	8	105004	105011	0 %	50 %	50 %	0 %	227116476
2011	NC_012582	AGC	2	6	105039	105044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116476
2012	NC_012582	CCAAC	2	10	105045	105054	40 %	0 %	0 %	60 %	227116476
2013	NC_012582	TGT	2	6	105075	105080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116476
2014	NC_012582	TGG	2	6	105134	105139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_012582	ACC	3	9	105196	105204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116477
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2023	NC_012582	GTAA	2	8	105751	105758	50 %	25 %	25 %	0 %	227116478
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2092	NC_012582	CTGG	2	8	110304	110311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2093	NC_012582	ATAGA	2	10	110320	110329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_012582	CGT	2	6	110339	110344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2096	NC_012582	TTTGT	2	10	110372	110381	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2102	NC_012582	ATG	2	6	111061	111066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116482
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2105	NC_012582	GAT	2	6	111199	111204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116482
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2108	NC_012582	TTCA	2	8	111322	111329	25 %	50 %	0 %	25 %	227116482
2109	NC_012582	AG	3	6	111397	111402	50 %	0 %	50 %	0 %	227116482
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2121	NC_012582	AATC	2	8	112268	112275	50 %	25 %	0 %	25 %	227116483
2122	NC_012582	GGC	2	6	112311	112316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116483
2123	NC_012582	CCT	2	6	112416	112421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116484
2124	NC_012582	GT	3	6	112467	112472	0 %	50 %	50 %	0 %	227116484
2125	NC_012582	CTT	2	6	112482	112487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116484
2126	NC_012582	AGGC	2	8	112529	112536	25 %	0 %	50 %	25 %	227116484
2127	NC_012582	AAT	2	6	112557	112562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116484
2128	NC_012582	ACA	2	6	112808	112813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116485
2129	NC_012582	AC	3	6	112868	112873	50 %	0 %	0 %	50 %	227116485
2130	NC_012582	CCCA	2	8	112923	112930	25 %	0 %	0 %	75 %	227116485
2131	NC_012582	TGA	2	6	112944	112949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116485
2132	NC_012582	CGCTG	2	10	112955	112964	0 %	20 %	40 %	40 %	227116485
2133	NC_012582	AAG	2	6	113125	113130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116485
2134	NC_012582	ACCA	2	8	113239	113246	50 %	0 %	0 %	50 %	227116485
2135	NC_012582	CCA	2	6	113256	113261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116485
2136	NC_012582	C	6	6	113272	113277	0 %	0 %	0 %	100 %	227116485
2137	NC_012582	AC	3	6	113292	113297	50 %	0 %	0 %	50 %	227116485
2138	NC_012582	TGC	2	6	113315	113320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116485
2139	NC_012582	GAA	2	6	113364	113369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116485
2140	NC_012582	GCTG	2	8	113432	113439	0 %	25 %	50 %	25 %	227116486
2141	NC_012582	CAC	2	6	113534	113539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116486
2142	NC_012582	CCG	2	6	113545	113550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116486
2143	NC_012582	CAAT	2	8	113586	113593	50 %	25 %	0 %	25 %	227116486
2144	NC_012582	ACC	2	6	113594	113599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116486
2145	NC_012582	TGT	2	6	113622	113627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116486
2146	NC_012582	AACC	2	8	113648	113655	50 %	0 %	0 %	50 %	227116486
2147	NC_012582	GGC	2	6	113663	113668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116486
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2150	NC_012582	CAT	2	6	114052	114057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116486
2151	NC_012582	TGG	2	6	114109	114114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116486
2152	NC_012582	TAGA	2	8	114130	114137	50 %	25 %	25 %	0 %	227116486
2153	NC_012582	CAAG	2	8	114285	114292	50 %	0 %	25 %	25 %	227116486
2154	NC_012582	GCA	2	6	114354	114359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116486
2155	NC_012582	TCA	2	6	114396	114401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116486
2156	NC_012582	AGCG	2	8	114424	114431	25 %	0 %	50 %	25 %	227116486
2157	NC_012582	CAT	2	6	114437	114442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116486
2158	NC_012582	GTA	2	6	114482	114487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116486
2159	NC_012582	CCT	2	6	114505	114510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116486
2160	NC_012582	ACT	2	6	114524	114529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116486
2161	NC_012582	CTC	2	6	114704	114709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227116487
2162	NC_012582	GAT	2	6	114730	114735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116487
2163	NC_012582	GGT	2	6	114824	114829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116487
2164	NC_012582	CA	3	6	114898	114903	50 %	0 %	0 %	50 %	227116487
2165	NC_012582	TCA	2	6	114948	114953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116487
2166	NC_012582	CTG	2	6	115078	115083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116487
2167	NC_012582	AATC	2	8	115106	115113	50 %	25 %	0 %	25 %	227116487
2168	NC_012582	TCT	2	6	115125	115130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116487
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2170	NC_012582	GCT	2	6	115300	115305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116487
