MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012582	ACC	2	6	79148	79153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116450
1502	NC_012582	GAC	2	6	79156	79161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1503	NC_012582	CAC	2	6	79213	79218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116450
1504	NC_012582	TCAA	2	8	79245	79252	50 %	25 %	0 %	25 %	227116450
1505	NC_012582	TCA	2	6	79402	79407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116450
1506	NC_012582	TGC	2	6	79428	79433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1507	NC_012582	A	6	6	79442	79447	100 %	0 %	0 %	0 %	227116450
1508	NC_012582	GTG	2	6	79553	79558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116450
1509	NC_012582	A	6	6	79593	79598	100 %	0 %	0 %	0 %	227116450
1510	NC_012582	AATG	2	8	79615	79622	50 %	25 %	25 %	0 %	227116450
1511	NC_012582	CAC	2	6	79736	79741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116450
1512	NC_012582	TGTT	2	8	79746	79753	0 %	75 %	25 %	0 %	227116450
1513	NC_012582	CGA	2	6	79825	79830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1514	NC_012582	G	6	6	79850	79855	0 %	0 %	100 %	0 %	227116450
1515	NC_012582	CCA	2	6	79932	79937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116450
1516	NC_012582	TGG	2	6	79956	79961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116450
1517	NC_012582	GCG	2	6	79998	80003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116450
1518	NC_012582	GGTGA	2	10	80054	80063	20 %	20 %	60 %	0 %	227116450
1519	NC_012582	CGC	2	6	80116	80121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116450
1520	NC_012582	AGC	2	6	80134	80139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1521	NC_012582	CT	3	6	80168	80173	0 %	50 %	0 %	50 %	227116450
1522	NC_012582	CAA	2	6	80186	80191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116450
1523	NC_012582	CGC	2	6	80305	80310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116450
1524	NC_012582	TGC	2	6	80440	80445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1525	NC_012582	GAAT	2	8	80590	80597	50 %	25 %	25 %	0 %	227116450
1526	NC_012582	TGG	2	6	80598	80603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116450
1527	NC_012582	GCA	2	6	80613	80618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1528	NC_012582	GATG	2	8	80734	80741	25 %	25 %	50 %	0 %	227116450
1529	NC_012582	CAA	2	6	80750	80755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116450
1530	NC_012582	TCG	2	6	80766	80771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1531	NC_012582	AGC	2	6	80814	80819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116450
1532	NC_012582	GCCA	2	8	80930	80937	25 %	0 %	25 %	50 %	227116450
1533	NC_012582	GAA	2	6	81014	81019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116450
1534	NC_012582	ATG	2	6	81054	81059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_012582	CAG	2	6	81060	81065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_012582	A	6	6	81085	81090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_012582	CCG	2	6	81098	81103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_012582	T	6	6	81105	81110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_012582	TCG	2	6	81121	81126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_012582	ATT	2	6	81153	81158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116451
1541	NC_012582	CAG	2	6	81178	81183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1542	NC_012582	TGT	2	6	81222	81227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116451
1543	NC_012582	AGC	2	6	81305	81310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1544	NC_012582	TGC	2	6	81341	81346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1545	NC_012582	GCA	2	6	81365	81370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1546	NC_012582	ATA	2	6	81380	81385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116451
1547	NC_012582	A	7	7	81427	81433	100 %	0 %	0 %	0 %	227116451
1548	NC_012582	TGG	2	6	81435	81440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116451
1549	NC_012582	CAG	2	6	81480	81485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1550	NC_012582	ATT	2	6	81536	81541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116451
1551	NC_012582	GAC	2	6	81544	81549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116451
1552	NC_012582	TCTG	2	8	81568	81575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_012582	CCG	2	6	81603	81608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_012582	TAAA	2	8	81639	81646	75 %	25 %	0 %	0 %	227116452
1555	NC_012582	TTTGG	2	10	81668	81677	0 %	60 %	40 %	0 %	227116452
1556	NC_012582	GGT	2	6	81713	81718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116452
1557	NC_012582	AAT	2	6	81759	81764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116453
1558	NC_012582	TGA	2	6	81827	81832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116453
1559	NC_012582	CT	3	6	81881	81886	0 %	50 %	0 %	50 %	227116453
1560	NC_012582	TTA	2	6	81930	81935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116453
1561	NC_012582	ATG	2	6	81970	81975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116453
1562	NC_012582	TCT	2	6	82004	82009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116453
1563	NC_012582	ATT	2	6	82020	82025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116453
1564	NC_012582	CAA	2	6	82035	82040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116453
1565	NC_012582	CAA	2	6	82107	82112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116453
1566	NC_012582	GAC	2	6	82201	82206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116453
1567	NC_012582	AAC	2	6	82236	82241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116453
1568	NC_012582	GA	3	6	82296	82301	50 %	0 %	50 %	0 %	227116453
1569	NC_012582	GC	4	8	82323	82330	0 %	0 %	50 %	50 %	227116454
1570	NC_012582	GCT	2	6	82400	82405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116454
