MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012582	TTC	3	9	287036	287044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116643
5502	NC_012582	ATA	2	6	287045	287050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116643
5503	NC_012582	ACCA	2	8	287052	287059	50 %	0 %	0 %	50 %	227116643
5504	NC_012582	GCTA	2	8	287155	287162	25 %	25 %	25 %	25 %	227116643
5505	NC_012582	CTTT	2	8	287231	287238	0 %	75 %	0 %	25 %	227116643
5506	NC_012582	AATT	2	8	287324	287331	50 %	50 %	0 %	0 %	227116643
5507	NC_012582	ATA	2	6	287341	287346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116643
5508	NC_012582	TAG	2	6	287381	287386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116643
5509	NC_012582	A	6	6	287440	287445	100 %	0 %	0 %	0 %	227116643
5510	NC_012582	T	6	6	287450	287455	0 %	100 %	0 %	0 %	227116643
5511	NC_012582	GTA	2	6	287460	287465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116643
5512	NC_012582	ACA	2	6	287531	287536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116644
5513	NC_012582	TGG	2	6	287551	287556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116644
5514	NC_012582	AGA	2	6	287632	287637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116644
5515	NC_012582	TAT	2	6	287653	287658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116644
5516	NC_012582	CCA	2	6	287714	287719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116644
5517	NC_012582	TGAC	2	8	287760	287767	25 %	25 %	25 %	25 %	227116644
5518	NC_012582	CAA	2	6	287855	287860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116644
5519	NC_012582	GAA	2	6	287867	287872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116644
5520	NC_012582	AT	3	6	287982	287987	50 %	50 %	0 %	0 %	227116644
5521	NC_012582	TGA	2	6	288016	288021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116644
5522	NC_012582	AAG	2	6	288065	288070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116644
5523	NC_012582	GTT	2	6	288080	288085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116644
5524	NC_012582	TCT	2	6	288089	288094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116644
5525	NC_012582	ACT	2	6	288189	288194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116644
5526	NC_012582	A	6	6	288209	288214	100 %	0 %	0 %	0 %	227116644
5527	NC_012582	A	6	6	288228	288233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_012582	GAA	2	6	288277	288282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116645
5529	NC_012582	A	6	6	288281	288286	100 %	0 %	0 %	0 %	227116645
5530	NC_012582	TAT	2	6	288327	288332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116645
5531	NC_012582	TAA	2	6	288333	288338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116645
5532	NC_012582	AAT	2	6	288390	288395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116645
5533	NC_012582	AGT	2	6	288420	288425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116645
5534	NC_012582	AGA	2	6	288453	288458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116645
5535	NC_012582	TAAT	2	8	288482	288489	50 %	50 %	0 %	0 %	227116645
5536	NC_012582	GA	3	6	288516	288521	50 %	0 %	50 %	0 %	227116646
5537	NC_012582	A	8	8	288611	288618	100 %	0 %	0 %	0 %	227116646
5538	NC_012582	TAA	2	6	288677	288682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116646
5539	NC_012582	TATT	2	8	288805	288812	25 %	75 %	0 %	0 %	227116646
5540	NC_012582	A	6	6	288814	288819	100 %	0 %	0 %	0 %	227116646
5541	NC_012582	TTA	2	6	288829	288834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116646
5542	NC_012582	ATAG	2	8	288840	288847	50 %	25 %	25 %	0 %	227116646
5543	NC_012582	ATA	2	6	288859	288864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116646
5544	NC_012582	TAC	2	6	288914	288919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116646
5545	NC_012582	A	6	6	288992	288997	100 %	0 %	0 %	0 %	227116646
5546	NC_012582	GGT	2	6	289080	289085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116646
5547	NC_012582	GCT	2	6	289099	289104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116646
5548	NC_012582	AT	3	6	289187	289192	50 %	50 %	0 %	0 %	227116646
5549	NC_012582	ATG	2	6	289375	289380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116646
5550	NC_012582	ATC	2	6	289425	289430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116646
5551	NC_012582	ATA	2	6	289432	289437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116646
5552	NC_012582	GTT	2	6	289578	289583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116646
5553	NC_012582	AAT	2	6	289619	289624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116646
5554	NC_012582	GGC	2	6	289632	289637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116646
5555	NC_012582	A	6	6	289638	289643	100 %	0 %	0 %	0 %	227116646
5556	NC_012582	TAT	2	6	289669	289674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116646
5557	NC_012582	GCT	2	6	289707	289712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116646
5558	NC_012582	TTG	2	6	289753	289758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116646
5559	NC_012582	A	6	6	289842	289847	100 %	0 %	0 %	0 %	227116646
5560	NC_012582	TATAG	2	10	289848	289857	40 %	40 %	20 %	0 %	227116646
5561	NC_012582	TCT	2	6	289908	289913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116646
5562	NC_012582	TAG	2	6	290016	290021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116647
