MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome chromosome I

Total Repeats: 57925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012582	GC	3	6	259181	259186	0 %	0 %	50 %	50 %	227116614
5002	NC_012582	GCA	2	6	259328	259333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116614
5003	NC_012582	TTTA	2	8	259342	259349	25 %	75 %	0 %	0 %	227116614
5004	NC_012582	TGC	2	6	259357	259362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116614
5005	NC_012582	TA	3	6	259386	259391	50 %	50 %	0 %	0 %	227116614
5006	NC_012582	TGA	2	6	259424	259429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116614
5007	NC_012582	GCG	2	6	259455	259460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116614
5008	NC_012582	CA	3	6	259525	259530	50 %	0 %	0 %	50 %	227116614
5009	NC_012582	ACC	2	6	259531	259536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116614
5010	NC_012582	GTC	2	6	259635	259640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116614
5011	NC_012582	T	6	6	259754	259759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012582	AG	4	8	259921	259928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012582	CCA	2	6	259935	259940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_012582	AAC	2	6	260025	260030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116615
5015	NC_012582	A	6	6	260042	260047	100 %	0 %	0 %	0 %	227116615
5016	NC_012582	CTA	2	6	260050	260055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116615
5017	NC_012582	CGT	2	6	260058	260063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116615
5018	NC_012582	AG	3	6	260099	260104	50 %	0 %	50 %	0 %	227116615
5019	NC_012582	ATC	2	6	260151	260156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116615
5020	NC_012582	A	6	6	260249	260254	100 %	0 %	0 %	0 %	227116616
5021	NC_012582	ATC	2	6	260265	260270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116616
5022	NC_012582	AAG	2	6	260378	260383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116616
5023	NC_012582	A	7	7	260426	260432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_012582	T	7	7	260450	260456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012582	CTC	2	6	260510	260515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_012582	ACT	2	6	260526	260531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_012582	AAC	2	6	260657	260662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227116617
5028	NC_012582	TATT	2	8	260726	260733	25 %	75 %	0 %	0 %	227116617
5029	NC_012582	A	6	6	260817	260822	100 %	0 %	0 %	0 %	227116617
5030	NC_012582	TGAGT	2	10	260848	260857	20 %	40 %	40 %	0 %	227116617
5031	NC_012582	CACT	2	8	260892	260899	25 %	25 %	0 %	50 %	227116617
5032	NC_012582	CAAC	2	8	260936	260943	50 %	0 %	0 %	50 %	227116617
5033	NC_012582	A	6	6	261037	261042	100 %	0 %	0 %	0 %	227116617
5034	NC_012582	TGAAGT	2	12	261130	261141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116618
5035	NC_012582	TACG	2	8	261198	261205	25 %	25 %	25 %	25 %	227116618
5036	NC_012582	TCG	2	6	261274	261279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116618
5037	NC_012582	ATT	2	6	261293	261298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116618
5038	NC_012582	CCG	2	6	261303	261308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116618
5039	NC_012582	TGA	2	6	261402	261407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116618
5040	NC_012582	TGA	2	6	261472	261477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116618
5041	NC_012582	AT	3	6	261538	261543	50 %	50 %	0 %	0 %	227116618
5042	NC_012582	GC	3	6	261554	261559	0 %	0 %	50 %	50 %	227116618
5043	NC_012582	TCCA	2	8	261657	261664	25 %	25 %	0 %	50 %	227116618
5044	NC_012582	TGC	2	6	261729	261734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116618
5045	NC_012582	GGC	2	6	261752	261757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116618
5046	NC_012582	T	7	7	262027	262033	0 %	100 %	0 %	0 %	227116619
5047	NC_012582	CCG	2	6	262086	262091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116619
5048	NC_012582	CGA	2	6	262118	262123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116619
5049	NC_012582	CGG	2	6	262141	262146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116619
5050	NC_012582	AC	3	6	262156	262161	50 %	0 %	0 %	50 %	227116619
5051	NC_012582	GC	3	6	262337	262342	0 %	0 %	50 %	50 %	227116619
5052	NC_012582	GGC	2	6	262391	262396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116619
5053	NC_012582	GAT	2	6	262403	262408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116619
5054	NC_012582	TCA	2	6	262413	262418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116619
5055	NC_012582	GCGCG	2	10	262426	262435	0 %	0 %	60 %	40 %	227116619
5056	NC_012582	TCAA	2	8	262437	262444	50 %	25 %	0 %	25 %	227116619
