MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012580	CCA	2	6	104589	104594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811723
2003	NC_012580	GC	3	6	104645	104650	0 %	0 %	50 %	50 %	227811723
2004	NC_012580	T	6	6	104653	104658	0 %	100 %	0 %	0 %	227811723
2005	NC_012580	CATG	2	8	104660	104667	25 %	25 %	25 %	25 %	227811723
2006	NC_012580	CCA	2	6	104856	104861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811723
2007	NC_012580	TGA	2	6	104871	104876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811723
2008	NC_012580	GGC	2	6	104901	104906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811723
2009	NC_012580	CG	3	6	104918	104923	0 %	0 %	50 %	50 %	227811723
2010	NC_012580	TCA	2	6	104972	104977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811723
2011	NC_012580	ACC	2	6	104986	104991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811723
2012	NC_012580	TGC	2	6	105030	105035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811723
2013	NC_012580	CAA	2	6	105043	105048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811723
2014	NC_012580	GCA	2	6	105256	105261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2015	NC_012580	TCAC	2	8	105263	105270	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2016	NC_012580	GCC	2	6	105315	105320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2017	NC_012580	GCTG	2	8	105358	105365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2018	NC_012580	CAA	2	6	105458	105463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_012580	CAT	2	6	105530	105535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811724
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2021	NC_012580	ATTG	2	8	105623	105630	25 %	50 %	25 %	0 %	227811724
2022	NC_012580	CTT	2	6	105657	105662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811724
2023	NC_012580	ATT	2	6	105724	105729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811724
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2030	NC_012580	CCGA	2	8	106296	106303	25 %	0 %	25 %	50 %	227811724
2031	NC_012580	ATG	2	6	106360	106365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811724
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2036	NC_012580	CGG	2	6	106585	106590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811724
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2041	NC_012580	CGC	2	6	106813	106818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2042	NC_012580	CCAG	2	8	106954	106961	25 %	0 %	25 %	50 %	227811725
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2057	NC_012580	CA	3	6	107747	107752	50 %	0 %	0 %	50 %	227811725
2058	NC_012580	CT	3	6	107875	107880	0 %	50 %	0 %	50 %	227811725
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2063	NC_012580	TCAA	2	8	107986	107993	50 %	25 %	0 %	25 %	227811726
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2124	NC_012580	ACC	2	6	111168	111173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811729
2125	NC_012580	TGA	2	6	111190	111195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811729
2126	NC_012580	TC	3	6	111266	111271	0 %	50 %	0 %	50 %	227811729
2127	NC_012580	ATT	2	6	111315	111320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811729
2128	NC_012580	TTG	2	6	111382	111387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811729
2129	NC_012580	GCT	2	6	111398	111403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811729
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2135	NC_012580	TGG	2	6	111839	111844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811729
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2137	NC_012580	GTG	2	6	111945	111950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811729
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2143	NC_012580	GCG	2	6	112274	112279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811729
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2145	NC_012580	GCTG	2	8	112379	112386	0 %	25 %	50 %	25 %	227811729
2146	NC_012580	A	6	6	112404	112409	100 %	0 %	0 %	0 %	227811729
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2151	NC_012580	CTTTT	2	10	112668	112677	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2152	NC_012580	GCT	2	6	112714	112719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811730
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2154	NC_012580	AAAC	2	8	112760	112767	75 %	0 %	0 %	25 %	227811730
2155	NC_012580	GAT	2	6	112822	112827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811730
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2162	NC_012580	AG	3	6	113234	113239	50 %	0 %	50 %	0 %	227811730
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2182	NC_012580	TGAG	2	8	114213	114220	25 %	25 %	50 %	0 %	227811730
2183	NC_012580	TTG	2	6	114441	114446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2184	NC_012580	TTTA	2	8	114512	114519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2185	NC_012580	ATG	3	9	114525	114533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2186	NC_012580	ACTT	2	8	114535	114542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2187	NC_012580	AGT	2	6	114563	114568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2190	NC_012580	TGT	2	6	114669	114674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2193	NC_012580	TAAT	2	8	114795	114802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2194	NC_012580	TTAAT	2	10	114844	114853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2198	NC_012580	GTA	2	6	115148	115153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811731