5563	NC_012582	TTA	3	9	290037	290045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116647
5564	NC_012582	CCTT	2	8	290048	290055	0 %	50 %	0 %	50 %	227116647
5565	NC_012582	TTA	2	6	290091	290096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116647
5566	NC_012582	GGC	2	6	290213	290218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116647
5567	NC_012582	TGC	2	6	290335	290340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116647
5568	NC_012582	CAA	2	6	290346	290351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116647
5569	NC_012582	GGCT	2	8	290359	290366	0 %	25 %	50 %	25 %	227116647
5570	NC_012582	GCT	2	6	290381	290386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116647
5571	NC_012582	T	6	6	290437	290442	0 %	100 %	0 %	0 %	227116647
5572	NC_012582	AAC	2	6	290503	290508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116647
5573	NC_012582	CT	4	8	290520	290527	0 %	50 %	0 %	50 %	227116647
5574	NC_012582	TGAT	2	8	290553	290560	25 %	50 %	25 %	0 %	227116647
5575	NC_012582	TGA	2	6	290568	290573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116647
5576	NC_012582	AAT	2	6	290599	290604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116647
5577	NC_012582	AGC	2	6	290642	290647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116647
5578	NC_012582	CAA	2	6	290666	290671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116647
5579	NC_012582	GCT	2	6	290672	290677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116647
5580	NC_012582	GGGT	2	8	290687	290694	0 %	25 %	75 %	0 %	227116647
5581	NC_012582	TTA	2	6	290780	290785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116647
5582	NC_012582	TAA	2	6	290869	290874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116647
5583	NC_012582	ATT	2	6	290881	290886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116647
5584	NC_012582	AAC	2	6	290940	290945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116647
5585	NC_012582	CTG	2	6	290982	290987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116647
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5587	NC_012582	ACTT	2	8	291134	291141	25 %	50 %	0 %	25 %	227116648
5588	NC_012582	CAT	2	6	291154	291159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116648
5589	NC_012582	A	7	7	291194	291200	100 %	0 %	0 %	0 %	227116648
5590	NC_012582	GAT	2	6	291301	291306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5591	NC_012582	TCT	2	6	291328	291333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116648
5592	NC_012582	TCG	2	6	291381	291386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116648
5593	NC_012582	AGG	2	6	291416	291421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227116648
5594	NC_012582	GCG	2	6	291505	291510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116648
5595	NC_012582	TTG	2	6	291602	291607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116648
5596	NC_012582	TGG	2	6	291747	291752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116648
5597	NC_012582	A	6	6	291757	291762	100 %	0 %	0 %	0 %	227116648
5598	NC_012582	TGA	2	6	291831	291836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5599	NC_012582	TGT	2	6	291837	291842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116648
5600	NC_012582	ATT	2	6	291931	291936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116648
5601	NC_012582	TGA	2	6	291939	291944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5602	NC_012582	GT	3	6	291958	291963	0 %	50 %	50 %	0 %	227116648
5603	NC_012582	TGT	2	6	292026	292031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116648
5604	NC_012582	GAA	2	6	292057	292062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116648
5605	NC_012582	A	7	7	292116	292122	100 %	0 %	0 %	0 %	227116648
5606	NC_012582	CAA	2	6	292195	292200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116648
5607	NC_012582	AG	3	6	292203	292208	50 %	0 %	50 %	0 %	227116648
5608	NC_012582	GAT	2	6	292240	292245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5609	NC_012582	CAG	2	6	292261	292266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116648
5610	NC_012582	TGGC	2	8	292306	292313	0 %	25 %	50 %	25 %	227116648
5611	NC_012582	AACC	2	8	292315	292322	50 %	0 %	0 %	50 %	227116648
5612	NC_012582	GC	3	6	292354	292359	0 %	0 %	50 %	50 %	227116648
5613	NC_012582	T	6	6	292485	292490	0 %	100 %	0 %	0 %	227116648
5614	NC_012582	T	6	6	292497	292502	0 %	100 %	0 %	0 %	227116648
5615	NC_012582	GTATC	2	10	292550	292559	20 %	40 %	20 %	20 %	227116648
5616	NC_012582	TAT	2	6	292676	292681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116648
5617	NC_012582	GGT	2	6	292717	292722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116648
5618	NC_012582	TGA	2	6	292737	292742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5619	NC_012582	TTA	2	6	292744	292749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116648
5620	NC_012582	TGT	2	6	292761	292766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116648
5621	NC_012582	G	7	7	292835	292841	0 %	0 %	100 %	0 %	227116648
5622	NC_012582	ATA	2	6	292883	292888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116648
5623	NC_012582	ATG	2	6	292921	292926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116648
5624	NC_012582	GTT	2	6	292927	292932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116648