5057	NC_012582	TCA	2	6	262527	262532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_012582	ATG	2	6	262589	262594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012582	CCG	2	6	262751	262756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116620
5060	NC_012582	ATC	2	6	262792	262797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116620
5061	NC_012582	GCA	2	6	262824	262829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116620
5062	NC_012582	CAG	2	6	262858	262863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116620
5063	NC_012582	GC	3	6	262921	262926	0 %	0 %	50 %	50 %	227116620
5064	NC_012582	T	6	6	263049	263054	0 %	100 %	0 %	0 %	227116620
5065	NC_012582	ATT	2	6	263074	263079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116620
5066	NC_012582	CAG	2	6	263108	263113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116620
5067	NC_012582	GCAGC	3	15	263122	263136	20 %	0 %	40 %	40 %	227116620
5068	NC_012582	GTG	2	6	263198	263203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116620
5069	NC_012582	AAT	2	6	263212	263217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116620
5070	NC_012582	GATG	2	8	263256	263263	25 %	25 %	50 %	0 %	227116620
5071	NC_012582	GTG	2	6	263275	263280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116620
5072	NC_012582	GAA	2	6	263299	263304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116620
5073	NC_012582	GCG	2	6	263311	263316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227116620
5074	NC_012582	GTTG	2	8	263379	263386	0 %	50 %	50 %	0 %	227116620
5075	NC_012582	GC	3	6	263408	263413	0 %	0 %	50 %	50 %	227116620
5076	NC_012582	TTC	2	6	263482	263487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116620
5077	NC_012582	CCG	2	6	263560	263565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116620
5078	NC_012582	A	6	6	263670	263675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012582	CTTTGT	2	12	263691	263702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5080	NC_012582	GATA	2	8	263713	263720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012582	AG	3	6	263795	263800	50 %	0 %	50 %	0 %	227116621
5082	NC_012582	A	6	6	263832	263837	100 %	0 %	0 %	0 %	227116621
5083	NC_012582	CTT	2	6	263906	263911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116621
5084	NC_012582	ATCGC	2	10	264000	264009	20 %	20 %	20 %	40 %	227116621
5085	NC_012582	AGTTG	2	10	264084	264093	20 %	40 %	40 %	0 %	227116621
5086	NC_012582	GCA	2	6	264198	264203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116621
5087	NC_012582	ACG	2	6	264356	264361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116621
5088	NC_012582	CG	3	6	264360	264365	0 %	0 %	50 %	50 %	227116621
5089	NC_012582	TCA	2	6	264411	264416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116621
5090	NC_012582	T	6	6	264465	264470	0 %	100 %	0 %	0 %	227116621
5091	NC_012582	TG	3	6	264561	264566	0 %	50 %	50 %	0 %	227116622
5092	NC_012582	ATG	2	6	264570	264575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116622
5093	NC_012582	CAG	2	6	264577	264582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5094	NC_012582	TTG	2	6	264608	264613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116622
5095	NC_012582	CTG	2	6	264668	264673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5096	NC_012582	CTT	2	6	264703	264708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227116622
5097	NC_012582	CCA	2	6	264892	264897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116622
5098	NC_012582	TGCT	2	8	264920	264927	0 %	50 %	25 %	25 %	227116622
5099	NC_012582	TTG	3	9	264992	265000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116622
5100	NC_012582	CTG	2	6	265015	265020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5101	NC_012582	TGCT	2	8	265054	265061	0 %	50 %	25 %	25 %	227116622
5102	NC_012582	CAC	2	6	265067	265072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116622
5103	NC_012582	GCT	2	6	265084	265089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5104	NC_012582	GTGA	2	8	265137	265144	25 %	25 %	50 %	0 %	227116622
5105	NC_012582	GC	3	6	265268	265273	0 %	0 %	50 %	50 %	227116622
5106	NC_012582	GC	3	6	265295	265300	0 %	0 %	50 %	50 %	227116622
5107	NC_012582	GCA	2	6	265348	265353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5108	NC_012582	TGC	2	6	265380	265385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116622
5109	NC_012582	T	6	6	265415	265420	0 %	100 %	0 %	0 %	227116622
5110	NC_012582	GCA	2	6	265689	265694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116623
5111	NC_012582	ACG	2	6	265765	265770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5112	NC_012582	GCA	2	6	265772	265777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5113	NC_012582	GTTTG	2	10	265782	265791	0 %	60 %	40 %	0 %	227116624
