MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 12870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012580	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012580	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012580	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012580	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012580	AGC	3	9	309	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012580	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012580	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012580	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012580	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012580	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012580	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012580	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012580	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012580	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012580	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012580	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012580	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
19	NC_012580	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811636
20	NC_012580	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
21	NC_012580	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
22	NC_012580	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
23	NC_012580	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
24	NC_012580	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
25	NC_012580	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
26	NC_012580	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
27	NC_012580	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811636
28	NC_012580	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811636
29	NC_012580	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
30	NC_012580	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
31	NC_012580	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
32	NC_012580	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
33	NC_012580	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811636
34	NC_012580	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811636
35	NC_012580	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
36	NC_012580	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
37	NC_012580	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
38	NC_012580	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
39	NC_012580	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
40	NC_012580	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
41	NC_012580	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012580	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012580	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012580	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
45	NC_012580	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811637
46	NC_012580	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
47	NC_012580	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
48	NC_012580	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
49	NC_012580	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
50	NC_012580	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811638
51	NC_012580	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
52	NC_012580	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811638
53	NC_012580	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
54	NC_012580	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811638
55	NC_012580	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645757
56	NC_012580	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012580	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
58	NC_012580	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811640
59	NC_012580	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811640
60	NC_012580	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
61	NC_012580	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
62	NC_012580	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
63	NC_012580	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811640
64	NC_012580	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811640
65	NC_012580	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811640
66	NC_012580	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811640
67	NC_012580	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
68	NC_012580	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
69	NC_012580	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645758
70	NC_012580	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
71	NC_012580	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
72	NC_012580	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
73	NC_012580	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
74	NC_012580	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645758
75	NC_012580	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012580	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
77	NC_012580	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
78	NC_012580	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
79	NC_012580	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
80	NC_012580	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811642
81	NC_012580	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
82	NC_012580	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
83	NC_012580	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
84	NC_012580	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811642
85	NC_012580	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
86	NC_012580	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
87	NC_012580	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
88	NC_012580	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
89	NC_012580	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811642
90	NC_012580	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
91	NC_012580	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
92	NC_012580	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
93	NC_012580	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
94	NC_012580	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
95	NC_012580	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
96	NC_012580	GTT	2	6	8306	8311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012580	TAA	2	6	8451	8456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012580	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645759
99	NC_012580	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
100	NC_012580	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
101	NC_012580	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645759
102	NC_012580	TGA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645759
103	NC_012580	TAG	2	6	8988	8993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
104	NC_012580	CTT	2	6	9031	9036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
105	NC_012580	TGG	2	6	9088	9093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
106	NC_012580	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
107	NC_012580	GTG	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
108	NC_012580	AGC	2	6	9291	9296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
109	NC_012580	TGC	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
110	NC_012580	ATC	2	6	9455	9460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
111	NC_012580	CAG	2	6	9476	9481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
112	NC_012580	CAG	2	6	9713	9718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
113	NC_012580	GCA	2	6	9952	9957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
114	NC_012580	TGC	2	6	9987	9992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
115	NC_012580	AGT	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
116	NC_012580	TGC	2	6	10134	10139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
117	NC_012580	CGA	2	6	10189	10194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
118	NC_012580	TGG	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
119	NC_012580	CGC	2	6	10373	10378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811644
