MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 2787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012580	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012580	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012580	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012580	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	227811636
6	NC_012580	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
7	NC_012580	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	227811636
8	NC_012580	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	227811636
9	NC_012580	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	227811636
10	NC_012580	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	227811636
11	NC_012580	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	227811636
12	NC_012580	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
13	NC_012580	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	227811636
14	NC_012580	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012580	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	227811637
16	NC_012580	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	227811637
17	NC_012580	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012580	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	475645757
19	NC_012580	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	475645757
20	NC_012580	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	227811640
21	NC_012580	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	227811640
22	NC_012580	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	227811640
23	NC_012580	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	475645758
24	NC_012580	GTCT	2	8	6195	6202	0 %	50 %	25 %	25 %	475645758
25	NC_012580	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	475645758
26	NC_012580	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	475645758
27	NC_012580	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	227811642
28	NC_012580	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	227811642
29	NC_012580	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	227811642
30	NC_012580	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	227811642
31	NC_012580	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	227811642
32	NC_012580	ATAG	2	8	8003	8010	50 %	25 %	25 %	0 %	227811642
33	NC_012580	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	227811642
34	NC_012580	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012580	AGTG	2	8	8483	8490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012580	AATG	2	8	9250	9257	50 %	25 %	25 %	0 %	227811644
37	NC_012580	TGGT	2	8	9408	9415	0 %	50 %	50 %	0 %	227811644
38	NC_012580	TCAA	2	8	9996	10003	50 %	25 %	0 %	25 %	227811644
39	NC_012580	GCCA	2	8	10425	10432	25 %	0 %	25 %	50 %	227811644
40	NC_012580	TTGA	2	8	10484	10491	25 %	50 %	25 %	0 %	227811644
41	NC_012580	AGTT	2	8	10732	10739	25 %	50 %	25 %	0 %	227811644
42	NC_012580	GAGC	2	8	10969	10976	25 %	0 %	50 %	25 %	227811644
43	NC_012580	GTTG	2	8	11089	11096	0 %	50 %	50 %	0 %	227811644
44	NC_012580	CACG	2	8	11161	11168	25 %	0 %	25 %	50 %	227811644
