MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012580	GGA	2	6	51976	51981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811674
1002	NC_012580	TGA	2	6	52068	52073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1003	NC_012580	CAC	2	6	52158	52163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811674
1004	NC_012580	TG	3	6	52188	52193	0 %	50 %	50 %	0 %	227811674
1005	NC_012580	CTC	2	6	52206	52211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811674
1006	NC_012580	TCTG	2	8	52221	52228	0 %	50 %	25 %	25 %	227811674
1007	NC_012580	GCA	2	6	52254	52259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1008	NC_012580	ACC	2	6	52295	52300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811674
1009	NC_012580	AAGC	2	8	52393	52400	50 %	0 %	25 %	25 %	227811674
1010	NC_012580	TCG	2	6	52422	52427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1011	NC_012580	TGG	2	6	52484	52489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811674
1012	NC_012580	ATG	2	6	52685	52690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1013	NC_012580	TCC	2	6	52705	52710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811674
1014	NC_012580	GAC	2	6	52740	52745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1015	NC_012580	TGA	2	6	53106	53111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1016	NC_012580	TGG	2	6	53114	53119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811674
1017	NC_012580	ATG	2	6	53126	53131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1018	NC_012580	TTCAAT	2	12	53164	53175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	227811674
1019	NC_012580	CAG	2	6	53249	53254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1020	NC_012580	GGT	2	6	53262	53267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811674
1021	NC_012580	AGC	2	6	53285	53290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1022	NC_012580	CTCA	2	8	53313	53320	25 %	25 %	0 %	50 %	227811674
1023	NC_012580	ATT	2	6	53323	53328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811674
1024	NC_012580	ATC	2	6	53362	53367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811674
1025	NC_012580	AATC	2	8	53403	53410	50 %	25 %	0 %	25 %	227811674
1026	NC_012580	TGA	2	6	53481	53486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1027	NC_012580	CTT	2	6	53790	53795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811674
1028	NC_012580	GAG	2	6	53818	53823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811674
1029	NC_012580	ATG	2	6	53846	53851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811674
1030	NC_012580	GCGT	2	8	53870	53877	0 %	25 %	50 %	25 %	227811674
1031	NC_012580	ATT	2	6	53941	53946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811674
1032	NC_012580	GAAA	2	8	53961	53968	75 %	0 %	25 %	0 %	227811674
1033	NC_012580	GAG	2	6	54049	54054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811674
1034	NC_012580	GCT	2	6	54105	54110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1035	NC_012580	GATG	2	8	54192	54199	25 %	25 %	50 %	0 %	227811674
1036	NC_012580	AAG	2	6	54467	54472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811674
1037	NC_012580	AGC	2	6	54530	54535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1038	NC_012580	GATT	2	8	54548	54555	25 %	50 %	25 %	0 %	227811674
1039	NC_012580	ATC	2	6	54616	54621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811674
1040	NC_012580	GCC	2	6	54685	54690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811674
1041	NC_012580	CTG	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811674
1042	NC_012580	CAA	2	6	54745	54750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_012580	A	6	6	54749	54754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012580	CGTT	2	8	54825	54832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_012580	C	6	6	54833	54838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1046	NC_012580	GT	3	6	54846	54851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012580	GCC	2	6	54879	54884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_012580	GAGGTA	2	12	54930	54941	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227811676
1049	NC_012580	ATC	2	6	55059	55064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811676
1050	NC_012580	CAC	2	6	55127	55132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811676
1051	NC_012580	TACCT	2	10	55191	55200	20 %	40 %	0 %	40 %	227811676
1052	NC_012580	AG	3	6	55252	55257	50 %	0 %	50 %	0 %	227811676
1053	NC_012580	GACA	2	8	55332	55339	50 %	0 %	25 %	25 %	227811676
1054	NC_012580	GCAC	2	8	55387	55394	25 %	0 %	25 %	50 %	227811676
1055	NC_012580	CAC	2	6	55463	55468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811676
1056	NC_012580	GGC	2	6	55527	55532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811676
1057	NC_012580	CTT	2	6	55715	55720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811676
1058	NC_012580	GAACA	2	10	55776	55785	60 %	0 %	20 %	20 %	227811676
1059	NC_012580	TGGTT	2	10	55804	55813	0 %	60 %	40 %	0 %	227811676
1060	NC_012580	CCA	2	6	55826	55831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811676
1061	NC_012580	AGT	2	6	55860	55865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811676
1062	NC_012580	GGT	2	6	55898	55903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811676
1063	NC_012580	TCA	2	6	55910	55915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811676
