MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012580	GTG	2	6	183820	183825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811791
3502	NC_012580	TGC	2	6	183851	183856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811791
3503	NC_012580	GA	3	6	183874	183879	50 %	0 %	50 %	0 %	227811791
3504	NC_012580	TTG	2	6	183964	183969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811791
3505	NC_012580	CAG	2	6	184009	184014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_012580	AAAT	2	8	184041	184048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_012580	A	6	6	184060	184065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_012580	GTT	2	6	184100	184105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_012580	AT	4	8	184228	184235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_012580	TC	3	6	184308	184313	0 %	50 %	0 %	50 %	227811792
3511	NC_012580	CGG	2	6	184321	184326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811792
3512	NC_012580	A	6	6	184421	184426	100 %	0 %	0 %	0 %	227811792
3513	NC_012580	GCT	2	6	184436	184441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811792
3514	NC_012580	GATT	2	8	184468	184475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_012580	GTG	2	6	184487	184492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_012580	ATT	2	6	184523	184528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_012580	A	6	6	184576	184581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012580	TAA	2	6	184590	184595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012580	CATT	2	8	184605	184612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_012580	T	6	6	184611	184616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_012580	TGT	2	6	184734	184739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_012580	GGT	2	6	184786	184791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645766
3523	NC_012580	TCG	2	6	184932	184937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645766
3524	NC_012580	TTG	2	6	184997	185002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	475645766
3525	NC_012580	TTG	2	6	185146	185151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	475645766
3526	NC_012580	T	6	6	185155	185160	0 %	100 %	0 %	0 %	475645766
3527	NC_012580	TAA	2	6	185229	185234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645766
3528	NC_012580	AGAGA	2	10	185264	185273	60 %	0 %	40 %	0 %	475645766
3529	NC_012580	CCA	2	6	185322	185327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645766
3530	NC_012580	TGT	2	6	185393	185398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	475645766
3531	NC_012580	AAG	2	6	185402	185407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645766
3532	NC_012580	GGC	2	6	185452	185457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645766
3533	NC_012580	TCC	2	6	185484	185489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_012580	ATTG	2	8	185491	185498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012580	GAC	2	6	185510	185515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_012580	CCA	2	6	185544	185549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_012580	CCT	2	6	185620	185625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_012580	CGG	2	6	185645	185650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811794
3539	NC_012580	CTGTTT	2	12	185687	185698	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	227811794
3540	NC_012580	CTC	2	6	185798	185803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811794
3541	NC_012580	TTG	2	6	185867	185872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811794
3542	NC_012580	CCAAG	2	10	185978	185987	40 %	0 %	20 %	40 %	227811794
3543	NC_012580	CAG	2	6	186005	186010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3544	NC_012580	CAG	2	6	186017	186022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3545	NC_012580	AT	3	6	186027	186032	50 %	50 %	0 %	0 %	227811794
3546	NC_012580	CGA	2	6	186049	186054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3547	NC_012580	CTG	2	6	186056	186061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3548	NC_012580	GGCT	2	8	186078	186085	0 %	25 %	50 %	25 %	227811794
3549	NC_012580	TTC	2	6	186107	186112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811794
3550	NC_012580	TGCC	2	8	186136	186143	0 %	25 %	25 %	50 %	227811794
3551	NC_012580	CCA	2	6	186179	186184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811794
3552	NC_012580	CCTG	2	8	186216	186223	0 %	25 %	25 %	50 %	227811794
3553	NC_012580	CTTG	2	8	186238	186245	0 %	50 %	25 %	25 %	227811794
3554	NC_012580	CT	3	6	186312	186317	0 %	50 %	0 %	50 %	227811794
3555	NC_012580	GGATGT	2	12	186325	186336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	227811794
3556	NC_012580	TTG	3	9	186344	186352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811794
3557	NC_012580	ATGGC	2	10	186390	186399	20 %	20 %	40 %	20 %	227811794
3558	NC_012580	TTG	2	6	186437	186442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811794
3559	NC_012580	AGT	2	6	186532	186537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811794
3560	NC_012580	GCCT	2	8	186638	186645	0 %	25 %	25 %	50 %	227811794
3561	NC_012580	GCTC	2	8	186721	186728	0 %	25 %	25 %	50 %	227811794
3562	NC_012580	CGA	2	6	186786	186791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3563	NC_012580	GTTC	2	8	186852	186859	0 %	50 %	25 %	25 %	227811794
3564	NC_012580	AGT	2	6	187027	187032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811794
3565	NC_012580	TGA	2	6	187039	187044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811794
3566	NC_012580	GAG	2	6	187053	187058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811794
3567	NC_012580	CAA	2	6	187075	187080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811794
3568	NC_012580	A	6	6	187079	187084	100 %	0 %	0 %	0 %	227811794