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5746	NC_012582	CAT	2	6	299482	299487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116653
5747	NC_012582	ATAC	2	8	299506	299513	50 %	25 %	0 %	25 %	227116653
5748	NC_012582	AG	3	6	299532	299537	50 %	0 %	50 %	0 %	227116653
5749	NC_012582	TCA	2	6	299553	299558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116653
5750	NC_012582	GCA	2	6	299618	299623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116653
5751	NC_012582	CAT	2	6	299649	299654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116653
5752	NC_012582	ATG	2	6	299677	299682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116653
5753	NC_012582	AGC	2	6	299727	299732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5754	NC_012582	CCAAC	2	10	299748	299757	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5755	NC_012582	ATG	2	6	299830	299835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116654
5756	NC_012582	CAA	2	6	299997	300002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116655
5757	NC_012582	GA	3	6	300054	300059	50 %	0 %	50 %	0 %	227116655
5758	NC_012582	AAGC	2	8	300183	300190	50 %	0 %	25 %	25 %	227116655
5759	NC_012582	CTG	2	6	300196	300201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116655
5760	NC_012582	ATG	2	6	300277	300282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116655
5761	NC_012582	AAC	2	6	300331	300336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116655
5762	NC_012582	TTA	2	6	300339	300344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116655
5763	NC_012582	GCA	2	6	300351	300356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116655
5764	NC_012582	ATG	2	6	300432	300437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116655
5765	NC_012582	TTG	2	6	300533	300538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116655
5766	NC_012582	T	7	7	300565	300571	0 %	100 %	0 %	0 %	227116655
5767	NC_012582	CTT	2	6	300606	300611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116655
5768	NC_012582	ATT	2	6	300647	300652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116655
5769	NC_012582	A	6	6	300757	300762	100 %	0 %	0 %	0 %	227116655
5770	NC_012582	GC	3	6	300804	300809	0 %	0 %	50 %	50 %	227116655
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5773	NC_012582	TGT	2	6	300896	300901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116656
5774	NC_012582	ATTG	2	8	300918	300925	25 %	50 %	25 %	0 %	227116656
5775	NC_012582	TG	3	6	300924	300929	0 %	50 %	50 %	0 %	227116656
5776	NC_012582	TGGT	2	8	301058	301065	0 %	50 %	50 %	0 %	227116656
5777	NC_012582	CTT	2	6	301067	301072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116656
5778	NC_012582	TGA	2	6	301113	301118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116656
5779	NC_012582	CTTG	2	8	301175	301182	0 %	50 %	25 %	25 %	227116656
5780	NC_012582	CAA	2	6	301189	301194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116656
5781	NC_012582	TTG	2	6	301202	301207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116656
5782	NC_012582	GAT	2	6	301317	301322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116656
5783	NC_012582	A	6	6	301338	301343	100 %	0 %	0 %	0 %	227116656
5784	NC_012582	TGG	2	6	301535	301540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5785	NC_012582	ACA	2	6	301596	301601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116657
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5788	NC_012582	GATT	2	8	301681	301688	25 %	50 %	25 %	0 %	227116657
5789	NC_012582	GGC	2	6	301810	301815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116657
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5792	NC_012582	CGG	2	6	301851	301856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116657
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5800	NC_012582	GAT	2	6	302236	302241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116657
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5802	NC_012582	CGG	2	6	302260	302265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116657
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5804	NC_012582	GCT	2	6	302308	302313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116657
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5816	NC_012582	CAAG	2	8	302866	302873	50 %	0 %	25 %	25 %	227116657
5817	NC_012582	TCC	2	6	302955	302960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5819	NC_012582	TCCC	2	8	303020	303027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5820	NC_012582	TCC	2	6	303121	303126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5821	NC_012582	C	6	6	303125	303130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5825	NC_012582	GGC	3	9	303454	303462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116658
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5827	NC_012582	GCT	2	6	303506	303511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116658
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5833	NC_012582	TGC	2	6	303619	303624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116658
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5847	NC_012582	TAC	2	6	304447	304452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5852	NC_012582	GAGT	2	8	304684	304691	25 %	25 %	50 %	0 %	227116659
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