5114	NC_012582	ACG	2	6	265792	265797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5115	NC_012582	TGC	2	6	265824	265829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5116	NC_012582	GCA	2	6	265844	265849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5117	NC_012582	TGCGT	2	10	265922	265931	0 %	40 %	40 %	20 %	227116624
5118	NC_012582	CGC	2	6	265938	265943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227116624
5119	NC_012582	GGT	2	6	265944	265949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116624
5120	NC_012582	TGG	2	6	265963	265968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116624
5121	NC_012582	TGC	2	6	266023	266028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5122	NC_012582	CTG	2	6	266097	266102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227116624
5123	NC_012582	TTGA	2	8	266268	266275	25 %	50 %	25 %	0 %	227116624
5124	NC_012582	ATT	2	6	266295	266300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116624
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5126	NC_012582	TAT	2	6	266426	266431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116624
5127	NC_012582	TTA	2	6	266614	266619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227116625
5128	NC_012582	TAA	2	6	266624	266629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227116625
5129	NC_012582	TA	3	6	266653	266658	50 %	50 %	0 %	0 %	227116625
5130	NC_012582	ATG	2	6	266668	266673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116625
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5145	NC_012582	T	7	7	267318	267324	0 %	100 %	0 %	0 %	227116625
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5165	NC_012582	CTCGC	2	10	268487	268496	0 %	20 %	20 %	60 %	227116627
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5232	NC_012582	ACC	2	6	272537	272542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227116631
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5242	NC_012582	TAGCT	2	10	272965	272974	20 %	40 %	20 %	20 %	227116631
5243	NC_012582	AG	3	6	273031	273036	50 %	0 %	50 %	0 %	227116631
5244	NC_012582	TG	3	6	273115	273120	0 %	50 %	50 %	0 %	227116632
5245	NC_012582	TGT	2	6	273150	273155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116632
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5247	NC_012582	AG	3	6	273230	273235	50 %	0 %	50 %	0 %	227116632
5248	NC_012582	A	6	6	273263	273268	100 %	0 %	0 %	0 %	227116632
5249	NC_012582	GT	3	6	273281	273286	0 %	50 %	50 %	0 %	227116632
5250	NC_012582	TCA	2	6	273364	273369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116632
5251	NC_012582	AAGA	2	8	273456	273463	75 %	0 %	25 %	0 %	227116632
5252	NC_012582	GTT	3	9	273479	273487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227116632
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5254	NC_012582	GCAT	2	8	273665	273672	25 %	25 %	25 %	25 %	227116632
5255	NC_012582	ATC	2	6	273885	273890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227116632
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5257	NC_012582	GAC	2	6	274258	274263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227116633
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5259	NC_012582	GTG	3	9	274303	274311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116633
5260	NC_012582	CAAC	2	8	274353	274360	50 %	0 %	0 %	50 %	227116633
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5281	NC_012582	TGA	2	6	275614	275619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116634
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5291	NC_012582	AGATA	2	10	275923	275932	60 %	20 %	20 %	0 %	227116634
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5300	NC_012582	TAGAG	2	10	276282	276291	40 %	20 %	40 %	0 %	227116634
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5371	NC_012582	TAT	2	6	280117	280122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_012582	ATT	2	6	280163	280168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5373	NC_012582	TTG	2	6	280169	280174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_012582	TTG	2	6	280264	280269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5489	NC_012582	ATTTT	2	10	286261	286270	20 %	80 %	0 %	0 %	227116642
5490	NC_012582	GA	3	6	286320	286325	50 %	0 %	50 %	0 %	227116642
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5493	NC_012582	GGT	2	6	286413	286418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227116642
5494	NC_012582	GAA	2	6	286503	286508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227116642
5495	NC_012582	GAAA	2	8	286550	286557	75 %	0 %	25 %	0 %	227116642
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5497	NC_012582	T	6	6	286674	286679	0 %	100 %	0 %	0 %	227116642
5498	NC_012582	T	6	6	286712	286717	0 %	100 %	0 %	0 %	227116643
5499	NC_012582	GAT	2	6	286870	286875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227116643
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