45	NC_012580	AATC	2	8	11897	11904	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012580	TCAC	2	8	12118	12125	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012580	ACCA	2	8	13331	13338	50 %	0 %	0 %	50 %	227811645
48	NC_012580	GAGT	2	8	13369	13376	25 %	25 %	50 %	0 %	227811645
49	NC_012580	GTGC	2	8	13448	13455	0 %	25 %	50 %	25 %	227811645
50	NC_012580	GCTG	2	8	13677	13684	0 %	25 %	50 %	25 %	227811645
51	NC_012580	GATG	2	8	14281	14288	25 %	25 %	50 %	0 %	227811645
52	NC_012580	CGAT	2	8	14846	14853	25 %	25 %	25 %	25 %	227811646
53	NC_012580	ATTG	2	8	15209	15216	25 %	50 %	25 %	0 %	227811646
54	NC_012580	TATG	2	8	18858	18865	25 %	50 %	25 %	0 %	227811647
55	NC_012580	GGAT	2	8	19112	19119	25 %	25 %	50 %	0 %	227811647
56	NC_012580	CAAG	2	8	19585	19592	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_012580	TCAT	2	8	19724	19731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012580	ATTC	2	8	19851	19858	25 %	50 %	0 %	25 %	227811648
59	NC_012580	GGAA	2	8	20397	20404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012580	TGCC	2	8	20719	20726	0 %	25 %	25 %	50 %	227811649
61	NC_012580	GCGG	2	8	21033	21040	0 %	0 %	75 %	25 %	227811649
62	NC_012580	CGGG	2	8	21590	21597	0 %	0 %	75 %	25 %	227811649
63	NC_012580	GGGC	2	8	21676	21683	0 %	0 %	75 %	25 %	227811649
64	NC_012580	TTTC	2	8	21733	21740	0 %	75 %	0 %	25 %	227811649
65	NC_012580	TTGA	2	8	21945	21952	25 %	50 %	25 %	0 %	227811649
66	NC_012580	CAAC	2	8	22028	22035	50 %	0 %	0 %	50 %	227811649
67	NC_012580	GCAG	2	8	22293	22300	25 %	0 %	50 %	25 %	227811649
68	NC_012580	TGGC	2	8	23610	23617	0 %	25 %	50 %	25 %	227811651
69	NC_012580	ATTG	2	8	23686	23693	25 %	50 %	25 %	0 %	227811651
70	NC_012580	CAAA	2	8	23708	23715	75 %	0 %	0 %	25 %	227811651
71	NC_012580	ATTT	2	8	24164	24171	25 %	75 %	0 %	0 %	227811651
72	NC_012580	ATGA	2	8	25288	25295	50 %	25 %	25 %	0 %	227811651
73	NC_012580	ATCG	2	8	25812	25819	25 %	25 %	25 %	25 %	227811651
74	NC_012580	ATGG	2	8	26265	26272	25 %	25 %	50 %	0 %	227811651
75	NC_012580	TTAT	2	8	26705	26712	25 %	75 %	0 %	0 %	227811652
76	NC_012580	ATTT	2	8	26802	26809	25 %	75 %	0 %	0 %	227811652
77	NC_012580	TGGG	2	8	27004	27011	0 %	25 %	75 %	0 %	227811652
78	NC_012580	TGTT	2	8	27022	27029	0 %	75 %	25 %	0 %	227811652
79	NC_012580	GCGG	2	8	27067	27074	0 %	0 %	75 %	25 %	227811652
80	NC_012580	AAGA	2	8	27124	27131	75 %	0 %	25 %	0 %	227811652
81	NC_012580	ATTG	2	8	27150	27157	25 %	50 %	25 %	0 %	227811652
82	NC_012580	ATTT	2	8	27520	27527	25 %	75 %	0 %	0 %	227811653
83	NC_012580	AATG	2	8	27672	27679	50 %	25 %	25 %	0 %	227811653
84	NC_012580	TGAC	2	8	28209	28216	25 %	25 %	25 %	25 %	227811654
85	NC_012580	ACAA	2	8	28476	28483	75 %	0 %	0 %	25 %	227811654
86	NC_012580	TTGA	2	8	28757	28764	25 %	50 %	25 %	0 %	227811654
87	NC_012580	TAAA	2	8	28942	28949	75 %	25 %	0 %	0 %	227811654
88	NC_012580	TGGT	2	8	31067	31074	0 %	50 %	50 %	0 %	227811656
89	NC_012580	ACTG	2	8	31120	31127	25 %	25 %	25 %	25 %	227811656
90	NC_012580	ATTG	2	8	31692	31699	25 %	50 %	25 %	0 %	227811656
91	NC_012580	TATT	2	8	31959	31966	25 %	75 %	0 %	0 %	227811657
92	NC_012580	TTGG	2	8	32316	32323	0 %	50 %	50 %	0 %	227811657
93	NC_012580	GCAA	2	8	32563	32570	50 %	0 %	25 %	25 %	227811657
94	NC_012580	ATCG	2	8	33838	33845	25 %	25 %	25 %	25 %	227811658