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2225	NC_012580	TAT	2	6	116418	116423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2227	NC_012580	T	8	8	116473	116480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2228	NC_012580	T	6	6	116488	116493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2229	NC_012580	GCA	2	6	116577	116582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2230	NC_012580	GCT	2	6	116587	116592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2231	NC_012580	ATA	2	6	116607	116612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2232	NC_012580	TCA	2	6	116623	116628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2233	NC_012580	AT	3	6	116629	116634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2234	NC_012580	ACA	3	9	116641	116649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2235	NC_012580	ATTT	2	8	116674	116681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2236	NC_012580	TTGA	2	8	116772	116779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2237	NC_012580	TCAA	2	8	116786	116793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2238	NC_012580	GAAG	2	8	116846	116853	50 %	0 %	50 %	0 %	227811733
2239	NC_012580	AAC	2	6	117014	117019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811733
2240	NC_012580	GAGC	2	8	117040	117047	25 %	0 %	50 %	25 %	227811733
2241	NC_012580	CTGA	2	8	117077	117084	25 %	25 %	25 %	25 %	227811733
2242	NC_012580	TGA	3	9	117082	117090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811733
2243	NC_012580	A	6	6	117176	117181	100 %	0 %	0 %	0 %	227811733
2244	NC_012580	TTGA	2	8	117182	117189	25 %	50 %	25 %	0 %	227811733
2245	NC_012580	ACTCA	2	10	117265	117274	40 %	20 %	0 %	40 %	227811733
2246	NC_012580	GA	3	6	117283	117288	50 %	0 %	50 %	0 %	227811733
2247	NC_012580	AAG	2	6	117324	117329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811733
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2373	NC_012580	GTC	2	6	124871	124876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811740
2374	NC_012580	GCC	2	6	124878	124883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811740
2375	NC_012580	GTG	2	6	124963	124968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811740
2376	NC_012580	ATC	2	6	125068	125073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811740
2377	NC_012580	CTA	2	6	125244	125249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811740
2378	NC_012580	TGC	2	6	125316	125321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811740
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2380	NC_012580	TGT	2	6	125407	125412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811741
2381	NC_012580	CGA	2	6	125414	125419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811741
2382	NC_012580	A	6	6	125425	125430	100 %	0 %	0 %	0 %	227811741
2383	NC_012580	ACT	2	6	125446	125451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811741
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2385	NC_012580	ACA	2	6	125548	125553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811741
2386	NC_012580	TTTA	2	8	125832	125839	25 %	75 %	0 %	0 %	227811741
2387	NC_012580	GCC	2	6	125917	125922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811741
2388	NC_012580	CTG	2	6	125931	125936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811741
2389	NC_012580	AGC	2	6	125937	125942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811741
2390	NC_012580	AG	3	6	125948	125953	50 %	0 %	50 %	0 %	227811741
2391	NC_012580	CCGA	2	8	125976	125983	25 %	0 %	25 %	50 %	227811741
2392	NC_012580	GTGC	2	8	125991	125998	0 %	25 %	50 %	25 %	227811741
2393	NC_012580	CAGA	2	8	126014	126021	50 %	0 %	25 %	25 %	227811741
2394	NC_012580	TCAA	2	8	126118	126125	50 %	25 %	0 %	25 %	227811741
2395	NC_012580	TCAA	2	8	126127	126134	50 %	25 %	0 %	25 %	227811741
2396	NC_012580	GGT	2	6	126158	126163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_012580	CT	4	8	126243	126250	0 %	50 %	0 %	50 %	227811742
2398	NC_012580	CT	3	6	126316	126321	0 %	50 %	0 %	50 %	227811742
2399	NC_012580	CAAG	2	8	126339	126346	50 %	0 %	25 %	25 %	227811742
2400	NC_012580	CTG	2	6	126436	126441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
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2402	NC_012580	GCT	2	6	126465	126470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2403	NC_012580	GTTT	2	8	126569	126576	0 %	75 %	25 %	0 %	227811742
2404	NC_012580	A	6	6	126601	126606	100 %	0 %	0 %	0 %	227811742
2405	NC_012580	GAT	2	6	126615	126620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811742
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2407	NC_012580	TCCTG	2	10	126756	126765	0 %	40 %	20 %	40 %	227811742
2408	NC_012580	TGG	2	6	126791	126796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811742
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2414	NC_012580	TGAT	2	8	127007	127014	25 %	50 %	25 %	0 %	227811742
2415	NC_012580	AAG	2	6	127088	127093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811742
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2419	NC_012580	CGAT	2	8	127247	127254	25 %	25 %	25 %	25 %	227811742
2420	NC_012580	CA	3	6	127301	127306	50 %	0 %	0 %	50 %	227811742
2421	NC_012580	TGA	2	6	127320	127325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811742
2422	NC_012580	GTC	2	6	127370	127375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2423	NC_012580	AGCG	2	8	127543	127550	25 %	0 %	50 %	25 %	227811742
2424	NC_012580	GCA	3	9	127617	127625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2425	NC_012580	A	6	6	127625	127630	100 %	0 %	0 %	0 %	227811742
