MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012580	TTGA	2	8	77988	77995	25 %	50 %	25 %	0 %	227811695
1502	NC_012580	CT	3	6	78049	78054	0 %	50 %	0 %	50 %	227811695
1503	NC_012580	GTTG	2	8	78083	78090	0 %	50 %	50 %	0 %	227811695
1504	NC_012580	TTG	2	6	78093	78098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811695
1505	NC_012580	TGC	2	6	78099	78104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811695
1506	NC_012580	TG	3	6	78116	78121	0 %	50 %	50 %	0 %	227811695
1507	NC_012580	TCA	2	6	78224	78229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811695
1508	NC_012580	CT	3	6	78283	78288	0 %	50 %	0 %	50 %	227811695
1509	NC_012580	CTT	2	6	78359	78364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811695
1510	NC_012580	TTG	2	6	78408	78413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811695
1511	NC_012580	ATG	2	6	78436	78441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811695
1512	NC_012580	ACT	2	6	78456	78461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811695
1513	NC_012580	TGCTCA	2	12	78523	78534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	227811695
1514	NC_012580	TCA	2	6	78538	78543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811695
1515	NC_012580	GTC	2	6	78547	78552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811695
1516	NC_012580	ATC	2	6	78598	78603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811695
1517	NC_012580	GTTT	2	8	78817	78824	0 %	75 %	25 %	0 %	227811695
1518	NC_012580	ATCA	2	8	78909	78916	50 %	25 %	0 %	25 %	227811695
1519	NC_012580	GTG	2	6	78919	78924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811695
1520	NC_012580	TGA	2	6	78941	78946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811695
1521	NC_012580	GTT	2	6	78947	78952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811695
1522	NC_012580	TGG	2	6	78970	78975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811695
1523	NC_012580	AAC	2	6	79024	79029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811695
1524	NC_012580	TAC	2	6	79047	79052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811695
1525	NC_012580	TTA	2	6	79114	79119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_012580	AAT	2	6	79122	79127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_012580	AAAT	2	8	79140	79147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_012580	ATA	2	6	79156	79161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_012580	ATG	2	6	79169	79174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_012580	TGA	2	6	79202	79207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_012580	GAA	2	6	79253	79258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_012580	T	6	6	79280	79285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_012580	TGA	2	6	79463	79468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645762
1534	NC_012580	CAG	2	6	79544	79549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645762
1535	NC_012580	AAG	2	6	79724	79729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645762
1536	NC_012580	GAA	2	6	79741	79746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645762
1537	NC_012580	CAG	2	6	79808	79813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645762
1538	NC_012580	TGG	2	6	79863	79868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645762
1539	NC_012580	GTG	2	6	79919	79924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645762
1540	NC_012580	CAT	2	6	79935	79940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645762
1541	NC_012580	AAAG	2	8	79950	79957	75 %	0 %	25 %	0 %	475645762
1542	NC_012580	AAG	2	6	79967	79972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645762
1543	NC_012580	AGCG	2	8	80118	80125	25 %	0 %	50 %	25 %	475645762
1544	NC_012580	ACAA	2	8	80180	80187	75 %	0 %	0 %	25 %	475645762
1545	NC_012580	CTG	2	6	80198	80203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645762
1546	NC_012580	GAA	2	6	80208	80213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645762
1547	NC_012580	TAAC	2	8	80280	80287	50 %	25 %	0 %	25 %	475645762
1548	NC_012580	CAA	2	6	80374	80379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645763
1549	NC_012580	ATA	2	6	80398	80403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	475645763
1550	NC_012580	ACG	2	6	80429	80434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645763
1551	NC_012580	GTTT	2	8	80464	80471	0 %	75 %	25 %	0 %	475645763
1552	NC_012580	CAT	2	6	80507	80512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645763
1553	NC_012580	AAG	2	6	80551	80556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645763
1554	NC_012580	ACC	2	6	80594	80599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	475645763
1555	NC_012580	GTC	2	6	80637	80642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645763
1556	NC_012580	CTT	2	6	80786	80791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645763
1557	NC_012580	ATC	2	6	80802	80807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645763
1558	NC_012580	CG	3	6	80925	80930	0 %	0 %	50 %	50 %	475645763
1559	NC_012580	AAG	2	6	80947	80952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645763
1560	NC_012580	CTG	2	6	80997	81002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645763
1561	NC_012580	CTG	2	6	81007	81012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645763
1562	NC_012580	ATC	2	6	81078	81083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645763