1571	NC_012582	T	7	7	82462	82468	0 %	100 %	0 %	0 %	227116454
1572	NC_012582	GT	3	6	82484	82489	0 %	50 %	50 %	0 %	227116454
1573	NC_012582	AAG	2	6	82576	82581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116454
1574	NC_012582	TTC	2	6	82597	82602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116454
1575	NC_012582	CT	3	6	82656	82661	0 %	50 %	0 %	50 %	227116454
1576	NC_012582	TCAC	2	8	82708	82715	25 %	25 %	0 %	50 %	227116454
1577	NC_012582	GCT	2	6	82770	82775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116454
1578	NC_012582	GAT	3	9	82872	82880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116454
1579	NC_012582	CAT	2	6	82934	82939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116454
1580	NC_012582	TAC	2	6	83010	83015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116454
1581	NC_012582	CAA	2	6	83052	83057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116454
1582	NC_012582	AAC	2	6	83109	83114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116454
1583	NC_012582	AAAAG	2	10	83177	83186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_012582	GA	3	6	83312	83317	50 %	0 %	50 %	0 %	227116455
1585	NC_012582	ATC	2	6	83352	83357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116455
1586	NC_012582	CTCTT	2	10	83470	83479	0 %	60 %	0 %	40 %	227116455
1587	NC_012582	CAG	2	6	83514	83519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1588	NC_012582	CAG	2	6	83568	83573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1589	NC_012582	TTC	2	6	83682	83687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116455
1590	NC_012582	CAA	2	6	83784	83789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116455
1591	NC_012582	TGT	2	6	83828	83833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116455
1592	NC_012582	ATA	2	6	83838	83843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116455
1593	NC_012582	TCA	2	6	83846	83851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116455
1594	NC_012582	AAT	2	6	83877	83882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116455
1595	NC_012582	CCA	2	6	83903	83908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116455
1596	NC_012582	GCA	2	6	83996	84001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1597	NC_012582	CAG	2	6	84066	84071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1598	NC_012582	CA	3	6	84080	84085	50 %	0 %	0 %	50 %	227116455
1599	NC_012582	TG	3	6	84119	84124	0 %	50 %	50 %	0 %	227116455
1600	NC_012582	TCA	2	6	84125	84130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116455
1601	NC_012582	TTCA	2	8	84222	84229	25 %	50 %	0 %	25 %	227116455
1602	NC_012582	GCA	2	6	84305	84310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1603	NC_012582	TTCTCT	2	12	84322	84333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116455
1604	NC_012582	GCA	2	6	84479	84484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1605	NC_012582	AAC	2	6	84544	84549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116455
1606	NC_012582	CGA	2	6	84604	84609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1607	NC_012582	GAA	2	6	84612	84617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116455
1608	NC_012582	CGC	3	9	84620	84628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116455
1609	NC_012582	CAG	2	6	84671	84676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1610	NC_012582	GCG	2	6	84683	84688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116455
1611	NC_012582	AGTA	2	8	84724	84731	50 %	25 %	25 %	0 %	227116455
1612	NC_012582	CAAC	2	8	84843	84850	50 %	0 %	0 %	50 %	227116455
1613	NC_012582	T	6	6	84867	84872	0 %	100 %	0 %	0 %	227116455
1614	NC_012582	CCG	2	6	84893	84898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116455
1615	NC_012582	CTT	2	6	84923	84928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116455
1616	NC_012582	GC	3	6	84930	84935	0 %	0 %	50 %	50 %	227116455
1617	NC_012582	TCA	2	6	85001	85006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116455
1618	NC_012582	CGC	2	6	85050	85055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116455
1619	NC_012582	TCTT	2	8	85242	85249	0 %	75 %	0 %	25 %	227116455
1620	NC_012582	CTT	2	6	85253	85258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116455
1621	NC_012582	CAG	2	6	85335	85340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1622	NC_012582	CAG	2	6	85389	85394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116455
1623	NC_012582	CTT	2	6	85478	85483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116455
1624	NC_012582	AGT	2	6	85630	85635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116455
1625	NC_012582	ATA	2	6	85643	85648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116455
1626	NC_012582	T	6	6	85754	85759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_012582	GC	3	6	85760	85765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1758	NC_012582	CA	3	6	92454	92459	50 %	0 %	0 %	50 %	227116463
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1882	NC_012582	TCA	2	6	98755	98760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116468
1883	NC_012582	A	7	7	98778	98784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1884	NC_012582	GGC	2	6	98817	98822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1885	NC_012582	CGA	2	6	98914	98919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116469
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1990	NC_012582	AC	3	6	104236	104241	50 %	0 %	0 %	50 %	227116476
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1997	NC_012582	TTG	2	6	104395	104400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116476
1998	NC_012582	CAT	2	6	104428	104433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116476
1999	NC_012582	GCT	2	6	104439	104444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116476
2000	NC_012582	TAA	2	6	104450	104455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116476

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