120	NC_012580	CAT	2	6	10399	10404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
121	NC_012580	GCG	2	6	10474	10479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
122	NC_012580	CGC	2	6	10493	10498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811644
123	NC_012580	CAG	2	6	10562	10567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
124	NC_012580	TGA	2	6	10605	10610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811644
125	NC_012580	GGC	3	9	10637	10645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
126	NC_012580	CAT	2	6	10801	10806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
127	NC_012580	GCT	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
128	NC_012580	TCG	2	6	10887	10892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
129	NC_012580	CTT	2	6	10906	10911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
130	NC_012580	TGC	2	6	10989	10994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
131	NC_012580	GTC	2	6	11106	11111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
132	NC_012580	ACC	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
133	NC_012580	TCA	2	6	11274	11279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
134	NC_012580	GGT	2	6	11287	11292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
135	NC_012580	CAC	2	6	11303	11308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
136	NC_012580	TTA	2	6	11430	11435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811644
137	NC_012580	GCA	2	6	11443	11448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811644
138	NC_012580	ATC	2	6	11483	11488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811644
139	NC_012580	ACC	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811644
140	NC_012580	TGG	2	6	11539	11544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811644
141	NC_012580	CGG	2	6	11557	11562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811644
142	NC_012580	TGC	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811644
143	NC_012580	TCT	2	6	11680	11685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811644
144	NC_012580	TCT	2	6	11844	11849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012580	TAC	2	6	11865	11870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012580	TGA	2	6	11883	11888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012580	AAC	2	6	11960	11965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_012580	ATT	2	6	11972	11977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012580	GGT	2	6	12059	12064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012580	CTC	3	9	12155	12163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_012580	ATG	2	6	12168	12173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012580	GGA	2	6	12183	12188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012580	GTT	2	6	12292	12297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811645
154	NC_012580	ACG	2	6	12404	12409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811645
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157	NC_012580	CAT	2	6	12603	12608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811645
158	NC_012580	GGT	2	6	12617	12622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811645
159	NC_012580	GCC	2	6	12635	12640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811645
160	NC_012580	GCG	2	6	12659	12664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811645
161	NC_012580	GAA	2	6	12728	12733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
162	NC_012580	AAG	2	6	12744	12749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
163	NC_012580	GTC	2	6	12842	12847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811645
164	NC_012580	ACT	2	6	13014	13019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811645
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166	NC_012580	GCA	2	6	13114	13119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811645
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170	NC_012580	CTG	2	6	13391	13396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811645
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174	NC_012580	GAA	2	6	13502	13507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811645
175	NC_012580	GCG	2	6	13574	13579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811645
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182	NC_012580	GCG	2	6	14033	14038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811645
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201	NC_012580	CAG	2	6	15594	15599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811646
202	NC_012580	CTG	2	6	15675	15680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811646
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219	NC_012580	TGA	2	6	16571	16576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811646
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222	NC_012580	GAA	2	6	16917	16922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811646
223	NC_012580	GCA	2	6	16957	16962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811646
224	NC_012580	AAG	2	6	17011	17016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
225	NC_012580	TCC	2	6	17036	17041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
226	NC_012580	CAA	2	6	17212	17217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
227	NC_012580	TGG	2	6	17336	17341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811647
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229	NC_012580	GAT	2	6	17470	17475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811647
230	NC_012580	CGG	2	6	17624	17629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811647
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232	NC_012580	CTT	2	6	17825	17830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811647
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239	NC_012580	GAG	2	6	18520	18525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811647
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241	NC_012580	GGC	2	6	18607	18612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811647
242	NC_012580	ACC	2	6	18695	18700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811647
243	NC_012580	GTG	2	6	18772	18777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811647
244	NC_012580	TGA	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811647
245	NC_012580	GCA	2	6	18822	18827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811647
246	NC_012580	CAG	2	6	19168	19173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811647
247	NC_012580	TTG	2	6	19213	19218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811647
248	NC_012580	CAG	2	6	19290	19295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811647
249	NC_012580	GCT	2	6	19314	19319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811647
250	NC_012580	GCC	2	6	19329	19334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811647
251	NC_012580	GCG	2	6	19456	19461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_012580	GTG	2	6	19509	19514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_012580	CTG	2	6	19833	19838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811648
254	NC_012580	CAG	2	6	19889	19894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811648
255	NC_012580	CGT	2	6	19903	19908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811648
256	NC_012580	CTG	2	6	20003	20008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811648
257	NC_012580	CTT	2	6	20092	20097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811648
258	NC_012580	CAC	2	6	20098	20103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811648
259	NC_012580	TGA	2	6	20254	20259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811648
260	NC_012580	GGC	2	6	20319	20324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_012580	TGG	2	6	20464	20469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811649
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382	NC_012580	ATG	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811655
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385	NC_012580	ATA	2	6	30472	30477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_012580	TTA	2	6	40091	40096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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