1064	NC_012580	CGC	2	6	55943	55948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811676
1065	NC_012580	AC	3	6	56011	56016	50 %	0 %	0 %	50 %	227811676
1066	NC_012580	CAG	2	6	56037	56042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811676
1067	NC_012580	ATT	2	6	56050	56055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811676
1068	NC_012580	GA	4	8	56100	56107	50 %	0 %	50 %	0 %	227811677
1069	NC_012580	TCA	2	6	56151	56156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811677
1070	NC_012580	AATG	2	8	56305	56312	50 %	25 %	25 %	0 %	227811677
1071	NC_012580	AAT	2	6	56372	56377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811677
1072	NC_012580	CGA	2	6	56398	56403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811677
1073	NC_012580	AAT	2	6	56425	56430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811677
1074	NC_012580	ATA	2	6	56507	56512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_012580	ATA	2	6	56533	56538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012580	TGC	2	6	56564	56569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_012580	AC	4	8	56582	56589	50 %	0 %	0 %	50 %	227811678
1078	NC_012580	ACGT	2	8	56643	56650	25 %	25 %	25 %	25 %	227811678
1079	NC_012580	GCAT	2	8	56762	56769	25 %	25 %	25 %	25 %	227811678
1080	NC_012580	AGG	2	6	56835	56840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811678
1081	NC_012580	CAC	2	6	56841	56846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811678
1082	NC_012580	TCA	2	6	56918	56923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811678
1083	NC_012580	GCA	3	9	56979	56987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811678
1084	NC_012580	CCAA	2	8	57006	57013	50 %	0 %	0 %	50 %	227811678
1085	NC_012580	CGG	2	6	57014	57019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811678
1086	NC_012580	TTC	2	6	57077	57082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811678
1087	NC_012580	GGT	2	6	57091	57096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811678
1088	NC_012580	GGC	2	6	57162	57167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811678
1089	NC_012580	TCA	2	6	57207	57212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811678
1090	NC_012580	CTTT	2	8	57234	57241	0 %	75 %	0 %	25 %	227811678
1091	NC_012580	CA	3	6	57279	57284	50 %	0 %	0 %	50 %	227811678
1092	NC_012580	GAAT	2	8	57326	57333	50 %	25 %	25 %	0 %	227811678
1093	NC_012580	CAG	2	6	57361	57366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811678
1094	NC_012580	TGG	2	6	57369	57374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811678
1095	NC_012580	AG	3	6	57397	57402	50 %	0 %	50 %	0 %	227811678
1096	NC_012580	TCA	2	6	57486	57491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811678
1097	NC_012580	TTG	2	6	57511	57516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811678
1098	NC_012580	GCTTG	2	10	57525	57534	0 %	40 %	40 %	20 %	227811678
1099	NC_012580	CAG	2	6	57556	57561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811678
1100	NC_012580	TCA	2	6	57587	57592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811678
1101	NC_012580	T	6	6	57714	57719	0 %	100 %	0 %	0 %	227811678
1102	NC_012580	GTA	2	6	57721	57726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811678
1103	NC_012580	TCA	2	6	57797	57802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811678
1104	NC_012580	CATGC	2	10	57805	57814	20 %	20 %	20 %	40 %	227811678
1105	NC_012580	CTCA	2	8	57886	57893	25 %	25 %	0 %	50 %	227811678
1106	NC_012580	GCG	2	6	57953	57958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811678
1107	NC_012580	CGG	2	6	57998	58003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811678
1108	NC_012580	TGA	2	6	58014	58019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811678
1109	NC_012580	GGT	2	6	58045	58050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811678
1110	NC_012580	CTT	2	6	58125	58130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811678
1111	NC_012580	GCA	2	6	58222	58227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811679
1112	NC_012580	GCA	2	6	58314	58319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811679
1113	NC_012580	GCT	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811679
1114	NC_012580	AGTG	2	8	58392	58399	25 %	25 %	50 %	0 %	227811679
1115	NC_012580	CA	3	6	58413	58418	50 %	0 %	0 %	50 %	227811679
1116	NC_012580	GAC	2	6	58448	58453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811679
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1118	NC_012580	CCA	2	6	58505	58510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811679
1119	NC_012580	GA	3	6	58533	58538	50 %	0 %	50 %	0 %	227811679
1120	NC_012580	GC	3	6	58589	58594	0 %	0 %	50 %	50 %	227811679
1121	NC_012580	GCT	2	6	58597	58602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811679
1122	NC_012580	GCA	2	6	58660	58665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811679
1123	NC_012580	TCA	2	6	58666	58671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811679
1124	NC_012580	T	6	6	58688	58693	0 %	100 %	0 %	0 %	227811679
1125	NC_012580	GCC	2	6	58707	58712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811679
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1127	NC_012580	TTG	2	6	58745	58750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811679
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