MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 19727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012580	TGG	2	6	25823	25828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811651
502	NC_012580	CAG	2	6	25890	25895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811651
503	NC_012580	ATT	2	6	25966	25971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811651
504	NC_012580	T	6	6	25970	25975	0 %	100 %	0 %	0 %	227811651
505	NC_012580	TGG	2	6	26010	26015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811651
506	NC_012580	AG	3	6	26160	26165	50 %	0 %	50 %	0 %	227811651
507	NC_012580	AGC	2	6	26256	26261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811651
508	NC_012580	ATGG	2	8	26265	26272	25 %	25 %	50 %	0 %	227811651
509	NC_012580	TCA	2	6	26411	26416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811651
510	NC_012580	AAC	2	6	26420	26425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811651
511	NC_012580	CG	3	6	26569	26574	0 %	0 %	50 %	50 %	227811651
512	NC_012580	CAG	2	6	26694	26699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811652
513	NC_012580	TTAT	2	8	26705	26712	25 %	75 %	0 %	0 %	227811652
514	NC_012580	GA	4	8	26735	26742	50 %	0 %	50 %	0 %	227811652
515	NC_012580	CTG	2	6	26777	26782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811652
516	NC_012580	ATTT	2	8	26802	26809	25 %	75 %	0 %	0 %	227811652
517	NC_012580	T	8	8	26807	26814	0 %	100 %	0 %	0 %	227811652
518	NC_012580	GCT	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811652
519	NC_012580	ACC	2	6	26906	26911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811652
520	NC_012580	TAT	2	6	26944	26949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811652
521	NC_012580	AAG	2	6	26957	26962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811652
522	NC_012580	TGGG	2	8	27004	27011	0 %	25 %	75 %	0 %	227811652
523	NC_012580	TGTT	2	8	27022	27029	0 %	75 %	25 %	0 %	227811652
524	NC_012580	CGT	2	6	27039	27044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811652
525	NC_012580	GCGG	2	8	27067	27074	0 %	0 %	75 %	25 %	227811652
526	NC_012580	CTG	2	6	27082	27087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811652
527	NC_012580	CCACC	2	10	27108	27117	20 %	0 %	0 %	80 %	227811652
528	NC_012580	AAGA	2	8	27124	27131	75 %	0 %	25 %	0 %	227811652
529	NC_012580	ATTG	2	8	27150	27157	25 %	50 %	25 %	0 %	227811652
530	NC_012580	AAAGA	2	10	27172	27181	80 %	0 %	20 %	0 %	227811652
531	NC_012580	TGG	2	6	27182	27187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811652
532	NC_012580	T	6	6	27235	27240	0 %	100 %	0 %	0 %	227811652
533	NC_012580	TGA	2	6	27249	27254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811652
534	NC_012580	ATA	2	6	27290	27295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811652
535	NC_012580	ACT	2	6	27382	27387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_012580	GCG	2	6	27406	27411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012580	CGT	2	6	27498	27503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811653
538	NC_012580	ATTT	2	8	27520	27527	25 %	75 %	0 %	0 %	227811653
539	NC_012580	GCG	2	6	27549	27554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811653
540	NC_012580	TGG	2	6	27579	27584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811653
541	NC_012580	GC	3	6	27604	27609	0 %	0 %	50 %	50 %	227811653
542	NC_012580	AATG	2	8	27672	27679	50 %	25 %	25 %	0 %	227811653
543	NC_012580	TG	3	6	27687	27692	0 %	50 %	50 %	0 %	227811653
544	NC_012580	CCA	2	6	27761	27766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811653
545	NC_012580	GCT	2	6	27803	27808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811653
546	NC_012580	TTC	2	6	27856	27861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811653
547	NC_012580	GCC	2	6	27955	27960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_012580	GTT	2	6	27976	27981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012580	GTG	2	6	28075	28080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811654
550	NC_012580	GTG	2	6	28110	28115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811654
551	NC_012580	GT	3	6	28138	28143	0 %	50 %	50 %	0 %	227811654
552	NC_012580	TCA	3	9	28183	28191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811654
553	NC_012580	CAC	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811654
554	NC_012580	TGAC	2	8	28209	28216	25 %	25 %	25 %	25 %	227811654
555	NC_012580	GTG	2	6	28317	28322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811654
556	NC_012580	CGA	2	6	28381	28386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811654
557	NC_012580	AAC	2	6	28416	28421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811654
558	NC_012580	ACAA	2	8	28476	28483	75 %	0 %	0 %	25 %	227811654
559	NC_012580	GC	3	6	28519	28524	0 %	0 %	50 %	50 %	227811654
560	NC_012580	GAC	2	6	28535	28540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811654
561	NC_012580	GCT	2	6	28544	28549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811654
562	NC_012580	GT	3	6	28601	28606	0 %	50 %	50 %	0 %	227811654
563	NC_012580	T	6	6	28606	28611	0 %	100 %	0 %	0 %	227811654
564	NC_012580	ATG	2	6	28632	28637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811654
565	NC_012580	ATC	2	6	28647	28652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811654
566	NC_012580	GCA	2	6	28714	28719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811654
567	NC_012580	TTGA	2	8	28757	28764	25 %	50 %	25 %	0 %	227811654
568	NC_012580	TAAA	2	8	28942	28949	75 %	25 %	0 %	0 %	227811654
569	NC_012580	TCA	2	6	28965	28970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811654