1563	NC_012580	CTG	2	6	81219	81224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645763
1564	NC_012580	TCA	2	6	81229	81234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645763
1565	NC_012580	GCG	2	6	81362	81367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811699
1566	NC_012580	CTT	2	6	81379	81384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811699
1567	NC_012580	ATC	2	6	81392	81397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811699
1568	NC_012580	GAT	2	6	81490	81495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811699
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1570	NC_012580	ATC	2	6	81608	81613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811699
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1572	NC_012580	TTCT	2	8	81711	81718	0 %	75 %	0 %	25 %	227811699
1573	NC_012580	ATT	2	6	81755	81760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811699
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1575	NC_012580	CCG	2	6	81847	81852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811699
1576	NC_012580	TGG	2	6	81954	81959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811699
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1580	NC_012580	ATGG	2	8	82386	82393	25 %	25 %	50 %	0 %	227811700
1581	NC_012580	ACCCA	2	10	82460	82469	40 %	0 %	0 %	60 %	227811700
1582	NC_012580	TGCG	2	8	82507	82514	0 %	25 %	50 %	25 %	227811700
1583	NC_012580	TGA	2	6	82541	82546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811700
1584	NC_012580	CAG	3	9	82635	82643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811700
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1586	NC_012580	GATG	2	8	82691	82698	25 %	25 %	50 %	0 %	227811700
1587	NC_012580	GAA	3	9	82760	82768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811700
1588	NC_012580	ACTC	2	8	82788	82795	25 %	25 %	0 %	50 %	227811700
1589	NC_012580	GCA	2	6	82799	82804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811700
1590	NC_012580	GC	3	6	82806	82811	0 %	0 %	50 %	50 %	227811700
1591	NC_012580	TTC	2	6	82833	82838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811700
1592	NC_012580	GTTG	2	8	82850	82857	0 %	50 %	50 %	0 %	227811700
1593	NC_012580	GAT	2	6	82896	82901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811700
1594	NC_012580	T	6	6	82998	83003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_012580	ATTTC	2	10	83010	83019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_012580	AATTCA	2	12	83129	83140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1597	NC_012580	CAT	3	9	83170	83178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_012580	TGC	2	6	83196	83201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_012580	GAT	2	6	83206	83211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_012580	C	6	6	83225	83230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1601	NC_012580	AC	3	6	83238	83243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_012580	GTT	2	6	83266	83271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012580	AG	4	8	83364	83371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_012580	GCG	2	6	83383	83388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_012580	CA	3	6	83506	83511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_012580	CAA	2	6	83521	83526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_012580	TACA	2	8	83578	83585	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_012580	TTG	2	6	83641	83646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_012580	GGC	2	6	83647	83652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_012580	GTT	2	6	83709	83714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_012580	GC	3	6	83719	83724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_012580	GAA	2	6	83737	83742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_012580	GATCA	2	10	83794	83803	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_012580	TAGG	2	8	83866	83873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_012580	CAG	2	6	84025	84030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_012580	CTT	2	6	84087	84092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811701
1617	NC_012580	TAA	2	6	84133	84138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811701
1618	NC_012580	TTC	2	6	84145	84150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811701
1619	NC_012580	ACCA	2	8	84178	84185	50 %	0 %	0 %	50 %	227811701
1620	NC_012580	GTA	2	6	84228	84233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811701
1621	NC_012580	ATA	2	6	84249	84254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811701
1622	NC_012580	AGC	2	6	84279	84284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811701
1623	NC_012580	GCAG	2	8	84418	84425	25 %	0 %	50 %	25 %	227811701
1624	NC_012580	GGC	2	6	84460	84465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811701
1625	NC_012580	GA	3	6	84504	84509	50 %	0 %	50 %	0 %	227811701
1626	NC_012580	CAC	2	6	84514	84519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811701
1627	NC_012580	ATT	2	6	84547	84552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811701
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1629	NC_012580	ATT	2	6	84699	84704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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