MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_012580	ATCCC	2	10	663930	663939	20 %	20 %	0 %	60 %	227812313
12502	NC_012580	CCA	2	6	664015	664020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812313
12503	NC_012580	GC	3	6	664070	664075	0 %	0 %	50 %	50 %	227812313
12504	NC_012580	TCA	2	6	664084	664089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812313
12505	NC_012580	AG	4	8	664158	664165	50 %	0 %	50 %	0 %	227812313
12506	NC_012580	CTT	2	6	664208	664213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812313
12507	NC_012580	GCT	2	6	664215	664220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812313
12508	NC_012580	GCC	2	6	664285	664290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812313
12509	NC_012580	GC	3	6	664394	664399	0 %	0 %	50 %	50 %	227812313
12510	NC_012580	GAA	2	6	664518	664523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812313
12511	NC_012580	TTTG	2	8	664582	664589	0 %	75 %	25 %	0 %	227812313
12512	NC_012580	CGC	2	6	664719	664724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_012580	CAT	2	6	664747	664752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_012580	AAAC	2	8	664821	664828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12515	NC_012580	TTA	2	6	664863	664868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_012580	T	6	6	664878	664883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_012580	AAC	2	6	664888	664893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_012580	T	6	6	664899	664904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_012580	CT	4	8	664905	664912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_012580	TTA	2	6	665019	665024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812314
12521	NC_012580	ATC	2	6	665087	665092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812314
12522	NC_012580	TTCA	2	8	665130	665137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12523	NC_012580	AAC	2	6	665181	665186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_012580	ATGAA	2	10	665191	665200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_012580	AAT	2	6	665201	665206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_012580	TCA	2	6	665284	665289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812315
12527	NC_012580	GGC	3	9	665292	665300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812315
12528	NC_012580	CAC	2	6	665384	665389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812315
12529	NC_012580	TGC	2	6	665407	665412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812315
12530	NC_012580	CG	3	6	665492	665497	0 %	0 %	50 %	50 %	227812315
12531	NC_012580	GTTT	2	8	665521	665528	0 %	75 %	25 %	0 %	227812315
12532	NC_012580	AGA	2	6	665540	665545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812315
12533	NC_012580	AAG	2	6	665620	665625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812315
12534	NC_012580	TG	3	6	665707	665712	0 %	50 %	50 %	0 %	227812315
12535	NC_012580	GC	3	6	665743	665748	0 %	0 %	50 %	50 %	227812315
12536	NC_012580	GCGT	2	8	665806	665813	0 %	25 %	50 %	25 %	227812315
12537	NC_012580	CAA	2	6	665856	665861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812315
12538	NC_012580	GCA	2	6	665871	665876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812315
12539	NC_012580	GCT	2	6	665945	665950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812315
12540	NC_012580	TAA	2	6	665969	665974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812315
12541	NC_012580	CAC	2	6	666050	666055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812315
12542	NC_012580	GC	3	6	666173	666178	0 %	0 %	50 %	50 %	227812315
12543	NC_012580	GAT	3	9	666210	666218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812315
12544	NC_012580	AGC	2	6	666265	666270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812315
12545	NC_012580	CAC	2	6	666290	666295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812315
12546	NC_012580	TGA	2	6	666313	666318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812315
12547	NC_012580	AAG	2	6	666360	666365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812315
12548	NC_012580	AAG	2	6	666418	666423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812315
12549	NC_012580	A	7	7	666438	666444	100 %	0 %	0 %	0 %	227812315
12550	NC_012580	CGA	2	6	666518	666523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812315
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12552	NC_012580	AAT	2	6	666606	666611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812315
12553	NC_012580	ACG	2	6	666623	666628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812315
12554	NC_012580	CCTT	2	8	666858	666865	0 %	50 %	0 %	50 %	227812315
12555	NC_012580	ACA	2	6	666884	666889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812315
12556	NC_012580	ATG	2	6	666890	666895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812315
12557	NC_012580	ATG	2	6	666900	666905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812316
12558	NC_012580	GCC	2	6	666941	666946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812316
12559	NC_012580	GC	3	6	666949	666954	0 %	0 %	50 %	50 %	227812316
12560	NC_012580	A	7	7	666967	666973	100 %	0 %	0 %	0 %	227812316
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12562	NC_012580	TTC	2	6	667012	667017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812316
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12564	NC_012580	A	6	6	667252	667257	100 %	0 %	0 %	0 %	227812316
12565	NC_012580	TTG	2	6	667323	667328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812316
12566	NC_012580	TGC	2	6	667362	667367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812316
12567	NC_012580	TGC	2	6	667494	667499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812316
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12570	NC_012580	TGA	2	6	667608	667613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812316
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12574	NC_012580	CGC	2	6	667966	667971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812316
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12582	NC_012580	GCACG	2	10	668655	668664	20 %	0 %	40 %	40 %	227812317
12583	NC_012580	CCAG	2	8	668693	668700	25 %	0 %	25 %	50 %	227812317
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12597	NC_012580	GGA	2	6	669521	669526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12599	NC_012580	AAG	2	6	669648	669653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	475645780
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12611	NC_012580	GGC	2	6	670333	670338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645780
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12617	NC_012580	AGA	2	6	670890	670895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812319
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12619	NC_012580	GC	3	6	670949	670954	0 %	0 %	50 %	50 %	227812319
12620	NC_012580	GCT	2	6	670986	670991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812319
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12622	NC_012580	GTG	2	6	671031	671036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812319
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