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2172	NC_012582	CAT	2	6	115369	115374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116487
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2179	NC_012582	AGA	2	6	115919	115924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116487
2180	NC_012582	AAT	2	6	115967	115972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116487
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2182	NC_012582	GAT	2	6	116009	116014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116487
2183	NC_012582	GC	3	6	116016	116021	0 %	0 %	50 %	50 %	227116487
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2186	NC_012582	TGA	2	6	116121	116126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116487
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2191	NC_012582	TAA	2	6	116652	116657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2192	NC_012582	GA	3	6	116689	116694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2193	NC_012582	TAA	2	6	116719	116724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2194	NC_012582	AG	3	6	116739	116744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2195	NC_012582	TCT	2	6	116745	116750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2196	NC_012582	GCA	2	6	116924	116929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116488
2197	NC_012582	A	7	7	116974	116980	100 %	0 %	0 %	0 %	227116488
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2202	NC_012582	CTC	2	6	117312	117317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2203	NC_012582	ATA	2	6	117344	117349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2204	NC_012582	ATTA	2	8	117447	117454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2205	NC_012582	CTG	2	6	117485	117490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2207	NC_012582	GA	3	6	117514	117519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2212	NC_012582	T	7	7	117712	117718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2213	NC_012582	ACA	2	6	117748	117753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2214	NC_012582	GTTTC	2	10	117814	117823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2215	NC_012582	CAA	2	6	117920	117925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2216	NC_012582	CA	4	8	117949	117956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2217	NC_012582	AC	3	6	118061	118066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2218	NC_012582	AAC	2	6	118092	118097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2219	NC_012582	AGC	2	6	118260	118265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2220	NC_012582	ACG	2	6	118314	118319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2221	NC_012582	TGA	2	6	118394	118399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2222	NC_012582	CCG	2	6	118422	118427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2223	NC_012582	ACC	2	6	118509	118514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2224	NC_012582	CTC	2	6	118628	118633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2225	NC_012582	GAG	2	6	118647	118652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2228	NC_012582	GTA	2	6	118829	118834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_012582	ATTTCA	2	12	118888	118899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2230	NC_012582	CAT	2	6	118927	118932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2231	NC_012582	GCC	2	6	119002	119007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2232	NC_012582	TAA	2	6	119127	119132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2233	NC_012582	TC	3	6	119254	119259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2234	NC_012582	ACC	2	6	119284	119289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2235	NC_012582	AGC	2	6	119374	119379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2236	NC_012582	CGT	2	6	119384	119389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2237	NC_012582	AG	4	8	119401	119408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2238	NC_012582	C	6	6	119484	119489	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2239	NC_012582	GAG	2	6	119615	119620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2240	NC_012582	CGACT	2	10	119792	119801	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2241	NC_012582	CTTT	2	8	119816	119823	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2242	NC_012582	ATG	2	6	119826	119831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2243	NC_012582	GCT	2	6	119832	119837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NC_012582	GTT	2	6	119921	119926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_012582	ACG	2	6	119936	119941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2246	NC_012582	GT	3	6	119958	119963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2247	NC_012582	TACT	2	8	119975	119982	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2248	NC_012582	AGT	2	6	120051	120056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_012582	TCGGT	2	10	120166	120175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2250	NC_012582	CAC	2	6	120352	120357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2251	NC_012582	GTAC	2	8	120377	120384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2252	NC_012582	GTCA	2	8	120460	120467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2253	NC_012582	GGA	2	6	120483	120488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2254	NC_012582	C	6	6	120493	120498	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2255	