95	NC_012580	TATG	2	8	34405	34412	25 %	50 %	25 %	0 %	227811658
96	NC_012580	TACG	2	8	34700	34707	25 %	25 %	25 %	25 %	227811658
97	NC_012580	ACTG	2	8	35035	35042	25 %	25 %	25 %	25 %	227811658
98	NC_012580	GACA	2	8	35044	35051	50 %	0 %	25 %	25 %	227811658
99	NC_012580	CAGT	2	8	35331	35338	25 %	25 %	25 %	25 %	227811658
100	NC_012580	GGCA	2	8	35464	35471	25 %	0 %	50 %	25 %	227811658
101	NC_012580	AAGT	2	8	35512	35519	50 %	25 %	25 %	0 %	227811658
102	NC_012580	TTGA	2	8	36109	36116	25 %	50 %	25 %	0 %	227811659
103	NC_012580	AATC	2	8	36925	36932	50 %	25 %	0 %	25 %	227811660
104	NC_012580	GTCA	2	8	37207	37214	25 %	25 %	25 %	25 %	227811660
105	NC_012580	GTTG	2	8	37419	37426	0 %	50 %	50 %	0 %	227811660
106	NC_012580	TGCA	2	8	37505	37512	25 %	25 %	25 %	25 %	227811660
107	NC_012580	TGAT	2	8	37535	37542	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012580	TGGT	2	8	37823	37830	0 %	50 %	50 %	0 %	227811661
109	NC_012580	GGTT	2	8	38106	38113	0 %	50 %	50 %	0 %	227811661
110	NC_012580	TATG	2	8	38388	38395	25 %	50 %	25 %	0 %	227811661
111	NC_012580	AACG	2	8	39024	39031	50 %	0 %	25 %	25 %	227811661
112	NC_012580	TGAG	2	8	39786	39793	25 %	25 %	50 %	0 %	227811662
113	NC_012580	AGTG	2	8	40360	40367	25 %	25 %	50 %	0 %	227811663
114	NC_012580	GCAA	2	8	40560	40567	50 %	0 %	25 %	25 %	227811663
115	NC_012580	ACGT	2	8	40722	40729	25 %	25 %	25 %	25 %	227811663
116	NC_012580	TGGA	2	8	41417	41424	25 %	25 %	50 %	0 %	227811663
117	NC_012580	TCGT	2	8	41670	41677	0 %	50 %	25 %	25 %	227811663
118	NC_012580	TGTT	2	8	42018	42025	0 %	75 %	25 %	0 %	227811663
119	NC_012580	CAAG	2	8	43663	43670	50 %	0 %	25 %	25 %	475645760
120	NC_012580	TTTC	2	8	43743	43750	0 %	75 %	0 %	25 %	475645760
121	NC_012580	GTCG	2	8	44122	44129	0 %	25 %	50 %	25 %	227811666
122	NC_012580	CAAA	2	8	44220	44227	75 %	0 %	0 %	25 %	227811666
123	NC_012580	CCGC	2	8	44258	44265	0 %	0 %	25 %	75 %	227811666
124	NC_012580	AGTA	2	8	44433	44440	50 %	25 %	25 %	0 %	227811666
125	NC_012580	AAGT	2	8	45430	45437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012580	AGAA	2	8	46056	46063	75 %	0 %	25 %	0 %	227811667
127	NC_012580	CTTT	2	8	46107	46114	0 %	75 %	0 %	25 %	227811668
128	NC_012580	TGGT	2	8	46280	46287	0 %	50 %	50 %	0 %	227811668
129	NC_012580	TGGG	2	8	46914	46921	0 %	25 %	75 %	0 %	227811669
130	NC_012580	TTTC	2	8	47471	47478	0 %	75 %	0 %	25 %	227811670
131	NC_012580	CATA	2	8	47663	47670	50 %	25 %	0 %	25 %	227811670
132	NC_012580	CAGG	2	8	47705	47712	25 %	0 %	50 %	25 %	227811670
133	NC_012580	TGAG	2	8	48364	48371	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012580	TGGG	2	8	48887	48894	0 %	25 %	75 %	0 %	227811671
135	NC_012580	GTTG	2	8	49511	49518	0 %	50 %	50 %	0 %	227811671
136	NC_012580	CTTT	2	8	49925	49932	0 %	75 %	0 %	25 %	227811671
137	NC_012580	ATCT	2	8	50929	50936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_012580	AGTG	2	8	51290	51297	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012580	ATCG	2	8	51744	51751	25 %	25 %	25 %	25 %	227811674
140	NC_012580	TCTG	2	8	52221	52228	0 %	50 %	25 %	25 %	227811674
141	NC_012580	AAGC	2	8	52393	52400	50 %	0 %	25 %	25 %	227811674
142	NC_012580	CTCA	2	8	53313	53320	25 %	25 %	0 %	50 %	227811674
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