570	NC_012580	AAT	2	6	29012	29017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811654
571	NC_012580	T	7	7	29149	29155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012580	A	6	6	29162	29167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012580	GGT	2	6	29271	29276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811655
574	NC_012580	ATA	2	6	29284	29289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811655
575	NC_012580	TCA	2	6	29363	29368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811655
576	NC_012580	GA	3	6	29437	29442	50 %	0 %	50 %	0 %	227811655
577	NC_012580	GCC	2	6	29511	29516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811655
578	NC_012580	AGT	2	6	29555	29560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811655
579	NC_012580	GAT	2	6	29631	29636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811655
580	NC_012580	GTG	2	6	29702	29707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811655
581	NC_012580	CCAAT	2	10	29810	29819	40 %	20 %	0 %	40 %	227811655
582	NC_012580	AG	3	6	29900	29905	50 %	0 %	50 %	0 %	227811655
583	NC_012580	A	6	6	29913	29918	100 %	0 %	0 %	0 %	227811655
584	NC_012580	A	7	7	29995	30001	100 %	0 %	0 %	0 %	227811655
585	NC_012580	CGCGA	2	10	30034	30043	20 %	0 %	40 %	40 %	227811655
586	NC_012580	TGG	2	6	30125	30130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811655
587	NC_012580	ATG	2	6	30151	30156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811655
588	NC_012580	TTC	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811655
589	NC_012580	CAA	2	6	30332	30337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_012580	ATA	2	6	30472	30477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012580	CCA	2	6	30506	30511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811656
592	NC_012580	T	7	7	30710	30716	0 %	100 %	0 %	0 %	227811656
593	NC_012580	GCG	2	6	30736	30741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811656
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595	NC_012580	GCA	2	6	30796	30801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811656
596	NC_012580	GCT	2	6	30906	30911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811656
597	NC_012580	GCC	2	6	30940	30945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811656
598	NC_012580	ATG	2	6	30946	30951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811656
599	NC_012580	GCA	2	6	31001	31006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811656
600	NC_012580	TGGT	2	8	31067	31074	0 %	50 %	50 %	0 %	227811656
601	NC_012580	TCC	2	6	31077	31082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811656
602	NC_012580	GCG	2	6	31093	31098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811656
603	NC_012580	ACTG	2	8	31120	31127	25 %	25 %	25 %	25 %	227811656
604	NC_012580	GAT	3	9	31152	31160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811656
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607	NC_012580	TGC	2	6	31445	31450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811656
608	NC_012580	TGG	3	9	31455	31463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811656
609	NC_012580	GTG	2	6	31555	31560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811656
610	NC_012580	GTG	2	6	31567	31572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811656
611	NC_012580	CTG	2	6	31627	31632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811656
612	NC_012580	ATTG	2	8	31692	31699	25 %	50 %	25 %	0 %	227811656
613	NC_012580	CCT	2	6	31709	31714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227811656
614	NC_012580	TGC	2	6	31724	31729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811656
615	NC_012580	CCG	2	6	31741	31746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811656
616	NC_012580	GAT	2	6	31788	31793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811656
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618	NC_012580	CAG	2	6	31945	31950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012580	TATT	2	8	31959	31966	25 %	75 %	0 %	0 %	227811657
620	NC_012580	GCA	2	6	32030	32035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811657
621	NC_012580	TTC	2	6	32037	32042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811657
622	NC_012580	GCC	2	6	32116	32121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811657
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624	NC_012580	CTT	2	6	32183	32188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811657
625	NC_012580	TTG	2	6	32226	32231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811657
626	NC_012580	AGT	2	6	32236	32241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811657
627	NC_012580	TTGG	2	8	32316	32323	0 %	50 %	50 %	0 %	227811657
628	NC_012580	CAC	2	6	32343	32348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811657
629	NC_012580	GAT	3	9	32358	32366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811657
630	NC_012580	A	6	6	32454	32459	100 %	0 %	0 %	0 %	227811657
631	NC_012580	GCC	2	6	32460	32465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811657
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635	NC_012580	TTTGT	2	10	32806	32815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_012580	A	6	6	32925	32930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_012580	TC	3	6	32932	32937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_012580	AG	3	6	33014	33019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_012580	TTG	2	6	33522	33527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811658
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