NC_012582	TCGC	2	8	120640	120647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2256	NC_012582	CTA	2	6	120650	120655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_012582	TCT	2	6	120674	120679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_012582	AAC	2	6	120926	120931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_012582	TGT	2	6	121035	121040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2260	NC_012582	ACAA	2	8	121075	121082	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2261	NC_012582	TTG	2	6	121090	121095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2262	NC_012582	TGA	2	6	121135	121140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2263	NC_012582	TGG	2	6	121180	121185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2264	NC_012582	CATGC	2	10	121217	121226	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2265	NC_012582	AATC	2	8	121279	121286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2266	NC_012582	TG	3	6	121287	121292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2267	NC_012582	TCA	2	6	121298	121303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2268	NC_012582	AGG	2	6	121320	121325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2269	NC_012582	TCC	2	6	121401	121406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2270	NC_012582	CTT	2	6	121425	121430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2271	NC_012582	GT	3	6	121461	121466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2272	NC_012582	ACG	2	6	121562	121567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2273	NC_012582	GT	3	6	121630	121635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_012582	ATG	2	6	121655	121660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2276	NC_012582	TCC	2	6	121681	121686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2277	NC_012582	CCA	2	6	121717	121722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2278	NC_012582	GAC	2	6	121795	121800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2280	NC_012582	TTC	2	6	121883	121888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2281	NC_012582	GCC	2	6	122126	122131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2282	NC_012582	C	6	6	122190	122195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2283	NC_012582	ACC	2	6	122272	122277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2284	NC_012582	GCT	2	6	122336	122341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2285	NC_012582	CTT	2	6	122361	122366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2286	NC_012582	TTAAC	2	10	122395	122404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2287	NC_012582	TCC	2	6	122410	122415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2288	NC_012582	CTT	2	6	122445	122450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2289	NC_012582	CTG	2	6	122504	122509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2291	NC_012582	TCG	2	6	122579	122584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2292	NC_012582	CCG	2	6	122753	122758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2293	NC_012582	TGC	2	6	122787	122792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2294	NC_012582	GCC	2	6	122818	122823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2295	NC_012582	T	6	6	122865	122870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2297	NC_012582	ATC	2	6	123006	123011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2299	NC_012582	GATT	2	8	123028	123035	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2300	NC_012582	TTC	2	6	123057	123062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2303	NC_012582	T	6	6	123123	123128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2304	NC_012582	T	6	6	123261	123266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2305	NC_012582	CTA	2	6	123330	123335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2307	NC_012582	ATG	2	6	123365	123370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116489
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2353	NC_012582	A	6	6	125631	125636	100 %	0 %	0 %	0 %	227116492
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2365	NC_012582	TAGC	2	8	126388	126395	25 %	25 %	25 %	25 %	227116493
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2369	NC_012582	GCGCA	2	10	126528	126537	20 %	0 %	40 %	40 %	227116493
2370	NC_012582	TGT	2	6	126547	126552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116493
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2374	NC_012582	TCA	2	6	126627	126632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116494
2375	NC_012582	A	7	7	126660	126666	100 %	0 %	0 %	0 %	227116494
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2377	NC_012582	ATAA	2	8	126705	126712	75 %	25 %	0 %	0 %	227116494
2378	NC_012582	TAT	2	6	126741	126746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116495
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2493	NC_012582	ATGG	2	8	133359	133366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2494	NC_012582	TAT	2	6	133394	133399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116503
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2497	NC_012582	CACT	2	8	133452	133459	25 %	25 %	0 %	50 %	227116503
2498	NC_012582	CAG	2	6	133482	133487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2499	NC_012582	CTG	2	6	133512	133517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116503
2500	NC_012582	AAC	2	6	133603	133608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116503

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