3569	NC_012580	CAG	2	6	187117	187122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3570	NC_012580	TGAC	2	8	187134	187141	25 %	25 %	25 %	25 %	227811794
3571	NC_012580	CAG	2	6	187238	187243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811794
3572	NC_012580	A	6	6	187252	187257	100 %	0 %	0 %	0 %	227811794
3573	NC_012580	GC	4	8	187344	187351	0 %	0 %	50 %	50 %	227811795
3574	NC_012580	AGT	2	6	187352	187357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811795
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3576	NC_012580	GGT	2	6	187429	187434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811795
3577	NC_012580	GC	3	6	187539	187544	0 %	0 %	50 %	50 %	227811795
3578	NC_012580	CAT	2	6	187563	187568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811795
3579	NC_012580	CT	3	6	187619	187624	0 %	50 %	0 %	50 %	227811795
3580	NC_012580	CTG	2	6	187633	187638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3581	NC_012580	TTTG	2	8	187661	187668	0 %	75 %	25 %	0 %	227811795
3582	NC_012580	TGA	2	6	187711	187716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811795
3583	NC_012580	TCT	2	6	187718	187723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811795
3584	NC_012580	CTT	2	6	187728	187733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811795
3585	NC_012580	GGA	2	6	187738	187743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811795
3586	NC_012580	CTG	2	6	187759	187764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3587	NC_012580	TTGCTG	13	78	187765	187842	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	227811795
3588	NC_012580	TGA	2	6	187880	187885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811795
3589	NC_012580	CTTG	2	8	187893	187900	0 %	50 %	25 %	25 %	227811795
3590	NC_012580	TTG	2	6	188105	188110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811795
3591	NC_012580	CTG	2	6	188161	188166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3592	NC_012580	ACTC	2	8	188176	188183	25 %	25 %	0 %	50 %	227811795
3593	NC_012580	AGC	2	6	188189	188194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3594	NC_012580	GCG	2	6	188234	188239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811795
3595	NC_012580	GCT	2	6	188325	188330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3596	NC_012580	GCT	2	6	188409	188414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3597	NC_012580	GC	3	6	188496	188501	0 %	0 %	50 %	50 %	227811795
3598	NC_012580	AAC	2	6	188552	188557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811795
3599	NC_012580	ATC	2	6	188590	188595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811795
3600	NC_012580	TGA	2	6	188621	188626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811795
3601	NC_012580	GCGGCA	2	12	188663	188674	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227811795
3602	NC_012580	ATG	2	6	188693	188698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811795
3603	NC_012580	GA	3	6	188705	188710	50 %	0 %	50 %	0 %	227811795
3604	NC_012580	GCA	2	6	188715	188720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3605	NC_012580	CAC	2	6	188758	188763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811795
3606	NC_012580	CTT	2	6	188802	188807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811795
3607	NC_012580	AGG	2	6	188819	188824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811795
3608	NC_012580	AC	3	6	188907	188912	50 %	0 %	0 %	50 %	227811795
3609	NC_012580	GCG	2	6	188915	188920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811795
3610	NC_012580	CGA	2	6	188982	188987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811795
3611	NC_012580	TAA	2	6	189001	189006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811795
3612	NC_012580	CGC	2	6	189020	189025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811795
3613	NC_012580	CAAT	2	8	189066	189073	50 %	25 %	0 %	25 %	227811795
3614	NC_012580	GCG	2	6	189104	189109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811795
3615	NC_012580	CAA	2	6	189112	189117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811795
3616	NC_012580	CAA	2	6	189127	189132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811795
3617	NC_012580	AGC	2	6	189204	189209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811796
3618	NC_012580	GATTG	2	10	189262	189271	20 %	40 %	40 %	0 %	227811796
3619	NC_012580	TTG	2	6	189320	189325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811796
3620	NC_012580	TGG	2	6	189355	189360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811796
3621	NC_012580	ACC	2	6	189435	189440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811796
3622	NC_012580	GTG	2	6	189474	189479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811796
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3624	NC_012580	TGC	2	6	189535	189540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811796
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3880	NC_012580	TGAGCG	2	12	202834	202845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	227811807
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3984	NC_012580	A	6	6	208534	208539	100 %	0 %	0 %	0 %	227811816
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3994	NC_012580	GCG	2	6	209134	209139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811816
3995	NC_012580	CAT	2	6	209152	209157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811816
3996	NC_012580	GAC	2	6	209206	209211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811816
3997	NC_012580	CGC	2	6	209230	209235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811816
3998	NC_012580	TCA	2	6	209327	209332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811816
3999	NC_012580	TGGG	2	8	209420	209427	0 %	25 %	75 %	0 %	227811816
4000	NC_012580	A	8	8	209473	209480	100 %	0 %	0 %	0 %	227811816

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