2426	NC_012580	TGG	2	6	127634	127639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811742
2427	NC_012580	ATC	2	6	127645	127650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811742
2428	NC_012580	GCTGA	2	10	127660	127669	20 %	20 %	40 %	20 %	227811742
2429	NC_012580	GCAAGA	2	12	127686	127697	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	227811742
2430	NC_012580	TGG	2	6	127712	127717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811742
2431	NC_012580	CGT	2	6	127975	127980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2432	NC_012580	CTG	2	6	128005	128010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2433	NC_012580	AGC	2	6	128060	128065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811742
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2437	NC_012580	GGT	2	6	128217	128222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811742
2438	NC_012580	TGA	2	6	128229	128234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811742
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2440	NC_012580	TTC	2	6	128341	128346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811742
2441	NC_012580	TGA	2	6	128406	128411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811742
2442	NC_012580	CTTT	2	8	128435	128442	0 %	75 %	0 %	25 %	227811742
2443	NC_012580	CTGCT	2	10	128447	128456	0 %	40 %	20 %	40 %	227811742
2444	NC_012580	TACC	2	8	128479	128486	25 %	25 %	0 %	50 %	227811742
2445	NC_012580	AAG	2	6	128495	128500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811742
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2447	NC_012580	AG	3	6	128583	128588	50 %	0 %	50 %	0 %	227811742
2448	NC_012580	TGC	2	6	128669	128674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2449	NC_012580	GCT	2	6	128691	128696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811742
2450	NC_012580	GA	3	6	128710	128715	50 %	0 %	50 %	0 %	227811742
2451	NC_012580	TGGC	2	8	128790	128797	0 %	25 %	50 %	25 %	227811743
2452	NC_012580	TGG	2	6	128812	128817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811743
2453	NC_012580	CCA	2	6	128831	128836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811743
2454	NC_012580	CTG	2	6	128859	128864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
2455	NC_012580	TGT	2	6	128896	128901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811743
2456	NC_012580	TCG	2	6	128907	128912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
2457	NC_012580	CAATC	2	10	129048	129057	40 %	20 %	0 %	40 %	227811743
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2463	NC_012580	TGG	2	6	129635	129640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811743
2464	NC_012580	ATT	2	6	129692	129697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811743
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2467	NC_012580	CTG	2	6	129789	129794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811743
2468	NC_012580	A	6	6	129807	129812	100 %	0 %	0 %	0 %	227811743
2469	NC_012580	GGC	2	6	129872	129877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811743
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2472	NC_012580	GC	3	6	130042	130047	0 %	0 %	50 %	50 %	227811743
2473	NC_012580	ACCCT	2	10	130101	130110	20 %	20 %	0 %	60 %	227811743
2474	NC_012580	GCTG	2	8	130184	130191	0 %	25 %	50 %	25 %	227811743
2475	NC_012580	GTCA	2	8	130233	130240	25 %	25 %	25 %	25 %	227811743
2476	NC_012580	ATC	2	6	130254	130259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811743
2477	NC_012580	CG	3	6	130290	130295	0 %	0 %	50 %	50 %	227811743
2478	NC_012580	GCG	2	6	130299	130304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811743
2479	NC_012580	AGC	2	6	130432	130437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811744
2480	NC_012580	AGCTG	2	10	130468	130477	20 %	20 %	40 %	20 %	227811744
2481	NC_012580	GGC	2	6	130600	130605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811744
2482	NC_012580	GCA	2	6	130665	130670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811744
2483	NC_012580	TAA	2	6	130747	130752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811744
2484	NC_012580	AAG	2	6	130782	130787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811744
2485	NC_012580	ATG	2	6	130895	130900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811744
2486	NC_012580	GCC	2	6	130907	130912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811744
2487	NC_012580	TGC	2	6	130929	130934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811744
2488	NC_012580	TGGT	2	8	131017	131024	0 %	50 %	50 %	0 %	227811744
2489	NC_012580	GT	3	6	131059	131064	0 %	50 %	50 %	0 %	227811745
2490	NC_012580	CAG	2	6	131077	131082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2491	NC_012580	GAT	2	6	131143	131148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811745
2492	NC_012580	CT	5	10	131158	131167	0 %	50 %	0 %	50 %	227811745
2493	NC_012580	CAGTG	2	10	131175	131184	20 %	20 %	40 %	20 %	227811745
2494	NC_012580	AGCAC	2	10	131196	131205	40 %	0 %	20 %	40 %	227811745
2495	NC_012580	CTG	2	6	131255	131260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811745
2496	NC_012580	TTA	2	6	131295	131300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811745
2497	NC_012580	TGA	2	6	131313	131318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811745
2498	NC_012580	TCAA	2	8	131328	131335	50 %	25 %	0 %	25 %	227811745
2499	NC_012580	TCA	2	6	131446	131451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811745
2500	NC_012580	GCG	2	6	131483	131488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811745

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