MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_012580	CT	3	6	131525	131530	0 %	50 %	0 %	50 %	227811745
2503	NC_012580	TGG	2	6	131538	131543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811745
2504	NC_012580	TGG	2	6	131550	131555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811745
2505	NC_012580	AGC	2	6	131586	131591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2506	NC_012580	AGC	2	6	131612	131617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2507	NC_012580	TGC	2	6	131638	131643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2508	NC_012580	GCG	2	6	131657	131662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811745
2509	NC_012580	TGG	3	9	131667	131675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811745
2510	NC_012580	AGC	2	6	131692	131697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2511	NC_012580	AAAC	2	8	131699	131706	75 %	0 %	0 %	25 %	227811745
2512	NC_012580	GCA	2	6	131790	131795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2513	NC_012580	CTG	2	6	131834	131839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2514	NC_012580	GAA	2	6	132020	132025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811745
2515	NC_012580	ACA	2	6	132028	132033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811745
2516	NC_012580	CGT	2	6	132041	132046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2517	NC_012580	GCT	2	6	132055	132060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2518	NC_012580	TGGC	2	8	132113	132120	0 %	25 %	50 %	25 %	227811745
2519	NC_012580	TGC	2	6	132142	132147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2520	NC_012580	TCGG	2	8	132155	132162	0 %	25 %	50 %	25 %	227811745
2521	NC_012580	AAG	2	6	132207	132212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811745
2522	NC_012580	ATG	2	6	132243	132248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811745
2523	NC_012580	CTG	2	6	132308	132313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2524	NC_012580	ATC	2	6	132321	132326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811745
2525	NC_012580	CGATG	2	10	132328	132337	20 %	20 %	40 %	20 %	227811745
2526	NC_012580	ACG	2	6	132374	132379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
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2531	NC_012580	GCA	2	6	132512	132517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811746
2532	NC_012580	TGG	2	6	132566	132571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811746
2533	NC_012580	TGGC	2	8	132591	132598	0 %	25 %	50 %	25 %	227811746
2534	NC_012580	AGC	2	6	132762	132767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2536	NC_012580	ACT	2	6	132828	132833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811746
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2539	NC_012580	TGG	2	6	132977	132982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811746
2540	NC_012580	TGA	2	6	132988	132993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
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2542	NC_012580	GAA	2	6	133046	133051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811746
2543	NC_012580	ATG	2	6	133053	133058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
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2547	NC_012580	TGC	2	6	133206	133211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2549	NC_012580	TGC	2	6	133446	133451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
2550	NC_012580	GAA	2	6	133481	133486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811746
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2552	NC_012580	GTG	2	6	133599	133604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811746
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2554	NC_012580	TACC	2	8	133635	133642	25 %	25 %	0 %	50 %	227811746
2555	NC_012580	TGA	2	6	133651	133656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
2556	NC_012580	CGT	2	6	133667	133672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
2557	NC_012580	GTCT	2	8	133677	133684	0 %	50 %	25 %	25 %	227811746
2558	NC_012580	GC	3	6	133705	133710	0 %	0 %	50 %	50 %	227811746
2559	NC_012580	CAT	2	6	133753	133758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811746
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2561	NC_012580	CT	3	6	133826	133831	0 %	50 %	0 %	50 %	227811746
2562	NC_012580	AG	3	6	133979	133984	50 %	0 %	50 %	0 %	227811746
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2565	NC_012580	CTT	2	6	134137	134142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811746
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2567	NC_012580	TCAA	2	8	134175	134182	50 %	25 %	0 %	25 %	227811746
2568	NC_012580	GAA	2	6	134195	134200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811746
2569	NC_012580	TGC	2	6	134211	134216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2572	NC_012580	GCT	2	6	134329	134334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
2573	NC_012580	AG	3	6	134377	134382	50 %	0 %	50 %	0 %	227811746
2574	NC_012580	AGC	2	6	134597	134602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2577	NC_012580	GC	3	6	134800	134805	0 %	0 %	50 %	50 %	227811746
2578	NC_012580	ATG	2	6	134847	134852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
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2580	NC_012580	GCT	2	6	134974	134979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811746
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2584	NC_012580	CTAT	2	8	135201	135208	25 %	50 %	0 %	25 %	227811746
2585	NC_012580	ATG	2	6	135254	135259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
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2589	NC_012580	CTT	2	6	135427	135432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811746
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2591	NC_012580	GCGTC	2	10	135501	135510	0 %	20 %	40 %	40 %	227811746
2592	NC_012580	AAG	2	6	135540	135545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811746
2593	NC_012580	GATCA	2	10	135551	135560	40 %	20 %	20 %	20 %	227811746
2594	NC_012580	TTC	2	6	135587	135592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811746
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2599	NC_012580	GAT	2	6	135916	135921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811746
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2601	NC_012580	GAG	2	6	136150	136155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811747
2602	NC_012580	CCG	2	6	136161	136166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811747
2603	NC_012580	AAC	2	6	136220	136225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811747
2604	NC_012580	GCCT	2	8	136276	136283	0 %	25 %	25 %	50 %	227811747
2605	NC_012580	TGA	2	6	136325	136330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811747
2606	NC_012580	CCAA	2	8	136343	136350	50 %	0 %	0 %	50 %	227811747
2607	NC_012580	GTG	2	6	136414	136419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811747
2608	NC_012580	CAA	2	6	136516	136521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811747
2609	NC_012580	GTT	2	6	136665	136670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811747
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2611	NC_012580	G	6	6	136707	136712	0 %	0 %	100 %	0 %	227811747
2612	NC_012580	TGATC	2	10	136845	136854	20 %	40 %	20 %	20 %	227811747
2613	NC_012580	GCA	2	6	136875	136880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811747
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2618	NC_012580	CAAA	2	8	137241	137248	75 %	0 %	0 %	25 %	227811747
2619	NC_012580	AGC	2	6	137285	137290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811747
2620	NC_012580	TTG	2	6	137308	137313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811747
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2622	NC_012580	T	6	6	137362	137367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_012580	CAT	2	6	143468	143473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811754
2747	NC_012580	GCG	2	6	143548	143553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811754
2748	NC_012580	GCGA	2	8	143562	143569	25 %	0 %	50 %	25 %	227811754
2749	NC_012580	GCA	2	6	143622	143627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811754
2750	NC_012580	A	6	6	143687	143692	100 %	0 %	0 %	0 %	227811755
2751	NC_012580	TTGA	2	8	143711	143718	25 %	50 %	25 %	0 %	227811755
2752	NC_012580	CTG	2	6	143738	143743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811755
2753	NC_012580	GTC	2	6	143756	143761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811755
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2762	NC_012580	CTG	2	6	144068	144073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811755
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2836	NC_012580	TGA	2	6	147774	147779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811759
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2864	NC_012580	ATC	2	6	148702	148707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811760
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2992	NC_012580	TCT	2	6	155408	155413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811767
2993	NC_012580	TCAC	2	8	155414	155421	25 %	25 %	0 %	50 %	227811767
2994	NC_012580	GTT	2	6	155508	155513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811767
2995	NC_012580	TCGAAC	2	12	155548	155559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227811767
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2997	NC_012580	GATG	2	8	155583	155590	25 %	25 %	50 %	0 %	227811767
2998	NC_012580	CGC	2	6	155680	155685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811767
2999	NC_012580	ATCA	2	8	155692	155699	50 %	25 %	0 %	25 %	227811767
3000	NC_012580	TTG	2	6	155872	155877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811767

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